O Papel da Brachyury no Desenvolvimento do Câncer
O impacto da brachyury no câncer, especialmente no cordoma, revela novas possibilidades de tratamento.
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Índice
A família de fatores de transcrição T-box tem um papel fundamental no corpo, regulando a atividade dos genes. Essas proteínas têm 18 membros nos humanos e são encontradas em várias espécies de animais. Elas podem atuar como promotores ou inibidores da atividade gênica, o que é crucial para o desenvolvimento de diferentes tipos de células. Quando há falhas nesses genes T-box, pode resultar em diversos distúrbios no desenvolvimento.
Brachyury e Seu Papel no Câncer
Um membro importante da família T-box é o brachyury, codificado pelo gene TBXT. O brachyury foi descoberto no início do século 20 e tem sido estudado extensivamente desde então. É essencial para o desenvolvimento de estruturas específicas no corpo, incluindo a notocorda, que é fundamental para a formação da coluna vertebral. No entanto, depois de um certo ponto no desenvolvimento humano, a expressão do brachyury cai significativamente, exceto em alguns tipos de tecidos como a tireoide e a glândula pituitária.
Curiosamente, níveis anormais de brachyury são encontrados em vários tipos de câncer, com uma forte ligação ao cordoma, um tipo raro de câncer ósseo. O cordoma ocorre ao longo da medula espinhal e acredita-se que surja de células remanescentes da notocorda embrionária. Infelizmente, tratar cordoma é desafiador, geralmente exigindo cirurgia, seguida de radiação e quimioterapia. A recorrência desse câncer é comum, e quem é afetado geralmente tem uma sobrevida média de apenas cerca de 7,7 anos.
Estudos recentes mostraram que o gene TBXT é frequentemente duplicado em pacientes com cordoma e é crítico para o crescimento celular em modelos laboratoriais da doença. Além disso, uma variação genética específica (G177D) no gene brachyury foi identificada, aumentando o risco de desenvolver cordoma. Essa variação muda um aminoácido na proteína brachyury, mas o efeito exato dessa mudança na função da proteína ainda é incerto.
Brachyury em Outros Cânceres
Para além do cordoma, o brachyury também foi implicado em outros tipos de câncer. Parece promover o crescimento e ajudar em um processo chamado transição epitelial-mesenquimal (EMT), que permite que células cancerígenas se espalhem de seu local original. Essa transição é essencial para a metástase, onde células cancerígenas se espalham para outras partes do corpo. Sugere-se que a interação do brachyury com certos genes é chave para seu papel nesses processos, especialmente porque pode afetar o gene E-caderina, que é um jogador importante na manutenção das conexões celulares.
Níveis altos de brachyury também foram ligados à resistência contra algumas formas de quimioterapia e radiação. Essa informação sugere que direcionar o brachyury poderia ser uma estratégia eficaz para tratar certos cânceres.
O Desafio de Dirigir o Brachyury
Dado seu papel crítico nos tumores, o brachyury parece um alvo promissor para novos tratamentos contra o câncer. No entanto, direcionar fatores de transcrição como o brachyury é geralmente considerado difícil. Essas proteínas não têm bolsões ou áreas claras onde drogas possam se ligar, dificultando a criação de tratamentos eficazes. Métodos tradicionais de descoberta de medicamentos podem não funcionar bem aqui.
Pesquisadores examinaram a estrutura do brachyury para encontrar maneiras de direcioná-lo de forma eficaz. Eles trabalharam para visualizar a forma da proteína e como ela interage com o DNA. Isso é essencial para entender como interromper sua função. Usando técnicas avançadas como cristalografia de raios-X, os cientistas conseguem ver como o brachyury se liga ao DNA e o que isso significa para sua função.
Entendendo a Estrutura do Brachyury
Em estudos laboratoriais, pesquisadores conseguiram produzir estruturas cristalinas do brachyury ligadas ao DNA, permitindo que eles examinassem como ele reconhece sequências específicas de DNA. Descobriram que a estrutura do brachyury é semelhante a outros membros da família T-box, mas com características únicas.
O brachyury geralmente se liga ao DNA de uma maneira específica, e os pesquisadores identificaram uma sequência comum que ele reconhece. Esse reconhecimento é crucial para seu papel na regulação da atividade gênica. Entender essas interações ajuda os cientistas a explorar como interrompê-las, potencialmente levando a novas terapias contra o câncer.
