Entendendo Comunidades Microbianas: Insights de Experimentos Controlados
Pesquisadores estudam comunidades microbianas pra revelar padrões na biodiversidade e no impacto ambiental.
William R. Shoemaker, A. Sanchez, J. Grilli
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Índice
As Comunidades Microbianas são grupos de seres vivos minúsculos, como bactérias, que estão praticamente em todo lugar na Terra. Elas são abundantes e diversas, ou seja, tem vários tipos diferentes. Esses microrganismos desempenham papéis essenciais para manter nosso planeta saudável e apoiar a vida. Por exemplo, eles ajudam em processos que tornam os nutrientes disponíveis no meio ambiente e até afetam a saúde de seres vivos maiores, incluindo os humanos. A coleção de microrganismos que vivem em nossos corpos, conhecida como microbioma, é crucial para o nosso bem-estar.
Dada a importância das comunidades microbianas para o nosso meio ambiente, saúde e economia, é vital criar teorias que nos ajudem a entender como essas comunidades funcionam. Pesquisadores de várias áreas estão estudando comunidades microbianas usando abordagens diferentes. Dois métodos significativos que recentemente ajudaram a melhorar nosso entendimento são a macroecologia e a ecologia experimental.
Macroecologia
A macroecologia é uma ramificação da ecologia que se concentra no estudo de padrões em larga escala na biodiversidade. Essa abordagem usa métodos estatísticos para fazer previsões sobre as características das comunidades ecológicas sem olhar muito de perto para as interações individuais entre as espécies. Ela tem sido bem-sucedida em identificar vários padrões na ecologia microbiana.
Com o tempo, os cientistas observaram que as comunidades microbianas típicas seguem três padrões principais: 1) o número de cada tipo de micróbio em uma comunidade geralmente segue uma distribuição estatística específica, 2) há uma relação entre a quantidade de um micróbio presente em uma comunidade e sua variabilidade, e 3) a quantidade média de um micróbio em várias comunidades tende a seguir outro padrão estatístico. Essas observações podem ser explicadas usando um modelo matemático simples que descreve como as populações microbianas crescem, o que se mostrou eficaz em prever vários padrões ecológicos.
Ecologia Experimental
Enquanto a macroecologia ajuda a identificar padrões gerais na natureza, a ecologia experimental se concentra em manipular e estudar essas comunidades diretamente em ambientes controlados. Essa abordagem permite aos pesquisadores observar como mudanças em fatores ambientais influenciam as comunidades microbianas. Avanços recentes na tecnologia permitiram que os cientistas estudassem várias comunidades microbianas replicadas em ambientes de laboratório, esclarecendo como as comunidades podem mudar ao longo do tempo.
Por meio de experimentos, os pesquisadores descobriram que mesmo em ambientes aparentemente simples, as comunidades microbianas podem ser muito diferentes. Por exemplo, quando indivíduos se movem entre comunidades, isso pode mudar a diversidade e a composição dessas comunidades.
Neste estudo, o objetivo era conectar os padrões gerais observados na natureza com aqueles encontrados em experimentos controlados. Os pesquisadores analisaram comunidades microbianas formadas em laboratório e como diferentes tratamentos de Migração poderiam influenciar a estrutura das comunidades. Eles introduziram dois tipos de tratamentos de migração: migração regional, onde microrganismos da comunidade original continuavam a se misturar com as comunidades em crescimento, e migração global, onde os microrganismos se moviam mais livremente entre comunidades interconectadas.
Design Experimental
Para investigar esses padrões, os pesquisadores montaram um experimento envolvendo cerca de 100 comunidades replicadas. Eles começaram pegando uma amostra de uma única comunidade de solo e criando muitos microcosmos que forneciam uma única fonte de carbono, como glicose. Cada microcosmos foi permitido crescer por 48 horas e, em seguida, uma parte dele foi usada para iniciar novos microcosmos, repetindo esse processo várias vezes.
Os pesquisadores manipularam as populações dentro desses microcosmos mudando como a migração ocorria. No tratamento de migração regional, amostras da comunidade original foram adicionadas aos microcosmos em crescimento. No tratamento de migração global, amostras de todas as comunidades foram misturadas e redistribuídas para os microcosmos originais no início do próximo ciclo de crescimento.
