Der verborgene Einfluss von Retroviren in unserer DNA
Retroviren schleichen sich in unsere DNA und beeinflussen Evolution und Immunität.
― 7 min Lesedauer
Inhaltsverzeichnis
- Ein verstecktes Erbe in unseren Genen
- Die Struktur eines Retrovirus
- Defekte Viren und ihre Freunde
- Der Stammbaum der Retroviren
- Die Herausforderung der Benennung von ERVs
- Auf der Suche nach neuen Typen von ERVs
- Erkenntnisse aus der Genom-Ausrichtung
- Die Entdeckung von ERV-Hako
- Verwandte ERVs bei verschiedenen Arten
- Der faszinierende Fall von ERV-V
- Wie ERVs bei der Immunität helfen
- MER41 und seine Rolle in der Evolution
- Die Suche geht weiter
- Fazit
- Originalquelle
- Referenz Links
Retroviren sind eine spezielle Art von Viren, die ihre RNA nach dem Eindringen in eine Zelle in DNA umwandeln können. Dieser Prozess wird Rücktranskription genannt. Sobald die RNA umgewandelt ist, wird die neue DNA in das genetische Material der Zelle eingefügt und wird zu dem, was wir Provirus nennen. Wenn diese Einfügung in den Keimzellen passiert, kann das Provirus an zukünftige Generationen weitergegeben werden. Wenn das passiert, nennt man das Provirus endogenes Retrovirus (ERV).
Was bedeutet das alles? Es bedeutet, dass manche Viren so hinterhältig sind, dass sie Teil unserer DNA werden und von Eltern an Kinder weitergegeben werden können, wie dieser peinliche Tanzmove, der in der Familie weitergegeben wird.
Ein verstecktes Erbe in unseren Genen
Tatsächlich tragen viele Lebewesen, einschliesslich Menschen, Überreste alter ERVs in ihrer DNA. Bei Menschen machen diese Teile etwa 8% unseres Genoms aus. Denk an diese Überreste wie an Fossilien, die die Geschichte von Virusgeschichte und Evolution erzählen. Einige dieser alten viralen Teile haben sich sogar in wichtige Gene verwandelt, die uns helfen, zu funktionieren.
Stell dir vor, du findest eine alte, verstaubte Kiste auf deinem Dachboden mit dem Etikett "Antike Dinge" — manche Sachen sind jetzt vielleicht nutzlos, aber andere könnten sich als wertvolle Schätze herausstellen!
Die Struktur eines Retrovirus
Ein retrovirales Provirus hat an beiden Enden einzigartige Strukturen, die lange terminale Wiederholungen (LTRs) genannt werden. Zwischen diesen LTRs liegt der Innenbereich, der essentielle Proteine kodiert, die für den Lebenszyklus des Virus notwendig sind. Meistens findet man jedoch nur einzelne LTRs als Überreste in unserer DNA. Diese einzelnen LTRs stammen wahrscheinlich von einem Prozess namens homologe Rekombination, der den Innenbereich entfernt und nur ein LTR übrig lässt.
Defekte Viren und ihre Freunde
Manchmal kann ein Virus mutieren und seine Fähigkeit verlieren, sich selbst zu replizieren, und wird zu dem, was wir ein „defektes“ Virus nennen. Überraschenderweise können selbst defekte Viren überleben, indem sie Elemente von einem „Helfer“-Virus ausleihen, um weiterhin zu verbreiten. Dieses Ausleihen kann zu neuen Virusformen führen, die Teile des genetischen Materials des Wirts integrieren.
Zum Beispiel wurde bei Koalas eine defekte Form eines Retrovirus namens RecKoRV gefunden. Einige Koalafamilien scheinen nur RecKoRV zu haben, was darauf hindeutet, dass diese Koalas in der Vergangenheit Helfer hatten, die die vollständige Version des Retrovirus trugen. Es ist ein bisschen so, als bräuchte man einen Freund, um das Gruppenprojekt zu beenden!
