Genetische Einblicke in Blutgruppen im Oman
Studie zeigt neue genetische Variationen, die Blutgruppen im Oman beeinflussen.
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Inhaltsverzeichnis
- Probenentnahme
- Methoden der Blutbank
- Genomsequenzierung und Analyse
- Ableitung von Blutgruppentypen
- Identifizierung von Diskrepanzen
- Ergebnisse zur ABO-Blutgruppe
- Ergebnisse zur Rh-Blutgruppe
- Ergebnisse zur Duffy-Blutgruppe
- Ergebnisse zur Lewis-Blutgruppe
- Ergebnisse zur Lutheran-Blutgruppe
- Ergebnisse zur MNS-Blutgruppe
- Ergebnisse zur P1-Blutgruppe
- Zusammenfassung der Ergebnisse
- Originalquelle
In den letzten 124 Jahren haben Wissenschaftler 45 verschiedene Blutgruppen bei Menschen entdeckt. Diese Gruppen werden durch unterschiedliche Gene markiert, die spezifische Proteine auf roten Blutkörperchen produzieren. Über 50 Gene sind mit diesen Blutgruppen verbunden. Obwohl es viele Infos über Blutgruppen gibt, stammen viele davon aus Einzelberichten von Patienten. Neueste Studien zeigen, dass es noch viel zu lernen gibt, besonders in verschiedenen Populationen weltweit.
Forscher, die die genetischen Unterschiede unter Menschen aus Afrika, Europa, Südasien, Ostasien und Amerika untersucht haben, fanden viele genetische Variationen in Blutgruppen-assoziierten Genen. Sie entdeckten über 1.200 Variationen in diesen Genen, wobei zahlreiche davon neu waren und zuvor nicht mit Blutgruppen in Verbindung gebracht wurden. Das deutet darauf hin, dass wir noch nicht ganz verstehen, wie Blutgruppen in verschiedenen Populationen variieren.
In Oman zeigte eine aktuelle Studie, dass es seltene genetische Veränderungen gibt, die wahrscheinlich beeinflussen, wie bestimmte Blutgruppen auftreten. Die Forscher schauten sich verschiedene Blutgruppenproteine an, indem sie die Ergebnisse von genetischen Tests mit traditionellen Blutgruppenbestimmungen verglichen. Die meisten Tests stimmten überein, aber es gab auch einige Ausnahmen. Diese Abweichungen waren wahrscheinlich auf genetische Veränderungen zurückzuführen, die nicht in den genetischen Tests enthalten waren.
Die Blutgruppenbestimmung, die für sichere Transfusionen wichtig ist, geht zunehmend dazu über, genetische Tests neben traditionellen Methoden zu nutzen. Genetische Tests können helfen, Blut für Patienten zu matchen, die häufig Transfusionen benötigen oder spezifische blutbezogene Probleme haben. Das ist besonders nützlich in Oman, wo bestimmte Blutkrankheiten verbreitet sind. Allerdings braucht es noch ein vollständiges Verständnis der seltenen genetischen Veränderungen, die Blutgruppen in dieser Region beeinflussen.
Die Studie in Oman verglich genetische Tests mit den Ergebnissen der Blutgruppenbestimmung, um genetische Veränderungen in Bezug auf Bluttypen zu identifizieren. Sie fanden sieben genetische Veränderungen, die zuvor bei Omanis nicht dokumentiert waren. Zudem identifizierten sie mehrere mögliche Veränderungen, die das Erscheinungsbild der Blutgruppe beeinflussen könnten. Diese Erkenntnisse liefern wichtige Infos für Blutbanken in Oman und umliegenden Gebieten.
Probenentnahme
Die Studie umfasste 100 gesunde männliche und weibliche Blutspender aus Oman, die zwischen 18 und 60 Jahre alt waren. Sie wurden zufällig ausgewählt und gaben ihr Einverständnis zur Teilnahme. Die Studie wurde von einem medizinischen Ethikkomitee genehmigt.
Methoden der Blutbank
Die Blutproben wurden innerhalb von 24 Stunden mit speziellen Antikörpern getestet, die so ausgelegt waren, dass sie mit verschiedenen Blutgruppenantigenen reagieren. Die Hauptblutgruppen, die getestet wurden, umfassten ABO, Rh, Kell, Kidd, Duffy, Lewis, Lutheran und MNS. Eine klare Reaktion zeigte ein negatives Ergebnis für dieses Antigen an. Schwache Reaktionen wurden weiter getestet, um eine genaue Zuordnung der Bluttypen zu gewährleisten.
