Melhorando o Registro de Imagens Médicas com Nuvens de Pontos
Novos métodos melhoram a precisão na alocação de nuvens de pontos médicos ao longo do tempo.
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Índice
O registro de imagens médicas é um processo onde imagens de diferentes momentos ou fontes são alinhadas para corresponder umas às outras. Isso pode ajudar os médicos a ver as mudanças na condição de um paciente ao longo do tempo. Uma forma de fazer isso é usando Nuvens de Pontos, que são coleções de pontos que representam as formas de objetos em um espaço tridimensional. Essas nuvens de pontos podem trazer vantagens como processamento mais rápido, proteção da identidade do paciente e serem menos afetadas por mudanças na luminosidade da imagem.
No entanto, usar nuvens de pontos não é sem desafios. Os métodos tradicionais costumam depender de imagens com muitos dados, o que pode gerar problemas ao tentar alinhar as nuvens de pontos mais simples. Para superar isso, os pesquisadores têm explorado como usar aprendizado de máquina, especificamente técnicas de Adaptação de Domínio, para melhorar o processo de alinhamento de nuvens de pontos.
Desafios no Registro de Nuvens de Pontos
As nuvens de pontos não vêm com dados de verdade, o que significa que é difícil saber se o alinhamento está correto. Essa falta de informação dificulta o treinamento de modelos usando aprendizado não supervisionado, onde o modelo aprende a partir dos dados sem exemplos rotulados. Em vez disso, os pesquisadores costumam criar Dados Sintéticos que simulam como as nuvens de pontos pareceriam sob certas condições. No entanto, há uma diferença notável entre dados sintéticos e dados do mundo real, o que pode afetar o desempenho ao tentar alinhar nuvens de pontos de pacientes reais.
Usar dados sintéticos é uma abordagem comum, mas também tem limitações. Em particular, a diferença entre dados sintéticos e reais pode levar a resultados menos precisos ao alinhar nuvens de pontos. É aí que a adaptação de domínio entra em cena. A adaptação de domínio tem como objetivo tornar os modelos melhores em trabalhar com dados reais, treinando-os em uma mistura de exemplos sintéticos e reais.
A Abordagem Mean Teacher
Um método que tem sido usado para adaptação de domínio em várias tarefas é conhecido como a abordagem Mean Teacher. Esse método consiste em dois modelos: um modelo aluno e um modelo professor. O modelo aluno aprende a partir dos dados, enquanto o modelo professor é uma versão mais lenta do aluno que fornece orientações. As previsões do professor devem ser mais estáveis, pois são baseadas em uma média das previsões anteriores do aluno.
No entanto, essa abordagem tem uma limitação significativa: as previsões feitas pelo professor podem ser ruidosas. Se o professor comete um erro, isso pode enganar o modelo aluno, fazendo-o aprender informações incorretas. Isso é particularmente problemático em aplicações médicas, onde a precisão é crucial.
Estratégias para Melhoria
Para superar os desafios impostos pelas previsões ruidosas do modelo professor, novas estratégias foram introduzidas. O objetivo é melhorar a forma como o professor e o aluno interagem durante o processo de treinamento.
Filtrando Previsões do Professor
A primeira estratégia envolve filtrar as previsões do professor com base em sua qualidade. Em vez de considerar todas as previsões do professor, o sistema avalia o quão bem as previsões do professor se comparam aos resultados reais em relação às previsões do aluno. Se a previsão do professor for pior que a do aluno, ela não é usada para guiar o aluno. Essa filtragem garante que apenas as previsões mais precisas do professor sejam usadas para supervisão, reduzindo o risco de o aluno aprender com orientações ruins.
Essa abordagem se baseia em uma medida chamada Distância Chamfer, que analisa quão bem o professor e o aluno alinham as nuvens de pontos. Usando essa medida, o sistema pode escolher as melhores previsões do professor, garantindo que o aluno aprenda a partir das informações mais precisas disponíveis.
Sintetizando Novos Dados de Treinamento
A segunda estratégia introduz um novo conceito onde o professor não apenas fornece previsões, mas também gera novos dados de treinamento. Quando o professor faz previsões sobre como mover os pontos na nuvem de pontos, ele pode criar novos pares de nuvens de pontos que estão alinhados com movimentos conhecidos e precisos. Esses novos pares criados são usados para treinar o aluno, fornecendo rótulos sem ruídos para ele aprender.
