Die Rolle des Bam-Komplexes im Überleben von Bakterien
Dieser Artikel untersucht den Einfluss des Bam-Komplexes auf die Überlebensmechanismen von gramnegativen Bakterien.
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Inhaltsverzeichnis
Die äussere Membran von Gram-negativen Bakterien spielt eine entscheidende Rolle dafür, wie diese Mikroben überleben und gedeihen. Diese Membran ist nicht nur eine Barriere; sie hilft den Bakterien, gegen Medikamente resistent zu sein, dem Immunsystem zu entkommen und trägt zur Fähigkeit bei, Krankheiten zu verursachen.
Struktur der äusseren Membran
Im Kern ist die äussere Membran eine einzigartige Struktur, die aus zwei Schichten besteht. Die innere Schicht enthält Phospholipide, während die äussere Schicht hauptsächlich aus einem Stoff namens Lipopolysaccharid (LPS) besteht. In dieser Membran sind auch verschiedene Proteine eingebettet. Diese Proteine sind für viele Funktionen unerlässlich, dazu gehört der Transport von Substanzen in und aus der Zelle, die Wahrnehmung der Umgebung und die Unterstützung der Haftfähigkeit der Bakterien an Oberflächen.
Zusammenbau von äusseren Membranproteinen
Damit diese Proteine richtig funktionieren, müssen sie korrekt gefaltet und in die äussere Membran eingefügt werden. Dieser Prozess hängt von einem komplexen System ab, das als β-Fass-Assemblierungsmaschine oder Bam-Komplex bekannt ist. Diese Maschinerie ist entscheidend dafür, dass die äusseren Membranproteine (OMPs) in die Membran gelangen, wo sie ihren Job machen können.
Wenn Proteine in der Zelle hergestellt werden, müssen sie zuerst die innere Membran passieren, um einen Raum namens Periplasma zu erreichen. Hier können diese Proteine ihre Reise zur äusseren Membran beginnen. Allerdings können diese Proteine während des Transits leicht zusammenklumpen, wenn sie nicht in einem entfaltetem Zustand gehalten werden. Eine Gruppe von Qualitätskontrollproteinen hilft, die OMPs in Form zu halten, während sie sich bewegen. Zu diesen Proteinen gehören SurA, Skp und DegP. Sie sorgen dafür, dass die OMPs erfolgreich den Bam-Komplex erreichen, ohne sich zu verheddern.
Studien zeigen, dass selbst wenn einige dieser Qualitätskontrollproteine anscheinend dieselbe Aufgabe erfüllen, jedes seine eigenen einzigartigen Rollen hat. SurA ist der Hauptchaperon, während Skp und DegP als Backup fungieren. Sie helfen bei spezifischen Problemen, die während des Proteintransports und -zusammenbaus auftreten können.
Struktur des Bam-Komplexes
Wenn die Proteine im Bam-Komplex ankommen, werden sie von einer Gruppe von Komponenten empfangen, die BamA und BamD umfasst, die für die Funktionsweise des Komplexes erforderlich sind. BamA ist der wichtigste Teil des Komplexes, da er einen Kanal bietet, durch den die OMPs hindurchgehen können. BamD interagiert eng mit BamA. Es gibt auch andere Lipoproteine wie BamB, BamC und BamE, die die Hauptkomponenten unterstützen.
Jedes dieser Zubehörproteine spielt eine Rolle dafür, dass der Bam-Komplex effizient arbeitet. Einige Studien deuten darauf hin, dass diese Proteine bei der Faltung und Bewegung von OMPs in die Membran helfen könnten. Obwohl sie sich in ihren Funktionen überschneiden, haben sie auch spezifische Rollen, die sie für den gesamten Prozess notwendig machen.
