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Entendendo a Resistência na Queima da Espiga por Fusarium

Pesquisas mostram como o F. asiaticum se adapta a fungicidas.

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Estudo sobre ResistênciaEstudo sobre Resistênciaao Fusarium Reveladofúngica ao fenamacril.Novas informações sobre a resistência
Índice

A podridão da espiga por Fusarium, geralmente chamada de escabiose, é uma doença séria que atinge cereais como trigo, milho e cevada pelo mundo todo. Essa doença não só reduz a quantidade de grãos produzidos, mas também os torna inseguros para consumo, já que contamina os grãos com toxinas perigosas conhecidas como tricotecenos, incluindo deoxinivalenol e zearalenona.

A principal causa da FHB é um grupo de fungos chamado complexo de espécies Fusarium graminearum. Esse grupo tem mais de 15 espécies, com F. asiaticum e F. graminearum sendo as mais comuns na China. F. asiaticum é especialmente prevalente em certas regiões, como as áreas do meio e inferior do rio Yangtze.

Desafios de Resistência no Trigo

Os agricultores enfrentam desafios significativos porque existem apenas algumas variedades de trigo que resistem naturalmente aos fungos Fusarium. Além disso, a resistência genética completa ao F. asiaticum ainda não é totalmente entendida ou integrada nas variedades de trigo disponíveis comercialmente. Como resultado, os agricultores continuam a depender fortemente de fungicidas durante o período de floração do trigo para controlar a FHB.

Um fungicida específico, o fenamacril, mostrou ser eficaz contra a FHB e outras doenças causadas por espécies de Fusarium. No entanto, o problema surge quando cepas resistentes desses fungos se desenvolvem. Essas cepas resistentes podem ser criadas através de processos laboratoriais, como expor os fungos a fungicidas e luz UV. O Comitê de Ação de Resistência a Fungicidas classificou o fenamacril como tendo um risco médio a alto para o desenvolvimento de resistência.

Mecanismo de Resistência em Espécies de Fusarium

Estudos indicaram que a resistência ao fenamacril em espécies de Fusarium está ligada a mudanças em uma proteína específica conhecida como Miosina5. Várias mutações no gene da Miosina5 levam a níveis variados de resistência a esse fungicida. Por exemplo, algumas mutações resultam em baixa resistência, enquanto outras podem conferir altos níveis de resistência.

O fenamacril atua se ligando à proteína Miosina5, o que interrompe sua função e impede o crescimento dos fungos. No entanto, cepas resistentes possuem mutações que alteram o local de ligação, permitindo que os fungos sobrevivam mesmo na presença do fungicida.

O Papel da Análise do Transcritoma

Recentemente, os pesquisadores têm usado a análise do transcritoma como uma ferramenta para estudar como os fungos se desenvolvem e reagem ao estresse causado pelo fungicida. Essa abordagem envolve examinar todo o RNA mensageiro (mRNA) produzido por um organismo em condições específicas. Essa técnica é conhecida pela sua sensibilidade e tem sido usada para entender como vários fungos reagem a diferentes fungicidas.

A análise do transcritoma já foi aplicada em estudos de espécies de Fusarium, examinando suas respostas a diferentes tratamentos. O objetivo é descobrir as mudanças genéticas que ocorrem quando esses fungos são expostos a fungicidas.

Objetivos do Estudo

O objetivo da pesquisa é esclarecer como o fenamacril funciona no F. asiaticum e identificar os genes ou caminhos-chave que são afetados por esse fungicida. Para alcançar isso, os pesquisadores criaram cepas sensíveis e resistentes de F. asiaticum com mutações conhecidas no gene da Miosina5.

Ao comparar a expressão gênica nessas cepas após tratamento com fenamacril, os pesquisadores esperam obter insights sobre os mecanismos de resistência e como o fenamacril inibe o crescimento do F. asiaticum.

Criação de Cepas com Mutações Pontuais

Para estudar os efeitos do fenamacril, os pesquisadores começaram com uma cepa sensível de F. asiaticum e introduziram mutações pontuais específicas no gene da Miosina5 para criar cepas resistentes. O processo de triagem envolveu o uso de marcadores específicos para diferenciar entre as cepas sensíveis e resistentes.

Depois de confirmar as mutações bem-sucedidas, os pesquisadores isolaram as cepas puras para mais análises.

