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Insights Genéticos sobre o Desenvolvimento do Câncer de Sangue

Pesquisa revela como mutações nas células-tronco do sangue levam à LMA.

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Nos últimos vinte anos, os pesquisadores aprenderam muito sobre as mudanças genéticas que levam ao câncer. A maioria dos cânceres começa com várias Mutações chave no DNA de uma única célula. Essas mutações podem se desenvolver anos antes da primeira célula cancerosa aparecer. No entanto, os cientistas ainda estão tentando descobrir como todas essas mutações se acumulam em uma célula ao longo da vida de uma pessoa.

As teorias iniciais sobre o câncer sugeriam que ganhar mutações era a principal razão pela qual as pessoas desenvolvem câncer conforme envelhecem. Porém, essas teorias têm dificuldade em explicar com que frequência os cânceres realmente ocorrem, com base em estimativas de quão rápido as mutações acontecem e quantas células-tronco estão no corpo.

Pesquisas recentes mostraram que algumas mutações são selecionadas no corpo, ou seja, células com essas mutações têm uma vantagem e são mais propensas a sobreviver. Essa Seleção parece acontecer não só quando o câncer começa, mas durante todo o processo de desenvolvimento dele. Medir essas mudanças iniciais em células que podem levar ao câncer pode ser complicado, então os cientistas ainda não confirmaram essas ideias com cálculos precisos.

O Papel do Sequenciamento de Células Únicas na Pesquisa do Câncer

Uma forma promissora de estudar como o câncer se desenvolve é através do sequenciamento de células únicas. Esse método permite que os cientistas olhem de perto a composição genética de células individuais e entendam sua história. Ao examinar mutações em um grupo de células relacionadas, os pesquisadores podem criar um mapa mostrando como o câncer pode evoluir ao longo do tempo.

O sistema sanguíneo é uma área excelente para essa pesquisa porque os cientistas podem encontrar e analisar facilmente Células-Tronco Sanguíneas. Essa pesquisa mostrou que indivíduos saudáveis têm muitas células-tronco sanguíneas que sustentam a produção de sangue. Em alguns cânceres sanguíneos, mutações chave podem até começar antes do nascimento. Além disso, há uma grande variedade dessas células-tronco em condições como leucemia mieloide aguda (LMA).

Uma nova abordagem envolve pegar células-tronco sanguíneas de pacientes diagnosticados com LMA e estudá-las mais de perto usando sequenciamento de células únicas. Isso permite que os cientistas observem como as mutações se desenvolvem ao longo do tempo e como algumas podem levar ao retorno do câncer após o tratamento.

Construindo uma Imagem da Evolução Pré-leucêmica

Nesta pesquisa, os cientistas se concentraram em 16 pacientes com LMA e analisaram suas amostras de sangue. Para garantir resultados precisos, escolheram amostras com um fundo genético similar. Depois de isolar as células-tronco sanguíneas, sequenciaram seu DNA para buscar mutações em genes importantes relacionados a cânceres sanguíneos. Esse processo permitiu identificar milhares de células-tronco sanguíneas individuais e reconstruir uma imagem das mutações genéticas de cada paciente.

A análise revelou que a maioria dos casos de LMA normalmente tem três ou quatro mutações chave. Entre essas mutações, alguns genes frequentemente apareciam junto com as mutações conhecidas. Os pesquisadores descobriram consistentemente que uma mutação geralmente ocorria antes das outras, mostrando um padrão em como essas mutações se desenvolvem.

O estudo das mudanças genéticas em células-tronco sanguíneas mostrou que há diferentes maneiras pelas quais essas células podem evoluir para o câncer. Em cerca de um terço dos casos, os pesquisadores observaram caminhos ramificados de evolução, sugerindo que múltiplas linhagens celulares mutantes poderiam existir simultaneamente. Nos casos restantes, a evolução parecia seguir um único caminho. Também houve diferenças notáveis no número de células com diferentes mutações, indicando que algumas mutações eram mais vantajosas que outras.

Entendendo a Competição Entre Células

Essas descobertas sobre a evolução das células-tronco sanguíneas sugerem que o tamanho e a composição de diferentes linhagens celulares mudam devido à competição entre elas, mutações aleatórias e eventos de acaso. Ao modelar esses processos, os pesquisadores poderiam entender melhor como os vários padrões de evolução nesses casos de LMA emergem.

