Fortschritte bei der Entwicklung von Mückenabwehrmitteln
Neue Methoden zielen darauf ab, Abwehrmittel zu verbessern, um die Schädlingsbekämpfung zu optimieren.
― 5 min Lesedauer
Inhaltsverzeichnis
- Aktuelle Repellentien und ihre Probleme
- Strategien zur Suche nach neuen Repellentien
- Nutzung historischer Daten für neue Lösungen
- Digitalisierung und Analyse des USDA-Datensatzes
- Modellaufbau für Vorhersagen
- Testen neuer Kandidaten
- Die Rolle der Calcium-Bildgebung
- Entdeckung wirksamer Moleküle
- Bewertung der Leistung der Kandidaten
- Verständnis der Einschränkungen
- Die Zukunft der Repellent-Entdeckung
- Fazit
- Originalquelle
- Referenz Links
Mücken und andere Blutsauger übertragen Krankheiten, die jedes Jahr viele Menschen töten. Um dieses Gesundheitsproblem anzugehen, müssen wir effektivere Mittel finden, herstellen und nutzen, um diese Schädlinge zu kontrollieren. Diese Kontrolle bedeutet nicht nur, die Insekten zu töten, sondern auch zu verhindern, dass sie Menschen stechen. Übliche Insektenschutzmittel wie DEET, Picaridin und IR3535 werden verwendet, um diese Plagegeister fernzuhalten, haben aber ihre Nachteile. Zum Beispiel kann DEET bestimmte Stoffe beschädigen und ist schädlich für manche Tiere. In den letzten Jahrzehnten wurden nur wenige neue Arten von Repellentien eingeführt, und wir brauchen einen besseren Weg, um schnell neue Optionen zu finden.
Aktuelle Repellentien und ihre Probleme
Übliche Repellentien wie DEET müssen in hohen Konzentrationen verwendet werden, was einschränkt, wo sie angewendet werden können. Sie können der Umwelt und der Tierwelt schaden. Manche Repellentien wirken gut gegen bestimmte Mückenarten, aber nicht gegen andere. Zum Beispiel ist IR3535 gegen Aedes aegypti Mücken wirksam, funktioniert aber nicht gegen Anopheles-Mücken, die für die Verbreitung von Malaria verantwortlich sind. Wegen dieser Einschränkungen müssen wir neue Wege finden, um potenzielle Repellentkandidaten zu entdecken und zu testen.
Strategien zur Suche nach neuen Repellentien
Es gibt verschiedene Methoden, um neue Repellentkandidaten zu identifizieren. Eine Möglichkeit sind Verhaltenstests, bei denen die Wirksamkeit eines Repellents in realen Situationen beobachtet wird. Zum Beispiel testete das USDA während des Zweiten Weltkriegs eine grosse Anzahl von Verbindungen, um zu sehen, wie gut sie Insekten abwehren konnten, was zur Entdeckung von DEET führte. Andere Methoden beinhalten, die molekulare Struktur von Verbindungen zu studieren und wie sie mit den Sinnen von Insekten interagieren. Diese Methoden können allerdings zeitaufwendig und arbeitsintensiv sein.
Nutzung historischer Daten für neue Lösungen
Das USDA hat einen riesigen Datensatz, der die Beziehung zwischen der Struktur von Verbindungen und ihrer Wirksamkeit als Repellenten beschreibt. Diese Informationen wurden bis jetzt nicht vollständig genutzt. In dieser Studie war das Ziel, einen modernen Ansatz zu verwenden, um diesen Datensatz mit einer Art von künstlicher Intelligenz namens Deep Learning zu analysieren. So könnten Forscher besser verstehen, welche chemischen Strukturen wahrscheinlich effektive Repellentien sind.
Digitalisierung und Analyse des USDA-Datensatzes
Der USDA-Datensatz, der viele Informationen zur Wirksamkeit von Repellentien enthält, lag viele Jahre hauptsächlich in gedruckter Form vor. Erst kürzlich wurde er gescannt und online verfügbar gemacht. Die Forscher haben diese Daten in ein Format umgewandelt, das Computer lesen können. Nach sorgfältiger Verarbeitung der Informationen konzentrierten sie sich auf spezifische Tests, die verschiedene Mückenarten involvierten. Dieser Prozess lieferte einen grossen Datensatz, der verwendet werden sollte, um Modelle zu trainieren, die vorhersagen, wie wirksam neue Repellentien sein könnten.
Modellaufbau für Vorhersagen
Durch den Einsatz von Deep Learning-Modellen wollten die Forscher die Wirksamkeit verschiedener Verbindungen als Repellenten vorhersagen. Sie wählten ein spezielles Modell namens Graph Neural Network, da sich gezeigt hat, dass es vielversprechend bei der Vorhersage der Eigenschaften chemischer Verbindungen basierend auf ihrer Struktur ist. Mit dem vorbereiteten Datensatz konnte das Modell aus den historischen Daten lernen, was zu besseren Vorhersagen für neue Testkandidaten führte.
