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O Complexo Integrador: Um Jogador Chave na Regulação Gênica

O complexo Integrator tem um papel fundamental em controlar a expressão gênica.

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Em organismos vivos, as células precisam controlar como os genes são ativados ou desativados. Uma parte crítica desse controle envolve um processo onde uma enzima chamada RNA Polimerase II faz uma pausa depois de começar a copiar um gene, mas antes de terminar completamente. Essa pausa é gerenciada por várias proteínas que ajudam ou atrapalham o processo de transcrição. Duas proteínas importantes, DSIF e NELF1, trabalham pra manter a RNA polimerase II pausada, enquanto outro complexo protéico, P-TEFb, ajuda a enzima a seguir em frente e terminar de fazer a cópia de RNA do gene. No entanto, às vezes a RNA polimerase II para cedo demais e não faz uma cópia completa, o que pode acontecer quando um outro complexo proteico chamado Integrador entra em cena. O Integrador foi descoberto primeiro por seu papel no processamento de certos tipos de RNA, mas agora já descobriram que ele influencia a transcrição de outros genes também.

O Papel do Complexo Integrador

O complexo Integrador é composto por várias partes proteicas, conhecidas como subunidades. Ele interage com a RNA polimerase II e está envolvido tanto em finalizar a cópia de RNA de um gene quanto em impedir paradas precoces. O complexo Integrador é formado por 15 componentes principais, incluindo algumas subunidades recém-identificadas. Pesquisadores descobriram que duas dessas proteínas, INTS11, que age como uma tesoura pra cortar RNA, e outra proteína chamada PP2A-C, que ajuda a modificar proteínas, trabalham juntas de uma forma equilibrada pra influenciar a expressão gênica. Se o Integrador não funcionar direito, pode causar sérios problemas genéticos.

Estrutura e Função do Integrador

Entender como o Integrador se parece e funciona é importante. Estudos recentes mostraram que o Integrador tem uma estrutura complexa, feita de diferentes módulos que servem a várias funções. Um desses módulos, chamado módulo Arm, tem um papel significativo em conectar o Integrador à RNA polimerase II. Os pesquisadores usaram técnicas avançadas pra visualizar essas estruturas em detalhes. Eles descobriram que o módulo Arm tem o formato de um gancho, onde diferentes partes do módulo estão conectadas por uma região flexível.

Essa flexibilidade significa que os componentes podem se mover, o que é crucial pra sua função. Um aspecto chave do design é como as subunidades se encaixam. Especificamente, uma subunidade, INTS15, age como uma ponte entre diferentes partes do Integrador, ajudando a manter a estabilidade dentro de toda a estrutura.

Interação do Integrador com Fatores de Transcrição

O Integrador não trabalha sozinho; ele interage com várias outras proteínas, incluindo fatores de transcrição - proteínas que se ligam a regiões específicas do DNA pra ajudar a controlar a atividade gênica. Um fator de transcrição interessante é o ZNF655, que pertence a uma família popular de fatores de transcrição conhecidos como proteínas de dedo de zinco. Esses fatores de transcrição muitas vezes ajudam a regular genes, especialmente em contextos como o câncer.

Os pesquisadores descobriram que o ZNF655 pode se ligar a uma parte específica do complexo Integrador, particularmente à subunidade INTS13. A ligação do ZNF655 ao Integrador é essencial pra estabilizar todo o complexo. Quando o ZNF655 está presente, o Integrador parece funcionar melhor no seu trabalho, potencialmente ligando-se a vários processos celulares, incluindo os envolvidos no crescimento celular e resposta a diferentes sinais.

Investigando Estruturas de Proteínas

Pra aprender mais sobre como essas proteínas interagem, os pesquisadores usaram um método chamado microscopia eletrônica crio pra visualizar estruturas em uma escala muito fina. Isso permitiu que eles criassem uma imagem precisa de como o módulo Arm se encaixa no complexo Integrador maior quando associado à RNA polimerase II.

