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# Física# Aglomerados atómicos e moleculares

Impacto da Radiação nas Bases do DNA

Investigando como a radiação afeta as bases do DNA e o papel protetor da água.

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Índice

A radiação pode causar danos ao DNA, que é essencial para a vida. Uma parte importante do DNA são seus blocos de construção chamados bases. Quando essas bases são atingidas pela radiação, elas podem perder elétrons, levando a mudanças que podem causar mutações. Esse dano não é só da radiação em si, mas também de partículas minúsculas criadas quando a radiação interage com outros materiais.

Entendendo o Dano ao DNA

As bases do DNA são sensíveis à radiação. Quando a radiação atinge elas, pode quebrá-las. Alguns estudos focam em como a radiação interage com essas bases e como a água ao redor muda a forma como as bases reagem. Essa interação é importante porque pode mudar a quantidade de energia necessária para remover elétrons das bases.

Estrutura Molecular das Bases do DNA

Duas bases no DNA são a Citosina e a timina. Elas têm estruturas únicas que determinam como reagem com a radiação. Entender essas estruturas ajuda os pesquisadores a aprender como essas bases se quebram e o que acontece com elas em diferentes condições.

Diferentes Formas de Ionização

Existem várias maneiras que a radiação pode fazer as bases do DNA perderem elétrons.

  1. Fotoionização Direta: Quando a radiação atinge diretamente a base do DNA, pode fazer com que ela perca um elétron na hora.
  2. Ionização de Penning: Isso acontece em condições especiais, como em uma gotícula de hélio, onde a base interage com um átomo de hélio excitado para perder um elétron.
  3. Ionização por Transferência de Carga: Semelhante à ionização de Penning, mas envolve um processo diferente depois que o átomo de hélio é ionizado.

Os pesquisadores podem estudar esses processos em ambientes controlados usando técnicas avançadas.

Pesquisa sobre Citosina e Timina

Nos experimentos, os pesquisadores olham como a citosina e a timina se comportam quando expostas à radiação. Eles comparam o que acontece com bases livres no ar (fase gasosa) com aquelas em gotículas de hélio. As gotículas de hélio são muito frias e permitem que os pesquisadores estudem como essas bases agem em um ambiente mais controlado.

O objetivo é ver como a presença de moléculas de água muda a forma como essas bases do DNA se quebram quando perdem elétrons. Ajustando a quantidade de água ao redor das bases, os cientistas conseguem observar mudanças nos produtos formados após a exposição à radiação.

Descobertas sobre Fragmentação

Quando as bases do DNA estão na presença de água, elas tendem a se quebrar menos do que quando estão sozinhas. Isso é importante porque sugere que a água pode ajudar a proteger o DNA de danos. Os experimentos revelam que quando as bases do DNA estão cercadas por outras moléculas, sua interrupção é minimizada.

O tipo de ionização também desempenha um papel. Por exemplo, a ionização de Penning tende a resultar em menos fragmentação em comparação com outros métodos, o que significa que pode ser uma maneira mais suave de ionizar as bases sem causar danos significativos.

Espectrometria de Massa na Análise

A espectrometria de massa é uma ferramenta usada para analisar os fragmentos criados quando as bases do DNA são ionizadas. Medindo a massa desses fragmentos, os pesquisadores podem identificar quais partes das bases do DNA foram perdidas ou alteradas.

Nos experimentos, eles reúnem informações sobre como diferentes processos de ionização afetam os rendimentos de vários fragmentos. Notam que quando a citosina e a timina fazem parte de grupos maiores de moléculas (agregados), elas tendem a se quebrar menos, o que destaca ainda mais o papel protetor da água.

Importância da Microhidração

Adicionar moléculas de água à mistura afeta significativamente como as bases do DNA reagem. A presença de água muda não só como as bases se ionizam, mas também como se quebram depois. Os pesquisadores descobrem que, à medida que aumentam a quantidade de água ao redor das bases, a quantidade de fragmentação diminui.

Isso indica que a água funciona como um amortecedor, proporcionando um colchão que ajuda a manter as bases intactas quando interagem com a radiação.

O Papel das Nanogotículas de Hélio

As nanogotículas de hélio são ambientes especiais que permitem que os pesquisadores examinem de perto o comportamento das bases do DNA. A temperatura fria dessas gotículas ajuda a estabilizar as moléculas, tornando mais fácil estudar suas reações.

As interações que acontecem nessas gotículas fornecem insights sobre como o DNA poderia ser protegido contra danos por radiação. Com a inércia do hélio, ele não interfere nos processos sendo estudados, permitindo observações mais claras.

Observações dos Espectros de Elétrons

Quando ocorre ionização, elétrons são liberados, e seu comportamento pode ser analisado usando técnicas como espectroscopia de fotoelétrons. Esse método permite que os pesquisadores observem como a energia desses elétrons muda com base em se as bases do DNA estavam sozinhas ou cercadas por outras moléculas.

Os dados coletados indicam que com a presença de água, o processo de ionização leva a um estado mais estável para as bases, mostrando como elas reagem de forma diferente comparado a quando estão em um ambiente gasoso puro.

Conclusão

Em resumo, entender como a radiação interage com as bases do DNA é crucial para compreender como as mutações podem ocorrer. Os efeitos protetores da água, especialmente em formas microhidratadas, são significativos para minimizar danos a esses blocos de construção essenciais da vida.

Através de técnicas de pesquisa como espectrometria de massa e espectroscopia, os cientistas podem desvendar as interações complexas entre radiação, bases do DNA e seus ambientes ao redor. Essa pesquisa não só beneficia nossa compreensão básica da biologia molecular, mas também pode levar a avanços em áreas como terapia de radiação e engenharia genética, abrindo caminho para uma melhor proteção contra danos ao DNA em organismos vivos.

Fonte original

Título: Secondary ionization of pyrimidine nucleobases and their microhydrated derivatives in helium nanodroplets

Resumo: Radiation damage in biological systems by ionizing radiation is predominantly caused by secondary processes such as charge and energy transfer leading to the breaking of bonds in DNA. Here, we study the fragmentation of cytosine (Cyt) and thymine (Thy) molecules, clusters and microhydrated derivatives induced by direct and indirect ionization initiated by extreme-ultraviolet (XUV) irradiation. Photofragmentation mass spectra and photoelectron spectra of free Cyt and Thy molecules are compared with mass and electron spectra of Cyt/Thy clusters and microhydrated Cyt/Thy molecules formed by aggregation in superfluid helium (He) nanodroplets. Penning ionization after resonant excitation of the He droplets is generally found to cause less fragmentation compared to direct photoionization and charge-transfer ionization after photoionization of the He droplets. When Cyt/Thy molecules and oligomers are complexed with water molecules, their fragmentation is efficiently suppressed. However, a similar suppression of fragmentation is observed when homogeneous Cyt/Thy clusters are formed in He nanodroplets, indicating a general trend. Penning ionization electron spectra (PIES) of Cyt/Thy are broad and nearly featureless but PIES of their microhydrated derivatives point at a sequential ionization process ending in unfragmented microsolvated Cyt/Thy cations.

Autores: Jakob D. Asmussen, Abdul R. Abid, Akgash Sundaralingam, Björn Bastian, Keshav Sishodia, Subhendu De, Ltaief Ben Ltaief, Sivarama R. Krishnan, Henrik B. Pedersen, Marcel Mudrich

Última atualização: 2023-06-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2306.12056

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.12056

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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