Proteínas N-myc: Jogadores Chave no Câncer
As proteínas N-myc são super importantes no crescimento celular e o papel delas no câncer é bem significativo.
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Índice
- Estrutura das Proteínas Myc
- O Papel da N-myc no Câncer
- Diferenças Entre as Proteínas Myc
- O Domínio de Transativação
- Interações com Outras Proteínas
- A Importância da Fosforilação
- Métodos para Estudar a N-myc
- Procedimentos Experimentais
- Resultados e Descobertas
- Conclusão
- Direções Futuras
- Fonte original
- Ligações de referência
As proteínas Myc são um grupo de proteínas que desempenham papéis importantes no crescimento e desenvolvimento celular. Elas estão envolvidas em vários tipos de câncer. Existem três tipos principais de proteínas Myc encontradas em mamíferos: N-myc, L-myc e c-myc. Dentre essas, a N-myc está relacionada a cânceres que começam nas células nervosas, como neuroblastoma, que é um câncer comum em crianças. Quando há muitas cópias do gene N-myc numa célula, geralmente isso leva a piores resultados para os pacientes com neuroblastoma.
Estrutura das Proteínas Myc
As proteínas Myc são compostas por muitos aminoácidos. Por exemplo, a N-myc tem 464 aminoácidos, enquanto a L-myc é menor, com 364 aminoácidos. Apesar dessas diferenças de tamanho, a estrutura geral delas é bem parecida. A parte final dessas proteínas tem uma sequência especial que permite que elas se liguem ao DNA e regulem a atividade de certos genes. Essa parte da proteína interage com outra proteína chamada Max, formando um complexo que pode se ligar a regiões específicas do DNA chamadas E-boxes, que são encontradas em promotores de genes.
O Papel da N-myc no Câncer
A N-myc é especialmente ativa em cânceres que se originam no sistema nervoso. Quando a N-myc está em excesso, pode levar a um crescimento e divisão celular descontrolados. Essa conexão entre N-myc e câncer a torna um alvo importante para pesquisa. As proteínas N-myc podem se ligar a muitas outras proteínas, ajudando a controlar vários processos biológicos, incluindo a Expressão Gênica.
Diferenças Entre as Proteínas Myc
Embora N-myc e c-myc compartilhem algumas semelhanças, elas também podem diferir em como funcionam. Por exemplo, a c-myc foi estudada mais extensivamente. Ela é conhecida por aumentar a expressão de muitos genes, mas também pode suprimir a atividade gênica em situações específicas. Esses papéis variados podem depender de onde elas se ligam e das proteínas com as quais interagem.
O Domínio de Transativação
Uma parte importante das proteínas Myc é chamada de domínio de transativação (TAD). Essa seção é responsável por ativar outros genes. Na N-myc, o TAD é composto por uma sequência de aminoácidos que ajuda a interagir com diferentes proteínas. Sabe-se que ele é flexível, o que significa que pode mudar de forma, permitindo que se encaixe com vários parceiros. O TAD inclui várias pequenas regiões conservadas chamadas de caixas myc, que ajudam a facilitar essas interações.
Interações com Outras Proteínas
A N-myc tem regiões específicas que são essenciais para interagir com várias proteínas. Essas interações são importantes para sua função na expressão gênica e em outros processos. Por exemplo, a N-myc pode se ligar a complexos de acetiltransferase de histonas, que modificam a estrutura do DNA e influenciam a atividade gênica.
Estudos mostram que a N-myc também pode interagir com proteínas como a quinase Aurora-A. Essa interação é crucial para prevenir conflitos entre a replicação do DNA e a transcrição durante a divisão celular. A região da N-myc que interage com a Aurora-A pode adotar uma estrutura helicoidal, o que pode ajudar a estabilizar a ligação entre essas proteínas.
Fosforilação
A Importância daA fosforilação é uma modificação química que pode mudar o comportamento das proteínas. Na N-myc, certos aminoácidos podem ser fosforilados por enzimas específicas. Por exemplo, as proteínas ERK1 e GSK3 podem adicionar grupos fosfato à N-myc. A fosforilação em locais específicos pode influenciar a estabilidade da N-myc e como ela interage com outras proteínas.
Quando a N-myc é fosforilada, ela pode reconhecer e se ligar ao complexo Fbxw7–Skp1, que está envolvido na marcação de proteínas para degradação. É assim que os níveis de N-myc na célula podem ser regulados. Se a N-myc não for regulada corretamente, pode contribuir para a progressão do câncer.
Métodos para Estudar a N-myc
Para entender como a N-myc funciona, os pesquisadores usam várias técnicas. Um método útil é chamado de NMR (Ressonância Magnética Nuclear), que ajuda os cientistas a ver como as proteínas se movem e interagem. Ao estudar a N-myc usando NMR, os cientistas podem observar sua estrutura e entender como ela muda ao se ligar a outras proteínas ou ser modificada.
Os estudos de NMR permitiram que os pesquisadores identificassem características-chave do TAD da N-myc, como certas áreas que podem adotar formas diferentes ao interagir com a Aurora-A ou durante a fosforilação. Esse tipo de informação ajuda a ter uma visão mais clara de como a N-myc funciona nas células.
Procedimentos Experimentais
Produção de Proteínas N-myc
Para estudar as proteínas N-myc, os cientistas criam sequências de DNA especiais chamadas de construções de expressão. Essas sequências são inseridas em bactérias, que produzem as proteínas N-myc. Uma vez produzidas, as proteínas são purificadas usando diferentes técnicas para separá-las de outros componentes celulares. Essa purificação é importante para garantir que os cientistas estão estudando a proteína específica de interesse.
