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# Biologie # Mikrobiologie

Das Verständnis des Spike-Proteins von SARS-CoV-2

Ein genauerer Blick auf die Rolle des Spike-Proteins bei der COVID-19-Infektion.

Sabrina Lusvarghi, Russell Vassell, Brittany Williams, Haseebullah Baha, Sabari Nath Neerukonda, Carol D. Weiss

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Einblicke in das Einblicke in das Spike-Protein von SARS-CoV-2 Spike-Protein und COVID-19-Infektionen. Wichtige Erkenntnisse über das
Inhaltsverzeichnis

SARS-CoV-2 ist das Virus, das für COVID-19 verantwortlich ist. Dieses Virus hat eine spezielle Struktur, die Spike-Protein genannt wird und hilft ihm, in menschliche Zellen einzudringen. Man kann sich das Spike-Protein wie einen Schlüssel vorstellen, der die Tür zu unseren Zellen öffnet, sodass das Virus eindringen und eine Infektion auslösen kann. Um zu verstehen, wie das passiert, müssen wir uns die Teile des Spike-Proteins ansehen und wie sie zusammenarbeiten.

Die Struktur des Spike-Proteins

Das Spike-Protein besteht aus drei identischen Einheiten, die Monomere heissen. Jedes Monomer hat zwei Hauptteile: S1 und S2. Der S1-Teil hilft dem Virus, an unseren Zellen zu haften, während der S2-Teil entscheidend für den eigentlichen Eintrittsprozess ist. Wenn das Virus sich einer Zelle nähert, verändert sich die Form des Spike-Proteins. Diese Formveränderung ermöglicht es dem Protein, an einen Rezeptor auf der Zelloberfläche zu binden, der ACE2 genannt wird. Man kann sich ACE2 wie den Türgriff vorstellen, den der Spike-Schlüssel dreht, um die Tür zu öffnen.

Wie das Spike-Protein funktioniert

Sobald das Spike-Protein an ACE2 bindet, geschehen eine Reihe von Veränderungen. Zuerst wird das Spike-Protein für andere Proteine in unseren Zellen zugänglicher. Eines dieser wichtigen Proteine heisst TMPRSS2, das das Spike-Protein an bestimmten Punkten schneidet. Dieser Schneideprozess ist wichtig, damit das Virus in die Zelle eindringen kann.

Nachdem das Spike-Protein geschnitten wurde, unterliegt es weiteren Veränderungen. Der S2-Teil des Spikes wird verlängert und faltet sich in eine Form, die es ihm ermöglicht, mit der Zellmembran zu verschmelzen. Diese Verschmelzung ist entscheidend, da sie ein Loch schafft, durch das das Virus hindurch kann und sein genetisches Material in die Wirtszelle abgeben kann.

Die Rolle von Peptiden beim Studium des Spike-Proteins

Forscher haben kleine Proteinstücke entwickelt, die Peptide genannt werden und die Fähigkeit des Spike-Proteins, mit Zellmembranen zu fusionieren, stören können. Ein solches Peptid heisst HR2. Mit diesem Peptid können Wissenschaftler das Spike-Protein in verschiedenen Formen einfangen, insbesondere in den Zwischenformen, die während des Fusionsprozesses auftreten.

Peptide wie HR2 wirken wie eine Art „Bremse“ während der Transformation des Spike-Proteins. Sie binden an spezifische Teile des Spike-Proteins und verhindern so, dass der Eintrittsprozess abgeschlossen wird. Das ist nützlich, um zu studieren, wie das Spike-Protein funktioniert und wie wir es blockieren könnten, um Infektionen zu verhindern.

Verschiedene Arten von Spikes und deren Varianten

SARS-CoV-2 ist nicht nur ein einzelnes Virus; es hat viele Varianten, die sich unterschiedlich verhalten können. Einige Varianten haben leicht unterschiedliche Spike-Proteine, die beeinflussen können, wie gut sie an Zellen haften oder wie effektiv sie in Zellen eindringen können. Zum Beispiel hat die D614G-Variante eine kleine Veränderung, die sie besser darin macht, Zellen zu infizieren.

