O Papel dos Receptores de Células T na Imunidade
Os receptores de células T são essenciais para as respostas imunológicas contra várias ameaças.
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Índice
As células T têm um papel crucial no nosso sistema imunológico. Elas ajudam a identificar o que faz parte do nosso corpo e o que é estranho, tipo germes ou vírus. Quando encontram algo estranho, elas decidem se devem iniciar uma resposta imunológica pra combater isso. Essa decisão se baseia na capacidade delas de reconhecer marquinhas especiais chamadas Antígenos.
Receptores de Células T
Antígenos eAs células T reconhecem os antígenos através de moléculas que chamamos de receptores de células T (TCRS). Cada célula T tem um TCR único que ajuda a detectar uma variedade de possíveis ameaças. O TCR é formado por duas partes: uma cadeia alfa e uma cadeia beta. Essas cadeias são criadas por um processo chamado recombinação V(D)J, que mistura diferentes segmentos de DNA. Esse processo ajuda a criar um pool diversificado de TCRs que podem reconhecer muitos antígenos diferentes.
Embora os cientistas achem que o número de TCRs possíveis dessa recombinação poderia ser extremamente alto, o número real de TCRs encontrados em indivíduos é bem menor. Isso acontece porque nem todas as células T sobrevivem ao processo de desenvolvimento, e muitas que sobrevivem podem não ser funcionais.
Estrutura dos Receptores de Células T
Os blocos de construção dos TCRs são segmentos de DNA conhecidos como segmentos de genes V, D e J. O processo de fabricar TCRs envolve cortar e juntar esses segmentos. Um componente importante nesse processo é um complexo proteico chamado Rag1/Rag2. Esse complexo ajuda a fazer cortes no DNA em lugares precisos pra permitir o rearranjo dos segmentos de genes. Depois dos cortes, o DNA é refeito através de um mecanismo chamado união de extremidades não-homólogas.
Existem sinais específicos que guiam esse rearranjo. Esses sinais são chamados de sequências de sinal de recombinação (RSS). Eles ajudam a garantir que a mistura dos segmentos de genes aconteça corretamente, permitindo a produção de TCRs funcionais.
Diversidade dos Genes TCR
Os cientistas observaram que o número de segmentos de genes TCR funcionais varia bastante entre diferentes espécies. Esses segmentos são agrupados em famílias com base em suas semelhanças. Nos camundongos, por exemplo, existem muitos segmentos de genes TCR, mas alguns segmentos são mais comuns que outros.
A região alfa do TCR (TCRα) contém um grande número de segmentos de genes TCR, enquanto a região beta do TCR (TCRβ) tem menos. O número de segmentos de genes TCR também pode mudar entre diferentes linhagens de camundongos, indicando que a evolução tem um papel na formação desses genes.
Expansão e Contração de Genes
A expansão e contração de lócus são comuns em segmentos de genes TCR. Isso significa que certos segmentos podem aumentar ou diminuir em número ao longo do tempo. Isso acontece através de um processo conhecido como modelo de nascimento e morte, onde duplicações e deleções de genes moldam a composição das famílias de genes.
Nos camundongos, algumas expansões no lócus TCRα são significativas. Um evento notável aconteceu onde uma grande parte da região TCRα se expandiu há apenas alguns milhões de anos. Isso sugere que existe um processo dinâmico acontecendo que influencia a estrutura dos genes TCR.
Diferenças Entre Linhagens de Camundongos
Diferentes linhagens de camundongos mostram variações em seus segmentos de genes TCR. Por exemplo, os pesquisadores notaram que enquanto algumas linhagens de camundongos expandiram seus segmentos de genes TCRα, outra linhagem mostrou uma contração, perdendo muitos de seus segmentos TCRα.
Essas diferenças são importantes pra entender porque podem impactar quão bem o sistema imunológico funciona em diferentes indivíduos. Algumas linhagens podem estar melhor equipadas pra reconhecer e responder a infecções do que outras por causa da sua composição única de TCR.
O Papel dos Segmentos de Genes Imunes
Os segmentos de genes TCR são cruciais para formar os receptores imunológicos que protegem o corpo. O processo pelo qual esses segmentos se rearranjam e criam receptores funcionais é essencial para uma resposta imunológica robusta. O número de segmentos de genes disponíveis influencia quão diversos os TCRs podem ser, o que por sua vez afeta a capacidade do sistema imunológico de responder a várias ameaças.
