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# Biologia# Genómica

Visões sobre a Diversidade e Seleção de Células T

Pesquisas mostram mais sobre a diversidade dos receptores T e o que isso significa para as respostas imunológicas.

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Índice

As Células T são uma parte chave do sistema imunológico, ajudando o corpo a combater infecções e doenças. Elas reconhecem moléculas específicas chamadas antígenos, que estão presentes na superfície de muitas células. Esses antígenos são apresentados às células T por proteínas especiais chamadas complexos maiores de histocompatibilidade (MHC). Existem duas classes principais de MHC: classe I e classe II. O MHC classe I apresenta antígenos para células T CD8+, enquanto o MHC classe II apresenta para células T CD4+.

As células T têm receptores em sua superfície, conhecidos como receptores de células T (TCRS). Os TCRs são importantes porque ajudam as células T a distinguir entre antígenos "próprios" e "estranhos". Essa distinção é crucial para evitar atacar as próprias células do corpo enquanto consegue direcionar células infectadas ou cancerosas.

Desenvolvimento e Seleção de Células T

As células T se desenvolvem no timo, um órgão pequeno localizado no peito. Durante seu desenvolvimento, as células T passam por várias fases de maturação, que incluem rearranjar seus genes TCR. Esse processo cria Diversidade nos TCRs, permitindo que eles reconheçam uma ampla gama de antígenos.

O desenvolvimento e a seleção das células T podem ser divididos em várias etapas:

  1. As células T começam como células precursoras e passam por diferentes estágios, sendo eles duplo negativo (DN), duplo positivo (DP) e único positivo (SP).
  2. No estágio DN, as células T rearranjam seus genes TCR para produzir uma cadeia TCRβ funcional, permitindo que elas passem por um ponto de controle.
  3. Em seguida, as células T rearranjam sua cadeia TCRα. Se o TCR conseguir se ligar às moléculas MHC próprias, a célula T sobrevive a um processo conhecido como seleção positiva no timo.
  4. As células T que se ligam com muita força ao MHC próprio durante a seleção negativa são eliminadas para evitar autoimunidade.

Estrutura do Receptor de Células T

Cada TCR é composto por duas cadeias, TCRα e TCRβ. Essas cadeias são formadas através de um processo chamado recombinação V(D)J, onde diferentes segmentos de genes são rearranjados para criar um TCR único. Esse processo introduz diversidade genética, permitindo que cada célula T reconheça diferentes antígenos.

A parte do TCR que se liga diretamente aos antígenos é chamada de região determinante de complementaridade 3 (CDR3). Outras regiões, CDR1 e CDR2, ajudam principalmente o TCR a se ligar ao MHC, em vez de reconhecer o próprio antígeno.

A Importância da Diversidade Genética

A diversidade dos TCRs é essencial para a capacidade do sistema imunológico de responder a vários patógenos. No entanto, ela é influenciada por processos genéticos aleatórios e fatores genéticos herdados. Por exemplo, gêmeos idênticos muitas vezes têm repertórios de TCRs mais similares porque compartilham o mesmo conjunto de alelos MHC.

Esse componente genético levanta perguntas interessantes sobre como os TCRs e os MHCS evoluem juntos e como diferentes combinações de alelos HLA (antígeno leucocitário humano) podem afetar as respostas imunológicas.

Análise do Repertório de Células T

Pesquisas sobre repertórios de células T são cruciais para entender como o sistema imunológico funciona. Ao estudar os TCRs, os cientistas podem aprender sobre a diversidade de células T em diferentes indivíduos e como elas respondem a várias infecções. No entanto, analisar os TCRs apresenta desafios devido à sua vasta diversidade.

As técnicas modernas de sequenciamento melhoraram a capacidade de estudar os TCRs, mas os métodos de alta capacidade ainda são limitados na capacidade de vincular duas cadeias de TCR (TCRα e TCRβ) da mesma célula T. Para enfrentar esse desafio, os pesquisadores desenvolveram um novo método chamado CITR-seq, que permite um sequenciamento eficiente e econômico dos TCRs.

CITR-seq: Um Novo Método para Sequenciamento de TCR

CITR-seq é uma técnica projetada para estudar cadeias pareadas de TCRα e TCRβ em grandes números de células T. O método combina várias etapas para capturar com precisão TCRs de uma ampla gama de células enquanto mantém os custos gerenciáveis.

As etapas principais do CITR-seq incluem:

  1. Isolamento de Células: Células T CD8+ são isoladas de baços de camundongos usando esferas magnéticas e depois purificadas através da sorting de células ativadas por fluorescência (FACS).
  2. Codificação de Barras e Transcrição Reversa: Os TCRs são transcritos reversamente em cDNA dentro de células individuais, anexando códigos de barras únicos que identificam a célula de origem.
  3. Amplificação e Preparação da Biblioteca: O cDNA codificado em barras é amplificado e preparado para sequenciamento, criando uma biblioteca que pode ser analisada usando plataformas de sequenciamento de alta capacidade.

O CITR-seq permite que os pesquisadores analisem milhões de células T de uma vez e capturem seus TCRs pareados de forma eficiente. Isso ajuda a fornecer uma visão abrangente da diversidade dos TCRs entre diferentes indivíduos e populações.

