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Investigando as proteínas SPFH e o crescimento de E. coli

Pesquisas mostram como as proteínas SPFH afetam o crescimento de E. coli em condições de alta oxigenação.

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Crescimento de E. coli eCrescimento de E. coli ePapéis das Proteínas SPFHproblemas de energia em bactérias.Estudo liga o complexo HflKC a
Índice

As proteínas SPFH são um grupo de proteínas que aparecem em todos os tipos de vida: bactérias, plantas e animais. Uma parte importante dessas proteínas é o domínio PHB, que ajuda elas a se ligarem a lipídios ou gorduras. Essas proteínas podem se grudar para formar estruturas grandes na membrana celular e têm várias funções que ainda não estão completamente claras, especialmente em como elas organizam as camadas de gordura da célula.

Nas células de plantas e animais, as proteínas SPFH podem ser encontradas em várias partes, como a camada externa da célula, mitocôndrias e outras estruturas celulares. Elas são cruciais pra manter outras proteínas e tipos específicos de gorduras unidas. Por exemplo, algumas proteínas SPFH ajudam a controlar canais iônicos, enquanto outras têm papéis na sinalização celular e regeneração nas células nervosas. As prohibetinas, um tipo de proteína SPFH encontrada nas mitocôndrias, trabalham com outra proteína que ajuda a quebrar outras proteínas. Se as prohibetinas não estiverem lá, muitas funções celulares, como crescimento e produção de energia, podem ser afetadas, mas a razão disso ainda é um mistério.

Proteínas SPFH em Bactérias

As proteínas SPFH bacterianas não são tão bem compreendidas quanto as das plantas e animais, mesmo que tenham sido descobertas há mais de vinte anos. Pesquisas em algumas bactérias mostraram que algumas dessas proteínas compartilham características com proteínas eucarióticas, como flotilinas, que ajudam a manter a fluidez das membranas celulares e suportam a formação de complexos proteicos envolvidos na sinalização celular. Mas se sabe menos sobre as proteínas SPFH em outros tipos de bactérias.

Em E. Coli, uma bactéria comum, foram identificadas quatro proteínas SPFH. As funções dessas proteínas ainda não estão claras, embora um dos complexos formados por elas interaja com uma enzima crucial que ajuda a degradar outras proteínas. Mesmo que perder esse complexo não prejudique muito o crescimento de E. coli, os motivos por trás disso ainda são um mistério.

Crescimento de E. coli em Condições Aeradas

Quando os pesquisadores analisaram uma cepa de E. coli que não tinha certos genes hfl, perceberam que ela tinha dificuldades pra crescer em algumas condições, especialmente quando os níveis de oxigênio estavam altos. Quando cultivada em um meio rico em nutrientes e agitada vigorosamente, o crescimento dessa cepa mutante foi muito mais lento em comparação com a cepa normal, especialmente em taxas de agitação mais altas, onde havia mais oxigênio disponível. Curiosamente, o crescimento também foi afetado pelos nutrientes específicos no meio usado.

A falta do complexo HflKC causou esses problemas de crescimento em condições de alta oxigênio, mas a adição de certos nutrientes não resolveu completamente o problema. As dificuldades de crescimento da cepa mutante foram observadas apenas em condições com alta aeração e não quando as bactérias foram cultivadas sem oxigênio.

Mudanças nos Níveis de Proteínas

Pra entender por que a deleção do gene hfl afetou o crescimento, os pesquisadores olharam pros níveis de proteínas em E. coli. Quando cultivadas no meio rico em nutrientes, houve apenas pequenas mudanças nos níveis de proteínas entre a cepa mutante e a normal. No entanto, em um meio onde a mutante mostrou problemas de crescimento, muitas mais proteínas apresentaram níveis diferentes. Em condições sem oxigênio, os níveis de proteínas foram mais semelhantes entre as duas cepas.

Algumas das mudanças significativas incluem um grupo de proteínas relacionadas à respiração. Em particular, duas proteínas importantes que ajudam E. coli a usar oxigênio foram afetadas, com uma tendo menos na cepa mutante e a outra mais. Além disso, houve uma diminuição notável em duas enzimas importantes necessárias pra fazer transportadores de energia na célula.