Principais Descobertas
Os resultados dos experimentos mostraram que as comunidades microbianas no laboratório podiam suportar uma ampla gama de variações ecológicas. Isso é essencial para examinar como diferentes padrões de diversidade microbiana podem existir e persistir ao longo do tempo.
Uma descoberta chave foi que a abundância geral de diferentes microrganismos podia flutuar bastante dependendo da forma de migração aplicada. No tratamento de migração regional, a abundância média das espécies mudou após a migração cessar, enquanto no tratamento de migração global, as flutuações de abundância entre comunidades aumentaram, mas não mudaram significativamente dentro de comunidades individuais.
Os pesquisadores descobriram que os padrões macroecológicos que identificaram em comunidades microbianas naturais também se mantinham verdadeiros em seus ambientes controlados de laboratório. Por exemplo, mesmo ao mudar a forma como a migração ocorria, as relações gerais entre abundância e variabilidade permaneceram consistentes.
O Papel da Migração
A migração desempenha um papel crítico na formação das comunidades microbianas. O estudo mostrou que a migração regional levou a mudanças nas Abundâncias típicas de um jeito que poderia ser previsto pelo modelo matemático deles. No entanto, a migração global afetou principalmente quanta variação havia entre as comunidades, em vez de mudar as abundâncias dos membros individuais.
Os pesquisadores notaram que os efeitos da migração podem ser complexos. No tratamento de migração global, o movimento de microrganismos ajudou a igualar suas abundâncias entre comunidades, levando a menos flutuação nas populações individuais. Em contraste, o tratamento de migração regional permitiu que certas populações voltassem a seus números típicos depois que a migração cessou.
Implicações Mais Amplas
Essas descobertas sugerem que comunidades microbianas em configurações controladas podem refletir os padrões observados na natureza. Essa semelhança abre portas para que os pesquisadores entendam melhor os fatores que influenciam a biodiversidade em ecossistemas estabelecidos. Além disso, a capacidade de manipular essas comunidades oferece insights valiosos sobre como mudanças ambientais podem afetá-las no mundo real.
A pesquisa também destaca a importância de usar modelos estatísticos e matemáticos para prever o comportamento das populações microbianas. Ao estabelecer uma conexão entre experimentos em laboratório e observações naturais, os cientistas podem refinar seu entendimento dos princípios ecológicos que governam esses sistemas complexos.
Conclusão
O estudo das comunidades microbianas é vital para entender a intrincada teia da vida na Terra. Ao vincular experimentos controlados com observações naturais, os pesquisadores podem aprimorar sua compreensão de como esses organismos minúsculos interagem e prosperam em vários ambientes. As descobertas desta pesquisa contribuem para um crescente corpo de conhecimento que pode informar iniciativas de gestão ambiental e saúde pública, enfatizando o papel crítico da diversidade microbiana.
Em resumo, essa pesquisa demonstra que experimentos controlados em laboratório podem ajudar a manter a variação ecológica e documentar padrões semelhantes aos encontrados em comunidades naturais. O uso de abordagens macroecológicas e manipulações experimentais nos aproxima de desvendar as complexidades dos ecossistemas microbianos.
Título: Macroecological patterns in experimental microbial communities
Resumo: Ecology has historically benefited from the characterization of statistical patterns of biodiversity within and across communities, an approach known as macroecology. Within microbial ecology, macroecological approaches have identified universal patterns of diversity and abundance that can be captured by effective models. Experimentation has simultaneously played a crucial role, as the advent of high-replication community time-series has allowed researchers to investigate underlying ecological forces. However, there remains a gap between experiments performed in the laboratory and macroecological patterns documented in natural systems, as we do not know whether these patterns can be recapitulated in the lab and whether experimental manipulations produce macroecological effects. This work aims at bridging the gap between experimental ecology and macroecology. Using high-replication time-series, we demonstrate that microbial macroecological patterns observed in nature exist in a laboratory setting, despite controlled conditions, and can be unified under the Stochastic Logistic Model of growth (SLM). We find that demographic manipulations (e.g., migration) impact observed macroecological patterns. By modifying the SLM to incorporate said manipulations alongside experimental details (e.g., sampling), we obtain predictions that are consistent with macroecological outcomes. By combining high-replication experiments with ecological models, microbial macroecology can be viewed as a predictive discipline.
Autores: William R. Shoemaker, A. Sanchez, J. Grilli
Última atualização: 2024-10-25 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.24.550281
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.24.550281.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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