ARHGAP9: Um Marcador Potencial para ccRCC
Pesquisas mostram que o ARHGAP9 é um marcador promissor para o carcinoma renal de células claras.
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Índice
Carcinoma de células renais (CCR) é um dos tipos mais comuns de câncer no mundo todo. Dentre eles, o carcinoma de células claras (CCC) é o mais diagnosticado, contribuindo para um monte de mortes relacionadas ao câncer. Aproximadamente 30% dos pacientes com CCC têm câncer que já se espalhou para outras partes do corpo no momento do diagnóstico. A previsão ruim para o CCC se deve em parte a essa disseminação do câncer. Apesar dos tratamentos disponíveis para o CCC, os casos avançados continuam bem sérios, com apenas cerca de 10% dos pacientes sobrevivendo cinco anos após o diagnóstico. Esse tipo de câncer costuma resistir a tratamentos comuns como quimioterapia e radioterapia. Isso mostra a necessidade urgente de encontrar opções de tratamento melhores e novos marcadores que ajudem a diagnosticar e prever os resultados para os pacientes com CCC.
ARHGAP9 e Sua Importância
ARHGAP9 é um gene que regula várias funções importantes dentro das células, como crescimento, movimento e comunicação. Ele pertence a uma família de proteínas conhecidas como Rho GTPases, que funcionam como interruptores para controlar o comportamento celular. Quando essas proteínas ficam fora de balance, pode rolar o crescimento e a disseminação do câncer. Estudos recentes sugerem que mudanças nos níveis de ARHGAP9 podem estar ligadas a vários tipos de câncer. Porém, o papel específico dele no CCC não tinha sido explorado a fundo até agora. Este estudo foca em examinar o potencial do ARHGAP9 como um marcador importante para o CCC e entender como ele pode impactar os resultados dos pacientes.
Objetivos da Pesquisa
Os principais objetivos dessa pesquisa são:
- Analisar a expressão de ARHGAP9 em pacientes com CCC e sua relação com os resultados dos pacientes.
- Coletar dados sobre os genes co-exprimidos com ARHGAP9 e seus possíveis papéis no CCC.
- Investigar como a expressão de ARHGAP9 se correlaciona com a presença de Células Imunes no CCC.
Fontes de Dados
Os pesquisadores utilizaram várias bases de dados para coletar informações:
- Conjuntos de Dados TCGA: Essa base contém dados de muitos pacientes com câncer, incluindo expressão gênica e informações clínicas, que foram analisadas para ARHGAP9.
- Base de Dados TIMER 2.0: Esse recurso ajuda a analisar a expressão gênica e a presença de células imunes em tumores.
- UALCAN e CPTAC: Essas bases foram usadas para estudar os níveis de proteína de ARHGAP9 em tecidos normais e de CCC.
- Base de Dados STRING: Essa foi usada para encontrar genes que trabalham junto com ARHGAP9 e criar redes de interação.
- TISIDB: Essa base foi utilizada para explorar como ARHGAP9 se relaciona com células imunes em tumores.
- GEPIA2: Esse recurso foi usado para estudar a conexão entre os níveis de ARHGAP9 e as taxas de sobrevivência em pacientes com CCC.
- Kaplan-Meier Plotter: Essa ferramenta ajudou a avaliar como a expressão de ARHGAP9 afeta a sobrevivência geral em CCC.
Descobertas
Níveis de Expressão de ARHGAP9
A análise revelou que os níveis de ARHGAP9 estavam significativamente mais altos em tecidos de CCC em comparação com tecidos normais. Isso foi verdade tanto para os níveis de gene quanto de proteína. Especificamente, as evidências mostraram que conforme os cânceres evoluíam, os níveis de ARHGAP9 aumentavam. Isso sugere que ARHGAP9 pode ter um papel na forma como o CCC se desenvolve e piora.
Associações Clínicas
Altos níveis de ARHGAP9 foram ligados a estágios mais avançados da doença, ou seja, o câncer havia se espalhado mais ou era mais agressivo. Descobriu-se que a expressão de ARHGAP9 se correlacionava com fatores como tamanho do tumor, disseminação para linfonodos e estágio geral do câncer. No entanto, não foram encontradas conexões significativas entre os níveis de ARHGAP9 e outros fatores como idade ou sexo.