Triagem de Fragmentos
Técnicas dePara identificar potenciais candidatos a medicamentos, os pesquisadores usaram técnicas de triagem de fragmentos. Isso envolve mergulhar pequenas moléculas em cristais de brachyury para ver se elas se ligam. Analisando os resultados, os cientistas podem encontrar pedaços menores ou fragmentos que podem ser pontos de partida promissores para desenvolver medicamentos que visem o brachyury.
Durante essas triagens, os pesquisadores encontraram múltiplos fragmentos que se ligam a diferentes partes do brachyury. Embora nem todos esses fragmentos levem diretamente a medicamentos eficazes, eles fornecem insights valiosos sobre onde novos candidatos a medicamentos podem ser projetados.
Otimizando Candidatos a Medicamentos
Depois de descobrir vários fragmentos de ligação, os pesquisadores se concentram em otimizar esses candidatos para melhorar sua eficácia. Esse processo inclui ajustar as estruturas químicas dos fragmentos para aumentar sua afinidade de ligação, ou seja, o quão fortemente eles aderem ao alvo.
Modificações na composição química podem levar a candidatos mais eficazes, que podem servir não apenas como terapias, mas também como ferramentas para estudar as funções do brachyury no câncer e em outros processos.
Relevância Biológica da Variação G177D
Embora a variação G177D não mude significativamente como o brachyury se liga ao DNA em testes, entender sua importância biológica é crucial. Os pesquisadores estudaram linhagens celulares para ver se essa variação se comporta de maneira diferente em um contexto vivo.
Foi mostrado que a presença da variação G177D não parece afetar significativamente a atividade geral do brachyury, sugerindo que tanto as formas normais quanto as variantes devem ser alvo em terapias potenciais.
Conclusão
Em resumo, a família de proteínas T-box, particularmente o brachyury, desempenha um papel essencial em vários cânceres, incluindo o cordoma. Embora haja desafios em direcionar fatores de transcrição para o desenvolvimento de medicamentos, os avanços recentes na compreensão da estrutura e funcionalidade do brachyury fornecem caminhos promissores para a pesquisa futura. Aproveitando a triagem de fragmentos e insights estruturais, os pesquisadores estão otimistas sobre o desenvolvimento de tratamentos eficazes que visem o brachyury, potencialmente beneficiando pacientes com cordoma e outros cânceres ligados a essa proteína crucial.
Título: Structures of the human transcription factor brachyury offer insights into DNA recognition, and identify small molecule binders for the development of degraders for cancer therapy
Resumo: The transcription factor brachyury is a member of the T-Box family of transcription factors. It is active during embryogenesis and is required for the formation of the posterior mesoderm and the notochord in vertebrates. Aside from its role in embryogenesis, brachyury plays an essential role in tumour growth of the rare chordoma bone cancer and is implicated in other solid tumours. Given that brachyury is minimally expressed in healthy tissues, these findings suggest that brachyury is a potential therapeutic target in cancer. Unfortunately, as a ligandless transcription factor, brachyury has historically been considered undruggable. To investigate direct targeting of brachyury by small molecules, we initially determined the structure of human brachyury both in complex with its cognate DNA and in the absence of DNA. Analysis of these structures provided insights into brachyury DNA binding and the structural context of the G177D variant which is strongly associated with chordoma risk. We used these structures to perform a crystallographic fragment screen of brachyury and identify hotspot regions on numerous pockets on the brachyury surface. Finally, we have performed follow-up chemistry on fragment hits and describe the structure-based progression of a thiazole-containing chemical series. Excitingly, we have produced brachyury binders with low {micro}M potency that can serve as starting point for further medicinal chemistry efforts. These data show that brachyury is ligandable and provides an example of how crystallographic fragment screening may be used to find ligands to target protein classes that are traditionally difficult to address using other approaches.
Autores: Joseph A Newman, A. E. Gavard, N. Imprachim, H. Aitkenhead, H. E. Sheppard, P. A. Clarke, M. A. Hossain, L. Temme, H. Oh, C. I. Wells, Z. W. Davis-Gilbert, P. Workman, O. Gileadi, D. Drewry
Última atualização: 2024-06-06 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597736
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597736.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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