Proteínas Myc: Reguladores Chave no Câncer e na Expressão Gênica
As proteínas Myc controlam a atividade gênica e estão ligadas ao desenvolvimento do câncer.
Richard Bayliss, E. Leen, S. Yeoh, E. Sahak, E. Mitchell, G. Wildsmith, M. Batchelor, A. N. Calabrese, G. Büchel
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Índice
- Funções das Proteínas Myc
- Como as Proteínas Myc Funcionam
- N-Myc e Câncer Infantil
- Interações com Outras Proteínas
- Entendendo a Estrutura da TFIIIC
- Preparando e Estudando as Proteínas Myc
- Métodos para Analisar Interações
- Insights sobre a Ligação de Proteínas
- Peptídeos de N-Myc e Sua Ligação
- O Papel do Plug Ácido
- Modelando a Interação
- Conclusão: Entendendo Myc e TFIIIC
- Fonte original
- Ligações de referência
A família de proteínas Myc inclui c-Myc, N-myc e L-Myc. Essas proteínas são importantes porque ajudam a controlar como os genes são ativados ou desativados nas células. Elas estão envolvidas em muitos processos, como crescimento e desenvolvimento, e têm um papel no câncer quando ficam hiperativas.
Essas proteínas são conhecidas como fatores de transcrição, que são como interruptores que ativam ou desativam genes. Elas fazem isso se ligando a partes específicas do DNA. As proteínas Myc geralmente ficam em uma forma flexível, mas têm uma parte específica que ajuda a se conectar a outra proteína chamada MAX. Quando Myc e MAX se juntam, elas se ligam a sequências de DNA conhecidas como E-boxes.
Funções das Proteínas Myc
As proteínas Myc têm papéis cruciais em como nossos corpos se desenvolvem e mantêm os tecidos. Elas ajudam a controlar processos como o crescimento celular e o metabolismo. Infelizmente, quando essas proteínas não são reguladas corretamente, podem levar ao câncer. Estudos mostram que quase 30% das amostras de câncer variadas têm cópias em excesso dos genes Myc.
As proteínas Myc amplificam os efeitos de outros sinais que dizem às células para crescer e se dividir. Elas podem ativar os três tipos de RNA Polimerases, que são importantes para fazer RNA a partir do DNA. Esse processo é essencial para produzir as proteínas que fazem a maior parte do trabalho nas células.
Como as Proteínas Myc Funcionam
Embora saibamos que as proteínas Myc são importantes para ativar genes, as maneiras exatas como fazem isso não são totalmente compreendidas. As proteínas Myc interagem com muitas outras proteínas na célula. Elas parecem trabalhar ajudando outras proteínas que influenciam a embalagem do DNA e a atividade gênica. Por exemplo, elas podem aumentar certas modificações químicas na RNA polimerase, facilitando para essa enzima iniciar o processo de produção de RNA.
Estudos recentes também mostram que as proteínas Myc podem afetar quanto tempo um gene fica ativo e quanto tempo outras proteínas permanecem ligadas ao DNA. Em altas concentrações, N-Myc pode se agrupar com outras moléculas que indicam o uso ativo do gene.
N-Myc e Câncer Infantil
N-Myc é particularmente importante no neuroblastoma, um tipo de câncer que ocorre em crianças pequenas. Ele foi encontrado pela primeira vez em células de neuroblastoma, e ter cópias extras de N-Myc é um sinal de que a doença pode piorar. Curiosamente, N-Myc pode assumir algumas funções de c-Myc durante o desenvolvimento de camundongos, sugerindo que eles podem basicamente se substituir.
Essas proteínas têm regiões especiais chamadas caixas Myc que ajudam a cumprir seus papéis. As três primeiras caixas Myc estão na parte da proteína responsável por ativar a Expressão Gênica. Essa parte é crucial tanto para ativar genes quanto para atividades relacionadas ao câncer.
Interações com Outras Proteínas
Uma das proteínas que interagem com Myc se chama TFIIIC. Essa proteína ajuda a trazer a RNA polimerase para as regiões do DNA que precisam ser ativadas. TFIIIC consiste em diferentes partes que se ligam a sequências específicas de DNA e ajudam a recrutar a RNA polimerase.
Descobertas recentes mostraram que TFIIIC e as proteínas Myc interagem de perto. Tanto N-Myc quanto c-Myc mostraram que podem se conectar diretamente a partes específicas de TFIIIC. Essa conexão parece ser importante para quão bem a RNA polimerase pode ser recrutada para os genes que precisam ser ativados.
Entendendo a Estrutura da TFIIIC
TFIIIC é um complexo feito de diferentes subunidades que ajudam a cumprir suas funções. TFIIIC interage com outro complexo chamado TFIIIB, que por sua vez ajuda a recrutar a RNA polimerase para os lugares certos no DNA. Cada uma dessas subunidades tem papéis específicos e pode se ligar a diferentes regiões do DNA.
Entender a estrutura da TFIIIC tem sido uma área importante de estudo. Avanços recentes revelaram que uma de suas subunidades é mais complexa do que se pensava anteriormente. Ela contém partes que ajudam a ligá-la a outros complexos de proteínas e a se ligar ao DNA.
Preparando e Estudando as Proteínas Myc
Para estudar essas proteínas, os pesquisadores criam diferentes versões delas em laboratório. Eles cultivam essas proteínas em bactérias e depois as purificam para estudar como interagem entre si e com o DNA.
