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Edição de Genes em Samambaias: Avançando a Pesquisa em Plantas

Este estudo detalha um novo método de edição gênica para a samambaia C. richardii.

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As samambaias são um tipo de planta que apareceu na Terra há cerca de 360 milhões de anos. Elas fazem parte de um grupo grande de plantas vasculares, ou seja, têm um sistema para transportar água e nutrientes. As samambaias são o segundo maior grupo de plantas vasculares, depois das plantas com flores, com mais de 10.500 espécies diferentes. Essas várias espécies desempenham um papel importante na manutenção da diversidade vegetal e no apoio a muitos ecossistemas.

As samambaias desenvolveram várias características únicas que tornam interessante seu estudo. Pesquisadores em áreas como genômica, evolução, ecologia, biologia molecular e fisiologia acham as samambaias valiosas para entender como as plantas se adaptam aos seus ambientes. Alguns genes específicos nas samambaias ajudam a resistir a desafios de outros organismos e a lidar com condições ambientais que mudam, como secas ou temperaturas extremas. Muitas samambaias também têm propriedades úteis para a medicina tradicional, sendo usadas para tratar questões de saúde comuns como febres e dores, devido aos compostos benéficos que possuem.

O Papel do CRISPR/Cas na Pesquisa com Plantas

Nos últimos anos, os cientistas têm usado cada vez mais uma técnica chamada CRISPR/Cas para edição genética em plantas. Esse método é popular devido à sua simplicidade e eficácia. O CRISPR/Cas funciona criando mudanças direcionadas no DNA de uma planta. Os cientistas podem usar essa tecnologia para editar genes específicos em várias plantas, desenvolvendo novas variedades com características desejadas, enfrentando menos desafios regulatórios em comparação com os organismos geneticamente modificados (OGMs) tradicionais.

Por exemplo, pesquisadores aplicaram com sucesso o CRISPR/Cas para aumentar o peso dos grãos de arroz, criar trigo com baixo teor de glúten e melhorar a resistência a doenças em tomates. Na última década, mais de 130 espécies de plantas verdes foram modificadas usando essa técnica. No entanto, é importante notar que nenhuma espécie de samambaia foi editada com CRISPR/Cas até agora.

Focando na Ceratopteris Richardii

A Ceratopteris richardii é uma samambaia tropical pequena e de crescimento rápido que tem sido usada como espécie modelo por muitos anos. Sua transformação genética foi estudada para explorar áreas importantes como determinação sexual, estrutura do genoma e biologia do desenvolvimento.

Enquanto os pesquisadores avançaram na transformação de outros tipos de plantas, conseguir mudanças genéticas bem-sucedidas em samambaias se mostrou desafiador. Vários métodos para transformar gametófitos de samambaias foram desenvolvidos, mas essas técnicas costumam depender de métodos projetados para plantas com flores. Portanto, criar um protocolo eficiente de edição genética para samambaias como a C. richardii é crucial.

Uma enzima, a SAL1, desempenha um papel significativo em como as plantas respondem ao estresse ambiental. Ela ajuda as plantas a gerenciar suas reações à seca e outros desafios. Pesquisas mostraram que manipular a SAL1 pode afetar a tolerância à seca nas plantas. Embora os cientistas tenham descoberto que o gene SAL1 na C. richardii responde a estresses ambientais, sua função não foi totalmente testada por meio de engenharia genética até agora.

Estabelecendo uma Plataforma de Edição Genética

Neste estudo, focamos em criar um sistema eficiente de edição genética para a C. richardii. Trabalhamos para melhorar os métodos de direcionamento e edição de genes usando a tecnologia CRISPR/Cas9. Ao editar com sucesso múltiplos genes na C. richardii, esperamos entender melhor suas funções e características.

Selecionamos genes específicos para edição, incluindo o CrSAL1, que está ligado a processos importantes como a Troca Gasosa nas plantas. Ao desativar ou superexpressar o CrSAL1, observamos mudanças em características relacionadas ao comportamento e crescimento da planta. Nossos resultados mostram que usar a técnica CRISPR/Cas9 em samambaias pode melhorar significativamente nossa capacidade de estudar sua biologia e aprimorar seu cultivo para várias finalidades.

Escolhendo a Espécie de Samambaia e Estágios de Desenvolvimento Certos

Recentemente, os cientistas montaram genomas de referência de alta qualidade para várias espécies de samambaias. Esses genomas fornecem informações valiosas que podem ajudar os pesquisadores a investigar funções específicas de genes em samambaias. Entre os métodos existentes para transformar espécies de samambaias, a C. richardii mostrou ser a candidata mais adequada para estabelecer um protocolo de edição genética.

