Previsão da Disseminação dos Linfonodos em Pacientes com Câncer de Útero
Usando redes bayesianas pra avaliar a envolvência de linfonodos no câncer de útero.
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Índice
Avaliar o risco de espalhamento para linfonodos em pacientes com câncer de útero antes da cirurgia é complicado. Isso acontece em parte porque os dados disponíveis podem ser confusos, com informações faltando, tamanhos de amostra pequenos e variáveis demais para acompanhar. Isso dificulta a criação de modelos de Aprendizado de Máquina confiáveis que os médicos possam usar. Em vez disso, podemos usar um modelo de rede bayesiana causal, que nos ajuda a evitar alguns desses problemas e usar o conhecimento que os médicos já têm sobre câncer de útero.
O processo envolve uma nova forma de descobrir relações, usando métodos que se baseiam em amostras repetidas. Também consideramos como os preconceitos de escolher grupos específicos de pacientes podem afetar o que encontramos. Em muitas situações do mundo real, dados faltando podem ser um grande problema e levar a conclusões erradas.
Inteligência Artificial na Medicina
A inteligência artificial (IA) tem muitos usos na medicina, especialmente em pesquisas sobre câncer. Ela é frequentemente usada para prever diagnósticos, chances de sobrevivência e opções de tratamento. O aprendizado de máquina (ML), uma parte da IA, mostrou bons resultados, especialmente na análise de imagens. No entanto, esses modelos de ML podem ser difíceis de explicar. Os médicos podem não confiar em modelos que não mostram claramente como as decisões são tomadas. Esforços recentes foram feitos para melhorar a compreensão da IA, mas muitos modelos ainda carecem de transparência.
Modelos gráficos probabilísticos (PGMs) mostram explicitamente como diferentes variáveis estão conectadas. Um tipo de PGM, as Redes Bayesianas (BNs), pode ser útil como ferramentas de suporte à decisão. As BNs podem ajudar a evitar problemas encontrados em previsões típicas feitas por outros modelos de ML, tornando-as mais adequadas para aplicações clínicas.
Espalhamento para Linfonodos em Pacientes com Câncer de Útero
Esse artigo foca em criar um modelo de rede bayesiana para prever o espalhamento para linfonodos em cancerígenas de útero. O câncer de útero ocorre no revestimento do útero e afeta muitas mulheres no mundo todo. A maioria das mulheres é diagnosticada cedo e tem uma boa chance de sobrevivência, mas cerca de 90.000 morrem a cada ano devido a esse câncer.
O tratamento geralmente começa com cirurgia para remover o útero e, em alguns casos, os ovários. A escolha dos tratamentos dados antes ou depois da cirurgia muitas vezes depende de quão provável é que o câncer se espalhe. Descobrir se há envolvimento dos linfonodos é crucial para planejar o tratamento futuro e melhorar os resultados dos pacientes.
Atualmente, não há consenso sobre a melhor maneira de descobrir quais pacientes se beneficiariam da cirurgia para remover linfonodos ao redor. Na verdade, em casos iniciais, remover linfonodos tem se mostrado ter pouco efeito nos resultados e pode levar a problemas de saúde a longo prazo. A precisão diagnóstica para o espalhamento de linfonodos também é limitada; cerca da metade dos casos é encontrada em pacientes que se acreditam ter baixo ou risco intermediário.
Esse trabalho se baseia em modelos de rede bayesiana existentes, focando em duas melhorias principais:
- Adicionar informações do hospital para identificar melhor os preconceitos na seleção de pacientes.
- Abordar os preconceitos criados por dados faltando, que podem resultar em associações enganosas.
O objetivo é criar um modelo causal que combine o conhecimento de especialistas com dados observacionais para identificar pacientes com câncer de útero com baixo ou risco intermediário de espalhamento para linfonodos. Isso visa ajudar os médicos a tomarem decisões informadas.
Trabalhos Relacionados
Tratamentos personalizados visam reduzir efeitos colaterais desnecessários das terapias, enquanto garantem uma gestão adequada com base nos níveis de risco. No contexto do câncer de útero, prever o risco de envolvimento de linfonodos antes da cirurgia não foi explorado a fundo na literatura. Um estudo analisou modelos bayesianos e descobriu que apenas um modelo teve um bom desempenho.
Outros estudos destacaram certos marcadores como potenciais preditores de resultados, junto com características dos pacientes, como condições de saúde existentes e características do tumor. Mais recentemente, um modelo chamado ENDORISK foi desenvolvido, que utiliza marcadores clínicos, histopatológicos e moleculares avaliados antes da cirurgia. Esse modelo teve um bom desempenho e ajudou nas discussões com os pacientes antes das decisões cirúrgicas.
Redes Bayesianas Causais
Para entender como funcionam as redes bayesianas, podemos olhar algumas definições-chave. Um gráfico é composto por nós e arestas que expressam relações. Focamos em gráficos direcionados, onde um nó está conectado a outro, mostrando uma relação de pai e filho.
