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Ritmos Circadianos e Câncer: Novas Descobertas

Pesquisas mostram como os relógios internos no câncer são diferentes das células saudáveis.

Bharath Ananthasubramaniam, R. Venkataramanan

― 8 min ler


Explorando os Relógios Explorando os Relógios Internos do Câncer circadianos ao comportamento do câncer. Novas pesquisas ligam ritmos
Índice

Os Ritmos Circadianos são ciclos diários no nosso corpo que ajudam a regular vários processos biológicos. Esses ritmos têm um papel importante em manter nossa saúde geral. Quando esses ritmos são atrapalhados, pode acabar resultando em diferentes problemas de saúde, incluindo várias doenças.

Os relógios internos do nosso corpo estão presentes em vários tecidos, e esses relógios controlam quando certos processos acontecem. Para entender de verdade como esses ritmos funcionam em pessoas saudáveis e doentes, é importante fazer medições ao longo do tempo. Mas coletar amostras regulares de tecidos internos pode ser invasivo e não prático para muita gente.

Avanços na Medição dos Ritmos Circadianos

Para resolver esse problema, os pesquisadores criaram novos testes que permitem medir os relógios humanos usando apenas uma única amostra de uma pessoa. Isso envolve identificar moléculas específicas no corpo relacionadas a esses ritmos, chamadas de Biomarcadores, e então prever a hora do dia com base nos níveis delas.

Embora a descoberta desses biomarcadores geralmente precise de amostragem extensiva ao longo do tempo, os pesquisadores descobriram que também podem usar dados de indivíduos falecidos para obter informações sobre ritmos circadianos em uma população. Analisando tecidos pós-morte de várias pessoas, eles podem determinar se esses ritmos existem e como eles variam.

No entanto, para fazer isso de forma eficaz, eles precisam ter características suficientes em suas amostras, como várias proteínas e materiais genéticos, que podem ser analisados para determinar padrões de tempo. Isso exige algoritmos avançados capazes de organizar e analisar dados complexos para extrair informações significativas.

Novos Métodos para Medir Ritmos

Uma abordagem inovadora envolve usar uma forma de análise de dados conhecida como análise de componentes principais circulares (PCA). Esse método permite que os pesquisadores encontrem e agrupem características relacionadas nos dados, reconhecendo a natureza circular do tempo.

Os pesquisadores também desenvolveram uma ferramenta que combina essa PCA com um método para validar resultados automaticamente. Essa ferramenta permite que eles analisem dados de vários tipos de câncer e revelem padrões que talvez não fossem visíveis antes.

Usando esse método, os pesquisadores conseguiram identificar milhares de genes que mostram um comportamento rítmico em vários tipos de câncer. Curiosamente, esses ritmos em tumores muitas vezes não se combinam com os encontrados em tecidos saudáveis, indicando que os tecidos cancerígenos podem ter seus próprios relógios internos únicos.

Encontrando Ritmos Circadianos em Cânceres Humanos

Para estudar ritmos circadianos em cânceres humanos, os pesquisadores utilizaram dados genéticos de alta qualidade coletados de pacientes. Eles focaram especificamente em Adenocarcinomas, que são tipos comuns de câncer que afetam glândulas e tecidos dentro dos órgãos.

A análise desses dados revelou que há muitos padrões rítmicos presentes nos tecidos cancerígenos. A quantidade de genes rítmicos identificados variou entre os tipos de câncer, variando de alguns a milhares. Isso sugere diferenças significativas em como os ritmos circadianos operam em diferentes tipos de câncer.

Os pesquisadores notaram que os genes rítmicos estavam intimamente ligados a processos celulares importantes. Alguns genes envolvidos no metabolismo e na divisão celular mostraram uma atividade rítmica forte. Mas, a forma como esses ritmos interagem com o ambiente ao redor ou outros sistemas biológicos ainda está sendo estudada.

Entendendo o Relógio Central no Câncer

Apesar da presença de ritmos nas células cancerígenas, houve uma diferença notável em como esses ritmos se comparam às células saudáveis. Os genes centrais que governam os ritmos circadianos mostraram horários de pico incomuns nos tecidos cancerígenos, sugerindo que, embora os ritmos ainda existam, eles podem estar desregulados.

Essa desregulação foi evidente em tipos de câncer como câncer de mama e câncer de ovário, onde os genes do relógio central exibiram atrasos significativos em suas atividades de pico. Esses achados indicam que o sistema circadiano em tumores pode estar funcionando de maneira diferente em comparação com tecidos não cancerígenos.

Processos Chave Ligados a Genes Rítmicos

Os pesquisadores também analisaram quais processos biológicos são influenciados por esses genes rítmicos. Eles descobriram que muitos desses genes estão ligados a funções cruciais dentro do corpo, especialmente aquelas associadas à progressão do câncer.

Os genes rítmicos se agruparam em diferentes grupos funcionais responsáveis pela produção de energia, respostas imunológicas e divisão celular. Entender essas conexões oferece insights sobre como o tempo e os ritmos biológicos podem impactar a progressão do câncer e potencialmente orientar abordagens terapêuticas.

