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# Biologie# Evolutionsbiologie

Die Evolution von Auxin-Transportern im Laufe des Lebens

Die spannende Geschichte von Auxin-Transportern in Pflanzen, Bakterien und Algen entdecken.

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Inhaltsverzeichnis

Auxine sind wichtige Pflanzenhormone, die das Wachstum und die Entwicklung steuern. Wissenschaftler haben jedoch herausgefunden, dass die Art und Weise, wie diese Hormone wirken – speziell durch eine Gruppe von Proteinen, die als Auxin-Efflux-Transporter bekannt sind – eine interessante Geschichte hat. Diese Geschichte geht über Pflanzen hinaus und umfasst sogar einige Bakterien und Algen. Zu verstehen, wie sich diese Proteine entwickelt haben und wie sie funktionieren, kann uns Einblicke in die Pflanzenbiologie und das grössere Bild des Lebens auf der Erde geben.

Auxin-Signalisierung und Proteine

Der Auxin-Signalweg ist für Pflanzen entscheidend, um verschiedene Prozesse wie Wachstum und Reaktionen auf Licht und Schwerkraft zu regulieren. In Pflanzen wird Auxin mit speziellen Proteinen produziert und transportiert. Während diese Auxin-Transporter, insbesondere die PIN-Proteinfamilie, bei Landpflanzen gut untersucht wurden, sind ihre Ursprünge und die evolutionäre Geschichte weniger klar.

Interessanterweise finden sich einige der Komponenten, die für den Auxintransport verwendet werden, auch in nicht-pflanzlichen Organismen. Zum Beispiel sind das Hormon IAA (Indol-3-essigsäure) und seine Nebenprodukte in vielen grünen Organismen vorhanden, nicht nur in terrestrischen Pflanzen. Ausserdem teilen sich die Proteine, die Auxin aus Pflanzenzellen transportieren, bekannt als PIN- und PILS-Proteine, Ähnlichkeiten mit Proteinen, die in anderen Lebewesen wie Algen und sogar einigen Bakterien vorkommen.

Evolution der Auxin-Transporter

Die Evolution der Auxin-Transporter ist komplex, wegen der Vielfalt der Organismen und der verschiedenen Rollen, die diese Proteine spielen. Einige auxinbezogene Proteine haben über verschiedene Arten hinweg bewährte Funktionen, während andere sich erheblich verändert haben. Dieses gemischte Muster kann als Ergebnis sowohl des horizontalen Gentransfers (wo Gene zwischen verschiedenen Organismen übertragen werden) als auch des Verlusts von Genen im Laufe der Zeit betrachtet werden.

Im Fall der PIN-Proteinfamilie wird die evolutionäre Geschichte zusätzlich durch die Existenz kürzerer Versionen dieser Proteine in einigen Organismen kompliziert. Diese kürzeren Versionen haben nicht alle regulatorischen Merkmale ihrer längeren Pendants. Erste Studien deuteten darauf hin, dass diese kürzeren Proteine ähnliche Rollen beim Transport von Auxinen spielen könnten, aber neuere Erkenntnisse zeigen, dass ihre Funktionen unterschiedlich sein könnten.

PIN- und PILS-Proteine

Die Hauptfamilie von Proteinen, die für den Auxintransport in Pflanzen verantwortlich ist, nennt sich PIN. Diese Proteine wurden jahrzehntelang untersucht, weil sie eine essentielle Rolle im Pflanzenwachstum spielen. Kürzlich wurde eine weitere Gruppe von Proteinen, die PILS heissen, entdeckt. Während beide Familien am Auxintransport beteiligt sind, haben sie unterschiedliche Funktionen. PIN-Proteine transportieren hauptsächlich Auxin aus den Zellen, während PILS-Proteine sich darauf konzentrieren, die inneren Auxinspiegel zu halten, ohne es auszusondern.

Forschungen legen nahe, dass die PIN-Familie ziemlich alt ist und lange bevor sich moderne Pflanzen entwickelten existierte. Es gibt Hinweise darauf, dass einige Algenarten auch Formen dieser Proteine besitzen, was darauf hindeutet, dass der Auxintransport möglicherweise eine Funktion ihrer Vorfahren war.