As samambaias têm um ciclo de vida único que inclui estágios distintos: o gametófito haploide e o esporófito diploide. Cada um desses estágios desempenha um papel crítico na reprodução e desenvolvimento das samambaias. Entender esse ciclo de vida ajuda a otimizar os esforços de transformação genética na C. richardii.

O Ciclo de Vida da C. richardii

Na espécie de samambaia, o ciclo de vida começa quando esporos haploides germinam no gametófito. Essa estrutura pode se desenvolver em formas masculinas ou hermafroditas. Uma vez que a fertilização ocorre, forma-se um zigoto diploide, dando origem a um esporófito, que é a geração dominante das samambaias. O esporófito produz esporos que reiniciam o ciclo.

Esse ciclo de vida oferece oportunidades para os pesquisadores usarem gametófitos na transformação genética. Ao contrário das plantas com flores que dependem principalmente de embriões ou tecidos de calos, usar gametófitos permite um acesso mais fácil a um número maior de materiais iniciais para a transformação.

Componentes Chave para Edição Genética

Para usar efetivamente o sistema CRISPR/Cas9 na edição genética da C. richardii, focamos na seleção de promotores apropriados para impulsionar a expressão gênica. Promotores são essenciais, pois controlam a expressão dos genes nas plantas.

Encontramos vários promotores potenciais no genoma da C. richardii. Identificamos genes de RNA nuclear pequeno U6, que mostraram altos níveis de expressão em diferentes partes da planta. No entanto, esses genes não se encaixaram nas características estruturais típicas de promotores eficazes, levando-nos a considerar alternativas.

Na nossa abordagem, também testamos um promotor de Actina que mostrou funcionar bem em outras espécies de samambaias. Substituímos os promotores padrão no nosso sistema de edição genética por esses novos identificados para aumentar a expressão gênica na C. richardii.

Melhorando o Processo de Transformação

Depois de identificar promotores adequados, trabalhamos para otimizar o processo de transformação dos gametófitos da C. richardii. Ajustamos fatores como duração do tratamento com enzimas, tempos de co-incubação e concentrações de antibióticos para crescimento seletivo. Fazendo esses ajustes, conseguimos aumentar as chances de obter transformantes positivos.

Nossos esforços iniciais focaram na edição do gene CrSAL1 enquanto refinávamos os parâmetros para a transformação. Um entendimento abrangente da via de sinalização SAL1-PAP nas plantas, que está conectada à abertura e fechamento estomatal, guiou nossos esforços para entender como manipular o CrSAL1 poderia impactar as características da planta.

Análise Molecular das Plantas Transgênicas

Nossos experimentos resultaram na geração bem-sucedida de plantas transgênicas exibindo níveis de expressão alterados do CrSAL1. Avaliamos a presença das mudanças genéticas desejadas realizando reações em cadeia da polimerase (PCRs) e avaliando os níveis de expressão dos genes. Através desse método, identificamos vários indivíduos Transgênicos positivos, ao mesmo tempo em que medimos sua capacidade de crescer e completar seus ciclos de vida.

A eficiência da transformação, uma medida de quantas plantas incorporaram com sucesso os genes desejados, variou nos nossos testes. No entanto, conseguimos uma eficiência geral que mostra potencial para edição genética na C. richardii.

Triagem para Linhas de Knockout de Genes

Assim que estabelecemos um método de transformação confiável para superexpressar genes-alvo, voltamos nossa atenção para criar linhas knockout usando o sistema CRISPR/Cas9 na C. richardii. Um dos nossos alvos foi o gene CrPDS, que é conhecido por causar mudanças visíveis específicas nas plantas quando mutado.

Geramos várias plantas transgênicas com versões editadas do gene CrPDS, e muitas exibiram as mudanças esperadas na coloração das folhas. Com a edição genética bem-sucedida, obtivemos insights valiosos sobre a eficiência da edição e as possíveis aplicações dessa técnica em samambaias.

Avaliação Fisiológica das Plantas Transgênicas

Para avaliar melhor os efeitos de nossas modificações genéticas, estudamos como a superexpressão e o knockout do CrSAL1 impactaram várias características fisiológicas na C. richardii. Focamos em parâmetros chave relacionados à saúde da planta, como troca gasosa e comportamento estomatal.

Nossos resultados revelaram que a superexpressão do CrSAL1 levou a um aumento na fotossíntese e melhorou as características estomatais em comparação com plantas selvagens. Em contrapartida, as linhas com o CrSAL1 desativado exibiram atividade fotossintética reduzida. No geral, essas descobertas sugerem que o CrSAL1 desempenha um papel significativo na melhoria das respostas das plantas às condições ambientais.