Entendendo o Crescimento Micelial e a Sensibilidade a Fungicidas

Os pesquisadores compararam o crescimento de diferentes cepas de F. asiaticum. Todas as cepas pareciam semelhantes visualmente, mas suas taxas de crescimento variavam, especialmente quando expostas ao fenamacril. As cepas sensíveis mostraram fortes respostas a concentrações mais baixas do fungicida, enquanto as cepas resistentes foram muito menos afetadas e puderam crescer até mesmo em altas doses de fenamacril.

Isso foi determinado através de ensaios onde diferentes cepas foram colocadas em meios contendo várias concentrações de fenamacril. Os resultados destacaram as diferenças significativas em sensibilidade entre as várias cepas de F. asiaticum.

Realizando Sequenciamento do Transcritoma

Para investigar mais as diferenças entre as cepas, os pesquisadores sequenciaram os mRNAs das cepas sensíveis e resistentes após tratá-las com fenamacril. Esse processo envolveu gerar leituras limpas e de alta qualidade, que foram então comparadas com o genoma de referência para identificar genes expressos.

No total, um número significativo de genes únicos foi identificado em todas as cepas, oferecendo uma visão abrangente de como cada cepa reage ao tratamento com fenamacril.

Analisando a Expressão Gênica Diferencial

Um dos principais propósitos do estudo de transcrição foi encontrar mudanças na expressão gênica entre as cepas sensíveis e resistentes após o tratamento. Um número de Genes Diferencialmente Expressos (DEGs) foi identificado, com alguns genes mostrando expressão aumentada em cepas resistentes e outros sendo regulados para baixo.

A análise mostrou que as cepas resistentes tinham vários genes que estavam significativamente regulados para cima, indicando uma mudança em suas vias metabólicas em resposta ao fenamacril. Em contraste, as cepas sensíveis apresentaram um número maior de genes regulados para baixo sob as mesmas condições.

Análise Funcional de Genes Diferencialmente Expressos

Para entender melhor as funções dos genes diferencialmente expressos, os pesquisadores realizaram uma análise de enriquecimento de ontologia gênica (GO). Esse sistema de classificação agrupa genes com base em suas funções biológicas.

A análise revelou que muitos dos genes regulados para cima nas cepas resistentes estavam associados à captação e metabolismo de nutrientes. Essas descobertas sugerem que cepas resistentes podem ser melhores em adquirir nutrientes, permitindo que cresçam apesar da presença do fungicida.

Resultados da Classificação GO

Diferentes categorias funcionais foram identificadas para os genes regulados para cima nas cepas resistentes, incluindo processos relacionados ao metabolismo de pequenas moléculas e ácidos orgânicos, assim como à homeostase do ferro. Entender essas funções ajuda a esclarecer como as cepas resistentes conseguem sobreviver na presença do fenamacril.

Mecanismos de Regulação da Resistência

Ao comparar os transcritomas, os pesquisadores identificaram genes específicos que desempenham um papel na regulação da resistência. Eles encontraram um grupo de genes que foram consistentemente expressos em cepas resistentes, mas não em cepas sensíveis. Muitos desses genes estavam ligados a processos metabólicos que poderiam apoiar o crescimento em condições adversas.

Além disso, identificaram genes envolvidos no transporte de nutrientes e vias metabólicas que melhoram a capacidade das cepas resistentes de utilizar efetivamente os recursos disponíveis.

Efeitos Inibitórios do Fenamacril

O estudo também analisou os genes que foram afetados pelo fenamacril em cepas sensíveis e resistentes. A análise revelou um conjunto central de genes cuja expressão foi alterada independentemente do tipo de cepa. Esses genes incluíam aqueles relacionados à produção de energia e processos de desintoxicação.

Ao entender esses alvos inibitórios comuns, os pesquisadores podem obter insights sobre como o fenamacril exerce seus efeitos em diferentes cepas e identificar possíveis caminhos para o desenvolvimento de novos fungicidas.

Resumo das Descobertas

Essa pesquisa destaca a complexidade da resistência a fungicidas no F. asiaticum. Ao combinar técnicas genéticas com análise do transcritoma, os pesquisadores conseguem começar a desvendar a intricada teia de mecanismos de resistência e o impacto dos fungicidas no crescimento fúngico.

