Abordagens Inovadoras para Normalização de Doenças
Novos métodos visam melhorar a padronização dos nomes de doenças em documentos clínicos.
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Índice
- Desafios na Normalização de Doenças
- O Problema da Escassez de Dados
- A Necessidade de Ampliação de Dados Específica para Doenças
- Métodos Propostos
- Tipos de Técnicas de Ampliação de Dados
- Processo de Treinamento
- Configuração Experimental
- Comparação de Métodos de Ampliação de Dados
- Estudo de Ablação
- Desempenho em Conjuntos de Dados Menores
- Conclusão
- Direções Futuras
- Fonte original
- Ligações de referência
Na área médica, entender doenças e seus nomes é fundamental. A normalização de doenças é um processo que alinha os nomes usados em documentos clínicos com nomes padrões usados em sistemas de codificação internacional, como o ICD-10. No entanto, normalizar nomes de doenças é complicado por várias razões, incluindo estilos de escrita diferentes, dados limitados e significados densos em nomes curtos.
Desafios na Normalização de Doenças
Estilos de Escrita Diversos
Os médicos escrevem os nomes das doenças de maneiras diferentes, resultando em várias variações para a mesma doença. Essa diversidade dificulta o reconhecimento e a correspondência correta dos nomes pelos computadores.
Dados Limitados
Em muitos casos, não há dados suficientes para treinar modelos de forma eficaz. Por exemplo, em um grande conjunto de dados contendo muitas doenças, apenas uma pequena porcentagem pode ter exemplos suficientes para treinamento. Isso leva a situações onde os modelos têm dificuldade com doenças que não viram antes, conhecidas como aprendizado few-shot ou zero-shot.
Significados Densos
Os nomes das doenças costumam ser curtos, o que significa que cada caractere carrega um significado significativo. Uma pequena mudança na grafia pode alterar drasticamente o significado da doença. Por exemplo, dois nomes de doenças podem diferir por apenas um caractere, mas referir-se a condições totalmente diferentes no corpo.
O Problema da Escassez de Dados
Entre os desafios, a escassez de dados é o mais significativo. Isso limita a capacidade do modelo de aprender de forma eficaz. Uma solução comum para a escassez de dados é a ampliação de dados, que envolve criar novos exemplos de dados a partir dos já existentes. Métodos tradicionais, como substituição de sinônimos ou tradução inversa, podem gerar novos exemplos, mas muitas vezes prejudicam o desempenho com nomes de doenças devido à sua estrutura única.
A Necessidade de Ampliação de Dados Específica para Doenças
Métodos gerais de ampliação de dados podem ajudar com estilos de escrita diversos, mas falham com nomes de doenças. Esses métodos podem alterar os significados dos nomes das doenças em vez de preservá-los. Portanto, é essencial desenvolver métodos especificamente adaptados à estrutura e aos desafios dos nomes das doenças.
Métodos Propostos
Para melhorar o processo de normalização de doenças, introduzimos um conjunto de técnicas de ampliação de dados focadas nos aspectos únicos dos nomes das doenças. Nossos métodos são projetados para ajudar os modelos a aprender melhores representações dos nomes das doenças e a melhorar o desempenho geral.
Invariância Estrutural
Acreditamos que os nomes das doenças têm uma propriedade de invariância estrutural. Isso significa que elementos dentro de um nome de doença, como sua localização ou tipo, podem muitas vezes ser trocados sem perder o significado. Ao substituir componentes específicos nos nomes das doenças por outros que se encaixam no mesmo tipo, podemos criar novos pares de nomes clínicos e padrões que ainda refletem os significados originais.
Transitividade dos Rótulos
Outro princípio em que nos baseamos é a natureza transitiva dos rótulos das doenças. Uma descrição mais detalhada de uma doença pode muitas vezes ser agrupada sob uma categoria mais ampla. Por exemplo, um tipo específico de doença pode pertencer a uma classe mais geral de doenças. Essa estrutura nos permite vincular doenças detalhadas a seus equivalentes mais amplos, ajudando o modelo a aprender as semelhanças entre elas.
Tipos de Técnicas de Ampliação de Dados
Apresentamos dois tipos principais de métodos de ampliação de dados: Substituição de Palavras- eixo e Agregação Multi-Grain.
Substituição de Palavras-eixo
Neste método, substituímos componentes específicos dos nomes das doenças enquanto mantemos seus significados principais. Identificamos diferentes elementos dentro dos nomes das doenças, como o centro da doença ou a localização anatômica. Ao substituir seletivamente esses componentes, criamos novos pares de normalização de doenças.
Diferentes Tipos de Substituição de Palavras-eixo
AR1: Identificar um par de doenças que compartilham parte de sua estrutura, mas diferem em outra parte. Substituir a parte diferente em uma doença pela parte correspondente da outra doença.
AR2: Neste método, pegamos uma doença não normalizada dos nossos dados de treinamento e uma doença padrão da lista de codificação ICD. Então encontramos outra doença correspondente da lista ICD e substituímos a parte diferente da primeira doença pela parte correspondente da nova doença.
