Simple Science

Ciência de ponta explicada de forma simples

# Informática# Visão computacional e reconhecimento de padrões# Aprendizagem de máquinas

Abordagens Inovadoras para Análise de Imagens Médicas

Usando a composicionalidade pra melhorar o aprendizado de máquina em imagens médicas.

― 8 min ler


Avanço das Técnicas deAvanço das Técnicas deAnálise de Imagensmétodos inovadores de machine learning.Transformando a imagem médica com
Índice

Na imagem médica, entender imagens como ressonâncias magnéticas (MRI) e tomografias computadorizadas (CT) de forma rápida e precisa é fundamental para o diagnóstico e tratamento. Enquanto as máquinas podem analisar essas imagens usando aprendizado profundo, elas costumam depender de muitos dados rotulados para aprender de forma eficaz. Em contrapartida, os humanos conseguem identificar estruturas importantes nessas imagens com muito menos ajuda. Essa habilidade de aprender rápido e se adaptar a novas imagens se deve à forma como nossos cérebros processam padrões visuais. Os modelos atuais de aprendizado de máquina ainda não conseguem replicar totalmente essa capacidade.

Esse artigo explora uma nova abordagem para melhorar como as máquinas aprendem a analisar imagens médicas, usando o conceito de Composicionalidade. Composicionalidade refere-se à ideia de que padrões complexos podem ser entendidos como combinações de elementos mais simples. No nosso caso, usamos isso para desenvolver modelos que podem generalizar melhor em diferentes tarefas de imagem médica. O objetivo final é criar modelos que consigam identificar efetivamente estruturas anatômicas em vários cenários de imagem com menos esforço de rotulagem.

A Importância da Composicionalidade na Imagem Médica

Ao analisar imagens médicas, os modelos de aprendizado profundo precisam de grandes quantidades de dados rotulados para treinar corretamente. Porém, os humanos podem aprender rapidamente a identificar a anatomia crucial com uma orientação mínima. Essa diferença destaca a necessidade de novos métodos que imitem as capacidades humanas no reconhecimento de imagens. A composicionalidade pode ajudar a melhorar o processo de aprendizado, permitindo que os modelos utilizem partes mais simples identificáveis das imagens e as combinem em um todo. Por exemplo, se um modelo aprende características relacionadas ao coração, ele pode aplicar esse conhecimento ao identificar o coração em novas imagens.

A composicionalidade também ajuda a tornar o processo de aprendizado mais inteligível, permitindo que a gente entenda quais características os modelos estão focando. Essa interpretabilidade é crítica em aplicações médicas, onde entender as decisões do modelo pode guiar práticas clínicas.

No trabalho, focamos em uma propriedade chamada equivariância composicional. Essa propriedade sugere que as representações aprendidas por um modelo deveriam mudar de uma maneira previsível quando as características anatômicas correspondentes nas imagens mudam. Ao garantir que os modelos sigam a composicionalidade, nosso objetivo é melhorar o desempenho deles na identificação de estruturas anatômicas.

Metodologia

Para estudar como a composicionalidade pode ser usada na segmentação de imagens médicas, propomos um framework baseado em núcleos von-Mises-Fisher (vMF) aprendíveis. Esse framework busca garantir que as representações criadas pelo modelo reflitam a estrutura composicional das imagens. Planejamos examinar como diferentes abordagens de aprendizado podem ajudar a impor a equivariância composicional em vários ambientes de treinamento.

Categorizamos os cenários em três tipos: Não supervisionado, fraco supervisionado e semi-supervisionado. Cada cenário será estudado para ver como bem os modelos conseguem aprender a identificar os componentes das imagens médicas.

Cenário Não Supervisionado

Em um cenário não supervisionado, o modelo aprende sem dados rotulados. O objetivo é identificar agrupamentos dos dados que compartilham características comuns. Aplicando uma abordagem de agrupamento, o modelo pode alinhar as representações aprendidas com os pontos centrais desses agrupamentos. Embora inicialmente não saiba características anatômicas específicas, ainda pode começar a descobrir relações entre os pontos de dados com base em suas semelhanças.

Cenário Fraco Supervisionado

Em um cenário fraco supervisionado, rótulos parciais são fornecidos. Por exemplo, o modelo pode saber apenas se um certo componente, como o coração, está presente em uma imagem. Essa informação extra ajuda o modelo a aprender representações que se correlacionam com a presença ou ausência de órgãos. Assim, o modelo pode começar a identificar características específicas mesmo com orientação limitada.

Cenários Semi-supervisionados

A abordagem semi-supervisionada permite que o modelo utilize tanto dados rotulados quanto não rotulados durante o treinamento. Por exemplo, o modelo pode aprender a partir de uma pequena quantidade de imagens rotuladas enquanto também aproveita muitas imagens não rotuladas. Esse cenário permite que o modelo capture melhor as relações entre diferentes pontos de dados, melhorando o desempenho geral na identificação de estruturas anatômicas.

Além disso, exploramos a supervisão pseudo cruzada, onde dois modelos são treinados juntos, com um usando as previsões do outro como guia. Esse método colaborativo ajuda a refinar o processo de aprendizado e fornece insights adicionais sobre as representações de características.

Construindo os Modelos

Para implementar nosso framework, começamos desenhando modelos que podem extrair características das imagens médicas. Os modelos utilizam os núcleos vMF para representar as características profundas em um espaço de menor dimensão. Cada posição na imagem corresponde a um vetor de características que pode ser transformado com base nas representações aprendidas.