Untersuchung spezieller Funktionen von Bam-assoziierten Proteinen
Forschung hat gezeigt, dass die Struktur von LPS in der äusseren Membran der Bakterien beeinflussen kann, wie effektiv der Bam-Komplex arbeitet. Wenn sich die Struktur von LPS ändert, kann dies zu einer erhöhten Membranfluidität führen, was es dem Bam-Komplex erschwert, seine Aufgaben zu erfüllen. Das deutet auf einen klaren Zusammenhang zwischen den physikalischen Eigenschaften der äusseren Membran und der Fähigkeit der Bakterien hin, ihre Proteine zu verwalten.
Ein Beispiel ist ein Kohlenhydrat namens enterobakterielles gemeinsames Antigen (ECA), das in der äusseren Membran vorkommt und für Bakterien ohne das SurA-Protein entscheidend ist. Diese Erkenntnis deutet darauf hin, dass ECA helfen könnte, die äussere Membran zu stabilisieren, besonders wenn andere Proteine nicht richtig funktionieren.
Darüber hinaus kann das Fehlen bestimmter Proteine wie BamB, BamC oder BamE zu Problemen mit einem anderen wichtigen Bestandteil namens meso-DAP führen. Dieser Bestandteil ist notwendig für den Aufbau der schützenden Schichten der Zelle, und ohne ihn haben die Bakterien Schwierigkeiten zu überleben.
Untersuchung der Fitness von Bam-assoziierten Proteinmutanten
Um besser zu verstehen, wie diese Bam-assoziierten Proteine funktionieren, haben Forscher verschiedene Mutantenstämme von E. Coli untersucht, denen spezifische Proteine fehlen. Indem sie beobachten, wie gut diese Mutanten unter verschiedenen Bedingungen wachsen, können sie die Rolle jedes Proteins bestimmen.
Ein Experiment mass, wie gut verschiedene Mutanten unter verschiedenen stressigen Umgebungen abschnitten. Die Ergebnisse zeigten, dass Mutanten ohne BamB und SurA am meisten Schwierigkeiten hatten, besonders bei Antibiotika oder beim Stress durch Salz. Interessanterweise hatten einige Mutanten ähnliche Reaktionen, während andere deutlich unterschiedliche zeigten, was darauf hinweist, dass jedes Protein spezialisierte Funktionen hat.
Genetische Interaktionen zwischen Bam-assoziierten Proteinen
Mit fortschrittlichen genetischen Techniken können Forscher feststellen, wie verschiedene Gene in Abwesenheit spezifischer Proteine miteinander interagieren. Diese Methode ermöglicht es ihnen zu finden, welche Gene notwendig werden, wenn bestimmte Bam-assoziierte Proteine entfernt werden. Zum Beispiel wurden bestimmte Gene, die für die LPS-Biosynthese wichtig sind, als bedingt essentiell in Abwesenheit spezifischer Bam-Proteine identifiziert.
Durch die Identifizierung dieser Beziehungen können Wissenschaftler die komplexen Interaktionen innerhalb der Bakterien besser verstehen, was Einblicke in effektivere Bekämpfung von Infektionen bietet.
Die Verbindung zwischen der äusseren Membran und der DNA-Replikation
Ein weiterer faszinierender Aspekt der Forschung ist die Beziehung zwischen den äusseren Membranproteinen und der DNA-Replikation in Bakterien. Die DNA in Bakterien muss während der Zellteilung korrekt kopiert und aufgeteilt werden, und bestimmte Proteine regulieren diesen Prozess.
Bei Mutanten, die kein BamB haben, fanden Forscher heraus, dass die DNA-Replikation zu früh initiiert wurde. Das deutet auf eine Koordination zwischen dem Prozess des Zusammenbaus der äusseren Membran und dem Timing der DNA-Replikation hin. Das Verständnis dieser Verbindung könnte neue Methoden zur Störung des Bakterienwachstums aufdecken, insbesondere bei schädlichen Stämmen.