Forscher haben verschiedene Varianten untersucht, einschliesslich Delta und Omicron, und verglichen, wie deren Spike-Proteine mit unseren Zellen interagieren und wie effektiv sie durch Peptide blockiert werden können. Diese Studien sind wichtig für die Entwicklung von Impfstoffen und das Verständnis, welche Varianten dominanter werden könnten.

Peptid-Potenz und Infektionswege

Nicht alle Peptide sind gleich. Einige sind besser darin, das Spike-Protein zu blockieren als andere, abhängig von den Bedingungen. Wie das Virus in die Zelle gelangt, kann ebenfalls beeinflussen, wie gut ein Peptid wirkt. Es gibt zwei Hauptwege für den viralen Eintritt: direkte Fusion mit der Zellmembran oder Nutzung endosomaler Wege (wie das Eindringen durch eine geheime Tür).

Studien zeigen, dass bestimmte Peptide besser funktionieren, wenn das Virus den direkten Eintrittsweg nutzt, verglichen mit dem endosomalen Weg. Das ist etwas, was Wissenschaftler im Labor mit Zellen testen können, die ACE2 oder ACE2/TMPRSS2-Rezeptoren exprimieren.

Einfangen von Spike-Intermediaten mit Peptiden

Durch die Verwendung speziell gestalteter HR2-Peptide können Forscher das Spike-Protein in Zwischenformen einfangen, die kurz vor der Fusion auftreten. Dieses Einfangen ist wichtig, da es den Wissenschaftlern hilft, diese Formen zu beobachten und besser zu verstehen, wie das Spike-Protein von seinen Vorfusions- zu seinen Nachfusionsformen übergeht.

Als Forscher HR2-Peptide zu Zellen hinzufügten, konnten sie sehen, dass die Spike-Proteine daran gehindert wurden, ihren Job zu beenden und sich mit der Zelle zu verschmelzen. Interessanterweise kann das Einfangen dieser Intermediaten je nach Variante des Spike-Proteins unterschiedlich sein.

Einfluss von Antikörpern auf konformationale Veränderungen des Spike-Proteins

Antikörper sind wichtige Akteure in unserer Immunabwehr. Einige Antikörper können an das Spike-Protein binden und seine Form beeinflussen. Die Forscher untersuchten zwei spezifische Antikörper: CB6 und Bebtelovimab. Sie fanden heraus, dass CB6 Veränderungen auslösen kann, die das Spike-Protein in seiner Zwischenform leichter fassbar machen. Währenddessen scheint Bebtelovimab solche Formveränderungen zu verhindern und hält das Spike-Protein davon ab, in den Fusionszustand überzugehen.

Diese Entdeckung ist wichtig, da sie zeigt, wie Antikörper den Verlauf einer viralen Infektion beeinflussen können. Das Verständnis dieser Interaktion kann bei der Entwicklung effektiverer Impfstoffe und Behandlungen helfen.

Die Komplexität der von Spike vermittelten Membranfusion

Membranfusion ist ein komplizierter Prozess. Es geht nicht nur um ein Spike-Protein; es erfordert die Koordination zwischen mehreren Spike-Proteinen, um einen Kanal für das Virus zu schaffen, um einzutreten. Das bedeutet, dass die Anzahl der an der Fusion beteiligten Spikes je nach Virusvariante und Zelltyp variieren kann.

Forscher fanden heraus, dass der Fusionsprozess effizienter sein kann, wenn die Anzahl der Spikes genau richtig ist. Das ist ein interessantes Thema, denn wenn wir verstehen können, wie verschiedene Faktoren den Fusionsprozess beeinflussen, können wir diese Mechanismen gezielt anvisieren, um bessere antivirale Strategien zu entwickeln.

Zukunft von Behandlungen und Impfstoffen erkunden

Die wichtigste Frage heute ist: Wie stoppen wir SARS-CoV-2? Indem wir das Spike-Protein, wie es funktioniert und wie es mit anderen Molekülen interagiert, verstehen, können Wissenschaftler effektivere Impfstoffe entwickeln. Aktuelle Impfstoffe könnten spezifische Varianten besser ansprechen als andere, was entscheidend ist, während wir weiterhin mit neu auftretenden Stämmen konfrontiert sind.