Pesquisa sobre Genes TCR em Espécies de Camundongos Selvagens
Estudos com linhagens de camundongos derivados da natureza revelaram muito sobre a diversidade dos segmentos de genes TCR. Ao observar linhagens de camundongos que se divergiram recentemente, os pesquisadores podem ver como os lócus TCR mudam ao longo do tempo. Esses estudos mostram não apenas a quantidade de segmentos, mas também sua funcionalidade e expressão em diferentes linhagens.
Em um caso, uma linhagem específica de camundongo mostrou uma redução nos segmentos TCRα em comparação a outras. Essa redução pode ser significativa pra entender como as respostas imunológicas diferem entre espécies. A natureza dinâmica dos segmentos de genes TCR permite uma adaptação contínua a novos patógenos.
Importância do Sequenciamento e Anotação
Pra pesquisa, sequenciar e anotar corretamente os segmentos de genes TCR é fundamental. Usando dados genômicos, os cientistas podem fazer inferências sobre a diversidade dos TCRs em diferentes espécies. Porém, devido à complexidade e variações nas regiões do gene TCR, lacunas nos dados genômicos podem dificultar a identificação de todos os segmentos de genes funcionais.
Pra superar isso, os pesquisadores usam dados transcriptômicos, que fornecem insights sobre os TCRs expressos em organismos vivos. Isso permite uma melhor validação do uso dos segmentos TCR e ajuda a esclarecer a paisagem dos segmentos de genes em várias linhagens.
Expressão dos Segmentos de Genes TCR
Pra validar ainda mais suas descobertas, os pesquisadores extraíram células T de linhagens específicas de camundongos e estudaram o repertório de TCR. Esse processo envolve sequenciar os TCRs presentes nessas células pra examinar quais segmentos de genes estão ativos.
Por exemplo, em um estudo envolvendo uma linhagem específica de camundongo, uma variedade de segmentos de genes TCR foi expressa, confirmando a presença de genes funcionais e pseudogenes. Isso ajuda os cientistas a entender como os TCRs são utilizados nas respostas imunológicas e destaca o potencial de encontrar segmentos novos que podem ter um papel na imunidade.
Conclusão sobre a Diversidade do TCR
A diversidade dos segmentos de genes TCR é essencial pro funcionamento eficaz do sistema imunológico. A capacidade de rearranjar esses segmentos de genes permite uma ampla gama de respostas a diversos patógenos. Entender a dinâmica dos segmentos de genes TCR em diferentes linhagens de camundongos e como eles podem mudar ao longo do tempo fornece insights valiosos sobre a evolução do sistema imunológico.
Os pesquisadores continuam a estudar esses segmentos de genes pra ganhar uma visão mais clara de como a diversidade do TCR afeta a função imunológica. A exploração contínua dos TCRs em vários organismos provavelmente vai trazer novas descobertas que podem ampliar nosso conhecimento sobre a imunidade adaptativa.
Título: Distinct evolution at TCRα and TCRβ loci in the genus Mus
Resumo: T cells recognize an immense spectrum of pathogens to initiate immune responses by means of a large repertoire of T cell receptors (TCRs) that arise from somatic rearrangements of variable, diversity and joining gene segments at the TCR loci. These gene segments have emerged from a limited number of ancestral genes through a series of gene duplication events, resulting in a greatly variable number of such genes across different species. Apart from the complete V(D)J gene annotations in the human and mouse reference assemblies, little is known about the structure of TCR loci in other species. Here, we performed a comprehensive comparison of the TCR and TCR{beta} gene segment clusters in mice and three of its closely related sister species. We show that the TCR variable gene cluster is frequently rearranged, leading to deletions and sequence inversions in this region. The resulting complexity of TCR loci severely complicates the assembly of these loci and the annotation of gene segments. By jointly utilizing genomic and transcriptomic data, we show that in Mus musculus castaneus the variable gene cluster at the locus has undergone a recent major locus contraction, leading to the loss of 74 variable gene segments. Additionally, we validated the expression of functional variable genes, including atypical ones with inverted orientation relative to other such segments. Disentangling the fine-scale structure of TCR loci in different species can provide valuable insights in the evolution and diversity of TCR repertoires.
Autores: Yingguang Frank Chan, M. A. Peters, V. Soltys, D. Su
Última atualização: 2024-09-11 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.05.611428
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.05.611428.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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