A Evolução dos Membros: Insights dos Peixes-Zebra
Pesquisas mostram como os controles genéticos moldaram a evolução dos membros a partir dos peixes.
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Índice
- O Debate sobre Membros de Peixes e Tetrapodes
- O Papel dos Genes no Desenvolvimento de Membros
- Como os Genes Hox Funcionam em Membros e Nadadeiras
- Zebrafish e Estudos Genéticos
- Investigando Paisagens Regulatórias em Zebrafish
- Estrutura e Função do HoxD em Zebrafishes
- Investigando Atividade Genética em Zebrafishes
- Cloaca e Desenvolvimento do Sistema Urogenital em Zebrafishes
- Reforços e Regulação Gênica no Sistema Urogenital
- A Evolução das Paisagens Regulatórias
- Resumo e Implicações
- Fonte original
Tetrapodes, que incluem animais como rãs, pássaros e mamíferos, têm Membros com uma estrutura única. Esses membros são formados por diferentes segmentos: um osso grande chamado estilopódio (como o braço ou a coxa), dois ossos menores chamados zeugópódio (como o antebraço ou a parte inferior da perna), depois um grupo de ossos no pulso ou tornozelo conhecido como mesopódio, e finalmente, os ossos da mão ou pé chamados autopódio. Esse design já existe desde antes desses bichos saírem da água e irem pra terra. Até peixes que são ancestrais desses tetrapodes mostram estruturas ósseas parecidas.
O Debate sobre Membros de Peixes e Tetrapodes
Quando olhamos de perto para os peixes, especialmente os mais relacionados aos tetrapodes, a coisa fica complicada. Embora eles tenham algumas partes semelhantes, ainda se debate se as nadadeiras deles têm estruturas que podem ser identificadas como as mesmas dos membros de tetrapodes, principalmente nos ossos do pulso e do pé. Algumas nadadeiras de peixes definitivamente têm partes que lembram estruturas de membros, mas a existência de verdadeiros ossos parecidos com dedos nesses peixes ainda é discutida.
O Papel dos Genes no Desenvolvimento de Membros
Alguns genes, especialmente o HoxA e HoxD, desempenham um papel crucial na formação dos membros dos tetrapodes. Os cientistas analisam esses genes durante o desenvolvimento das nadadeiras dos peixes pra ver se tem alguma dica de estruturas semelhantes a membros. Dois genes específicos, Hoxa13 e Hoxd13, são interessantes porque são conhecidos por ajudar na formação da área do pulso e dos dedos nos membros dos tetrapodes. Quando esses genes não funcionam direito em camundongos, os resultados mostram que as partes do pulso e dos dedos estão faltando.
Pesquisas também mostraram que atividades genéticas semelhantes existem nas nadadeiras dos peixes, o que sugere que algumas regras de desenvolvimento já estavam em vigor antes mesmo de os primeiros membros aparecerem. No entanto, enquanto o design genético é meio preservado, as partes reais que surgem durante o desenvolvimento dos membros e nadadeiras podem variar.
Como os Genes Hox Funcionam em Membros e Nadadeiras
Durante o crescimento de um broto de membro em tetrapodes, uma parte do DNA chamada 3DOM controla como certos genes Hox são ativados nas primeiras fases. Essa parte regula os genes que vão comandar a formação do braço ou da coxa. À medida que o membro continua a se desenvolver, uma parte diferente chamada 5DOM se ativa, regulando os genes associados ao pulso e aos dedos. Se 3DOM for deletado, a estrutura do membro superior não se desenvolve adequadamente, enquanto remover 5DOM impede a formação do pulso e dos dedos.
Zebrafish e Estudos Genéticos
Nos zebrafishes, que são frequentemente usados em estudos de genética, ocorrem atividades genéticas semelhantes quando suas nadadeiras se desenvolvem. As primeiras fases mostram que os genes hoxda são ativados e expandidos de uma forma que combina com o que acontece em camundongos, embora algumas diferenças possam existir depois. Apesar dessas semelhanças, ainda não está claro se os zebrafishes seguem os mesmos padrões vistos em mamíferos em relação à regulação distante dos genes Hox deles.
Investigando Paisagens Regulatórias em Zebrafish
Os cientistas estão curiosos pra saber se os genes hoxda dos zebrafishes podem ser regulados por controles distantes semelhantes aos vistos em camundongos. Criando linhagens de zebrafish onde partes das áreas regulatórias hoxda foram deletadas, os pesquisadores descobriram que, embora o controle principal para o crescimento inicial dos membros esteja presente tanto em peixes quanto em camundongos, os controles de longa distância vistos em camundongos não têm um equivalente nas nadadeiras dos peixes. No entanto, o 5DOM dos zebrafishes ainda mostra alguma função em organizar onde certos genes são ativados, especialmente na área cloacal, que está ligada a onde os sistemas digestivo e urinário se encontram.
Estrutura e Função do HoxD em Zebrafishes
A disposição dos genes hoxda nos zebrafishes é parecida com a dos mamíferos, com características-chave preservadas que controlam o desenvolvimento de várias partes do corpo. A organização do cluster de genes, incluindo as duas áreas ao redor desse cluster, é considerada como um traço que já existia antes da separação entre peixes com nadadeiras raiadas e tetrapodes.
Ao olhar para essas áreas, os pesquisadores descobriram que, embora algumas partes compartilhem sequências com as de camundongos, outras não têm tanta semelhança. Mesmo assim, a estrutura geral sugere que as partes regulatórias que controlam esses genes são vitais e podem ter sido preservadas por causa das suas funções importantes.
