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# Biologie# Genomik

Neue Einblicke in pädiatrische solide Tumoren

Forschung zeigt genetische Faktoren, die mit pädiatrischen soliden Tumoren verbunden sind, und betont die Notwendigkeit besserer Tests.

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Genetik hinterGenetik hinterpädiatrischenKrebserkrankungenRisiken bei Tumoren im Kindesalter.Studie zeigt versteckte genetische
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Pädiatrische solide Tumoren sind Krebsarten, die bei Kindern auftreten. Sie können ziemlich ernst sein und machen etwa ein Drittel aller neuen Krebsfälle bei Kids jedes Jahr aus. Diese Gruppe umfasst Krebsarten wie Ewing-Sarkom, Neuroblastom und Osteosarkom. Diese Tumoren sind oft aggressiv, was bedeutet, dass sie sich schnell ausbreiten können. Die Behandlung erfordert normalerweise eine Mischung aus verschiedenen Methoden wie Operation, Chemotherapie und Strahlentherapie. Leider sind die Chancen, diese Tumoren vollständig zu heilen, begrenzt, und selbst wenn Kinder überleben, können sie langfristige gesundheitliche Probleme haben.

Die Rolle der Genetik

In den letzten zwanzig Jahren haben Wissenschaftler enorme Fortschritte im Verständnis der Genetik hinter diesen Tumoren gemacht. Sie haben herausgefunden, dass sowohl vererbte (Keimbahn-) als auch nicht vererbte (somatische) genetische Veränderungen eine Rolle spielen, wie sich diese Krebsarten entwickeln. Die Keimbahn-Genetik betrachtet die Veränderungen, mit denen man geboren wird, während die somatische Genetik Veränderungen im Laufe der Zeit untersucht.

Forschungen haben gezeigt, dass bestimmte Veränderungen in der DNA-Sequenz zur Entstehung von Krebs führen können. Mit anderen Worten, einige Variationen in Genen können dazu führen, dass ein Kind eher diese Tumoren entwickelt. Allerdings ist es eine Herausforderung, alle genetischen Faktoren zu identifizieren, die zu pädiatrischen Krebserkrankungen beitragen. Studien schätzen, dass die Genetik etwa 4,5-mal mehr Risiko in Familien mit einer Geschichte von pädiatrischen soliden Tumoren ausmacht, doch nur ein kleiner Prozentsatz dieser Fälle kann durch bekannte genetische Faktoren erklärt werden.

Das Rätsel der fehlenden genetischen Faktoren

Trotz der Fortschritte in der genetischen Forschung bleibt ein grosser Teil des erblichen Risikos für diese Krebserkrankungen unerklärt. Viele herkömmliche Studien haben sich nur auf kleine Variationen in bestimmten Genen konzentriert. Aber es gibt ein wachsendes Interesse an einer anderen Art von genetischen Veränderungen, den strukturellen Varianten (SVs). Diese SVs beinhalten grössere Veränderungen in der DNA-Struktur, die die Funktionsweise von Genen erheblich beeinflussen könnten.

SVs können grosse Deletionen, Duplikationen oder Umstellungen von DNA-Abschnitten umfassen. Im Gegensatz zu kleinen Variationen können SVs mehrere Gene gleichzeitig beeinflussen. Da aktuelle Methoden diese wichtigen strukturellen Veränderungen weitgehend ignorieren, könnten sie wichtige Puzzlestücke fehlen, um zu verstehen, was diese Tumoren verursacht.

Forschungsfokus

Diese Studie untersuchte die Rolle seltener Keimbahn-SVs bei drei Arten von pädiatrischen soliden Tumoren: Ewing-Sarkom, Neuroblastom und Osteosarkom. Durch den Einsatz fortschrittlicher Ganzgenom-Sequenzierungstechniken wollten die Forscher die Häufigkeit und Art der SVs, die bei Kindern mit diesen Tumoren im Vergleich zu gesunden Personen vorhanden sind, aufdecken.

Die Forschung umfasste die Analyse genetischer Daten von über 10.000 Personen, was einen umfassenden Blick auf die verschiedenen SVs bei kranken Kindern und gesunden Kontrollen ermöglichte. Durch den Vergleich dieser Genome wollten die Wissenschaftler Verbindungen zwischen bestimmten SVs und einem erhöhten Krebsrisiko herstellen.

Wichtige Erkenntnisse zu Keimbahn-SVs

Eine der wichtigsten Entdeckungen aus dieser Forschung war, dass grosse, unausgeglichene Keimbahn-SVs das Risiko für pädiatrische solide Tumoren erheblich erhöhen könnten. Diese grossen Veränderungen betreffen oft die normale Menge an DNA im Genom und können zur Krebsentwicklung führen. Die Forscher stellten fest, dass männliche Kinder eine deutlich höhere Rate dieser grossen SVs im Vergleich zu weiblichen Kindern hatten.

Interessanterweise überlappte die Mehrheit der gefundenen grossen SVs nicht mit bekannten krebsbezogenen Genen. Das deutet darauf hin, dass ihre Auswirkungen möglicherweise über andere Mechanismen erfolgen, die noch nicht gründlich untersucht wurden.