Valor Diagnóstico
O estudo avaliou o potencial de ARHGAP9 como uma ferramenta diagnóstica usando uma técnica chamada análise de Característica Operacional do Receptor (ROC). Os resultados mostraram que ARHGAP9 tem um potencial excelente para distinguir entre tecidos de CCC e normais, com alta sensibilidade e especificidade. Isso indica que ARHGAP9 pode ser um marcador valioso para identificar o CCC.
Análise de Sobrevivência
Uma análise adicional mostrou que pacientes com altos níveis de ARHGAP9 tinham taxas de sobrevivência mais curtas em comparação com aqueles com níveis mais baixos. Isso foi confirmado usando várias ferramentas de análise. As descobertas apontaram que ARHGAP9 é um fator de risco para resultados piores.
Papel na Infiltração Imune
Os níveis de ARHGAP9 também foram analisados em relação às células imunes dentro dos tumores. Os resultados indicaram uma forte correlação positiva entre a expressão de ARHGAP9 e vários tipos de células imunes, como células B, células T CD8+ e macrófagos. Isso sugere que ARHGAP9 poderia ter um papel em como o sistema imunológico interage com o CCC, possivelmente influenciando os resultados dos pacientes.
Conclusão
Esse estudo esclarece a importância do ARHGAP9 no carcinoma de células renais claras. As descobertas indicam que ARHGAP9 é superexpresso em tecidos de CCC em comparação com tecidos normais e está associado a doenças mais avançadas. Seus níveis podem servir como um marcador diagnóstica útil e ajudar a prever as taxas de sobrevivência dos pacientes. Além disso, a conexão do ARHGAP9 com a presença de células imunes em tumores abre novas possibilidades para entender como o CCC interage com o sistema imunológico.
A pesquisa destaca o potencial do ARHGAP9 como um biomarcador e um alvo para tratamentos futuros do CCC. Mais estudos são necessários para explorar essas descobertas e como elas podem ser aplicadas em ambientes clínicos para melhorar o atendimento e os resultados dos pacientes.
Título: Upregulation of ARHGAP9 is correlated with poor prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma
Resumo: BackgroundRho GTPase Activating Protein (ARHGAP) family genes play critical roles in the onset and progression of human cancer. Rho GTPase Activating Protein 9 (ARHGAP9) is upregulated in various tumors. However, far too little attention has been paid to the prognostic value of ARHGAP9 and correlation with immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. Our aim is to evaluate the prognostic significance of ARHGAP9 expression and its correlation with immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. MethodsTranscriptional expression profiles of ARHGAP9 between clear cell renal cell carcinoma tissues and normal tissues were downloaded from the Cancer Genome Atlas (TCGA). The ARHGAP9 protein expression was assessed by the Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC). Receiver operating characteristic (ROC) curve was used to differentiate clear cell renal cell carcinoma from adjacent normal tissues. The Kaplan-Meier method was conducted to assess the effect of ARHGAP9 on survival. Protein-protein interaction (PPI) networks were constructed by the STRING. Functional enrichment analyses were performed using the "ClusterProfiler" package. The immune infiltration patterns were evaluated via the tumor immune estimation resource 2.0 (TIMER 2.0) and TISIDB database. ResultsARHGAP9 expression was substantially higher in clear cell renal cell carcinoma tissues than in adjacent normal tissues. Increased ARHGAP9 mRNA expression was shown to be linked to high TNM stage and lymph node metastases. The diagnostic value of ARHGAP9 gene expression data was assessed using ROC curve analysis. The survival analysis module of GEPIA2 and the Kaplan-Meier plotter both showed clear cell renal cell carcinoma patients with high-ARHGAP9 had a worse prognosis than those with low-ARHGAP9. Correlation analysis indicated ARHGAP9 mRNA expression was significantly correlated with tumor purity and immune infiltrates. ConclusionThese findings demonstrate that up-regulated ARHGAP9 indicates poor prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. The current findings suggest that ARHGAP9 can be an effective biomarker and potential therapeutic strategy for ccRCC.
Autores: Yue Tian, Y.-l. Xiong, C. Peng
Última atualização: 2023-09-03 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.31.23294890
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.31.23294890.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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