O Papel das Espécies Reativas de Oxigênio e Resposta ao ABA

Também investigamos como nossas mudanças genéticas afetaram a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) nas células estomáticas das plantas transgênicas. As ROS são importantes moléculas sinalizadoras que ajudam as plantas a responder ao estresse. Nossos dados indicaram que a edição do CrSAL1 alterou os níveis de ROS nas células estomáticas, impactando o comportamento estomatal sob diferentes condições, incluindo a presença do hormônio vegetal ácido abscísico (ABA).

Nossas descobertas sugerem que manipular o gene SAL1 influencia o delicado equilíbrio entre ROS e a resposta ao ABA, o que pode ter implicações para melhorar a tolerância ao estresse e a saúde geral das plantas.

Entendendo a Verificação Funcional de Genes em Samambaias

A aplicação da tecnologia CRISPR/Cas9 em samambaias é um desenvolvimento relativamente recente, e até nosso estudo, não houve tentativas bem-sucedidas de editar genes nessas plantas. Ao criar um método de edição genética eficaz para a C. richardii, abrimos novas oportunidades para explorar funções gênicas em samambaias.

Nossa pesquisa demonstra como modificar genes específicos pode levar a insights sobre respostas a estresses e adaptações em samambaias. Essas informações podem ajudar a avançar o conhecimento sobre a biologia das plantas e contribuir para melhorias agrícolas e aplicações medicinais.

Direções Futuras para a Pesquisa com Samambaias

Olhando para o futuro, prevemos que os métodos de edição genética estabelecidos na C. richardii possam ser adaptados para uso em outras espécies de samambaias. Ao aplicar essa tecnologia, os pesquisadores podem obter uma compreensão mais profunda dos papéis que vários genes desempenham no desenvolvimento das plantas, respostas ao estresse e processos evolutivos.

Em particular, as propriedades únicas dos gametófitos de samambaias podem ser aproveitadas para mais estudos sobre reprodução de plantas, resiliência em ambientes desafiadores e a evolução de características chave. À medida que continuamos a refinar nossos métodos e expandir nossa pesquisa, esperamos desbloquear novas descobertas que beneficiarão tanto a ciência quanto a sociedade.

Conclusão

Resumindo, nosso trabalho estabeleceu uma plataforma eficiente de edição genética para a samambaia C. richardii. Ao otimizar técnicas de transformação e editar com sucesso genes-chave, lançamos as bases para futuras pesquisas focadas em entender e aprimorar a biologia das samambaias. Isso avança não apenas nossa compreensão científica, mas também possíveis aplicações em agricultura e medicina, demonstrando a importância da pesquisa com plantas para enfrentar desafios globais.

Fonte original

Título: Efficient Gene Editing and Overexpression of Gametophyte Transformation in a Model Fern

Resumo: The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-related nuclease (Cas) system allows precise and easy editing of genes in many plant species. However, this system has not yet been applied to any fern species due to the complex characteristics of fern genomes, genetics and physiology. Here, we established, for the first time, a protocol for gametophyte-based screening single-guide RNAs (sgRNAs) with high efficiency for CRISPR/Cas-mediated gene editing in a model fern species, Ceratopteris richardii. We utilized the C. richardii Actin promoter to drive sgRNA expression and enhanced CaMV 35S promoter to drive the expression of Streptococcus pyogenes Cas9 in this CRISPR-mediated editing system, which was employed to successfully edit a few genes (e.g., nucleotidase/phosphatase 1, CrSAL1; Cryptochrome 4, CRY4) and CrPDS, encoding a phytoene desaturase protein that resulted in an albino phenotype in C. richardii. Knockout of CrSAL1 resulted in significantly reduced stomatal conductance (gs), leaf transpiration rate (E), stomatal/pore length, and abscisic acid (ABA)-induced reactive oxygen species (ROS) accumulation in guard cells. Moreover, CrSAL1 overexpressing plants showed significantly increased net photosynthetic rate (A), gs, E and intrinsic water use efficiency (iWUE) as well as most of the stomatal traits and ROS production in guard cells compared to those in the wild-type (WT) plants. Taken together, the optimized CRISPR/Cas9 system provides a useful tool for functional genomics in a model fern species, allowing the exploration of fern gene functions for evolutionary biology, herbal medicine discovery and agricultural applications.

Autores: Zhonghua Chen, W. Jiang, F. Deng, M. Babla, D. Yang, T. Tong, Y. Qin, B. Marchant, P. S. Soltis, D. Soltis, F. Zeng

Última atualização: 2024-04-11 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.10.588889

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.10.588889.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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