Testen neuer Kandidaten
Um sicherzustellen, dass das Modell effektiv war, mussten die Forscher seine Vorhersagen im Labor testen. Sie verwendeten einen speziellen Membranfütterungstest, der misst, wie gut potenzielle Repellentien Mücken vom Fressen abhalten. Nachdem sie vielversprechende Kandidaten basierend auf den Vorhersagen des Modells ausgewählt hatten, testeten sie diese Moleküle auf ihre Abwehrwirkung. Die Ergebnisse wurden genutzt, um das Modell weiter zu verfeinern, was einen aktiven Lernansatz ermöglichte, der Vorhersagen basierend auf neuen Daten kontinuierlich verbessert.
Die Rolle der Calcium-Bildgebung
Die Forscher nutzten auch fortschrittliche Bildgebungstechniken, um zu beobachten, wie die Gehirne von Mücken auf verschiedene Verbindungen reagierten. Sie konzentrierten sich auf bestimmte Teile des Mückengehirns, die antennalen Lappen, die an der Verarbeitung von Gerüchen beteiligt sind. Durch die Analyse, wie verschiedene Substanzen verschiedene Neuronen aktivierten, hofften sie, Einblicke zu erhalten, wie Mücken Repellentien erkennen.
Entdeckung wirksamer Moleküle
Durch diesen Prozess haben die Forscher eine Vielzahl chemischer Substanzen gefunden, die potenziell als Repellentien wirken könnten. Einige dieser neuen Moleküle zeigen eine Wirksamkeit, die gleich oder besser als DEET ist. Das ist entscheidend im Kampf gegen von Mücken übertragene Krankheiten, besonders in Gebieten, wo Malaria verbreitet ist.
Bewertung der Leistung der Kandidaten
Nachdem potenzielle Repellentkandidaten identifiziert wurden, war der nächste Schritt, zu bewerten, wie gut sie in verschiedenen Umgebungen abschneiden. Die Forscher testeten ausgewählte Moleküle nicht nur gegen Mücken, sondern auch gegen andere Schädlinge wie Zecken. Sie stellten fest, dass viele ihrer Kandidaten über verschiedene Arten hinweg wirksam waren und ein breites Anwendungsspektrum zeigten.
Verständnis der Einschränkungen
Trotz der vielversprechenden Ergebnisse gab es noch Fragen darüber, wie gut die Modellvorhersagen mit dem tatsächlichen Verhalten der Verbindungen übereinstimmten. Einige Variationen zeigten, dass das Modell zwar effektive Kandidaten vorschlagen konnte, die tatsächliche Leistung jedoch je nach Umweltfaktoren und der spezifischen Biologie der Schädlinge unterschiedlich sein konnte.
Die Zukunft der Repellent-Entdeckung
Die Ergebnisse verdeutlichen, wie wichtig es ist, historische Daten mit moderner Technologie zu verbinden, um neue Repellentien zu entdecken. Diese Arbeit hilft nicht nur, neue Produkte zur Schädlingsbekämpfung zu finden, sondern eröffnet auch Möglichkeiten, andere Arten von verhaltensmodifizierenden Substanzen in verschiedenen Kontexten zu untersuchen.
Fazit
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass die Kombination aus der Digitalisierung alter Datensätze, der Anwendung von Deep Learning-Modellen und Laboruntersuchungen einen vielversprechenden Weg bietet, neue und effektive Insektenschutzmittel zu entdecken. Während diese Forschung fortschreitet, wird sie zur besseren Kontrolle von Mückenpopulationen und den Krankheiten, die sie übertragen, beitragen und letztendlich dazu helfen, Leben zu retten und die öffentliche Gesundheit zu verbessern.
Titel: A deep learning and digital archaeology approach for mosquito repellent discovery
Zusammenfassung: Insect-borne diseases kill >0.5 million people annually. Currently available repellents for personal or household protection are limited in their efficacy, applicability, and safety profile. Here, we describe a machine-learning-driven high-throughput method for the discovery of novel repellent molecules. To achieve this, we digitized a large, historic dataset containing [~]19,000 mosquito repellency measurements. We then trained a graph neural network (GNN) to map molecular structure and repellency. We applied this model to select 317 candidate molecules to test in parallelizable behavioral assays, quantifying repellency in multiple pest species and in follow-up trials with human volunteers. The GNN approach outperformed a chemoinformatic model and produced a hit rate that increased with training data size, suggesting that both model innovation and novel data collection were integral to predictive accuracy. We identified >10 molecules with repellency similar to or greater than the most widely used repellents. We analyzed the neural responses from the mosquito antennal (olfactory) lobe to selected repellents and found a limited correlation between these responses and our GNN representation. This approach enables computational screening of billions of possible molecules to identify empirically tractable numbers of candidate repellents, leading to accelerated progress towards solving a global health challenge.
Autoren: Alexander B Wiltschko, J. N. Wei, C. Ruiz, M. Vlot, B. Sanchez-Lengeling, B. K. Lee, L. Berning, M. W. Vos, R. W. Henderson, W. W. Qian, D. M. Ando, K. M. Groetsch, R. C. Gerkin, J. A. Riffell, K. J. Dechering
Letzte Aktualisierung: 2024-05-02 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.01.504601
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.01.504601.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
Vielen Dank an biorxiv für die Nutzung seiner Open-Access-Interoperabilität.