Ubiquinona e Seu Papel

Os pesquisadores também focaram em um componente chave da produção de energia chamado ubiquinona. Descobriram que a deleção dos genes hfl reduziu os níveis de ubiquinona, que é crítica pra respiração aeróbica. Os baixos níveis de enzimas envolvidas na produção de ubiquinona levaram a uma diminuição na produção de energia aeróbica e no consumo de oxigênio na cepa mutante.

Menos consumo de oxigênio e uma menor produção de espécies reativas de oxigênio também foram notados na cepa mutante. Quando a quantidade de moléculas de energia, como ATP, foi medida, constatou-se que a cepa mutante produzia menos ATP, indicando uma redução significativa na produção de energia.

Restaurando Função com IspG

Investigações adicionais revelaram que uma enzima específica chamada IspG, crucial pra produção de ubiquinona, estava em menor quantidade na cepa mutante. Os pesquisadores acharam que isso era uma das principais razões pros problemas de crescimento. Quando IspG foi aumentado artificialmente na cepa mutante, os níveis de ubiquinona e o consumo de oxigênio melhoraram, e as bactérias cresceram melhor em alta aeração.

Efeitos da Redução de IspG

Como IspG é vital pra sobrevivência de E. coli, os pesquisadores tentaram reduzir seus níveis artificialmente pra ver o que aconteceria. Quando fizeram isso, notaram problemas de crescimento muito parecidos com os da cepa mutante que não tinha os genes hfl, confirmando que baixos níveis de IspG eram responsáveis pelas falhas de crescimento em altos níveis de oxigênio.

Influência do Sistema ArcAB

Os pesquisadores olharam como essas mudanças nos níveis de proteínas eram controladas. Descobriram que níveis baixos de ubiquinona levaram à ativação de um sistema regulatório chamado ArcAB, que ajuda E. coli a se adaptar a diferentes níveis de oxigênio. Esse sistema controla a expressão de genes relacionados à respiração e normalmente fica desligado quando há ubiquinona suficiente; no entanto, essa regulação foi desregulada na cepa mutante devido aos baixos níveis de ubiquinona.

Descobertas Inesperadas

Curiosamente, enquanto a ausência total do complexo HflKC teve um grande impacto nos níveis de IspG e na produção de energia, a perda de um dos seus componentes, HflC, não pareceu afetar muito as bactérias. A proteína HflK parece ser a principal responsável pelas funções do complexo, mesmo em quantidades menores.

Conclusão

Resumindo, essa pesquisa ilumina os papéis importantes do complexo de proteínas HflKC no crescimento de E. coli, especialmente em condições de alta oxigênio. A deleção desse complexo leva a níveis reduzidos de IspG, o que impacta a produção de ubiquinona e a geração de energia. Entender esses processos pode ajudar no futuro, oferecendo insights de como as bactérias gerenciam sua energia e respondem a mudanças ambientais. Os achados também podem dar pistas sobre mecanismos semelhantes em organismos mais complexos, embora mais pesquisas sejam necessárias pra explorar esses possíveis vínculos.

Fonte original

Título: The SPFH complex HflK-HflC regulates aerobic respiration in bacteria

Resumo: The bacterial HflK-HflC membrane complex is a member of the highly conserved SPFH protein family, which is found throughout all domains of life and includes eukaryotic stomatins, flotillins, and prohibitins. These proteins organize cell membranes and are involved in various processes. However, the exact physiological functions of most bacterial SPFH proteins remain unclear. Here, we report that the HflK-HflC complex in Escherichia coli is required for growth under high aeration. The absence of this complex causes an aerobic growth defect due to a reduced abundance of IspG, a crucial enzyme in the isoprenoid biosynthetic pathway. This reduction leads to lower levels of ubiquinone, reduced respiration, lower ATP levels, and misregulated expression of respiratory genes. The regulation of aerobic respiration by the HflK-HflC complex resembles the mitochondrial respiratory defects caused by prohibitin mutations in mammalian and yeast cells, suggesting a functional commonality between these bacterial and eukaryotic SPFH proteins.

Autores: Victor Sourjik, M. I. Perez-Lopez, P. Lubrano, G. Angelidou, T. Glatter, N. Paczia, H. Link

Última atualização: 2024-04-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.21.590321

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.21.590321.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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