Nessas visualizações, ficou claro que o complexo Integrador forma conexões fortes com a RNA polimerase II em múltiplos pontos. Essa conexão é crucial pra sua função de regular a expressão gênica. Os estudos também revelaram que a posição do Integrador em relação à RNA polimerase II poderia permitir interações complexas com sequências de DNA. Tais interações podem influenciar o quão facilmente o processo de transcrição pode ocorrer.

Importância do ZNF655 e Outros Fatores de Transcrição

A interação entre ZNF655 e o complexo Integrador ilumina um potencial mecanismo regulatório pelo qual o Integrador pode influenciar a transcrição gênica. Isso significa que quando o ZNF655 se liga ao Integrador, ele pode aumentar a estabilidade de todo o complexo e potencialmente afetar quanto tempo o Integrador permanece associado à RNA polimerase II. Essa interação pode ser crítica em lugares onde respostas rápidas a mudanças no ambiente são necessárias.

Além do ZNF655, vários outros fatores de transcrição interagem com o Integrador. Cada um desses fatores pode fornecer capacidades regulatórias únicas, permitindo que o Integrador responda a diferentes sinais na célula. Isso sugere que o Integrador pode não ser apenas um jogador passivo na expressão gênica, mas também pode participar ativamente de decidir quando e como os genes são expressos com base no contexto fornecido por esses fatores de transcrição.

Implicações para a Regulação Gênica

Entender como o Integrador e os fatores de transcrição interagem contribui pra uma visão mais abrangente da regulação gênica. A capacidade do Integrador de se associar a diferentes fatores de transcrição sugere que ele poderia ajudar a direcionar a máquina de transcrição a genes específicos em diferentes circunstâncias. Essa versatilidade é crucial pra um funcionamento celular adequado e resposta a sinais de estresse ou crescimento.

Dado o que sabemos sobre as interações do Integrador, isso levanta questões sobre a possibilidade de estratégias terapêuticas visando esses complexos pra tratar doenças, especialmente cânceres onde a expressão gênica costuma estar desregulada. Ao potencialmente modificar como o Integrador interage com fatores de transcrição, os pesquisadores podem encontrar novas maneiras de influenciar a expressão gênica de uma forma controlada.

Conclusão

Resumindo, o complexo Integrador é vital pra regular a expressão gênica, gerenciando o processo de transcrição e trabalhando com várias proteínas, incluindo fatores de transcrição como o ZNF655. As relações e estruturas intrincadas dessas proteínas destacam um sistema sofisticado de controle gênico. Ao continuar estudando essas interações e seus impactos nas funções celulares, podemos abrir caminho pra novas descobertas sobre regulação genética e abordagens terapêuticas pra tratar várias doenças. O Integrador, embora seja um componente complexo das células, desempenha um papel crucial em garantir que os genes sejam expressos corretamente, o que é essencial pra saúde e funcionamento dos organismos vivos.

Fonte original

Título: Structural basis of the Integrator complex assembly and association with transcription factors

Resumo: Integrator is a multi-subunit protein complex responsible for premature transcription termination of coding and non-coding RNAs in Metazoans. This is achieved via Integrators two enzymatic activities, RNA endonuclease and protein phosphatase, acting on the promoter-proximally paused RNA Polymerase II (RNAPII). Yet, it remains unclear how Integrator assembly and recruitment are regulated and what are the functions of many of its core subunits. Here we report two cryo-EM reconstructions of large Integrator sub-complexes: INTS10/13/14/15 (Arm module) and INTS5/8/10/15, which allowed integrative modelling of the fully-assembled Integrator bound to the RNAPII paused elongating complex (PEC). INTS13/14 are positioned near the DNA upstream from the transcription pause site, suggesting a potential role in the chromatin context. An in silico protein interaction screen of over 1500 transcription factors (TFs), identified Zinc Finger Protein 655 (ZNF655) as a direct interacting partner of INTS13 that associates with a fully assembled, 17-subunit Integrator complex. We propose a model wherein the Arm module acts as a platform for the recruitment of TFs that could modulate the stability of the Integrators association at specific loci and modulate transcription attenuation of the target genes.

Autores: Wojciech P. Galej, M. Razew, A. Fraudeau, M. M. Pfleiderer

Última atualização: 2024-01-31 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577955

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577955.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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