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Avanços no Diagnóstico de Embolia Pulmonar

PECon combina tomografias e dados de EHR pra melhorar o diagnóstico de PE.

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Embolia Pulmonar (EP) é uma condição séria que acontece quando um coágulo de sangue bloqueia um vaso sanguíneo nos pulmões. É considerada uma das principais causas de mortes relacionadas ao sistema cardiovascular. Apesar dos avanços em diagnóstico e tratamento, muitos pacientes enfrentam atrasos para receber um diagnóstico adequado, o que pode levar a altas taxas de mortalidade. Isso destaca a necessidade de melhores ferramentas para ajudar os médicos a diagnosticar a EP.

O Papel das Tomografias e Dados de EHR

Tradicionalmente, os médicos têm confiado nas Tomografias computadorizadas (TC) para identificar a EP. As TC podem fornecer imagens dos pulmões que ajudam a detectar coágulos de sangue. No entanto, as TC sozinhas muitas vezes não oferecem todas as informações necessárias para um diagnóstico correto. É aqui que entram os Prontuários Eletrônicos de Saúde (EHR). Os EHRs contêm dados valiosos sobre o histórico médico de um paciente, incluindo dados demográficos, medicamentos e diagnósticos anteriores. Combinar as TC com os dados dos EHR pode oferecer uma visão mais completa da saúde do paciente, melhorando a chance de um diagnóstico preciso de EP.

Apresentando PECon

Para melhorar o diagnóstico de EP usando tanto TC quanto dados de EHR, foi desenvolvido um novo método chamado PECon. O PECon usa uma técnica chamada pré-treinamento contrastivo supervisionado. Essa abordagem alinha características das TC com características dos dados de EHR, permitindo uma melhor compreensão e previsão dos casos de EP.

Na aprendizagem contrastiva supervisionada, o método reúne características que pertencem à mesma categoria (por exemplo, características de pacientes com EP) enquanto separa características de categorias diferentes (como características de pacientes sem EP). Ao fazer isso, o método visa criar distinções mais claras entre os diferentes casos de pacientes.

Resultados e Desempenho

O PECon foi testado em um conjunto de dados chamado RadFusion, que inclui tanto imagens de TC quanto dados de EHR de pacientes diagnosticados com ou sem EP. Os resultados indicaram que o PECon teve um desempenho superior aos métodos existentes, atingindo altas pontuações em várias métricas de desempenho. Especificamente, apresentou uma pontuação F1 de 0,913, uma precisão de 0,90 e uma pontuação AUROC de 0,943. Esses resultados sugerem que o PECon pode ajudar significativamente na detecção de EP, oferecendo uma melhor classificação do que quando se usa apenas TC ou dados de EHR.

Entendendo a Embolia Pulmonar

A Embolia Pulmonar é uma condição crítica que surge quando coágulos de sangue viajam para os pulmões e bloqueiam o fluxo sanguíneo. Isso pode levar a dor no peito, dificuldade para respirar e, em casos graves, morte. É essencial reconhecer que a EP muitas vezes não é diagnosticada ou é diagnosticada incorretamente no início, o que pode agravar a condição do paciente. Os métodos atuais de detecção de EP envolvem uma série de testes, com as TC sendo uma das principais ferramentas utilizadas.

Por Que As Tomografias Sozinhas Não São Suficientes

As tomografias fornecem imagens detalhadas dos pulmões, tornando-as valiosas no diagnóstico de EP. No entanto, elas mostram apenas um instantâneo da condição do paciente em um momento específico. Fatores como histórico do paciente, sintomas e condições médicas anteriores, todos encontrados nos EHRs, são cruciais para um diagnóstico preciso. Deixar de considerar todo o histórico médico do paciente pode levar a omissões e diagnósticos incorretos.

Fusão de Dados Multimodais

Combinar diferentes tipos de dados, conhecido como fusão de dados multimodais, é crucial para melhorar o diagnóstico na área da saúde. No caso da EP, juntar TC e EHRs permite uma análise mais abrangente da condição de um paciente. Estudos mostraram que usar tanto dados de imagem quanto dados clínicos melhora significativamente o Desempenho Diagnóstico para diversas condições médicas.

Desafios na Fusão Multimodal

Embora combinar TC e dados de EHR tenha suas vantagens, também vem com desafios. Diferentes tipos de dados têm características únicas e podem exigir métodos de processamento diferentes. A eficácia das abordagens de fusão pode variar, tornando essencial testar e validar diferentes métodos para encontrar as melhores soluções para o diagnóstico de EP.