Relógios Tumorais vs. Relógios Saudáveis

Uma descoberta crucial da pesquisa foi que os relógios circadianos nos tumores não se alinham com os encontrados em tecidos saudáveis. Essa falta de sincronização levanta questões sobre como as células cancerígenas respondem a tratamentos administrados em diferentes momentos do dia.

Comparando dados de amostras tumorais e tecidos saudáveis correspondentes, os pesquisadores descobriram que o tempo de Expressão Gênica em tumores era aleatório e não seguia os padrões esperados encontrados em tecidos saudáveis. Esse desacoplamento dos ritmos naturais do corpo pode desempenhar um papel em como o câncer se comporta e responde a tratamentos.

Ligando Ritmos Circadianos ao Ciclo Celular

Outra observação interessante foi a conexão entre ritmos circadianos e o ciclo celular. O ciclo celular é o processo pelo qual as células se dividem e se replicam. Analisando dados de expressão gênica, os pesquisadores descobriram que havia um ritmo nas fases do ciclo celular em certos tipos de câncer. Esses ritmos pareciam seguir um tempo específico associado ao relógio circadiano, sugerindo uma relação que poderia influenciar a progressão do câncer.

Em alguns cânceres, o momento em que as células passam por diferentes fases de divisão poderia estar ligado à hora do dia. Essa compreensão poderia ser importante para desenvolver estratégias de tratamento que aproveitem esses ritmos para melhorar os resultados.

Analisando Ritmos de Proteínas no Câncer

Além dos genes, os pesquisadores também analisaram proteínas envolvidas no câncer. As proteínas são produtos dos genes e desempenham um papel significativo nas funções celulares. Muitas proteínas exibiram comportamentos rítmicos semelhantes aos de seus genes correspondentes.

As descobertas revelaram que, mesmo em cânceres com menos genes rítmicos, muitas proteínas mostraram atividade rítmica. Isso sugere que o timing também desempenha um papel importante no nível proteico, e entender esses ritmos pode fornecer novas oportunidades para intervenções terapêuticas.

Potencial para Cronoterapia

O conhecimento adquirido ao estudar esses ritmos apresenta possibilidades empolgantes para tratamentos contra o câncer. Se certos medicamentos visam genes rítmicos, ajustar o timing da administração de medicamentos pode aumentar sua eficácia. Essa abordagem, conhecida como cronoterapia, pode oferecer novas avenidas para melhorar o cuidado do câncer.

Levando em conta os ritmos naturais presentes no corpo, os profissionais de saúde podem potencialmente personalizar planos de tratamento que coincidam com os períodos em que as células cancerígenas estão mais vulneráveis.

Conclusão: Avanços na Pesquisa Circadiana

Para concluir, essa pesquisa demonstra a importância dos ritmos circadianos na compreensão da biologia do câncer. A capacidade de estudar esses ritmos em tecidos humanos usando métodos avançados de análise de dados permite que os pesquisadores descubram padrões significativos que estavam ocultos anteriormente.

Embora muitas perguntas ainda permaneçam, os achados destacam a complexidade dos ritmos biológicos e seus impactos potenciais na saúde e na doença. Continuando a explorar as relações entre ritmos circadianos, câncer e estratégias de tratamento, podemos desbloquear novas maneiras de aprimorar terapias contra o câncer e, em última análise, melhorar os resultados para os pacientes.

Os avanços na medição dos ritmos circadianos usando técnicas inovadoras como o COFE oferecem um futuro promissor para pesquisas e aplicações clínicas. À medida que mergulhamos mais fundo nas conexões entre tempo, biologia e saúde, abrimos portas para novas possibilidades que podem transformar nossa compreensão do câncer e de outras doenças.

Fonte original

Título: Time series-free rhythm profiling using COFE reveals multi-omic circadian rhythms in in vivo human cancers

Resumo: The study of ubiquitous circadian rhythms in human physiology requires regular measurements across time. Repeated sampling of the different internal tissues that house circadian clocks is both practically and ethically infeasible. Here, we present a novel unsupervised machine learning approach (COFE) that can use single high-throughput omics samples (without time labels) from individuals to reconstruct circadian rhythms across cohorts. COFE can simultaneously assign time labels to samples and identify rhythmic data features used for temporal reconstruction, while also detecting invalid orderings. With COFE, we discovered widespread de novo circadian gene expression rhythms in 11 different human adenocarcinomas using data from the TCGA database. The arrangement of peak times of core clock gene expression was conserved across cancers and resembled a healthy functional clock except for the mistiming of a few key genes. Moreover, rhythms in the transcriptome were strongly associated with the cancer-relevant proteome. The rhythmic genes and proteins common to all cancers were involved in metabolism and the cell cycle. Although these rhythms were synchronized with the cell cycle in many cancers, they were uncoupled with clocks in healthy matched tissue. The targets of most of FDA-approved and potential anti-cancer drugs were rhythmic in tumor tissue with different amplitudes and peak times. These findings emphasize the utility of considering "time" in cancer therapy, and suggest a focus on clocks in healthy tissue rather than free-running clocks in cancer tissue. Our approach thus creates new opportunities to repurpose data without time labels to study circadian rhythms.

Autores: Bharath Ananthasubramaniam, R. Venkataramanan

Última atualização: 2024-12-19 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584582

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584582.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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