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# Informática# Engenharia, finanças e ciências computacionais# Computação distribuída, paralela e em cluster

Serviço de Nuvem para Processar Imagens Médicas

Um novo serviço de nuvem melhora o processamento de imagens médicas enquanto protege a privacidade dos pacientes.

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Processamento EficienteProcessamento Eficientede Imagens Médicassegura de imagens médicas.Uma solução em nuvem para análise
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Imagens médicas, especialmente as usadas em patologia, viraram essenciais pra diagnosticar doenças como câncer. Mas o tamanho dessas imagens pode ser enorme, muitas vezes atingindo vários gigapixels. Isso torna difícil processá-las de forma eficiente, especialmente quando há preocupações com a Privacidade. Hospitais e instituições médicas precisam garantir que as informações sensíveis dos pacientes estejam protegidas enquanto conseguem analisar essas imagens grandes.

O Desafio

Imagens de Lâmina Inteira (WSIs) são representações digitais de lâminas de histopatologia. Elas contêm tanto dados visuais quanto metadados importantes, que podem incluir detalhes dos pacientes e outras informações sensíveis. Mandar essas imagens pra nuvem pra processamento levanta questões de privacidade porque os metadados podem expor informações confidenciais.

Um grande obstáculo no processamento de WSIs é o tamanho delas. Fazer o upload de imagens gigapixel exige muita largura de banda da internet, o que pode ser um problema pra muitos hospitais com recursos limitados. Além disso, essas imagens geralmente contêm Artefatos-imperfeições indesejadas que podem resultar do manuseio de amostras de tecido. Esses artefatos podem enganar análises médicas, tornando essencial pré-processar as imagens antes de aplicar qualquer algoritmo diagnóstico.

Solução Proposta

Pra resolver essas questões, um novo serviço de nuvem foi proposto. Esse serviço processa grandes imagens médicas usando uma abordagem paralela, o que significa que o trabalho é distribuído entre vários recursos de computação. O objetivo é aumentar a eficiência enquanto mantém os dados dos pacientes seguros.

Etapas de Pré-processamento

O pré-processamento consiste em várias etapas:

  1. Preparação dos Dados: Antes de enviar qualquer dado pra nuvem, o serviço vai remover metadados sensíveis das WSIs. Isso é crucial pra manter a privacidade. As imagens grandes serão então divididas em tiles menores, o que facilita o manuseio e processamento.

  2. Alocação de Recursos: Uma vez que os dados estão prontos, o serviço vai atribuir várias tarefas a diferentes recursos de computação. Isso ajuda a otimizar o uso da infraestrutura disponível, seja em hospitais, universidades ou serviços de nuvem.

  3. Implantação e Execução: Depois de planejar como os recursos serão utilizados, o serviço vai implantar as tarefas. Ele vai garantir que os dados permaneçam armazenados de forma segura e que o processamento continue suavemente, mesmo se alguns sistemas tiverem problemas.

  4. Balanceamento de Carga: Pra evitar sobrecarregar algum recurso específico, o sistema vai gerenciar a distribuição das tarefas. Se um computador desacelerar, outros podem entrar em ação pra manter a eficiência.

  5. Agregação de Dados: Por fim, os resultados de diferentes tarefas de processamento serão combinados. O serviço vai reconstruir os tiles processados e fornecer uma visão resumida dos resultados.

Preservação da Privacidade

Durante todo esse processo, a privacidade é uma prioridade. Ao remover informações sensíveis antes de fazer o upload das imagens e aplicar técnicas pra proteger os dados durante o processamento, o serviço garante que a confidencialidade dos pacientes seja mantida.

Estudo de Caso: Tratando Artefatos

Na patologia digital, artefatos podem aparecer nas WSIs por várias razões, como tecido danificado ou dobrado, desfoque, bolhas de ar e outros dados irrelevantes. Esses artefatos podem interferir em diagnósticos precisos. Portanto, é essencial identificá-los e eliminá-los antes de rodar qualquer algoritmo de diagnóstico.

Pesquisadores frequentemente precisam executar várias análises em milhares de WSIs, o que requer recursos computacionais substanciais. Um método paralelizado pra processar imagens pode ajudar os pesquisadores a gerenciar essa carga de trabalho de forma mais eficaz.

Benefícios do Serviço Proposto

Esse novo serviço de nuvem paralelo oferece várias vantagens:

  • Maior Eficiência: Ao distribuir o trabalho entre diferentes recursos, o serviço pode processar imagens mais rápido do que métodos tradicionais que dependem de uma única máquina.

  • Escalabilidade: À medida que a demanda aumenta, mais recursos podem ser adicionados à rede, permitindo cargas de trabalho maiores sem comprometer o desempenho.

  • Segurança Aprimorada: Ao criptografar dados e remover informações sensíveis no início do processo, potenciais violações de privacidade são minimizadas.

  • Uso Flexível de Recursos: O serviço pode utilizar recursos disponíveis de forma eficaz, seja em um hospital local ou em sistemas de nuvem remotos.

Desenvolvimentos Futuros

Pra frente, a equipe por trás desse serviço planeja criar protótipos funcionais e testá-los com dados médicos reais de vários hospitais. Eles pretendem demonstrar a eficiência e eficácia do sistema em um contexto do mundo real.

Além disso, o serviço será integrado com um ambiente virtual de pesquisa amigável. Isso vai permitir que profissionais de saúde personalizem facilmente seus fluxos de trabalho, automatizem processos e garantam que estejam cumprindo com as regulamentações de privacidade enquanto conduzem suas pesquisas.

Conclusão

O serviço de nuvem proposto pra processar grandes imagens médicas enfrenta desafios significativos no campo da patologia digital. Ao focar em preservar a privacidade dos pacientes enquanto também melhora a velocidade e eficiência do processamento, esse serviço representa um avanço promissor na análise de imagens médicas. À medida que a jornada continua, ele tem o potencial de fazer uma grande diferença em como os profissionais de saúde analisam e interpretam dados médicos essenciais.

Fonte original

Título: Towards a privacy-preserving distributed cloud service for preprocessing very large medical images

Resumo: Digitized histopathology glass slides, known as Whole Slide Images (WSIs), are often several gigapixels large and contain sensitive metadata information, which makes distributed processing unfeasible. Moreover, artifacts in WSIs may result in unreliable predictions when directly applied by Deep Learning (DL) algorithms. Therefore, preprocessing WSIs is beneficial, e.g., eliminating privacy-sensitive information, splitting a gigapixel medical image into tiles, and removing the diagnostically irrelevant areas. This work proposes a cloud service to parallelize the preprocessing pipeline for large medical images. The data and model parallelization will not only boost the end-to-end processing efficiency for histological tasks but also secure the reconstruction of WSI by randomly distributing tiles across processing nodes. Furthermore, the initial steps of the pipeline will be integrated into the Jupyter-based Virtual Research Environment (VRE) to enable image owners to configure and automate the execution process based on resource allocation.

Autores: Yuandou Wang, Neel Kanwal, Kjersti Engan, Chunming Rong, Zhiming Zhao

Última atualização: 2023-09-13 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2307.06266

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2307.06266

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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