Avançando a Genômica Bacteriana pra Melhorar o Tratamento de Infecções
Analisando a genômica bacteriana pra melhorar as estratégias de tratamento de infecções.
― 6 min ler
Índice
Avanços recentes na tecnologia permitem uma análise detalhada dos Genomas Bacterianos. Esse progresso melhorou os esforços de saúde pública e os procedimentos hospitalares para gerenciar infecções. Uma aplicação importante é a previsão de como as bactérias podem resistir aos antibióticos. No entanto, embora essa tecnologia tenha avançado em estudos sobre humanos e câncer, seu uso no tratamento de infecções bacterianas ainda é raro. Essa situação surge de dois problemas principais: o tempo que leva para obter resultados muitas vezes é longo demais para casos urgentes e ainda não há clareza suficiente sobre como os traços genéticos nas bactérias afetam os resultados dos pacientes.
Por Que a Genômica Bacteriana É Importante
A genômica bacteriana fornece informações precisas sobre as bactérias que causam infecções. Com o sequenciamento de alta resolução, os médicos conseguem identificar cepas bacterianas específicas em um paciente. Esse entendimento detalhado é essencial para personalizar os planos de tratamento para infecções. Uma das grandes vantagens de estudar os genomas bacterianos é aprender como as bactérias mudam e se adaptam durante as infecções. Essas mudanças podem levar à resistência aos antibióticos, dificultando o tratamento da infecção.
O Desafio da Evolução Adaptativa
A evolução adaptativa se refere à forma como as bactérias evoluem para sobreviver melhor em um ambiente hostil, como quando os antibióticos são usados contra elas. Muitas bactérias conseguem se adaptar, o que lhes permite escapar do sistema imunológico e continuar causando doenças. Embora esse conceito seja bem compreendido no tratamento do câncer, não é frequentemente analisado na gestão de infecções bacterianas.
Entender como as bactérias evoluem durante uma infecção poderia oferecer insights cruciais sobre Falhas no tratamento. Por exemplo, se os médicos conseguem identificar como as bactérias desenvolvem resistência, isso pode levar a estratégias de tratamento mais eficazes.
Uma Nova Estrutura para Avaliar Infecções
Propomos uma estrutura prática para usar a genômica bacteriana para entender como as bactérias se adaptam durante infecções em andamento ou repetidas, focando particularmente no Staphylococcus aureus. Esse tipo de bactéria é uma causa comum de infecções graves e ficou claro que sua capacidade de persistir pode levar a problemas de saúde significativos.
Acreditamos que entender essas Mudanças Genéticas no S. aureus pode ajudar os médicos a descobrir por que os tratamentos estão falhando e como ajustá-los. Nossa abordagem consiste em várias etapas. Primeiro, comparando as informações genéticas das bactérias no início do tratamento com aquelas coletadas quando o tratamento falha, os médicos podem determinar se o paciente foi reinfectado ou se a infecção original retornou. Essa distinção é essencial porque os planos de tratamento para cada situação são diferentes.
Em segundo lugar, por meio de testes, podemos identificar novas formas de resistência que os médicos podem não estar cientes. Essa informação pode ajudar os médicos a escolher os antibióticos certos para a situação. Terceiro, analisar como as bactérias evoluem ao longo do tempo dentro do paciente pode revelar padrões relacionados à resistência, dando aos médicos insights adicionais sobre como gerenciar o tratamento de seus pacientes de forma eficaz.
Finalmente, se os testes não mostram sinais de adaptação, pode significar que o mesmo tratamento pode continuar. No entanto, também pode indicar que problemas mais profundos existem na infecção do paciente que precisam ser abordados, possivelmente levando a medidas de tratamento mais agressivas.
Testes em Hospitais
Para colocar nossa estrutura em ação, realizamos um estudo preliminar em hospitais de ensino. Os médicos foram convidados a encaminhar casos em que suspeitavam de falhas de tratamento em infecções por S. aureus. Analisamos as informações genéticas das bactérias desses pacientes enquanto também testávamos sua resposta a vários antibióticos.