Compreendendo a Diversidade do Repertório de Células T

A diversidade nos repertórios de células T é influenciada por muitos fatores, incluindo variações genéticas e os processos de seleção positiva e negativa durante o desenvolvimento das células T. Por exemplo, certos segmentos de genes TCR podem ser mais comuns em alguns indivíduos devido à herança genética ou aos anticorpos específicos aos quais seu sistema imunológico foi exposto.

Comparando os repertórios de TCR entre diferentes linhagens de camundongos, os pesquisadores podem descobrir como o background genético afeta a seleção e a diversidade das respostas das células T. Essa comparação é essencial para entender por que alguns indivíduos podem ter respostas imunológicas mais fortes a infecções ou vacinas.

O Papel do Timo na Seleção de TCR

O timo desempenha um papel crucial na formação do repertório de células T. As células T que não conseguem se ligar efetivamente ao MHC ou que se ligam com muita força a antígenos próprios são eliminadas. Esse processo de seleção garante que células T maduras possam reconhecer invasores estrangeiros sem atacar o próprio corpo.

Diferentes espécies de camundongos apresentam padrões únicos no uso de segmentos de genes TCR e nos processos de seleção. Por exemplo, algumas linhagens podem mostrar maior variabilidade em seu uso de genes V(D)J, levando a diferenças em como seus sistemas imunológicos respondem.

Investigando a Diversidade do TCR entre Espécies de Camundongos

Nesta pesquisa, os cientistas usaram o CITR-seq para analisar repertórios de TCR de várias espécies de camundongos inbred e seus híbridos. O objetivo era entender como a composição genética influencia a diversidade do TCR e os processos que moldam as respostas imunológicas.

Ao examinar os repertórios de TCR de 32 camundongos de quatro espécies diferentes, os pesquisadores descobriram padrões significativos no uso de genes V(D)J. Esses padrões revelam como o desenvolvimento e a seleção das células T diferem entre as espécies, com possíveis implicações para entender a função do sistema imunológico em humanos.

Resultados do Estudo

Os resultados indicaram que a diversidade dos TCRs é altamente estruturada e influenciada por herança genética e fatores ambientais. Por exemplo, o estudo descobriu que certos segmentos de TCR eram mais prevalentes em linhagens específicas de camundongos e que essas diferenças persistiam mesmo na prole híbrida.

Além disso, a análise de TCRs pareados mostrou que o processo de seleção tímica afeta fortemente o repertório final de TCR. Essa seleção leva a viéses em quais segmentos de genes TCR são usados, moldando ainda mais a diversidade da resposta imunológica.

Conclusões

Em resumo, estudar a diversidade dos TCRs é vital para entender a imunidade adaptativa e suas implicações para a saúde e doenças. O desenvolvimento de novos métodos, como o CITR-seq, permite que os pesquisadores explorem os TCRs em detalhes sem precedentes, destacando a importância dos fatores genéticos na formação das respostas imunológicas.

Ao analisar os repertórios de TCR entre diferentes espécies e seus híbridos, os cientistas podem obter insights sobre os mecanismos que impulsionam a diversidade imunológica. Esse conhecimento pode levar a melhores estratégias para o desenvolvimento de vacinas e tratamentos para doenças autoimunes.

As descobertas desta pesquisa sublinham a complexa interação entre genética e o sistema imunológico, ressaltando a necessidade de mais estudos para desvendar as intricadas questões do desenvolvimento e da função das células T.

Fonte original

Título: Genetic determinants of distinct CD8+ α/β-TCR repertoires in the genus Mus

Resumo: The adaptive immune systems efficacy relies on the diversity of T cell receptors and the ability to distinguish between self and foreign antigens. Analysis of the paired heterodimeric {beta}-TCR chains of individual T cells requires single-cell resolution, but existing single-cell approaches offer limited coverage of the vast TCR repertoire diversity. Here we introduce CITR-seq, a novel, instrument-free, high-throughput method for single-cell TCR sequencing with >88% {beta}-TCR pairing precision. We analyzed the TCR repertoires of CD8+ T cells originated from 32 inbred mice using CITR-seq, comprising four evolutionary divergent sister species and their F1 hybrids. Overall, we identified more than 5 million confidently paired TCRs. We found that V(D)J gene usage patterns are highly specific to the genotype and that V{beta}-gene usage is strongly impacted by thymic selection. Using F1 hybrids, we show that differences in gene segment usage across species are likely caused by cis-acting factors prior to thymic selection, which imposed strong allelic biases. At the greatest divergence, this led to increased rates of TCR depletion through rejection of particular V{beta}-genes. TCR repertoire overlap analysis across all mice revealed that sharing of identical paired CDR3 amino acid motifs is four times more frequent than predicted by random pairing of TCR and TCR{beta} chains, with significantly increased sharing rates among related individuals. Collectively, we show that beyond the stochastic nature of TCR repertoire generation, genetic factors contribute significantly to the shape of an individuals repertoire.

Autores: Yingguang Frank Chan, M. A. Peters, V. Soltys, D. Su, M. Kucka

Última atualização: 2024-09-11 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.05.611437

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.05.611437.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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