Agregação Multi-Grain
Essa abordagem aproveita a natureza hierárquica da classificação de doenças na codificação ICD. Podemos relacionar descrições detalhadas de doenças às suas categorias mais amplas, permitindo que o modelo aprenda quais doenças são mais semelhantes com base em características compartilhadas.
Diferentes Tipos de Agregação Multi-Grain
MGA-code: Atribuir o mesmo rótulo a doenças que compartilham componentes, ajudando o modelo a aprender conexões entre doenças em diferentes níveis de granularidade.
MGA-position: Semelhante ao MGA-code, esse método foca em localizações anatômicas, agrupando doenças que compartilham uma localização mais ampla.
Processo de Treinamento
Treinamos nossos modelos usando tanto o conjunto de dados original quanto os dados recém-ampliados, permitindo que eles aprendam mais associações semânticas durante a fase de treinamento. O processo envolve:
- Usar conjuntos de dados ampliados para treinar o modelo, permitindo que ele aprenda com as informações adicionais fornecidas.
- Ajustar o modelo no conjunto de dados original de normalização de doenças.
Configuração Experimental
Para avaliar nossos métodos, testamos em um conjunto de dados de normalização de doenças chinês específico chamado CHIP-CDN. Este conjunto contém pares de nomes de doenças não normalizadas e padrões, permitindo que testemos nossas técnicas de forma eficaz.
Modelos de Referência
Comparamos nossos métodos com vários modelos de referência, incluindo:
- BILSTM: Um modelo simples com camadas dedicadas ao reconhecimento de padrões em textos.
- BERT-base: Um modelo mais complexo que usa conhecimento pré-existente para entender a linguagem.
- CDN-Baseline: Um modelo especializado em tarefas de normalização de doenças.
Métricas de Avaliação
Para nossas avaliações, usamos a precisão para os modelos BILSTM e BERT-base. Para o modelo CDN-Baseline, utilizamos a pontuação F1 para uma perspectiva diferente sobre o desempenho.
Comparação de Métodos de Ampliação de Dados
Em nossos experimentos, descobrimos que enquanto alguns métodos tradicionais como tradução reversa podem gerar dados diversos, eles geralmente diminuem o desempenho. Nossos métodos propostos consistentemente melhoraram os resultados em diferentes modelos, demonstrando sua eficácia nas tarefas de normalização de doenças.
Estudo de Ablação
Testamos ainda mais nossas técnicas propostas ao remover cada método de ampliação um por um para entender suas contribuições individuais. Os resultados indicaram que cada método desempenha um papel crítico em melhorar o desempenho.
Desempenho em Conjuntos de Dados Menores
Também examinamos como nossos métodos se saíram em conjuntos de dados menores, onde a escassez de dados é mais pronunciada. Descobrimos que nossas técnicas melhoraram significativamente os resultados, especialmente quando o conjunto de dados continha menos exemplos, destacando sua importância em enfrentar os desafios da normalização de doenças.
Conclusão
Resumindo, nosso trabalho introduz métodos inovadores de ampliação de dados especificamente adaptados para tarefas de normalização de doenças chinesas. Ao focar nas estruturas e relações únicas dentro dos nomes das doenças, conseguimos criar modelos com melhor desempenho, mesmo diante de desafios como escassez de dados e descrições diversas. Nossos métodos não apenas melhoram o desempenho em conjuntos de dados padrão, mas também mostram potencial para uso em várias aplicações médicas no futuro.
Direções Futuras
Embora nossa pesquisa atual demonstre a eficácia de nossos métodos, uma investigação mais aprofundada sobre os mecanismos internos por trás dessas melhorias é essencial. Além disso, desenvolver métodos avançados para filtrar informações erradas dos dados ampliados poderia levar a resultados ainda melhores no futuro. Pretendemos continuar explorando essas áreas e contribuir ainda mais para melhorar os esforços de normalização de doenças.
Título: Simple Data Augmentation Techniques for Chinese Disease Normalization
Resumo: Disease name normalization is an important task in the medical domain. It classifies disease names written in various formats into standardized names, serving as a fundamental component in smart healthcare systems for various disease-related functions. Nevertheless, the most significant obstacle to existing disease name normalization systems is the severe shortage of training data. Consequently, we present a novel data augmentation approach that includes a series of data augmentation techniques and some supporting modules to help mitigate the problem. Our proposed methods rely on the Structural Invariance property of disease names and the Hierarchy property of the disease classification system. The goal is to equip the models with extensive understanding of the disease names and the hierarchical structure of the disease name classification system. Through extensive experimentation, we illustrate that our proposed approach exhibits significant performance improvements across various baseline models and training objectives, particularly in scenarios with limited training data.
Autores: Wenqian Cui, Xiangling Fu, Shaohui Liu, Mingjun Gu, Xien Liu, Ji Wu, Irwin King
Última atualização: 2024-06-13 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2306.01931
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.01931
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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