Die Rolle anderer Organismen

Bakterien und bestimmte Algen besitzen ebenfalls Proteine, die den Auxin-Efflux-Transportern ähnlich sind, was darauf hindeutet, dass diese Proteine von einer gemeinsamen Abstammungslinie stammen. Diese Proteine spielen verschiedene Rollen, einschliesslich des Transports verschiedener organischer Moleküle über Zellmembranen. Einige Funktionen scheinen mit dem Transport von Auxinen in Verbindung zu stehen und erweitern unser Verständnis dafür, wie weit verbreitet diese Arten von Proteinen im Lebensbaum genutzt werden.

Unter diesen Proteinen wurden Sequenzen gefunden, die PIN- und PILS-ähnlich sind, sowohl in Bakterien als auch in einfachen mehrzelligen Organismen wie Pilzen. Diese Homologe funktionieren jedoch nicht immer auf die gleiche Weise wie ihre Pendants in höheren Pflanzen.

Strukturelle Einblicke

Neueste technologische Fortschritte haben es Wissenschaftlern ermöglicht, die Strukturen dieser Proteine besser zu verstehen. Mit Techniken wie AlphaFold haben Forscher Modelle dieser Proteine erstellt, die grundlegende Merkmale darüber enthüllen, wie sie auf molekularer Ebene funktionieren. Das Verständnis der Struktur ist entscheidend, um zu begreifen, wie diese Proteine mit Auxin interagieren und es durch Membranen bewegen.

Interessanterweise zeigen PIN- und PILS-Proteine strukturelle Ähnlichkeiten, aber auch signifikante Unterschiede. Zum Beispiel helfen die zytoplasmatischen Schleifen in PIN-Proteinen, mit anderen Zellkomponenten zu interagieren, was entscheidend für ihre Funktion im Auxintransport ist. PILS hingegen fehlt diese Flexibilität, ist aber dennoch wichtig, um die Auxinspiegel in den Zellen aufrechtzuerhalten.

Phylogenetische Analyse

Um die evolutionären Beziehungen dieser Proteine nachzuvollziehen, haben Forscher phylogenetische Analysen durchgeführt. Durch die Untersuchung der Ähnlichkeiten und Unterschiede in den Sequenzen dieser Proteine über verschiedene Arten hinweg können Wissenschaftler beginnen, die Geschichte zu rekonstruieren, wie sich diese Proteine entwickelt haben.

Diese Analysen haben gezeigt, dass, obwohl die PILS- und PIN-Proteine funktional ähnlich erscheinen mögen, sie durch eine signifikante evolutionäre Distanz getrennt sind, was bedeutet, dass sie wahrscheinlich aus unterschiedlichen evolutionären Drücken und Kontexten entstanden sind.

Verbreitung in verschiedenen Organismen

Die Verbreitung von PIN- und PILS-Proteinen ist nicht gleichmässig über alle Lebensformen. In Landpflanzen sind PIN-Proteine weit verbreitet, während PILS-Proteine auch vorhanden sind, aber konsistenter in verschiedenen Algen und Pilzen vorkommen. Ausserhalb des Pflanzenreichs zeigen diese Proteine eine unregelmässige Verteilung, was darauf hindeutet, dass sie zu unterschiedlichen Zeitpunkten in der evolutionären Geschichte verloren oder erworben wurden.

Interessanterweise zeigt die Forschung, dass, während PIN-Proteine in vielen Tiergruppen fehlen, sie einen nahen Verwandten in einem Rezeptor namens GPR155 haben. Dieses Tierprotein spielt ebenfalls eine Rolle bei der Cholesterinsensorik innerhalb der Zellen und weist einige strukturelle Merkmale mit PIN-Proteinen auf, was darauf hindeutet, dass sie einen gemeinsamen Vorfahren haben könnten.

