小麦が危機に瀕してる:真菌の課題に対処する
小麦の生産に対する菌類の影響と抵抗戦略を探る。
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目次
小麦は世界で最も重要な作物の一つで、年に約7億7000万トン生産されてるんだ。多くの人にとって主食となってるよ。小麦には普通の小麦とデュラム小麦の2つの主な種類があって、普通の小麦はパンに、デュラム小麦はパスタに使われる。小麦は重要な食料源だから、その収量や品質に影響を与える要因は農家や農業経済にとって大きな問題になる。
小麦生産の脅威
小麦生産にとって最大の課題の一つは、壊死性病原菌として知られる特定の種類の真菌から来てる。この真菌は死んだり枯れかけた植物の組織を好んで、結構なダメージを小麦作物に与えることがあるんだ。研究によると、気候変動がこれらの病原菌の広がりと影響を加速させてるかもしれないから、植物がこれらの有害な真菌とどう関わるかを理解することがますます重要になってる。
真菌は小麦をどう攻撃するか
壊死性病原菌は生き残るための面白い戦略を発展させてる。彼らは植物の防御システムを操って、生体栄養型の病原菌(生きた組織に依存するやつ)を防ぐために設計されたものを無力化するんだ。この壊死性真菌は、壊死性エフェクター(NE)と呼ばれる特定のタンパク質を生成して、宿主植物の特定の遺伝子に認識されることができるんだ。これらの遺伝子がNEを感知すると、それに反応して植物の組織が死ぬことになり、真菌にとってもっと好都合な環境ができるんだ。
セプトリア・ノドラム斑点病(SNB)
特にダメージを与える病気の一つがセプトリア・ノドラム斑点病(SNB)なんだ。この病気は小麦の葉や茎に影響を与えて、最大30%の収量損失を引き起こすことがある。オーストラリア、南アジア、北アフリカ、ヨーロッパ、北アメリカなど、多くの小麦生産地域で観察されてるよ。このSNBの原因となる真菌はパラスタゴノスポラ・ノドラムとして知られている。
抵抗遺伝子の理解
研究者たちは、P.ノドラムからのNEの存在を感知できる小麦のいくつかの遺伝子を特定したんだ。その中でも、Snn1遺伝子は重要で、これが小麦の植物がSNBに敏感か抵抗力があるかを決定できるんだ。Snn1がNEのSnTox1と相互作用すると、植物は感染に対して脆弱になることがある。こうした相互作用がどう起こるかを理解することが、科学者や農家が小麦を病気から守るためのより良い戦略を開発するのに役立つ。
小麦系統の違い
研究によると、いろんな小麦系統がSnTox1に対する感受性の盛り上がりが異なってる。感受性を評価するためのスコアリングシステムが開発されていて、低いスコアは抵抗力を示し、高いスコアは感受性を示すんだ。研究は、これらの小麦系統がSnTox1に対する反応に基づいてグループ化できることを示していて、小麦品種内の遺伝的多様性を強調してる。
遺伝子コピー数と発現
Snn1遺伝子を調べたところ、いくつかの小麦系統は遺伝子のコピーが複数あったんだ。114の小麦系統を調査した結果、約92系統がSnn1のコピーを一つ持っていて、22系統が二つ持ってた。これらの重複は、遺伝子がどのように機能するか、植物内での発現に影響を与えることがある。いくつかの系統は一つのコピーだけを発現することがあって、これがSnTox1への反応に影響を及ぼすことがある。
遺伝的多様性
栽培された小麦内のSnn1遺伝子の中には注目すべき遺伝的多様性がある。異なる小麦植物間でのDNA配列の変異である単一塩基多型(SNP)の数に違いがあるんだ。これらのSNPは、Snn1遺伝子によって生成されるタンパク質の変化を引き起こし、病原菌への植物の反応に影響を与えることができる。この遺伝的多様性を理解することは、より良い病気抵抗性を持つ新しい小麦品種を開発するために重要なんだ。
タンパク質構造のモデリング
Snn1遺伝子によって作られるタンパク質は、小麦が壊死性真菌にどのように反応するかに重要な役割を果たしている。研究者たちは、Snn1遺伝子に基づいてタンパク質の構造を予測するためのモデルを使ってきたんだ。このモデルは、タンパク質が互いにどう相互作用するかや、SnTox1エフェクターとの関わりを理解するのに役立つ。この情報は、Snn1タンパク質の変化が病気への感受性にどう影響するかを理解するのに極めて重要だ。
重要な変異の特定
遺伝子分析を通じて、科学者たちはSnn1遺伝子の機能を変える重要な変異を特定したんだ。これらの変異は、植物を病原菌に対してより感受性にしたり、より抵抗力を持たせたりすることがある。例えば、いくつかの変異はタンパク質の挙動を変えることがあって、SnTox1エフェクターを認識する能力に影響を与える。
育種のためのマーカー開発
この研究の目標の一つは、植物育種者がどの小麦品種が病気抵抗性のための望ましい特性を持っているかを特定できるマーカーを開発することなんだ。どのマーカーが抵抗アレルと関連しているかを知ることで、育種者はこれらの特性をより効果的に選択できるようになり、SNBのような病気に対抗できる新しい小麦品種の開発につながるんだ。
作物改善における育種の役割
育種は小麦品種を改善する上で重要な役割を果たしてる。抵抗性の遺伝的基盤とそれに関連する特定のアレルを理解することで、育種者はどの植物を交配すべきかをより良い判断ができるようになるんだ。SNP分析やタンパク質モデリングから得られる情報は、これらの育種プログラムを導くのに役立ち、病気圧の下でも良い収量を上げられる小麦を作成するのに貢献するよ。
ナルアレルの重要性
研究では、一部の小麦系統がSnn1遺伝子のコピーを全く持っていないことがわかっていて、これが「ナルアレル」と呼ばれるものにつながる。これらのナルアレルは特定の病気に対する感受性を与えることがある。特定の遺伝子マーカーを通じてこれらのナル系統を特定することで、病気に強い小麦を開発する育種努力を助けることができるんだ。
小麦生産の課題