Der Stammbaum der Retroviren
Retroviren gehören zu einer Familie namens Retroviridae, die verschiedene Gruppen wie Alpharetrovirus, Betaretrovirus und andere umfasst. Wissenschaftler klassifizieren oft ERVs, die mit diesen Retroviren verwandt sind, in verschiedene Gruppen. Zum Beispiel stehen Gruppe I ERVs in Beziehung zu Gamma- und Epsilonretroviren, während Gruppe II mit Alpha- und Betaretroviren assoziiert ist.
Die Klassifizierung von ERVs kann komplex sein, fast so, als würde man ein grosses Familientreffen organisieren, ohne ein Stammbaumdiagramm!
Die Herausforderung der Benennung von ERVs
Die Benennung dieser ERVs kann verwirrend sein. Viele Typen haben kryptische Namen, die Nicht-Experten nicht helfen, zu verstehen, was sie sind. Zum Beispiel könnten Namen wie MER41E wie der Name eines Roboters klingen, anstatt wie ein biologisches Element. Diese Verwirrung kann das Lernen über diese Elemente schwieriger machen, besonders für Leute in Bereichen wie der Genetik. Wissenschaftler haben ein einfacheres Benennungssystem vorgeschlagen, um die Sache zu klären.
Auf der Suche nach neuen Typen von ERVs
Forscher haben Studien durchgeführt, um unbekannte Typen von mobilen Elementen im menschlichen Genom zu finden. Sie konzentrierten sich auf Bereiche, die keine klare Klassifizierung hatten, was auf die Präsenz neuer ERVs hindeutet. Diese Bemühungen zeigten, dass noch nicht alle Typen von mobilen Elementen identifiziert wurden, was überraschend ist, da das menschliche Genom über die Jahre viel untersucht wurde.
Es ist ein bisschen so, als würde man sein ganzes Haus nach verlorenen Socken durchsuchen und immer noch ein paar versteckt hinter dem Sofa finden!
Erkenntnisse aus der Genom-Ausrichtung
Durch die Untersuchung von Lücken in genetischen Sequenzen und wie verschiedene Elemente miteinander ausgerichtet sind, schlossen Wissenschaftler auf die Präsenz neuer ERVs. Wenn eine DNA-Sequenz in einigen Arten vorhanden ist, in anderen jedoch nicht, kann das darauf hindeuten, dass eine Einfügung bei ihrem gemeinsamen Vorfahren passiert ist. Dieser Ansatz hilft zu veranschaulichen, wie die genetische Geschichte von verschiedenen Arten geteilt wird.
Die Entdeckung von ERV-Hako
Eine bemerkenswerte Entdeckung ist ein ERV namens Hako. Dieses ERV scheint in das Genom unserer Vorfahren eingefügt worden zu sein, nachdem sie sich von anderen Primatenlinien getrennt haben. Was Hako besonders interessant macht, ist, dass Teile seiner Struktur einem Gen in Menschen ähnlich sind, was darauf hindeutet, dass es im Laufe der Zeit eine Rolle in unserem genetischen Profil gespielt hat.
Wenn Gene Superhelden wären, könnte Hako der heimliche Sidekick sein, der im Schatten geholfen hat!
Verwandte ERVs bei verschiedenen Arten
Interessanterweise fanden Forscher auch verwandte ERVs bei verschiedenen Primaten, einschliesslich Affen und Lemuren. Diese gemeinsamen Elemente können uns sagen, dass bestimmte Retroviren zu ähnlichen Zeiten in ihre Genome eingedrungen sind, was auf eine gemeinsame virale Geschichte hindeutet.
Stell dir einen Stammbaum vor, der sich nicht nur mit Verwandten, sondern auch mit unerwünschten Gästen verzweigt — die Viren, die die genetische Party gestürmt haben!
Der faszinierende Fall von ERV-V
Ein weiteres ERV, genannt ERV-V, hat zwei Kopien im menschlichen Genom und scheint Funktionen zu haben, die mit der Plazenta verbunden sind. Einige Forscher haben beobachtet, dass diese viralen Elemente evolutionäre Veränderungen aufweisen, die zur Fitness der Tiere beitragen können. Diese Entdeckung wirft faszinierende Fragen auf, wie virale Überreste Gesundheit und Entwicklung beeinflussen können.