Darüber hinaus, wenn wir Peptide entwerfen können, die die Aktivität des Spike-Proteins effektiv blockieren, könnten wir neue antivirale Behandlungen schaffen. Wenn wir diese Ansätze kombinieren, könnten wir einen Vorteil im Umgang mit und der Prävention von COVID-19 erhalten.

Fazit

Das Spike-Protein von SARS-CoV-2 ist ein komplexes und faszinierendes Ziel für die Forschung. Durch die Untersuchung seiner Struktur, Funktion und der Auswirkungen verschiedener Peptide und Antikörper versuchen Forscher zu verstehen, wie man Infektionen verhindern und behandeln kann. Mit ein wenig Humor könnte man sagen, dass das Spike-Protein wie der unerwünschte Partygast ist, der einen soliden Türsteher (Peptide und Antikörper) braucht, um ihn daran zu hindern, ungebeten einzutreten.

Während die Forschung fortschreitet, kommen wir dem Ziel näher, effektive Strategien zu entwickeln, die die Auswirkungen von COVID-19 auf die globale Gesundheit minimieren könnten. Mit den richtigen Werkzeugen und dem Wissen könnten wir es tatsächlich schaffen, diese Partygäste für immer fernzuhalten!

Originalquelle

Titel: Capture of fusion-intermediate conformations of SARS-CoV-2 spike requires receptor binding and cleavage at either the S1/S2 or S2' site

Zusammenfassung: Although the structures of pre- and post-fusion conformations of SARS-CoV-2 spikes have been solved by cryo-electron microscopy, the transient spike conformations that mediate virus fusion with host cell membranes remain poorly understood. In this study, we used a peptide fusion inhibitor corresponding to the heptad repeat 2 (HR2) in the S2 transmembrane subunit of the spike to investigate fusion-intermediate conformations that involve exposure of the highly conserved heptad repeat 1 (HR1). The HR2 peptide disrupts the assembly of the HR1 and HR2 regions of the spike, which form six-helix bundle during the transition to the post-fusion conformation. We show that binding of the spike S1 subunit to ACE2 is sufficient to trigger conformational changes that allow the peptide to capture a fusion-intermediate conformation of S2 and inhibit membrane fusion. When TMPRSS2 is also present, an S2 fusion intermediate is captured though the proportion of the S2 intermediate relative to the S2 intermediate is lower in Omicron variants than pre-Omicron variants. In spikes lacking the natural S1/S2 furin cleavage site, ACE2 binding alone is not sufficient for trapping fusion intermediates; however, co-expression of ACE2 and TMPRSS2 allows trapping of an S2 intermediate. These results indicate that, in addition to ACE2 engagement, at least one spike cleavage is needed for unwinding S2 into an HR2-sensitive fusion-intermediate conformation. Our findings elucidate fusion-intermediate conformations of SARS-CoV-2 spike variants that expose conserved sites on spike that could be targeted by inhibitors or antibodies. Author summaryThe SARS-CoV-2 spike protein undergoes two proteolytic cleavages and major conformational changes that facilitate fusion between viral and host membranes during virus infection. Spike is cleaved to S1 and S2 subunits during biogenesis, and S2 is subsequently cleaved to S2 as the virus enters host cells. While structures of pre-fusion and post-fusion spike conformations have been extensively studied, transient fusion-intermediate conformations during the fusion process are less well understood. Here, we use a peptide fusion inhibitor corresponding to a heptad repeat domain in the S2 subunit to investigate fusion-inducing conformational changes. During spike-mediated cell-cell fusion, we show that the peptide binds to spike only after spike engages ACE2 and is cleaved at the S1/S2, S2, or both sites. Thus, S2 needs at least one cleavage to refold to a peptide-sensitive fusion intermediate. SARS-CoV-2 variants differed in the proportion of S2 and S2 fusion intermediates captured after receptor binding, indicating that the virus has evolved not only to alter its entry pathway but also to modulate S2 unfolding. This work informs the development of antiviral strategies targeting conserved sites in fusion-intermediate conformations of spike and contributes more broadly to the understanding of the entry mechanisms of viral fusion proteins.

Autoren: Sabrina Lusvarghi, Russell Vassell, Brittany Williams, Haseebullah Baha, Sabari Nath Neerukonda, Carol D. Weiss

Letzte Aktualisierung: 2024-12-06 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.05.627124

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.05.627124.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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