As descobertas mostram que cepas resistentes adaptaram suas vias metabólicas para sobreviver ao tratamento, focando na captação de nutrientes e geração de energia. O estudo enfatiza a importância de entender esses mecanismos para desenvolver estratégias eficazes de manejo de doenças por Fusarium nas culturas.

Conclusão

A batalha contínua contra a FHB é complicada pelo desenvolvimento de cepas resistentes de fungos Fusarium. Ao aprofundar nosso entendimento de como esses fungos se adaptam a fungicidas como o fenamacril, os pesquisadores podem informar práticas de manejo mais eficazes e contribuir para o sucesso contínuo da produção de culturas de cereais. As percepções obtidas dessa pesquisa também podem ajudar na descoberta de novos alvos para o desenvolvimento de fungicidas, oferecendo esperança para um melhor controle dessa doença destrutiva.

Fonte original

Título: Comparative transcriptome analysis provides insights into the resistance regulation mechanism and inhibitory effect of fungicide phenamacril in Fusarium asiaticum

Resumo: Fusarium asiaticum is a destructive phytopathogenic fungus that causes Fusarium head blight of wheat (FHB), leading to serious yield and economic losses to cereal crops worldwide. Our previous studies indicated that target-site mutations (K216R/E, S217P/L, or E420K/G/D) of Type I myosin FaMyo5 conferred high resistance to phenamacril. Here, we first constructed a sensitive strain H1S and point mutation resistant strains HA, HC and H1R. Then we conducted comparative transcriptome analysis of these strains in F. asiaticum after 1 g{middle dot}mL-1 and 10 g{middle dot}mL-1 phenamacril treatment. Results indicated that 2135 genes were differentially expressed (DEGs) among the sensitive and resistant strains. Among them, the DEGs encoding ammonium transporter MEP1/MEP2, nitrate reductase, copper amine oxidase 1, 4-aminobutyrate aminotransferase, amino-acid permease inda1, succinate-semialdehyde dehydrogenase, 2, 3-dihydroxybenzoic acid decarboxylase, etc., were significantly up-regulated in all the phenamacril-resistant strains. Compared to the control group, a total of 1778 and 2097 DEGs were identified in these strains after 1 g{middle dot}mL-1 and 10 g{middle dot}mL-1 phenamacril treatment, respectively. These DEGs involved in 4-aminobutyrate aminotransferase, chitin synthase 1, multiprotein-bridging factor 1, transcriptional regulatory protein pro-1, amino-acid permease inda1, ATP-dependent RNA helicase DED, acetyl-coenzyme A synthetase, sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, etc., showed significantly down-regulated expression in phenamacril-sensitive strain but not in resistant strains after phenamacril treatment. In addition, cyanide hydratase, mating-type protein MAT-1, putative purine nucleoside permease, plasma membrane protein yro2, etc., showed significantly co-down-regulated expression in all the strains after phenamacril treatment. Taken together, This study provide deep insights into the resistance regulation mechanism and inhibitory effect of fungicide phenamacril and these new annotated proteins or enzymes are worth for the discovery of new fungicide targets. Author summaryFungicide phenamacril resistance occur in F. asiaticum and the resistance regulation mechanis are systematic and complex. Here, we conducted comparative transcriptome analysis of a sensitive strain H1S and point mutation resistant strains HA, HC and H1R in F. asiaticum after 1 g{middle dot}mL-1 and 10 g{middle dot}mL-1 phenamacril treatment. Among these annotated proteins or enzymes, amino-acid permease inda1, 1, 4-aminobutyrate aminotransferase, chitin synthase 1, multiprotein-bridging factor 1, ATP-dependent RNA helicase DED, acetyl-coenzyme A synthetase, sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, cyanide hydratase, mating-type protein MAT-1, putative purine nucleoside permease, plasma membrane protein yro2, etc., were involved in the resistance regulation mechanism and inhibitory effect of fungicide phenamacril. Our paper provides a reference basis for the study of drug resistance in other microorganisms. In addition, the relevant proteins or enzymes annotated in our study also have reference value for the discovery of new fungicide targets.

Autores: Zhitian Zheng, H. Liu, X. Luo, R. Liu, A. Joe, H. Li, H. Sun, L. Yanling, Y. Li, Y. Wang

Última atualização: 2024-01-29 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577693

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577693.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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