Aprimorando a Aprendizagem Contrastiva

A aprendizagem contrastiva surgiu como uma abordagem promissora na imagem médica. Ela permite que modelos aprendam a partir dos dados disponíveis, enfatizando as semelhanças e diferenças no conjunto de dados. Métodos anteriores, como o ConVIRT, tentaram preencher a lacuna entre imagens médicas e dados textuais. No entanto, eles muitas vezes enfrentaram desafios ao lidar com terminologia médica especializada.

Em contraste, o PECon foca somente em aprender a partir de imagens de TC e dados de EHR. Usando a aprendizagem contrastiva supervisionada, o PECon aproveita dados de pacientes rotulados para melhorar o desempenho diagnóstico. Essa abordagem ajuda o modelo a se concentrar em características relevantes que distinguem pacientes com e sem EP.

Aplicação no Mundo Real

A aplicação do PECon no mundo real foi testada no conjunto de dados RadFusion, que compreende tanto TC quanto dados de EHR. O conjunto de dados inclui uma variedade de casos de pacientes, ajudando a validar a eficácia do método proposto. Por meio de processos extensivos de treinamento e validação, o PECon demonstrou sua capacidade de classificar com precisão casos de EP enquanto considerava os aspectos únicos de cada paciente.

Importância da Explicabilidade

Além da precisão, a explicabilidade é um aspecto importante das ferramentas de diagnóstico médico. Os clínicos precisam confiar nas informações oferecidas por essas ferramentas. Ao visualizar mapas de ativação de classe, fica evidente que o PECon pode melhorar a interpretabilidade das decisões do modelo. Comparando o PECon com outros modelos, revelou-se que o PECon foca em áreas relevantes nas imagens de TC, fornecendo insights mais claros sobre o processo de tomada de decisão.

Direções Futuras

Embora o PECon tenha mostrado resultados promissores, mais pesquisas são necessárias para confirmar sua eficácia em outros conjuntos de dados e populações de pacientes. Testar em diferentes conjuntos de dados pode ajudar a avaliar se o método se generaliza bem. Além disso, trabalhos futuros podem explorar diferentes técnicas de fusão para examinar seu impacto no desempenho diagnóstico.

Além de melhorar os métodos de combinação de dados de imagem e clínicos, podem haver oportunidades para aprimorar a agregação de características por meio de técnicas de atenção. Esses avanços poderiam levar a ferramentas de diagnóstico ainda mais precisas no futuro.

Conclusão

O PECon representa um avanço significativo na melhoria do diagnóstico de Embolia Pulmonar. Ao combinar a força das tomografias e dos dados de EHR por meio da aprendizagem contrastiva supervisionada, ele aprimora o alinhamento de características e o desempenho de classificação. Os resultados promissores obtidos a partir do conjunto de dados RadFusion mostram o potencial dessa abordagem para ajudar os profissionais de saúde a diagnosticar EP de forma mais precisa e eficiente. Embora desafios permaneçam, o desenvolvimento contínuo de abordagens multimodais como o PECon é vital para avançar no campo dos diagnósticos médicos.

Fonte original

Título: PECon: Contrastive Pretraining to Enhance Feature Alignment between CT and EHR Data for Improved Pulmonary Embolism Diagnosis

Resumo: Previous deep learning efforts have focused on improving the performance of Pulmonary Embolism(PE) diagnosis from Computed Tomography (CT) scans using Convolutional Neural Networks (CNN). However, the features from CT scans alone are not always sufficient for the diagnosis of PE. CT scans along with electronic heath records (EHR) can provide a better insight into the patients condition and can lead to more accurate PE diagnosis. In this paper, we propose Pulmonary Embolism Detection using Contrastive Learning (PECon), a supervised contrastive pretraining strategy that employs both the patients CT scans as well as the EHR data, aiming to enhance the alignment of feature representations between the two modalities and leverage information to improve the PE diagnosis. In order to achieve this, we make use of the class labels and pull the sample features of the same class together, while pushing away those of the other class. Results show that the proposed work outperforms the existing techniques and achieves state-of-the-art performance on the RadFusion dataset with an F1-score of 0.913, accuracy of 0.90 and an AUROC of 0.943. Furthermore, we also explore the explainability of our approach in comparison to other methods. Our code is publicly available at https://github.com/BioMedIA-MBZUAI/PECon.

Autores: Santosh Sanjeev, Salwa K. Al Khatib, Mai A. Shaaban, Ibrahim Almakky, Vijay Ram Papineni, Mohammad Yaqub

Última atualização: 2023-08-27 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2308.14050

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2308.14050

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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