P2X7受容体をターゲットにした:インヒビターに関する新しい知見
研究が特定の阻害剤がP2X7受容体とどのように相互作用するかを明らかにし、薬の開発に役立ってる。
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ATP、つまりアデノシン三リン酸は、細胞内のさまざまなプロセスにエネルギーを供給する分子だよ。エネルギー伝達の役割に加えて、ATPは細胞間の信号送信にも重要なんだ。一群のたんぱく質でATPに反応するのがP2X受容体と呼ばれるもの。これらの受容体は、ATPが結合すると特定のイオンが細胞に入ることを許すチャネルとして働くんだ。P2X受容体は哺乳類の神経系、呼吸系、生殖系、免疫系などいくつかのシステムに存在してるよ。
P2X受容体にはP2X1からP2X7までの7種類があって、それぞれ体内で特有の機能を持ってる。年々、科学者はこれらのP2X受容体をターゲットにした薬の開発に興味を持つようになってきたんだ。これは多くの健康問題における役割によるもので、いくつかの有望な薬の候補も出てきてる。これらの薬の中には、慢性咳の治療を目指すゲファピクサントのように臨床試験にまで進んでいるものもあるよ。
現在の阻害剤の課題
P2X受容体を阻害するために開発された多くの薬はATPの類似物で、受容体をブロックするためにATPを模倣してるんだ。残念ながら、これらのATP類似物は特異性が不足していることが多く、体内でATPに結合する他のたんぱく質にも影響を与えることがあるんだ。これが望ましくない副作用につながることも。だから、研究者たちはATP類似物の代替を探してるんだ。
一つの有望なアプローチは、PPADSやPPNDSのようなピリドキシルリン酸誘導体と呼ばれる化合物のクラスを含んでる。これらの化合物はP2X受容体を選択的に阻害し、受容体の機能を研究するために使われてきたんだ。ただ、これらの化合物が受容体にどのように作用して活動をブロックするのかは完全には理解されてないんだ。
研究の焦点
この研究は、P2X7受容体がピリドキシルリン酸誘導体、特にPPADSとPPNDSとどのように相互作用するかを理解することに焦点を当ててる。主な目的は、これらの阻害剤に結合した状態のP2X7受容体の構造を明らかにすることなんだ。
洞察を得るために、科学者たちはクライオ電子顕微鏡(cryo-EM)と呼ばれる技術を使って、阻害剤に結合したP2X7受容体を視覚化したんだ。パンダのバージョンの受容体を使用して、これらの薬が受容体にどのように付着し、阻害剤が存在するときに受容体の構造にどんな変化が起こるのかを見分けることができたよ。
クライオ-EMからの発見
クライオ-EMの構造では、PPADSとPPNDSがP2X7受容体の特定の部位に結合することが示された。この部位はATPが結合するところと似ていて、これらの阻害剤が競合的にブロックすることを示してる。簡単に言うと、PPADSやPPNDSが存在すると、ATPが通常入るべき空間を占拠して、ATPが受容体を活性化するのを防ぐんだ。
受容体の構造を阻害剤に結合したときとATPに結合したときで比較したところ、大きな違いに気づいた。ATPが結合すると受容体の構造に変化が起きてチャネルが開くのに対し、PPADSやPPNDSが結合してもこの変化は引き起こされない。この発見は、これらの阻害剤が受容体を開くのを効果的にブロックして、正常な細胞シグナルを妨げていることを示唆してる。
P2X7受容体の感受性の重要性
この研究では、PPADSとPPNDSに結合するために重要なP2X7受容体の特定の部分も調べたんだ。特定のアミノ酸は、受容体がこれらの阻害剤とどれだけ強く相互作用するかの重要なプレーヤーとして特定された。この発見は重要で、受容体の構造に少しの変化があっても、これらの化合物の効果に大きな違いをもたらす可能性があることを示唆してる。
例えば、受容体の特定の変異は、阻害剤に対する感受性を高めたり低下させたりすることがある。この結合相互作用をよりよく理解することで、研究者はP2X受容体をより効果的にターゲットにした薬をデザインできるようになるかもしれない。
構造に基づく変異解析
研究者たちは、発見をさらにテストするために受容体の構造の特定のアミノ酸を変更する実験を行ったんだ。この実験は、薬の結合に重要な受容体の部分を特定するのに役立ったよ。受容体が阻害剤に対して敏感であればあるほど、その受容体の特定の部分が相互作用にとって重要だということ。
一連の変異解析を通じて、特定の受容体バリアントがPPNDSに対して感受性を高める一方で、他のバリアントはあまり敏感ではないことがわかった。この情報は、特定のP2X受容体タイプに対してより高い特異性とより良い効果を持つ薬の開発に役立つんだ。
結論と今後の方向性
要するに、この研究はP2X7受容体がピリドキシルリン酸誘導体とどのように相互作用するかの理解を深めたんだ。クライオ-EMを通じて得られた詳細な構造は、これらの阻害剤の結合部位と作用メカニズムを明らかにしたよ。
結合相互作用のユニークな特性は、特定のP2X受容体に対してより選択的な薬を作る道を提供する。これらの進展は、さまざまな疾患に対するターゲット療法の開発につながるかもしれないし、より安全で効果的な治療が期待できるね。
今後の研究は、これらの阻害剤をさらに洗練させたり、既存のものに挑戦して臨床使用に最適な候補を見つけることに焦点を当てるだろう。この研究から得られた洞察は、その進行中の作業のためのしっかりとした土台を提供し、P2X受容体や薬剤設計においてどのようにターゲットにできるかの理解を深める助けになるだろう。
タイトル: Structural insights into the orthosteric inhibition of P2X receptors by non-ATP-analog antagonists
概要: P2X receptors are extracellular ATP-gated ion channels that form homo-or heterotrimers and consist of seven subtypes. They are expressed in various tissues, including neuronal and nonneuronal cells, and play critical roles in physiological processes such as neurotransmission, inflammation, pain, and cancer. As a result, P2X receptors have attracted considerable interest as drug targets, and various competitive inhibitors have been developed. However, although several P2X receptor structures from different subtypes have been reported, the limited structural information of P2X receptors in complex with competitive antagonists hampers the understanding of orthosteric inhibition, hindering the further design and optimization of those antagonists for drug discovery. Here, we determined the cryo-EM structures of the mammalian P2X7 receptor in complex with two classical competitive antagonists of pyridoxal-5-phosphate derivatives, PPNDS and PPADS, at 3.3 and 3.6 [A] resolution, respectively, and performed structure-based mutational analysis by patch-clamp recording as well as MD simulations. Our structures revealed the orthosteric site for PPADS/PPNDS, and structural comparison with the previously reported apo-and ATP-bound structures showed how PPADS/PPNDS binding inhibits the conformational changes associated with channel activation. In addition, structure-based mutational analysis identified key residues involved in the PPNDS sensitivity of P2X1 and P2X3, which are known to have higher affinity for PPADS/PPNDS than other P2X subtypes. Overall, our work provides structural insights into the orthosteric inhibition and subtype specificity of P2X receptors by the classical P2X antagonists, pyridoxal-5-phosphate derivatives, thereby facilitating the rational design of novel competitive antagonists for P2X receptors.
著者: Motoyuki Hattori, D. Sheng, C. Yue, F. Jin, Y. Wang, M. Ichikawa, Y. Yu, C.-R. Guo
最終更新: 2024-02-07 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.15.558037
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.15.558037.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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