Zudem war die Häufigkeit seltener genstörender SVs bei Kindern mit Tumoren im Vergleich zu gesunden Kontrollen höher. Das bedeutet, dass einige Kinder spezifische genetische Varianten haben könnten, die die Funktion wichtiger Gene schwächen und somit ihr Krebsrisiko erhöhen.

Genstörung und Krebsrisiko

Die Studie lieferte auch Einblicke, wie genstörende SVs die Entwicklung pädiatrischer Krebserkrankungen beeinflussen können. Kinder mit diesen SVs hatten im Durchschnitt mehr betroffene Gene als solche ohne diese. Dieser Effekt wurde sowohl bei Verlust- als auch bei Gewinnfunktionen in Genen beobachtet.

Verlustvarianten deaktivieren normalerweise ein Gen, während Gewinnvarianten ein Gen überaktiv machen. Beide Arten von Veränderungen können Krebs verursachen, indem sie normale zelluläre Prozesse stören. Bei Kindern mit soliden Tumoren wurden mehr dieser störenden Veränderungen in ihren Genomen gefunden, was darauf hindeutet, dass spezifische genetische Veränderungen das Krebsrisiko erhöhen können.

Einfluss nichtkodierender SVs

Nicht alle Teile des Genoms sind für die Codierung von Proteinen verantwortlich. Ein grosser Teil der DNA, der als nichtkodierende Regionen bezeichnet wird, hat regulatorische Rollen, die auch das Krebsrisiko beeinflussen können. Die Forschung untersuchte, wie nichtkodierende SVs zu pädiatrischen soliden Tumoren beitragen könnten.

Insbesondere bei Neuroblastom-Fällen fanden die Forscher einen Zusammenhang mit nichtkodierenden SVs, die sich in bestimmten Regionen des Genoms, den topologisch assoziierenden Domänen (TADs), befinden. Diese Regionen können die Genexpression regulieren, und Veränderungen in ihnen könnten die normale Funktion benachbarter Gene stören.

Klinische Implikationen

Die Ergebnisse dieser Forschung heben die Notwendigkeit umfassenderer genetischer Tests in Fällen von pädiatrischem Krebs hervor. Aktuelle Praktiken übersehen oft Strukturelle Varianten, was zu verpassten Gelegenheiten führt, das Krebsrisiko eines Kindes zu verstehen. Durch die Einbeziehung von SV-Analysen in die routinemässige Testung könnten Gesundheitsdienstleister zusätzliche Risikofaktoren identifizieren, die die Behandlungspläne informieren.

Zusammenfassung

Zusammenfassend bleibt der Umgang mit pädiatrischen soliden Tumoren eine erhebliche Herausforderung in der Gesundheit von Kindern. Diese Forschung beleuchtet die komplexe Rolle der Genetik, insbesondere den Einfluss von grossen und kleinen strukturellen Varianten. Durch ein besseres Verständnis dieser genetischen Faktoren können wir die diagnostischen Prozesse verbessern und die Behandlungsansätze optimieren, um Kindern, die von diesen aggressiven Krebsarten betroffen sind, besser zu helfen. Zukünftige Studien werden weiterhin die Komplexität pädiatrischer solider Tumoren aufschlüsseln und hoffentlich neue therapeutische Ziele und Präventionsstrategien identifizieren.

Originalquelle

Titel: Rare germline structural variants increase risk for pediatric solid tumors

Zusammenfassung: AO_SCPLOWBSTRACTC_SCPLOWPediatric solid tumors are rare malignancies that represent a leading cause of death by disease among children in developed countries. The early age-of-onset of these tumors suggests that germline genetic factors are involved, yet conventional germline testing for short coding variants in established predisposition genes only identifies pathogenic events in 10-15% of patients. Here, we examined the role of germline structural variants (SVs)--an underexplored form of germline variation--in pediatric extracranial solid tumors using germline genome sequencing of 1,766 affected children, their 943 unaffected relatives, and 6,665 adult controls. We discovered a sex-biased association between very large (>1 megabase) germline chromosomal abnormalities and a four-fold increased risk of solid tumors in male children. The overall impact of germline SVs was greatest in neuroblastoma, where we revealed burdens of ultra-rare SVs that cause loss-of-function of highly expressed, mutationally intolerant, neurodevelopmental genes, as well as noncoding SVs predicted to disrupt three-dimensional chromatin domains in neural crest-derived tissues. Collectively, our results implicate rare germline SVs as a predisposing factor to pediatric solid tumors that may guide future studies and clinical practice.

Autoren: Eliezer Van Allen, R. Gillani, R. L. Collins, J. Crowdis, A. Garza, J. K. Jones, M. Walker, A. Sanchis-Juan, C. W. Whelan, E. Pierce-Hoffman, M. E. Talkowski, H. Brand, K. M. Haigis, J. LoPiccolo, S. H. AlDubayan, A. H. Gusev, B. D. Crompton, K. Janeway

Letzte Aktualisierung: 2024-04-29 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.27.591484

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.27.591484.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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