GPR155 und seine Rolle

GPR155, ein in Tieren vorkommendes Protein, wurde kürzlich als Cholesterinrezeptor identifiziert, was es mit Stoffwechselprozessen verbindet. Die evolutionäre Beziehung zu der PIN-Proteinfamilie eröffnet neue Diskussionen darüber, wie sich diese Proteine im Laufe der Zeit in ihren Funktionen verändert haben könnten.

Die Idee, dass PIN-Proteine ursprünglich beim Transport von organischen Säuren oder beim Aufrechterhalten des zellulären Gleichgewichts geholfen haben könnten, vertieft unser Verständnis ihrer Evolution. Wenn das stimmt, deutet es darauf hin, dass Proteine wie GPR155 einen evolutionären Schritt darstellen könnten, bei dem eine Transportfunktion zu einer Rezeptorfunktion übergegangen ist.

Zukünftige Richtungen

Trotz der Fortschritte beim Verständnis von Auxin-Transportern und ihrer evolutionären Geschichte bleiben viele Fragen offen. Die Rolle von IAA ausserhalb von Landpflanzen muss weiter untersucht werden. Ist es nur ein Abfallprodukt oder hat es in anderen Organismen eine signalisierende Bedeutung? Ausserdem bleibt die Substratvielfalt unter prokaryotischen Auxinträgern zu erforschen, insbesondere inwieweit sie IAA transportieren.

In Zukunft wird das Feld von mehr Forschung zur Physiologie verschiedener Nicht-Modellorganismen profitieren. Zu verstehen, wie diese Proteine in unterschiedlichen Kontexten funktionieren, wird helfen, ein umfassenderes Bild der Rolle von Auxin im Lebensbaum zu erstellen.

Fazit

Zusammengefasst zeigen die Auxin-Signalisierung und ihre zugehörigen Proteine einen faszinierenden Aspekt der Pflanzenbiologie, der über das Pflanzenreich hinausgeht. Die evolutionären Beziehungen zwischen Auxin-Transportern in Bakterien, Algen und Pflanzen vermitteln Einblicke in die gemeinsame Geschichte des Lebens. Während die Forschung fortschreitet, wird das Verständnis dieser Proteine und ihrer Funktionen sowohl in Pflanzen als auch in anderen Organismen weiterentwickelt, was tiefere Einblicke in die Komplexität des Lebens auf der Erde bietet.

Originalquelle

Titel: Origin and evolution of Auxin Efflux Carrier family: PIN, PILS, GPR155 and the others

Zusammenfassung: The resolution of the 3D structure of PIN proteins and the ability to universally predict protein structures using AlphaFold allowed us to reconsider the classification of Auxin efflux carriers within the BART superfamily, and we propose to merge members of this superfamily, possessing a characteristic fold with a helical crossover, with other families carrying this fold (BASS, NhaA, CPA and others) into a newly proposed superfamily named X-Helices Carriers (XHC). We further demonstrate a profound divergence between PIN and PILS proteins and monophyly of eukaryotic PINs with the animal cholesterol receptor GPR155/LYCHOS. We hypothesise that its signalling capacity is derived from a general feature of PIN proteins to interact with membrane lipids within the core membrane fold. Finally, we discuss the auxin-transport ability of PIN and PILS proteins in the context of the described properties of bacterial homologs that act as organic acid permeases. DisclaimerThis version is a draft and it will be updated during the next few weeks. HighlightsO_LIPINs are in plants and fragmentary in many algae and protists, but never in fungi C_LIO_LIEukaryotic PINs are monophyletic together with animal cholesterol receptor GPR155 C_LIO_LIPILS are frequently present in protists and in all fungi, but not in animals C_LIO_LIPINs/PILS split is occurred very early in Prokaryota C_LIO_LIAECs belongs to proposed superfamily of transporter with helical crossover C_LI

Autoren: Stanislav Vosolsobě, S. Vosolsobe, K. Kurtovic, V. Schmidt, R. Skokan, J. Petrasek

Letzte Aktualisierung: 2024-06-29 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.26.600818

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.26.600818.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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