Essa abordagem leva a uma experiência de treinamento mais realista, já que os novos pares de dados estão diretamente relacionados aos dados originais. O aluno pode então aprender com esses exemplos mais limpos, tornando o processo de treinamento mais eficaz.
Avaliação Experimental
Os métodos propostos foram testados em uma tarefa médica específica: alinhar nuvens de pontos de vasos pulmonares capturadas durante diferentes fases da respiração (inspirar e expirar). Um conjunto de dados público amplamente utilizado de nuvens de pontos de vasos pulmonares serviu como base para esses testes. Esse conjunto de dados tem uma variedade de pares de dados que foram usados para ver como os métodos funcionaram em diferentes condições.
Os experimentos mostraram que as novas estratégias melhoraram significativamente o desempenho da abordagem Mean Teacher tradicional. Ao filtrar as previsões do professor e gerar novos pares de dados de treinamento, o método alcançou melhor precisão no registro de nuvens de pontos. De fato, as melhorias foram tão substanciais que o novo método estabeleceu um recorde de precisão nessa área de pesquisa.
Vantagens do Novo Método
A abordagem apresentada oferece várias vantagens. Primeiro, aborda as limitações dos métodos anteriores que dependiam muito de dados sintéticos. Ao usar estratégias para filtrar previsões ruins e gerar dados de treinamento realistas, o novo método preenche a lacuna entre dados sintéticos e dados do mundo real.
Além disso, esse método elimina a necessidade de designs complicados destinados a criar tipos específicos de transformações de dados. Em vez disso, utiliza uma abordagem mais geral que poderia ser aplicada a diferentes tipos de estruturas médicas, além de apenas vasos pulmonares.
Direções Futuras
Embora o método atual mostre grande potencial, ainda há áreas para melhoria e mais pesquisa. Uma direção empolgante é a possibilidade de aplicar essas estratégias a outras estruturas anatômicas. As técnicas aprendidas com o registro de vasos pulmonares poderiam ser adaptadas de maneira benéfica para outras áreas, como o abdômen ou o cérebro.
Além disso, esse método pode inspirar aprimoramentos no registro de imagens densas, onde dados baseados em imagens mais tradicionais são usados. Combinar os pontos fortes dos métodos de nuvens de pontos com abordagens baseadas em imagens pode levar a novos avanços no campo de imagens médicas e registro.
Conclusão
Resumindo, alinhar nuvens de pontos é uma tarefa importante em imagens médicas que enfrenta vários desafios. Ao aproveitar técnicas de adaptação de domínio, especificamente a abordagem Mean Teacher, e introduzir novas maneiras de filtrar previsões e sintetizar dados de treinamento, melhorias substanciais podem ser feitas. Os resultados dos experimentos demonstram a eficácia desses métodos, estabelecendo novos padrões de precisão enquanto mantêm a capacidade de processamento rápido.
À medida que o campo continua a evoluir, esses avanços abrem portas para melhorias em como os profissionais de saúde analisam e interpretam os dados dos pacientes, levando, em última análise, a melhores resultados para os pacientes.
Título: A denoised Mean Teacher for domain adaptive point cloud registration
Resumo: Point cloud-based medical registration promises increased computational efficiency, robustness to intensity shifts, and anonymity preservation but is limited by the inefficacy of unsupervised learning with similarity metrics. Supervised training on synthetic deformations is an alternative but, in turn, suffers from the domain gap to the real domain. In this work, we aim to tackle this gap through domain adaptation. Self-training with the Mean Teacher is an established approach to this problem but is impaired by the inherent noise of the pseudo labels from the teacher. As a remedy, we present a denoised teacher-student paradigm for point cloud registration, comprising two complementary denoising strategies. First, we propose to filter pseudo labels based on the Chamfer distances of teacher and student registrations, thus preventing detrimental supervision by the teacher. Second, we make the teacher dynamically synthesize novel training pairs with noise-free labels by warping its moving inputs with the predicted deformations. Evaluation is performed for inhale-to-exhale registration of lung vessel trees on the public PVT dataset under two domain shifts. Our method surpasses the baseline Mean Teacher by 13.5/62.8%, consistently outperforms diverse competitors, and sets a new state-of-the-art accuracy (TRE=2.31mm). Code is available at https://github.com/multimodallearning/denoised_mt_pcd_reg.
Autores: Alexander Bigalke, Mattias P. Heinrich
Última atualização: 2023-07-04 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2306.14749
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.14749
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
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