Um gráfico causal delineia as relações causa-efeito em um sistema. As variáveis nesse gráfico ajudam a explicar o comportamento do sistema. Diferente das redes bayesianas padrão, as redes causais mostram explicitamente esses vínculos causa-efeito, tornando-as mais claras para interpretação.
Quando o gráfico causal não é conhecido, ele pode ser reconstruído a partir de uma mistura de conhecimento prévio e métodos baseados em dados. Esse processo é chamado de Descoberta Causal. Um algoritmo de descoberta causal utiliza tanto dados quanto conhecimento existente para construir um modelo causal preciso.
Os algoritmos de descoberta causal são geralmente divididos em dois tipos: baseados em restrições e baseados em pontuações. Enquanto os algoritmos tradicionais podem não lidar bem com dados faltando, combiná-los com métodos de imputação pode criar um conjunto de dados completo para análise.
Uma abordagem comum é o método de Busca Gananciosa, onde o algoritmo examina gráficos possíveis e seleciona o melhor com base em um sistema de pontuação. Esse espaço de busca pode ser ajustado incluindo conhecimento prévio, permitindo um processo de descoberta mais direcionado e eficaz.
Resultados Experimentais
Técnicas de descoberta causal podem oferecer resultados confiáveis quando há amostras de dados suficientes. No entanto, em situações do mundo real, especialmente na saúde, os tamanhos das amostras tendem a ser pequenos, levando a ruídos nos dados que podem alterar os resultados. Portanto, é vital avaliar a confiança nas relações mostradas na rede causal.
Para avaliar a força das relações, podemos usar uma técnica conhecida como bootstrapping, onde um conjunto de dados é amostrado repetidamente para ver quão consistentes são as relações. Isso ajuda a identificar a confiabilidade das conexões encontradas nos dados.
Os modelos desenvolvidos foram testados com base em uma coorte de pacientes com câncer de útero. Os dados foram divididos em conjuntos de treinamento e teste. Cada modelo foi avaliado prevendo o envolvimento dos linfonodos no conjunto de teste. Os resultados foram analisados usando métricas como sensibilidade, especificidade e a área sob a curva (AUC).
Os dados mostram que os modelos alcançaram altas pontuações de AUC, indicando fortes habilidades preditivas.
Força das Relações
As arestas nas redes bayesianas mostram as conexões entre as variáveis. A força dessas conexões ajuda a interpretar o modelo geral. Os gráficos resultantes após a análise podem ilustrar como diferentes fatores se relacionam com o espalhamento para linfonodos.
A inclusão de dados hospitalares nos modelos permite identificar como diferentes instituições podem influenciar os resultados, possivelmente devido a fatores não observáveis. Enquanto algumas relações se alinham com o conhecimento de especialistas, outras revelam conexões inesperadas, sugerindo que mais investigações são necessárias.
Conclusões e Trabalhos Futuros
Métodos de descoberta causal têm sido úteis para desvendar e abordar associações imprecisas em dados observacionais. Essa abordagem melhora a forma como avaliamos o risco de envolvimento de linfonodos em pacientes com câncer de útero.
Os resultados mostram que integrar o conhecimento de especialistas pode aprimorar modelos preditivos, alcançando melhor precisão em comparação com trabalhos anteriores.
Seguindo em frente, alguns desafios permanecem.
- O impacto dos dados faltantes deve ser considerado, especialmente onde preconceitos estão envolvidos.
- A influência causal de vários tratamentos no espalhamento para linfonodos precisa ser examinada.
- Compreender como preconceitos de dados relacionados a hospitais afetam os resultados é crucial.
Ao abordar essas questões, podemos melhorar o processo de tomada de decisão no tratamento de pacientes com câncer de útero e, finalmente, melhorar o atendimento ao paciente.
Título: Risk Assessment of Lymph Node Metastases in Endometrial Cancer Patients: A Causal Approach
Resumo: Assessing the pre-operative risk of lymph node metastases in endometrial cancer patients is a complex and challenging task. In principle, machine learning and deep learning models are flexible and expressive enough to capture the dynamics of clinical risk assessment. However, in this setting we are limited to observational data with quality issues, missing values, small sample size and high dimensionality: we cannot reliably learn such models from limited observational data with these sources of bias. Instead, we choose to learn a causal Bayesian network to mitigate the issues above and to leverage the prior knowledge on endometrial cancer available from clinicians and physicians. We introduce a causal discovery algorithm for causal Bayesian networks based on bootstrap resampling, as opposed to the single imputation used in related works. Moreover, we include a context variable to evaluate whether selection bias results in learning spurious associations. Finally, we discuss the strengths and limitations of our findings in light of the presence of missing data that may be missing-not-at-random, which is common in real-world clinical settings.
Autores: Alessio Zanga, Alice Bernasconi, Peter J. F. Lucas, Hanny Pijnenborg, Casper Reijnen, Marco Scutari, Fabio Stella
Última atualização: 2023-05-17 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2305.10041
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.10041
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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