小麦の遺伝学に関する理解が進む中、課題は残ってる。病原菌からの脅威、特に気候が変わる中での脅威が続いているから、遺伝的抵抗性や育種戦略に関する研究を継続する必要がある。このリスクを効果的に管理する方法を理解することが、食料安全保障を確保するためには重要だね。
結論
小麦は世界中で何百万人もの人々の主食であり、SNBのような病気に対する収量と耐性を向上させる努力は重要だ。病気抵抗性の背後にある遺伝的および分子メカニズムを探ることで、科学者や育種者が協力して、壊死性病原菌の脅威に対してあまり敏感でない小麦品種を育てることができるんだ。
継続的な研究と効果的なマーカーの開発を通じて、小麦が環境の変化に対応して生き残れる未来に希望があるよ。育種プログラムが抵抗性を選択するために必要な知識やツールを備えていることを確保することが、世界の食料供給を守るためには必須なんだ。
タイトル: Evolution, diversity, function, and marker-based elimination of the disease susceptibility gene Snn1 in wheat
概要: Septoria nodorum blotch (SNB), caused by Parastagonospora nodorum, is a disease of durum and common wheat initiated by the recognition of pathogen-produced necrotrophic effectors (NEs) by specific wheat genes. The wheat gene Snn1 encodes a wall-associated kinase that directly interacts with the NE SnTox1 leading to the development of SNB. Here, sequence analysis of Snn1 from 114 accessions including diploid, tetraploid and hexaploid wheat species revealed that some wheat lines possess two copies of Snn1 (designated Snn1-B1 and Snn1-B2) approximately 120 kb apart. Snn1-B2 evolved relatively recently as a paralog of Snn1-B1, and both genes have undergone diversifying selection. Three point mutations associated with the formation of the first SnTox1-sensitive Snn1-B1 allele from a primitive wild wheat were identified. Four subsequent and independent SNPs, three in Snn1-B1 and one in Snn1-B2, converted the sensitive alleles to insensitive forms. Protein modeling indicated these four mutations could abolish Snn1-SnTox1 compatibility either through destabilization of the Snn1 protein or direct disruption of the protein-protein interaction. High-throughput markers were developed for the causal mutations and evaluated on panels of durum and common wheat. The markers were able to correctly identify 96.9 % of SnTox1-sensitive durum wheat accessions, and a marker for the null allele was 100% accurate at predicting SnTox1-insensitive lines in both durum and spring wheat. Results of this study increase our understanding of the evolution, diversity, and function of Snn1-B1 and Snn1-B2 genes and will be useful for marker-assisted elimination of these genes for better host resistance.
著者: Justin D Faris, S. Seneviratne, G. Shi, A. Szabo-Hever, Z. Zhang, A. Peters Haugrud, K. L. D. Running, G. Singh, R. S. Nandety, J. D. Fiedler, P. E. McClean, S. Xu, T. L. Friesen
最終更新: 2024-01-26 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.24.577084
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.24.577084.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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