Por exemplo, eles usam técnicas específicas para capturar as proteínas e remover impurezas. Isso permite que os cientistas investiguem como as proteínas Myc se ligam a TFIIIC e entendam os detalhes de suas interações.
Métodos para Analisar Interações
Para analisar como as proteínas Myc interagem com TFIIIC, diferentes métodos são usados. Por exemplo, experimentos podem ser realizados para ver como a ligação de proteínas muda quando diferentes partes das proteínas são alteradas.
Os pesquisadores também podem usar técnicas que medem como as proteínas trocam átomos de hidrogênio. Isso ajuda a entender como a ligação afeta a estrutura das proteínas, revelando mais sobre como elas trabalham juntas.
Insights sobre a Ligação de Proteínas
Usando várias técnicas, os pesquisadores identificaram partes específicas de Myc que são cruciais para sua interação com TFIIIC. Certas sequências em Myc mostraram forte ligação a TFIIIC, indicando que essas regiões são essenciais para sua interação.
Além disso, a ligação das proteínas Myc a TFIIIC pode influenciar quão bem os genes são ativados. Interações entre as proteínas Myc e TFIIIC podem afetar a atividade geral da RNA polimerase enquanto ela se move ao longo do DNA para produzir RNA.
Peptídeos de N-Myc e Sua Ligação
Pesquisadores sintetizaram pequenas partes de N-Myc para testar quão bem elas se ligam a TFIIIC. Alguns desses peptídeos mostram forte atividade de ligação, ajudando a identificar as áreas-chave de Myc responsáveis pela interação.
Os resultados sugerem que existem sequências específicas dentro de N-Myc que são importantes para a ligação a TFIIIC. Essas sequências incluem tanto as partes iniciais quanto finais da estrutura de N-Myc.
O Papel do Plug Ácido
Dentro da TFIIIC, há uma região conhecida como plug ácido. Essa parte parece bloquear outras proteínas, incluindo N-Myc, de se ligarem efetivamente. Os pesquisadores descobriram que, quando o plug ácido está presente, a ligação de N-Myc é reduzida.
Isso sugere que o plug ácido desempenha um papel significativo em determinar quais proteínas podem interagir com TFIIIC em um determinado momento. Ao entender como o plug ácido funciona, os cientistas podem obter insights sobre como controlar melhor as interações de proteínas nas células.
Modelando a Interação
Os pesquisadores criaram modelos para prever como os peptídeos de N-Myc se encaixam na TFIIIC. Esses modelos ajudam a visualizar suas interações em 3D, fornecendo uma imagem mais clara de como essas proteínas se juntam.
No entanto, enquanto esses modelos oferecem insights valiosos, eles precisam ser validados com dados experimentais reais para confirmar sua precisão.
Conclusão: Entendendo Myc e TFIIIC
Resumindo, as proteínas Myc são cruciais para controlar a expressão gênica e têm papéis significativos no desenvolvimento de certos cânceres. Suas interações com TFIIIC são vitais para entender como essas proteínas influenciam a atividade da RNA polimerase e a regulação gênica.
Pesquisas futuras continuarão a explorar essas interações, revelando mais detalhes sobre como as proteínas Myc funcionam e como podem ser direcionadas para fins terapêuticos no tratamento do câncer. O conhecimento adquirido ao estudar essas proteínas será importante para desenvolver estratégias para combater os efeitos do câncer relacionados à atividade de Myc.
Título: Mechanism of Interaction Between the Transactivation Domain of N-MYC and the DNA-Binding Surface of TFIIIC5
Resumo: N-myc is a member of the myc family of transcription factors, which are powerful drivers of cellular growth and consequently, important oncoproteins. N-myc interacts with many factors and complexes to affect transcription. One such complex is the RNA Polymerase III assembly factor, TFIIIC, a six-member complex that is essential for the transcription of small, structured RNA. TFIIIC and N-myc mutually restrict each others chromatin association, and their complex contributes to quality control in mRNA transcription. We previously demonstrated that the largely intrinsically disordered transactivation domain of N-myc interacts directly with a sub-complex of TFIIIC, {tau}A. Structural studies by others show that DNA binding of {tau}A is largely mediated by TFIIIC3, which suggests that TFIIIC5 is at most a secondary binding site for DNA. Here we identified the DNA binding domain of TFIIIC5 as a key binding site for N-myc. We used an integrated approach combining NMR, HDX mass spectrometry, pull-downs and biophysical assays to elucidate the molecular basis of the interaction. Two sequences in the transactivation domain of N-myc bind to the DNA binding interface of TFIIIC5. AlphaFold modelling predicts a high-confidence binding mode for the higher affinity N-myc motif that overlaps with the predicted intramolecular binding site of the C-terminal acidic plug of TFIIIC5, removal of which enhances the binding of N-myc. The same two motifs in N-myc also interact with Aurora-A kinase, which competes with N-myc for TFIIIC binding during S-phase. This model elucidates how the N-myc:TFIIIC5 interaction competes with other interactions, providing a basis for their mutual censoring function and regulation. GRAPHICAL ABSTRACT O_FIG O_LINKSMALLFIG WIDTH=200 HEIGHT=125 SRC="FIGDIR/small/619198v1_ufig1.gif" ALT="Figure 1"> View larger version (33K): [email protected]@[email protected]@37dd2f_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG C_FIG
Autores: Richard Bayliss, E. Leen, S. Yeoh, E. Sahak, E. Mitchell, G. Wildsmith, M. Batchelor, A. N. Calabrese, G. Büchel
Última atualização: 2024-10-20 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.19.619198
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.19.619198.full.pdf
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