Genomsequenzierung und Analyse
Die vollständige Genomsequenzierung wurde an den Proben durchgeführt, um genetische Variationen zu analysieren. Die Sequenzreads wurden mit einem Referenzgenom abgeglichen, und Variationen wurden unter Verwendung etablierter Protokolle identifiziert. Das Forschungsteam schloss anschliessend die Blutgruppentypen aus diesen genetischen Variationen.
Ableitung von Blutgruppentypen
Die Studie bezog sich auf eine Liste genetischer Variationen, die bekannt dafür sind, Blutgruppentypen zu beeinflussen. Durch die Nutzung dieser Liste konnte das Team genetische Daten mit Bluttypen abgleichen, die durch traditionelle serologische Methoden bestimmt wurden. Die Übereinstimmung, das heisst wie oft die genetischen Daten mit den serologischen Ergebnissen übereinstimmten, war insgesamt hoch. Bei einigen Bluttypen gab es 100% Übereinstimmung, während andere etwas niedriger waren.
Identifizierung von Diskrepanzen
Das Team identifizierte Fälle, in denen die genetischen Daten nicht mit den serologischen Ergebnissen übereinstimmten. Sie fanden bekannte genetische Variationen, die Bluttypen beeinflussten und die zuvor bei Omanis nicht gemeldet worden waren. In einigen Fällen identifizierten sie neue genetische Variationen, die Diskrepanzen in der Blutgruppenbestimmung erklären könnten, insbesondere für die Blutgruppen Rh, Duffy, Lewis und MNS.
Ergebnisse zur ABO-Blutgruppe
Die ABO-Blutgruppe wird durch spezifische Gene bestimmt. Durch genetische Tests fanden sie einen hohen Übereinstimmungsgrad mit den serologischen Ergebnissen. Allerdings gab es Fälle, in denen die genetischen Daten einen anderen Bluttyp vorschlugen als der, der durch traditionelle Tests ermittelt wurde. Eine weitere Untersuchung löste einige dieser Fälle.
Ergebnisse zur Rh-Blutgruppe
Die Rh-Blutgruppe wird ebenfalls von spezifischen Genen beeinflusst. Die Forscher fanden einige Diskrepanzen zwischen genetischen und serologischen Testergebnissen für die Rh-Gruppe. Bei einer Person wurde eine genetische Variante gefunden, die die Interpretation des Rh-Bluttyps beeinflusst. Das deutet auf genetische Komplexität in dieser Blutgruppe hin.
Ergebnisse zur Duffy-Blutgruppe
Für die Duffy-Blutgruppe konnten die Forscher den Bluttyp auf Basis bekannter genetischer Varianten ableiten. Sie fanden einige Individuen mit genetischen Ergebnissen, die nahelegten, sie sollten einen positiven Bluttyp haben, während die Serologie ein negatives Ergebnis zeigte. Das war mit bekannten genetischen Varianten verknüpft, die den Ausdruck der Blutgruppe beeinflussten.
Ergebnisse zur Lewis-Blutgruppe
Bei der Lewis-Blutgruppe wurden sowohl Sekretor- als auch Nicht-Sekretor-Phänotypen untersucht. Das Team fand einen hohen Übereinstimmungsgrad zwischen genetischen Tests und Serologie, wobei einige Individuen einzigartige Varianten trugen. Das Vorhandensein einer spezifischen genetischen Variante deutete auf einen anderen Sekretor-Status hin als in der Serologie berichtet.
Ergebnisse zur Lutheran-Blutgruppe
Die Lutheran-Blutgruppe zeigte einen hohen Übereinstimmungsgrad in den Testergebnissen. Allerdings gab es eine Person, deren genetische Ergebnisse ein anderes Ergebnis anzeigen als die serologischen Ergebnisse. Weitere Untersuchungen zeigten keine bekannten Funktionsverlust-Allel, die diese Diskrepanz erklären könnten.