Investigando Atividade Genética em Zebrafishes
Pra entender como os genes hoxda dos zebrafishes são ativados, os pesquisadores analisaram a acessibilidade do DNA e as modificações de histona nas áreas ao redor dos genes hoxda. Testes específicos mostraram que ambas as regiões flanqueadoras estavam ativas na regulação da expressão gênica. Usando técnicas de edição genética, os cientistas criaram mutantes de zebrafish com deleções nessas áreas regulatórias e observaram como essas deleções afetaram a expressão gênica.
Em zebrafishes com 3DOM deletado, alguns genes essenciais para o desenvolvimento da nadadeira não puderam mais ser expressos. No entanto, deletar 5DOM teve um efeito menos dramático, já que algumas atividades gênicas permaneceram inalteradas inicialmente. Isso indica que, enquanto 3DOM é crucial para estabelecer a estrutura do membro, 5DOM desempenha um papel mais sutil, especialmente nas fases posteriores do desenvolvimento da nadadeira.
Cloaca e Desenvolvimento do Sistema Urogenital em Zebrafishes
A cloaca é uma estrutura que serve como uma abertura para vários sistemas corporais em muitos animais. Nos zebrafishes, a área em desenvolvimento mostra aspectos intrigantes que podem estar ligados à evolução de tais estruturas em outras espécies. Os pesquisadores descobriram que a cloaca dos zebrafishes tem duas aberturas separadas para os sistemas urinário e digestivo, influenciadas por genes como hox13.
Mutantes que não têm certos genes hox13 apresentaram problemas de desenvolvimento significativos na área cloacal, levando à fusão dessas aberturas. Pesquisas semelhantes em camundongos mostraram que os genes Hox são críticos para a formação adequada do seio urogenital, que também se origina da cloaca.
Reforços e Regulação Gênica no Sistema Urogenital
Em camundongos, os pesquisadores descobriram que a região 5DOM desempenha um papel crucial na regulação dos genes Hox relacionados ao desenvolvimento do sistema urogenital. Deletar seções dessa paisagem regulatória resultou em uma perda significativa de função, provando sua importância. Essa pesquisa lança luz sobre como os reforços localizados dentro dessa área regulatória conduzem a expressão de genes cruciais para a formação do sistema urogenital.
A Evolução das Paisagens Regulatórias
As descobertas sugerem que a paisagem regulatória responsável pelo desenvolvimento da cloaca em peixes influenciou significativamente as adaptações posteriores que levaram à formação de membros e genitais externos em tetrapodes. A transição de nadadeiras para membros envolveu a reutilização desse antigo sistema regulatório, que inicialmente controlava a disposição da cloaca e foi ajustado depois para gerenciar a complexidade dos membros e sistemas reprodutivos em animais terrestres.
Através de estudos extensivos, está claro que, enquanto a evolução de nadadeiras para membros traz novas estruturas, ela utiliza sistemas regulatórios já existentes que se adaptaram ao longo do tempo para atender às necessidades de diferentes organismos.
Resumo e Implicações
A pesquisa destaca as conexões profundas entre os controles genéticos para o desenvolvimento de membros e nadadeiras e como características antigas como a cloaca moldaram a evolução de espécies modernas. Entender esses processos fornece insights não só sobre as estruturas físicas de várias formas animais, mas também sobre as estruturas genéticas subjacentes que impulsionam seu desenvolvimento.
Em conclusão, a relação entre estruturas de membros e nadadeiras em vertebrados enfatiza a importância dos genes Hox e suas paisagens regulatórias, mostrando como os processos evolutivos aproveitaram de forma engenhosa os sistemas genéticos existentes para criar adaptações diversas em diferentes espécies. O trabalho continua a explorar essas conexões, oferecendo novas perspectivas sobre como a vida evoluiu da água para a terra.
Título: EVOLUTIONARY CO-OPTION OF AN ANCESTRAL CLOACAL REGULATORY LANDSCAPE DURING THE EMERGENCE OF DIGITS AND GENITALS
Resumo: The transition from fins to limbs has been a rich source of discussion for more than a century. One open and important issue is understanding how the mechanisms that pattern digits arose during vertebrate evolution. In this context, the analysis of Hox gene expression and functions to infer evolutionary scenarios has been a productive approach to explain the changes in organ formation, particularly in limbs. In tetrapods, the transcription of Hoxd genes in developing digits depends on a well-characterized set of enhancers forming a large regulatory landscape1,2. This control system has a syntenic counterpart in zebrafish, even though they lack bona fide digits, suggestive of deep homology3 between distal fin and limb developmental mechanisms. We tested the global function of this landscape to assess ancestry and source of limb and fin variation. In contrast to results in mice, we show here that the deletion of the homologous control region in zebrafish has a limited effect on the transcription of hoxd genes during fin development. However, it fully abrogates hoxd expression within the developing cloaca, an ancestral structure related to the mammalian urogenital sinus. We show that similar to the limb, Hoxd gene function in the urogenital sinus of the mouse also depends on enhancers located in this same genomic domain. Thus, we conclude that the current regulation underlying Hoxd gene expression in distal limbs was co-opted in tetrapods from a preexisting cloacal program. The orthologous chromatin domain in fishes may illustrate a rudimentary or partial step in this evolutionary co-option.
Autores: Denis Duboule, A. Hintermann, C. C. Bolt, M. B. Hawkins, G. Valentin, L. Lopez-Delisle, S. Gitto, P. B. Gomez, B. Mascrez, T. A. Mansour, T. Nakamura, M. P. Harris, N. H. Shubin
Última atualização: 2024-03-27 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.24.586442
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.24.586442.full.pdf
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