O estudo tentou simular como as células-tronco sanguíneas poderiam mudar ao longo do tempo, considerando vários fatores e ignorando as identidades específicas de cada mutação. Os pesquisadores definiram um ponto em que consideravam que um paciente tinha câncer com base no número de mutações chave encontradas em suas células. Essa modelagem poderia ajudar a comparar as sequências reais observadas em pacientes com aquelas criadas em simulações.

Para aprimorar a análise, os cientistas compararam os tamanhos dos clones nos dados reais dos pacientes com muitos cenários simulados para ver como as pressões de seleção poderiam diferir entre os vários casos. Parecia que vantagens seletivas moderadas a fortes levaram a padrões de evolução mais complexos, o que ajudou a esclarecer por que alguns pacientes tinham formas de câncer mais agressivas.

Validando Descobertas com Mais Dados

Para garantir que suas descobertas fossem aplicáveis a mais casos de LMA, os pesquisadores analisaram dados adicionais de 27 outros casos de LMA. Eles novamente observaram como o tamanho e a composição das linhagens celulares mudaram. Suas descobertas ecoaram as dos 16 casos originais, mostrando que a evolução da LMA não poderia ser explicada apenas por mutações aleatórias. Em vez disso, níveis moderados de seleção positiva estavam em ação em muitos casos.

A análise indicou que a maioria dos padrões observados poderia ser explicada por forças de seleção similares, significando que a presença de certas mutações aumentava as chances de as células sobreviverem e se multiplicarem. Assim, casos em que algumas mutações dominavam a paisagem estavam ligados a uma seleção mais fraca, enquanto aqueles que mostravam uma mistura de múltiplas mutações indicavam pressões seletivas mais fortes.

Olhando para Riscos Futuros de LMA

A percepção de que muitas dessas árvores de clones pré-leucêmicos mostravam evidências de seleção positiva leva os pesquisadores a pensar que esses clones poderiam se desenvolver ao longo de muitos anos, proporcionando uma longa janela para prever quem poderia estar em risco de desenvolver LMA. No entanto, é crucial entender quão comuns certos marcadores são em pessoas que não desenvolvem a doença.

Simulações mostraram que os caminhos evolutivos levando à LMA poderiam diferir significativamente dos caminhos de quem não desenvolve câncer. Normalmente, indivíduos com mutações únicas eram comuns, tornando essas mutações menos úteis como indicadores de risco futuro de câncer. Em contraste, a presença de células com duas mutações antes dos 30 anos era muito mais rara em indivíduos saudáveis, mas mais comum em aqueles destinados a desenvolver LMA. O mesmo padrão se aplica a indivíduos que adquirem três mutações antes dos 50 anos, mostrando um risco notável de transformação em câncer.

Conclusão

Esse estudo enfatiza que as células-tronco sanguíneas podem conter evidências de mudanças iniciais que levam ao câncer. Ao estudar essas mudanças em detalhes, os cientistas podem criar uma imagem mais clara de como a LMA evolui e identificar indivíduos que podem estar em maior risco de desenvolver a doença. Embora algumas simplificações tenham sido feitas durante a pesquisa, as descobertas ressaltam as interações complexas entre mutações genéticas e pressões seletivas na evolução pré-leucêmica. A esperança é que, ao detectar certas combinações de mutações cedo, os pesquisadores possam prever melhor quem pode precisar de monitoramento mais cuidadoso para o desenvolvimento de LMA no futuro.

Fonte original

Título: Single-cell DNA sequencing reveals pervasive positive selection throughout preleukemic evolution

Resumo: The representation of driver mutations in preleukemic haematopoietic stem cells (pHSCs) provides a window into the somatic evolution that precedes Acute Myeloid Leukemia (AML). Here, we isolate pHSCs from the bone marrow of 16 patients diagnosed with AML and perform single-cell DNA sequencing on thousands of cells to reconstruct phylogenetic trees of the major driver clones in each patient. We develop a computational framework that can infer levels of positive selection operating during preleukemic evolution from the statistical properties of these phylogenetic trees. Combining these data with 67 previously published phylogenetic trees, we find that the highly variable structures of preleukemic trees emerge naturally from a simple model of somatic evolution in which there is pervasive positive selection acting throughout the disease trajectory. We infer that selective advantages of preleukemic clones are typically in the range of 9%-24% per year, but vary considerably between individuals. At these level of positive selection, we show that the identification of early multiple-mutant clones identifies individuals at risk of future AML.

Autores: Gladys Y.P. Poon, J. R. Blundell, A. Vedi, E. Laurenti, M. A. Sanders, P. Valk

Última atualização: 2024-05-22 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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