Nossos testes focaram em características específicas das bactérias, como mudanças em como elas respondem aos antibióticos. Analisamos cepas bacterianas isoladas no laboratório para coletar informações genéticas detalhadas.
Analisando Resultados
De maio de 2019 a agosto de 2023, estudamos 65 cepas bacterianas de 13 casos diferentes de infecções por S. aureus. Em todos esses casos, a principal preocupação era o S. aureus na corrente sanguínea. Desses casos, nove envolveram infecções repetidas e dois foram casos de infecções persistentes.
Na maioria dos casos, a investigação começou com informações dos médicos que estavam tratando ou de microbiologistas clínicos. Através de nossos testes de antibióticos, descobrimos que algumas cepas desenvolveram resistência aumentada em comparação com as cepas originais. Por exemplo, em alguns casos, nossos testes mostraram que as bactérias se adaptaram de uma forma que as deixou menos eficazes contra certos tratamentos.
Entendendo a Falha no Tratamento
Examinando os detalhes de cada caso, categorizamos as razões por trás da falha no tratamento. Descobrimos que em sete casos, o problema provavelmente se devia a focos de infecção persistentes dentro do paciente. Em quatro casos, as bactérias claramente se adaptaram ao longo do tempo. Em dois casos, não conseguimos tirar conclusões definitivas.
Importante ressaltar que não encontramos co-infecções ou reinfecções, o que significa que a falha no tratamento provavelmente se deve à evolução da mesma bactéria e não a novas infecções. Através desse processo, reunimos evidências que apoiam a ideia de que a evolução bacteriana desempenha um papel significativo em como os pacientes respondem ao tratamento.
Observações Principais
Durante nosso estudo, notamos mutações específicas no DNA das bactérias que estão ligadas ao aumento da resistência aos antibióticos. Por exemplo, algumas mutações foram encontradas em um gene relacionado à Resistência a Antibióticos comuns. Isso destaca a importância da pesquisa contínua em genômica bacteriana e seu impacto nos resultados do tratamento.
Desafios clínicos permanecem tanto para os pacientes quanto para os provedores de saúde quando se trata de gerenciar infecções complicadas, como as causadas pelo S. aureus. Nossa abordagem, fundamentada na análise genômica, mostra potencial para enfrentar esses desafios.
Olhando para o Futuro
Embora nossa pesquisa ainda esteja em estágios iniciais e limitada em escopo, ela estabelece uma base para um método estruturado de acompanhamento das mudanças genéticas nas bactérias responsáveis pelas falhas no tratamento. O objetivo é combinar insights genômicos com testes de suscetibilidade a antibióticos para informar melhor as decisões clínicas.
Trabalhos futuros são necessários para avaliar completamente como essas descobertas podem influenciar os resultados do tratamento para os pacientes. Abordar as implicações clínicas da genômica bacteriana será crucial para avançar nos cuidados médicos e melhorar a saúde dos pacientes.
Título: A multi-hospital, clinician-initiated bacterial genomics program to investigate treatment failure in severe Staphylococcus aureus infections
Resumo: Bacterial genomics is increasingly used for infectious diseases surveillance, outbreak control and prediction of antibiotic resistance. With expanding availability of rapid whole-genome sequencing, bacterial genomics data could become a valuable tool for clinicians managing bacterial infections, driving precision medicine strategies. Here, we present a novel clinician-driven bacterial genomics framework that applies within-patient evolutionary analysis to identify in real-time microbial genetic changes that have an impact on the outcome of severe Staphylococcus aureus infections, a strategy that is increasingly used in cancer genomics. Our approach uses a combination of bacterial genomics and novel microbiological testing to identify and track bacterial adaptive mutations that underlie antibiotic treatment failure. We show real-life examples of the impact of our approach and propose a roadmap for the use of bacterial genomics to advance the management of severe bacterial infections.
Autores: Stefano G Giulieri, M. Leroi, D. Daniel, R. Chean, K. Bond, H. Walker, N. Holmes, N. Mothobi, A. Alexander, A. Jenney, C. Beckett, A. Mahony, K. Stevens, N. Sherry, B. P. Howden
Última atualização: 2023-10-24 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.23.23297384
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.23.23297384.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
Obrigado ao medrxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.