Evolution und Erhaltung von Bam-assoziierten Proteinen
Die Studie der Bam-Proteine geht über Labortypen hinaus, da Forscher analysieren, wie sich diese Proteine über verschiedene Bakterien hinweg entwickelt haben. Viele Gram-negative Bakterien haben ähnliche Versionen dieser Proteine, aber es gibt auch einzigartige Variationen. Diese Vielfalt deutet darauf hin, dass während die Kernfunktionen des Bam-Komplexes erhalten bleiben, die spezifischen Rollen je nach Organismus ganz unterschiedlich sein können.
Indem sie zahlreiche Bakterienarten untersuchen, können Wissenschaftler herausfinden, welche Proteine vorhanden oder abwesend sind. Einige Bakterien haben bestimmte Proteine ganz verloren, möglicherweise weil sie weniger Äussere Membranproteine zu verwalten haben.
Die Zukunft der Forschung zu Bam-assoziierten Proteinen
Angesichts der Bedeutung des Bam-Komplexes und seiner assoziierten Proteine sind sie ein wertvolles Ziel für die Entwicklung neuer antimikrobieller Therapien. Da Bakterien weiterhin evolvieren und Resistenzen gegen bestehende Medikamente entwickeln, könnte das Verständnis der komplexen Abläufe im Bam-Komplex neue Behandlungsmöglichkeiten eröffnen.
Die Forschung geht weiter, um diese Rollen weiter zu klären. Während Wissenschaftler weiterhin die Beziehungen zwischen diesen Proteinen erkunden, werden sie wahrscheinlich mehr über ihre Funktionen und Wichtigkeit aufdecken. Das Verständnis des Bam-Komplexes und seiner assoziierten Proteine wird helfen, effektive Strategien gegen bakterielle Infektionen zu entwickeln, was zu erfolgreicheren Behandlungen führen kann.
Insgesamt hebt die Arbeit in diesem Bereich die komplexen Interaktionen innerhalb bakterieller Zellen und die kritischen Rollen hervor, die äussere Membranproteine bei der Aufrechterhaltung des Überlebens und der Fitness von Bakterien spielen. Je mehr unser Wissen wächst, desto mehr können wir auf neue Ansätze hoffen, um schädliche bakterielle Infektionen zu bekämpfen.
Titel: Bam complex associated proteins in Escherichia coli are functionally linked to peptidoglycan biosynthesis, membrane fluidity and DNA replication
Zusammenfassung: Biogenesis of the bacterial outer membrane is key to bacterial survival and antibiotic resistance. Central to this is the {beta}-barrel assembly machine (Bam) complex and its associated chaperones, which are responsible for transport, folding and insertion of outer membrane proteins (OMPs). The Escherichia coli Bam complex is composed of two essential subunits, BamA and BamD, and three non-essential accessory lipoproteins, BamB, BamC and BamE. Optimal Bam function is further dependent on the non-essential periplasmic chaperones DegP, Skp and SurA. Despite intensive study, the specific function of these non-essential Bam-associated proteins remains unknown. Here, we analysed {Delta}bamB, {Delta}bamC, {Delta}bamE, {Delta}surA, {Delta}skp and {Delta}degP knockout strains by phenotypic screening, conservation analysis and high-throughput genetics. We reveal that Bam complex activity is impacted by changes in outer membrane lipid composition and that enterobacterial common antigen is essential in the absence of the chaperone SurA. We also show components of peptidoglycan are conditionally essential with Bam accessory lipoproteins and that DNA replication control is perturbed in the absence of specific OMP assembly components. Together, our data indicates potential mechanisms for coordination of OMP biogenesis with other cellular growth processes such as LPS and peptidoglycan biogenesis, and DNA replication control.
Autoren: Jack Alfred Bryant, K. A. Staunton, H. M. Doherty, M. B. Alao, X. Ma, J. Morcinek-Orlowska, E. C. A. Goodall, J. Gray, M. Milner, J. A. Cole, F. de Cogan, T. J. Knowles, M. K. Glinkowska, D. Moradigaravand, I. R. Henderson, M. Banzhaf
Letzte Aktualisierung: 2024-05-17 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.05.547807
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.05.547807.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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