Purificação de Proteínas
Depois que as bactérias produzem as proteínas N-myc, são tomadas medidas para purificá-las para um estudo mais aprofundado. Isso geralmente envolve abrir as bactérias, remover detritos e usar técnicas como cromatografia de afinidade para isolar a N-myc. As proteínas purificadas podem então ser analisadas usando vários métodos, como espectroscopia de NMR, para entender melhor suas propriedades.
Espectroscopia de NMR
A NMR é uma ferramenta poderosa para estudar a dinâmica e interações de proteínas. Nas experiências de NMR, o comportamento da N-myc é observado em diferentes temperaturas e condições. Coletando dados sobre como a proteína se comporta em solução, os pesquisadores podem aprender sobre sua estrutura e quaisquer mudanças que ocorram quando ela interage com outras proteínas ou é modificada por fosforilação.
Resultados e Descobertas
Atribuição de Backbone do TAD da N-myc
Usando dados de NMR, os pesquisadores identificaram e atribuíram a estrutura de backbone do TAD da N-myc. Essa atribuição revelou informações sobre como a N-myc pode interagir com outras proteínas e os tipos de estruturas secundárias que pode adotar.
Dinâmica da N-myc
Os dados de NMR também mostram que a N-myc não é totalmente desordenada. Certas regiões da N-myc apresentam menos dinamismo, indicando que podem ter estruturas que ajudam na ligação a outras proteínas. Esse comportamento pode fornecer insights sobre como a N-myc funciona em processos celulares.
Interação com Aurora-A
A interação entre a N-myc e a Aurora-A foi explorada mais a fundo através de estudos de NMR. Esses estudos mostraram como a ligação afeta as propriedades de ambas as proteínas, incluindo mudanças nos deslocamentos químicos e intensidades de pico da N-myc. Os dados indicaram que múltiplas regiões da N-myc estão envolvidas nessa interação, sugerindo uma interface de ligação complexa.
Estudos de Fosforilação
Os estudos de fosforilação usando NMR ajudaram os cientistas a rastrear as mudanças na N-myc quando ela passa por modificações por enzimas. Isso permitiu uma compreensão mais profunda de como a fosforilação afeta a estabilidade da N-myc e suas interações com outras proteínas, incluindo o complexo Fbxw7–Skp1.
Conclusão
As proteínas Myc, especialmente a N-myc, são peças-chave no crescimento celular e no câncer. Entender sua estrutura e interações é fundamental para descobrir seus papéis em processos celulares e doenças. Estudos de NMR fornecem insights valiosos sobre como a N-myc funciona e como pode ser regulada por fosforilação e interações com outras proteínas.
Os pesquisadores continuam explorando novas maneiras de direcionar a N-myc no tratamento do câncer, buscando desenvolver estratégias que possam inibir sua função nas células cancerígenas. À medida que mais informações sobre a N-myc se tornam disponíveis, isso pode levar a avanços na compreensão e tratamento de cânceres associados a essa proteína importante.
Direções Futuras
O estudo contínuo da N-myc oferece promessas para avançar nossa compreensão da biologia do câncer. Ao elucidar os mecanismos que fundamentam sua função, os cientistas esperam desenvolver terapias direcionadas que possam efetivamente enfrentar os desafios impostos pelos cânceres que envolvem a N-myc. Pesquisas futuras podem se concentrar nas nuances estruturais da N-myc, nos efeitos de várias modificações pós-traducionais e na identificação de potenciais alvos para medicamentos.
Em resumo, a N-myc não é apenas uma proteína única; é uma entidade complexa com múltiplos papéis na saúde e na doença. Entender sua dinâmica, interações e mecanismos regulatórios será vital para desenvolver novas terapias contra o câncer que possam ajudar a melhorar os resultados dos pacientes.
Título: Exploring the dynamics and interactions of the N-myc transactivation domain through solution NMR
Resumo: The myc family of proteins (c-, N- and L-myc) are transcription factors (TFs) responsible for maintaining the proliferative program in cells. They consist of a C-terminal domain that mediates heterodimerisation with Max and DNA binding, and an N-terminal disordered region culminating in the transactivation domain (TAD). The TAD participates in many protein-protein interactions, notably with kinases that promote stability (Aurora-A) or degradation (ERK1, GSK3) via the ubiquitin-proteasome system. Structural characterization of the TAD of N-myc, is very limited, with the exception of a crystal structure of Aurora-A bound to a helical region of N-myc. We probed the structure, dynamics and interactions of N-myc TAD using nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy following its complete backbone assignment enabled by a truncation approach. Chemical shift analysis revealed that N-myc has two regions with clear helical propensity: one region within Trp77-Glu86 and the second between Ala122-Glu132. These regions also have more restricted ps-ns motions than the rest of the TAD, and, along with another known interaction site (myc box I), have comparatively high transverse (R2) 15N relaxation rates, indicative of slower timescale dynamics and/or chemical exchange. Collectively these features suggest differential propensities for structure and interaction, either internal or with binding partners, across the TAD. Solution studies on the interaction between N-myc and Aurora-A revealed a previously uncharacterised binding site. The specificity and kinetics of sequential phosphorylation of N-myc by ERK1 and GSK3 were characterised using NMR and showed no significant structural changes through the rest of the TAD. When doubly phosphorylated on residues Ser62 and Thr58, N-myc formed a robust interaction with the Fbxw7-Skp1 complex. Our study provides foundational insights into N-myc TAD dynamics and a backbone assignment that will underpin future work on the structure, dynamics, interactions and regulatory post-translational modifications of this key oncoprotein.
Autores: Richard Bayliss, E. Rejnowicz, M. Batchelor, E. Leen, M. S. Ahangar, M. W. Richards, A. Kalverda
Última atualização: 2024-05-23 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.22.595265
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.22.595265.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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