Es ist wie herauszufinden, dass ein altes Familienrezept von einem geheimnisvollen Vorfahren stammt, der bis jetzt nicht einmal Teil der Familie war!
Wie ERVs bei der Immunität helfen
Bestimmte ERV-Sequenzen, wie die aus der MER41-Familie, wurden mit wichtigen Immunprozessen in Verbindung gebracht, die helfen, die Reaktionen auf Infektionen zu regulieren. Andere Sequenzen könnten sogar als Verstärker für Gene dienen, die an der Immunität beteiligt sind.
Denk daran, wie ein Familienmitglied, das immer die besten Snacks mitbringt, um bei Familienfeiern jede Krankheit abzuwehren!
MER41 und seine Rolle in der Evolution
Die MER41-Sequenzen wurden auch bei anderen Arten als wichtig angesehen. Sie sind zur gleichen Zeit in die Genome verschiedener Tiere eingedrungen und können Einblicke geben, wie unterschiedliche Kreaturen auf Infektionen reagieren und sich im Laufe der Zeit anpassen.
Viele dieser Erkenntnisse zeigen, dass, während einige ERVs wie nutzlose Reste erscheinen mögen, sie tatsächlich Einflüsse auf unsere Biologie und Evolution haben können.
Die Suche geht weiter
Trotz zahlreicher Studien suchen Wissenschaftler weiterhin nach mehr Typen von ERVs. Die Erkenntnisse in neueren Genomversionen deuten darauf hin, dass es noch viel zu lernen gibt.
Alle verschiedenen ERV-Typen im Blick zu behalten, ist ein bisschen so, als würde man versuchen, sich an jede Figur in einer lang laufenden Seifenoper zu erinnern — immer wenn man denkt, man kennt sie alle, taucht eine neue auf!
Fazit
Endogene Retroviren sind ein spannendes Forschungsfeld, das uns hilft, unsere genetische Geschichte zu verstehen. Sie zeigen uns, wie Viren in unsere DNA eindringen und verschiedene Aspekte unserer Biologie beeinflussen können. Auch wenn sie Überreste alter Infektionen sein mögen, spielen sie oft bedeutende Rollen in unserem Leben heute. Die fortlaufende Suche nach neuen Typen von ERVs verspricht, mehr Geheimnisse über die Vergangenheit und deren Einfluss auf unsere Gegenwart zu enthüllen.
Während die Forscher weiterarbeiten, könnten wir entdecken, dass unsere Gene mehr Geschichten tragen, als wir jemals erwartet hätten — fast wie ein mysteriöses Familienalbum, das wir dachten zu kennen!
Originalquelle
Titel: Further varieties of ancient endogenous retrovirus in human DNA
Zusammenfassung: A retrovirus inserts its genome into the DNA of a cell, occasionally a germ-line cell that gives rise to descendants of the host organism: it is then called an endogenous retrovirus (ERV). The human genome contains relics from many kinds of ancient ERV. Some relics contributed new genes and regulatory elements. This study finds further kinds of ancient ERV, in the thoroughly-studied human genome version hg38: ERV-Hako, ERV-Saru, ERV-Hou, ERV-Han, and ERV-Goku. It also finds many relics of ERV-V, previously known from just two copies on chromosome 19 with placental genes. It finds a type of ERV flanked by MER41E long terminal repeats (LTRs), with surprisingly little similarity to the known MER41 ERV. ERV-Hako has subtypes that contain sequence from host genes SUSD6 and SPHKAP : the SUSD6 variant was transferred between catarrhine and platyrrhine primates. A retrovirus uses tRNA to prime reverse transcription: Hako is the only human ERV relic that used tRNA-Trp (tryptophan, symbol W), and HERV-W is misnamed because it used tRNA-Arg, based on the Genomic tRNA Database. One ERV-Saru LTR is the previously-described enhancer of AIM2 in innate immunity. This study contributes to understanding primate ERV history, but also shows that related ERVs can have drastic differences, challenging the goal of clearly annotating all ERV relics in genomes.
Autoren: Martin C. Frith
Letzte Aktualisierung: 2024-12-13 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.11.627920
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.11.627920.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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