Investigando Pleiotropia na Pesquisa sobre Comportamento de Fumar
Esse estudo analisa os efeitos da genética nos comportamentos de fumar, levando em conta a pleiotropia.
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Índice
A Randomização Mendeliana (MR) é um jeito de descobrir se uma coisa causa outra usando informações genéticas. Ela analisa marcadores genéticos específicos, chamados SNPS, pra ver se eles têm relação com certos comportamentos ou resultados de saúde. Quando os pesquisadores têm dados de estudos grandes, eles podem usar MR pra investigar essas conexões.
Uma ideia principal por trás da MR é que os SNPs estão ligados ao resultado só por causa de uma causa específica. Se essa ideia estiver errada, pode gerar confusão, tornando os achados dos estudos de MR pouco confiáveis. Essa situação é chamada de pleiotropia, que significa que uma variante genética influencia várias características.
Tipos de Pleiotropia
A pleiotropia pode ser de dois tipos: vertical e horizontal.
- Pleiotropia Vertical: Isso acontece quando um SNP afeta o resultado através de outra característica que está no meio. Normalmente, isso não é um problema pra MR.
- Pleiotropia Horizontal: Isso ocorre quando o SNP está relacionado ao resultado por mais de um caminho. A pleiotropia horizontal pode ser balanceada, onde um efeito cancela o outro, ou desbalanceada, onde um efeito domina. A pleiotropia horizontal desbalanceada é um baita problema pra MR porque pode levar a conclusões erradas.
Um caso especial de pleiotropia horizontal inclui pleiotropia horizontal correlacionada, onde um SNP afeta um fator comum que também influencia tanto a exposição quanto o resultado. Isso pode complicar ainda mais os resultados.
A Importância de Identificar Pleiotropia
Quando estuda os efeitos de comportamentos como fumar, é crucial determinar se os SNPs usados pra entender o comportamento estão realmente apontando apenas pra fumar ou se também estão afetando outras características. Se for o segundo caso, os dados podem não refletir com precisão os efeitos de fumar.
Pesquisas mostraram que SNPs relacionados a Comportamentos de Fumar podem ter conexões com várias outras características que não têm relação com fumar, como personalidade e comportamentos de risco. Portanto, identificar pleiotropia é fundamental pra garantir que os achados dos estudos de MR sejam válidos.
Nosso Estudo Sobre Comportamentos de Fumar
Focamos nos comportamentos de fumar pra ver se a pleiotropia horizontal afetou nossos achados. Especificamente, examinamos se características que poderiam ser afetadas por fumar ou aquelas que poderiam não estar ligadas a fumar estavam associadas a escores genéticos para comportamentos de fumar, incluindo início do fumo, intensidade do fumo e um índice de fumo ao longo da vida.
Usamos dois grupos pra nossa análise: o UK Biobank e o Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC). Esses grupos forneceram diferentes tipos de dados que ajudaram a identificar possíveis viéses.
Além disso, realizamos análises em pessoas que nunca fumaram pra servir como controle. Nessas pessoas, qualquer associação entre dados genéticos e resultados não poderia ter vindo do ato de fumar.
Metodologia da Pesquisa
Nossa pesquisa consistiu de duas fases principais:
Fase de Descoberta: Fizemos um estudo pra descobrir como diferentes características estavam associadas ao início do fumo. Analisamos os principais resultados pra encontrar características que poderiam estar ligadas a fumar ou aquelas que definitivamente não estariam.
Fase de Análise: Testamos nossos achados do UK Biobank contra dados do ALSPAC pra ver se nossos resultados se mantinham.
Coortes do Estudo
UK Biobank: É um grande recurso de saúde com cerca de 500.000 participantes. Coleta uma variedade de dados, incluindo informações de saúde, estilo de vida e demografia. Todos os participantes relataram sua etnia, que restringimos a aqueles que se identificaram como 'Brancos' e 'Britânicos' para nossa análise.
ALSPAC: Este estudo analisou mulheres grávidas em Avon, UK, e acompanhou seus filhos. Envolveu um grupo menor em comparação ao UK Biobank, mas forneceu insights valiosos pra nossa pesquisa.
Medidas Fenotípicas para Exposições Relacionadas ao Fumo
Em nossas análises, consideramos três comportamentos relacionados ao fumo:
- Início do Fumo: Se alguém já fumou ou não.
- Intensidade do Fumo: O número médio de cigarros fumados por dia.
- Índice de Fumo ao Longo da Vida: Um sistema de pontuação pra avaliar o comportamento de fumar.
Essas medidas ajudaram a avaliar tanto as associações positivas quanto negativas com diferentes características.
Achados da Fase de Descoberta
Na fase de descoberta, identificamos características ligadas ao início do fumo e começamos a fazer distinções entre as características que poderiam plausivelmente resultar do fumo e aquelas que poderiam não.
Características Provavelmente Causadas pelo Fumo
Identificamos treze características que provavelmente foram afetadas pelo fumo. Isso incluiu vários marcadores de saúde e condições, como Índice de Massa Corporal (IMC), doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC) e níveis de proteína C-reativa. Essas condições são geralmente consideradas influenciadas diretamente pelo fumo.
Características Provavelmente Não Causadas pelo Fumo
Também identificamos treze características que não deveriam ser afetadas pelo fumo. Essas incluíram o número de parceiros sexuais, idade na primeira gravidez, comportamentos de risco e mais. A distinção entre esses dois grupos foi crucial pra entender a potencial presença de pleiotropia.
Resultados das Associações
Características Plausivelmente Causadas pelo Fumo
Nas nossas análises, encontramos associações fortes entre nossos escores genéticos para comportamentos de fumar e as características que acreditávamos poderem ser causadas pelo fumo. Notavelmente, tanto os escores de início do fumo quanto os de fumo ao longo da vida mostraram ligações significativas com problemas de saúde frequentemente conectados ao fumo.