Ergebnisse zur MNS-Blutgruppe
Die MNS-Blutgruppentests zeigten einige Diskrepanzen. Die Forscher fanden heraus, dass einige Individuen genetische Ergebnisse hatten, die anzeigten, dass sie bestimmte Antigene ausdrücken sollten, aber die serologischen Ergebnisse stimmten nicht überein. Das deutet darauf hin, dass der genetische Testprozess in diesem Bereich möglicherweise verbessert werden muss.
Ergebnisse zur P1-Blutgruppe
Die Analyse der P1-Blutgruppe ergab einige Unterschiede zwischen den genetischen und serologischen Daten. Die Forscher identifizierten eine potenzielle neue Variante, die einige dieser Diskrepanzen erklären könnte, was einen weiteren Untersuchungsbedarf zeigt.
Zusammenfassung der Ergebnisse
Insgesamt dokumentierten die Forscher die genetischen Variationen, die den häufigen Blutgruppen in Oman zugrunde liegen. Sie fanden einen hohen Übereinstimmungsgrad zwischen genetischen Tests und serologischen Ergebnissen für die routinemässige Blutgruppenbestimmung. Allerdings hoben sie auch die Einschränkungen von genetischen Tests bei bestimmten Blutgruppen hervor, insbesondere bei den MNS-, ABO- und Rh-Gruppen. Sie empfahlen, populationsspezifische Varianten in den Praktiken der Blutgruppenbestimmung zu berücksichtigen.
Die Analyse deutete auf das Vorhandensein von Varianten hin, die in afrikanischen Populationen häufig sind, was auf einen gemeinsamen genetischen Hintergrund unter Omani-Individuen hindeutet. Das betont die Wichtigkeit, die Bevölkerungsgeschichte in genetischen Studien zu verstehen.
Das Forschungsteam kam zu dem Schluss, dass, obwohl für die meisten Blutgruppen eine hohe Übereinstimmung festgestellt wurde, eine weitere Untersuchung notwendig ist für bestimmte Gruppen, bei denen Diskrepanzen festgestellt wurden. Sie wiesen auf das Potenzial von Kombination aus vollständiger Genomsequenzierung und traditioneller Serologie hin, um unser Verständnis von Blutgruppen zu verbessern und Transfusionspraktiken zu optimieren.
Zusammenfassend beleuchtet diese Studie, wie die Genetik von Blutgruppen regional variieren kann und hebt die Bedeutung präziser Zuordnungen in der Transfusionsmedizin hervor. Durch die Erweiterung des Wissens in diesem Bereich können Gesundheitsdienstleister sicherere Bluttransfusionen gewährleisten.
Titel: Characterization of Blood Group Variants in an Omani Population by Comparison of Whole Genome Sequencing and Serology
Zusammenfassung: Although blood group variation was first described over a century ago, our understanding of the genetic variation affecting antigenic expression on the red blood cell surface in many populations is lacking. This deficit limits the ability to accurately type patients, especially as serological testing is not available for all described blood groups, and targeted genotyping panels may lack rare or population-specific variants. Here, we perform serological assays across 24 antigens and whole genome sequencing on 100 Omanis, a population underrepresented in genomic databases. We inferred blood group phenotypes using the most commonly typed genetic variants. The comparison of serological to inferred phenotypes resulted in an average concordance of 96.9%. Among the 22 discordances, we identify seven known variants in four blood groups that, to our knowledge, have not been previously reported in Omanis. Incorporating these variants for phenotype inference, concordance increases to 98.8%. Additionally, we describe five candidate variants in the Lewis, Lutheran, MNS, and P1 blood groups that may affect antigenic expression, although further functional confirmation is required. Notably, we identify several blood group alleles most common in African populations, likely introduced to Oman by gene flow over the last thousand years. These findings highlight the need to evaluate individual populations and their population history when considering variants to include in genotype panels for blood group typing. This research will inform future work in blood banks and transfusion services. Key PointsO_LIUtilizing whole genome sequencing to infer blood types in Omanis demonstrates high sensitivity for most blood groups C_LIO_LIPopulation history influences blood group variation, necessitating population-specific genotype panels C_LI
Autoren: Ellen M. Leffler, P. E. Haffener, A. Z. Al Riyami, S. Al-Zadjali, M. Al-Rawahi, S. Al Hosni, A. Al Marhoobi, A. Al Sheriyani
Letzte Aktualisierung: 2024-06-18 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599396
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599396.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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