Avanços em IA para Geração de Notas Clínicas
Modelos de IA mostram potencial em automatizar a criação de anotações clínicas a partir das conversas entre médicos e pacientes.
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Índice
Nos últimos anos, a inteligência artificial (IA) na saúde cresceu rápido, mostrando muito potencial pra mudar como as anotações clínicas são feitas. Uma parte chave desse processo é pegar as notas das conversas entre médicos e pacientes. Quando isso é feito de forma automática, ajuda os trabalhadores da saúde a focarem mais no cuidado dos pacientes em vez da papelada. Encontrar maneiras de resumir essas conversas com precisão é importante porque pode melhorar a qualidade e a eficiência geral da saúde.
O Desafio MEDIQA-Chat 2023
O evento MEDIQA-Chat 2023 foi criado pra incentivar novos métodos de resumir conversas médicas. O objetivo principal era fazer anotações clínicas automaticamente com base nas conversas entre médicos e pacientes. Duas tarefas principais faziam parte desse desafio: Dialogue2Note e Note2Dialogue. A parte Dialogue2Note tem como foco transformar as conversas entre médicos e pacientes em anotações clínicas, que podem incluir diferentes seções como Avaliação ou História Médica Anterior. Dentro do Dialogue2Note, existem duas subtarefas:
- Subtarefa A: Criar resumos e nomes de seções a partir de partes específicas das conversas.
- Subtarefa B: Desenvolver anotações clínicas completas baseadas nas conversas.
Nesse desafio, a gente olhou pra aplicar modelos de IA avançados pra melhorar como essas notas são geradas.
Métodos Usados
Na Subtarefa A, precisávamos classificar seções das conversas e desenvolver resumos. Exploramos dois métodos principais:
- Usamos modelos de IA avançados chamados RoBERTa e SciBERT pra classificar as seções das notas.
- Ajustamos outro modelo poderoso de IA, o Davinci da OpenAI, pra melhorar a performance na criação de resumos.
Depois, focamos em gerar resumos específicos usando um modelo conhecido de sumarização de diálogos chamado CONFIT. Esse modelo foi ajustado num conjunto de dados específico pra garantir que os resumos fossem factualmente precisos e de boa qualidade.
Na Subtarefa B, a gente se concentrou em usar grandes modelos de linguagem (LLMs) como o GPT pra gerar notas completas. Fizemos o seguinte:
- Ajustamos o modelo Davinci de novo pra melhorar os resultados.
- Testamos o aprendizado em contexto com o GPT-4 pra usar exemplos e instruções que guiassem o modelo na geração de notas.
Resultados e Análise
A gente usou diferentes métricas pra medir como nossos modelos estavam se saindo. Algumas medidas importantes incluíam ROUGE e BERTScore, que ajudam a mostrar o quanto os resumos gerados são parecidos com os resumos de referência. Nossos resultados mostraram que nossos métodos produziram resultados fortes nessas avaliações.
Na nossa análise da Subtarefa A, criamos visuais pra mostrar como as seções estavam distribuídas entre os conjuntos de dados de treinamento e validação. Não encontramos grandes diferenças nos tipos de seções, mas notamos que algumas categorias tinham menos exemplos, o que poderia levar a desafios no treinamento eficaz dos modelos.
Na Subtarefa B, vimos que o desempenho dos nossos modelos variava. Os modelos de machine learning pra criação de notas se saíram bem, com alguns modelos performando melhor que outros. Notavelmente, os modelos baseados em GPT receberam notas altas quando avaliados por humanos. Isso mostra que mesmo que as pontuações automatizadas fossem um pouco mais baixas, as avaliações humanas proporcionaram uma melhor compreensão da eficácia dos modelos.
Avaliação dos Especialistas
Apesar das nossas medidas quantitativas, reconhecemos a necessidade de avaliações humanas pra dar um quadro mais completo do desempenho. A gente convidou estudantes de medicina pra avaliar nossos resultados com base em vários aspectos de qualidade. Eles usaram uma escala de 1 a 10, e essa avaliação destacou as forças e fraquezas dos nossos modelos de forma mais eficaz que as métricas automatizadas sozinhas.