Características Não Plausivelmente Causadas pelo Fumo
Quando examinamos características que não deveriam ser afetadas pelo fumo, ainda encontramos associações com escores genéticos para fumo ao longo da vida e início do fumo. Isso foi preocupante porque indicou que os SNPs poderiam estar influenciando características não ligadas ao fumo.
Notavelmente, não encontramos nenhuma associação para nunca fumantes com a intensidade do fumo, sugerindo que os efeitos capturados por essa medida eram menos propensos a estar relacionados a outras características.
Achados da Fase de Análise no ALSPAC
No ALSPAC, também analisamos as mesmas relações pra ver se nossos achados eram consistentes. Encontramos algumas semelhanças, mas também várias diferenças.
Características Plausivelmente Causadas pelo Fumo
No ALSPAC, foram encontradas menos associações entre nossos escores genéticos e as características plausivelmente causadas pelo fumo em comparação ao UK Biobank. No entanto, conseguimos replicar algumas associações chave, incluindo aquelas relacionadas ao IMC e chiado em mães.
Características Não Plausivelmente Causadas pelo Fumo
Semelhante aos nossos achados no UK Biobank, identificamos várias associações entre escores genéticos para fumo ao longo da vida e características que não foram plausivelmente causadas pelo fumo no ALSPAC. Essas incluíram características relacionadas a estilo de vida e comportamentos.
Implicações dos Nossos Achados
Nossos resultados indicam que provavelmente há pleiotropia horizontal entre os escores genéticos para características relacionadas ao fumo. Isso significa que, quando usamos dados genéticos relacionados ao fumo em estudos, precisamos ser cautelosos em relação a possíveis interpretações erradas.
Além disso, nossa análise sugere que os SNPs que analisamos podem estar influenciando outras características, o que pode levar a conclusões incorretas. Isso reforça a importância de considerar cuidadosamente os caminhos pelos quais variantes genéticas afetam características.
Limitações do Nosso Estudo
Várias limitações devem ser reconhecidas em nossa pesquisa. Por um lado, a amostra do UK Biobank pode não representar a população geral devido a um viés de seleção. Os participantes tendem a ser mais saudáveis que a média, o que pode distorcer os resultados. Além disso, os métodos que usamos pra classificar comportamentos de fumar podem não capturar a gama completa de como os indivíduos se identificam como fumantes.
Além disso, algumas associações poderiam ser explicadas por fatores genéticos compartilhados entre características, o que complica a compreensão das conexões.
Conclusões
Nosso estudo fornece evidências de pleiotropia horizontal nos instrumentos genéticos usados pra características relacionadas ao fumo. Isso sugere que os pesquisadores precisam abordar suas análises com cautela, já que os SNPs podem estar capturando influências além do simples fumar.
À medida que os estudos examinando características complexas se expandem, é crucial que os pesquisadores apliquem métodos pra levar em conta a potencial pleiotropia. Fazendo isso, eles podem garantir que as conclusões tiradas de seus estudos sejam mais precisas e confiáveis.
Pesquisas futuras devem considerar incorporar análises de controle negativas pra refinar ainda mais as interpretações. Nossos achados destacam a necessidade de uma exploração contínua sobre como variantes genéticas influenciam uma gama de comportamentos e resultados além dos seus alvos pretendidos.
Título: Exploring pleiotropy in Mendelian randomisation analyses: What are genetic variants associated with "cigarette smoking initiation" really capturing?
Resumo: BackgroundGenetic variants used as instruments for exposures in Mendelian randomisation (MR) analyses may also have horizontal pleiotropic effects (i.e., influence outcomes via pathways other than through the exposure), which can undermine the validity of results. We examined the extent to which horizontal pleiotropy may be present, using smoking behaviours as an example. MethodsWe first ran a phenome-wide association study in UK Biobank, using a genetic instrument for smoking initiation. From the most strongly associated phenotypes, we selected those that we considered could either plausibly or not plausibly be caused by smoking. We next examined the association between genetic instruments for smoking initiation, smoking heaviness and lifetime smoking and these phenotypes in both UK Biobank and the Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC). We conducted negative control analyses among never smokers, including children in ALSPAC. ResultsWe found evidence that smoking-related genetic instruments (mainly for smoking initiation and lifetime smoking) were associated with phenotypes not plausibly caused by smoking in UK Biobank and (to a lesser extent) ALSPAC, although this may reflect the much smaller sample size in ALSPAC. We also observed associations with several phenotypes among never smokers. ConclusionOur results suggest that genetic instruments for smoking-related phenotypes demonstrate horizontal pleiotropy. When using genetic variants - particularly those for complex behavioural exposures - in genetically-informed causal inference analyses (e.g., MR) it is important to include negative control outcomes where possible, and other triangulation approaches, to avoid arriving at incorrect conclusions.
Autores: Zoe E Reed, R. E. Wootton, J. N. Khouja, T. G. Richardson, E. G. Sanderson, G. Davey Smith, M. R. Munafo
Última atualização: 2023-08-08 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.04.23293638
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.04.23293638.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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Ligações de referência
- https://doi.org/10.17605/OSF.IO/37XYN
- https://www.bristol.ac.uk/alspac/researchers/our-data/
- https://www.bristol.ac.uk/alspac/researchers/research-ethics/
- https://conservancy.umn.edu/handle/11299/201564
- https://research.23andme.com/collaborate/#dataset-access/
- https://www.bristol.ac.uk/alspac/researchers/access/
- https://www.ukbiobank.ac.uk/using-the-resource/
- https://data.bris.ac.uk/data/
- https://www.bristol.ac.uk/alspac/external/documents/grant-acknowledgements.pdf