O processo de extração envolve identificar componentes anatômicos relevantes para que o modelo aprenda quais características correspondem a estruturas específicas. Essa abordagem ajuda o modelo a desenvolver uma compreensão mais clara das imagens.

Uma vez que as características são extraídas, aplicamos procedimentos de treinamento nos vários cenários mencionados antes. Ao combinar dados rotulados com processos de agrupamento e ativação, criamos um modelo que pode prever efetivamente máscaras de segmentação para diferentes componentes anatômicos.

Avaliação do Desempenho do Modelo

Para avaliar a eficácia dos nossos modelos, realizamos extensos experimentos em vários conjuntos de dados de imagem médica. Nossa avaliação inclui comparar os modelos propostos com métodos de referência robustos que se mostraram eficazes em tarefas semelhantes.

Durante a avaliação, observamos várias métricas de desempenho, incluindo índices de Dice e distâncias de Hausdorff, que medem a precisão da segmentação. Índices mais altos indicam melhor desempenho na identificação correta das estruturas anatômicas nas imagens.

Resultados dos Experimentos

Nos experimentos, modelos que utilizam a abordagem de composicionalidade demonstraram desempenho significativamente melhor em diferentes cenários. Por exemplo, modelos treinados no cenário semi-supervisionado superaram consistentemente aqueles em condições totalmente supervisionadas, especialmente quando os dados rotulados eram limitados.

Os resultados também mostraram que modelos que se beneficiaram de supervisão fraca e da presença de informações estruturais tiveram resultados comparáveis aos treinados com conjuntos de dados rotulados mais extensos. Essa descoberta apoia a hipótese de que incorporar a composicionalidade no processo de aprendizado permite que o modelo generalize melhor em várias tarefas e conjuntos de dados.

Interpretabilidade e Generalização

Um aspecto chave da nossa abordagem é quão bem as representações aprendidas pelos modelos podem ser interpretadas. Depois do treinamento, examinamos quais características foram ativadas para diferentes imagens médicas. Descobrimos que as ativações eram realmente mais interpretáveis do que em modelos tradicionais, ou seja, conseguimos rastrear as decisões do modelo para padrões anatômicos específicos.

Essa interpretabilidade é crucial porque permite que profissionais da saúde entendam e confiem nas previsões do modelo. Além disso, aumenta a confiabilidade geral dos sistemas automatizados nas práticas clínicas.

Em termos de generalização, os modelos mostraram bom desempenho em múltiplos conjuntos de dados com condições variadas. Por exemplo, mesmo quando as imagens vinham de diferentes instituições médicas ou continham diferentes doenças, os modelos treinados usando representações composicionais ainda identificavam efetivamente a anatomia relevante.

Conclusão

Em resumo, este trabalho demonstra como alavancar a composicionalidade pode melhorar significativamente a análise de imagens médicas. Ao desenvolver modelos que utilizam a equivariância composicional, conseguimos um bom desempenho em várias configurações, incluindo aprendizado não supervisionado, fraco supervisionado e semi-supervisionado.

Nossas descobertas sugerem que aumentar a capacidade dos modelos de entender e processar estruturas anatômicas por meio de representações composicionais leva a uma melhor precisão e interpretabilidade. À medida que o campo de imagem médica continua a evoluir, adotar essas técnicas promete melhorar processos de diagnóstico e aprimorar o cuidado com os pacientes.

Pesquisas futuras devem focar em refinar ainda mais esses modelos e explorar suas aplicações em diferentes tarefas de imagem médica. Os insights obtidos a partir deste trabalho podem abrir caminho para sistemas mais sofisticados que ajudem profissionais de saúde a oferecer diagnósticos rápidos e precisos.

Fonte original

Título: Compositionally Equivariant Representation Learning

Resumo: Deep learning models often need sufficient supervision (i.e. labelled data) in order to be trained effectively. By contrast, humans can swiftly learn to identify important anatomy in medical images like MRI and CT scans, with minimal guidance. This recognition capability easily generalises to new images from different medical facilities and to new tasks in different settings. This rapid and generalisable learning ability is largely due to the compositional structure of image patterns in the human brain, which are not well represented in current medical models. In this paper, we study the utilisation of compositionality in learning more interpretable and generalisable representations for medical image segmentation. Overall, we propose that the underlying generative factors that are used to generate the medical images satisfy compositional equivariance property, where each factor is compositional (e.g. corresponds to the structures in human anatomy) and also equivariant to the task. Hence, a good representation that approximates well the ground truth factor has to be compositionally equivariant. By modelling the compositional representations with learnable von-Mises-Fisher (vMF) kernels, we explore how different design and learning biases can be used to enforce the representations to be more compositionally equivariant under un-, weakly-, and semi-supervised settings. Extensive results show that our methods achieve the best performance over several strong baselines on the task of semi-supervised domain-generalised medical image segmentation. Code will be made publicly available upon acceptance at https://github.com/vios-s.

Autores: Xiao Liu, Pedro Sanchez, Spyridon Thermos, Alison Q. O'Neil, Sotirios A. Tsaftaris

Última atualização: 2023-06-17 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2306.07783

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.07783

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

Obrigado ao arxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.

Mais de autores

Artigos semelhantes