Desafios Enfrentados
Enquanto trabalhávamos nas tarefas, encontramos várias limitações. Por exemplo, os modelos às vezes produziam resumos muito longos porque o comprimento da entrada não era gerenciado diretamente durante a geração do resumo, levando a uma verbosidade excessiva. Mas modelos avançados como o GPT-3 e GPT-4 têm capacidades maiores de entrada e saída, o que ajuda a gerenciar isso melhor.
Outro desafio foi o conjunto de dados de treinamento menor na Subtarefa A, o que dificultou a adaptação dos modelos e a geração de saídas concisas. No futuro, é crucial criar métodos que controlem o comprimento dos resumos, mantendo-os relevantes e úteis.
Na Subtarefa B, achamos mais difícil obter bons resultados usando modelos tradicionais. Situações do mundo real muitas vezes envolvem diálogos longos e saídas estruturadas, tornando exemplos contextuais muito úteis. Modelos de IA como o GPT-4, que lidam melhor com textos mais longos, superaram modelos tradicionais mais curtos.
Inaccurácias Fatuais
Notamos que alguns resumos continham erros factuais ou interpretações erradas de informações importantes. Embora não tenhamos explorado profundamente essa área, reconhecemos que esses erros poderiam afetar a confiabilidade dos resumos gerados.
Importância da Solicitação
A forma como configuramos nossos prompts e os exemplos que escolhemos tiveram um grande impacto em nossos resultados. Ao incluir mais exemplos no prompt, os resumos produzidos pelos modelos melhoraram significativamente. Embora não tenhamos explorado estratégias avançadas de seleção pra escolher exemplos, acreditamos que considerar esses métodos no futuro poderia levar a resultados ainda melhores.
Questões de Privacidade de Dados
Como usamos modelos através de APIs, também enfrentamos questões de privacidade de dados, especialmente em relação a regulamentações como a HIPAA. É vital pensar na segurança dos dados dos pacientes ao utilizar esses modelos de IA pra gerar notas.
Conclusão
Apresentamos nossas abordagens para gerar anotações clínicas a partir de conversas entre médicos e pacientes no evento MEDIQA-Chat. Usando diferentes modelos como CONFIT, GPT-3 e GPT-4, conseguimos criar métodos eficazes pra resumir diálogos médicos. A combinação de avaliações automatizadas e humanas forneceu insights ricos, destacando o potencial da IA em melhorar a documentação na saúde.
No futuro, nossa pesquisa vai focar em desenvolver melhores estratégias pra lidar com limitações de comprimento, melhorar a precisão, aprimorar avaliações humanas e garantir a privacidade dos dados. A evolução contínua da IA na saúde mostra grande potencial, e com exploração e aprimoramento contínuos, pode mudar significativamente como as anotações clínicas são criadas e usadas.
Título: GersteinLab at MEDIQA-Chat 2023: Clinical Note Summarization from Doctor-Patient Conversations through Fine-tuning and In-context Learning
Resumo: This paper presents our contribution to the MEDIQA-2023 Dialogue2Note shared task, encompassing both subtask A and subtask B. We approach the task as a dialogue summarization problem and implement two distinct pipelines: (a) a fine-tuning of a pre-trained dialogue summarization model and GPT-3, and (b) few-shot in-context learning (ICL) using a large language model, GPT-4. Both methods achieve excellent results in terms of ROUGE-1 F1, BERTScore F1 (deberta-xlarge-mnli), and BLEURT, with scores of 0.4011, 0.7058, and 0.5421, respectively. Additionally, we predict the associated section headers using RoBERTa and SciBERT based classification models. Our team ranked fourth among all teams, while each team is allowed to submit three runs as part of their submission. We also utilize expert annotations to demonstrate that the notes generated through the ICL GPT-4 are better than all other baselines. The code for our submission is available.
Autores: Xiangru Tang, Andrew Tran, Jeffrey Tan, Mark Gerstein
Última atualização: 2023-05-08 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2305.05001
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.05001
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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