神経変性疾患に関する新しい知見
研究によると、いろんな神経変性疾患の間に共通の遺伝的要因があることがわかったんだ。
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神経変性疾患(NDD)にはアルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、レビー小体型認知症、前頭側頭型認知症などの状態が含まれる。これらの病気は脳や神経系に影響を与え、全世界で4,000万人以上が影響を受けている。人口が高齢化するにつれて、影響を受ける人の数は増えると予想されており、原因や治療法の研究が進められている。
神経変性疾患における遺伝的要因
科学者たちは、ゲノムワイド関連解析(GWAS)を使って、これらの病気を発症するリスクを高める遺伝的特性を特定している。あるNDDのリスクを高める遺伝的特性は、他の疾患とも関連があるかもしれない。この遺伝的特性の重なりが、異なる疾患に共通する症状や健康問題の理由を探る手がかりになる。
たとえば、GRNやGBAのような特定の遺伝子は複数のNDDに関連付けられていて、これらの状態の共有特性に関与している可能性が示唆されている。また、これらの病気に対する遺伝的リスクが高い人と低い人がどのように病気の体験が異なるかを研究者が調査している。
研究アプローチ
この研究では、研究者たちが複数のNDDの遺伝データを調べて、遺伝的特性に基づいて患者をグループ化した。さまざまな公開されているデータソースからデータを集め、主に5つの疾病に焦点を当てた。多様な代表性を確保するために、数千の遺伝サンプルを使用した。
データの質と正確性を確保するために、研究者たちは遺伝データを慎重にチェックし、これらの病気に関連する最も重要な遺伝情報に焦点を当てられるように必要な調整を行った。
クラスター分析
研究者たちは、UMAPという手法を使って分析を行い、大規模なデータセットをよりシンプルに視覚化するのを助けた。この手法を用いることで、複雑な遺伝情報を3つの重要な次元に縮約し、より簡単に分析できるようにした。
同様に、Mean Shiftという手法を使って、遺伝データの類似性に基づいて個人をクラスタにグループ化した。このアプローチにより、遺伝的構成の複雑さを扱いながら、主要な個人のクラスターを特定することができた。
このクラスター分析を通じて、研究者たちは3つの主要な個人のグループを見つけた:
- クラスター0(C0): このグループは最も多くの個人が含まれ、主にALSと関連していた。
- クラスター1(C1): このクラスターは主にアルツハイマー病と関連していた。
- クラスター2(C2): この小さなグループは主に前頭側頭型認知症に関連していた。
疾患の関連性
さらに分析した結果、各クラスターには異なるNDDへの特定のリンクがあった。たとえば、クラスター0はALSとの強い関連があり、クラスター1はアルツハイマー病のリスクが高い個人で構成されていた。小さなクラスター2は前頭側頭型認知症との強い関連を示した。
興味深いことに、研究者たちは各クラスターの個人が特定の遺伝的特性を共有するだけでなく、さまざまな神経変性疾患に対するリスクのパターンが異なることも発見した。これは、これらの病気の境界線が以前考えられていたほど明確でない可能性を示している。
多因子リスクスコア
研究者たちは多因子リスクスコア(PRS)を計算して、異なる疾患に対する遺伝的リスクがクラスターのメンバーシップにどのように影響するかを評価した。結果は、特定の遺伝的要因がクラスターのメンバーシップに大きく影響していることを示した。たとえば、クラスター0の個人はアルツハイマー病のリスクスコアが低いが、ALSのリスクスコアは高かった。
このアプローチは、一つの病気が診断された個人が実際には別の病気に対して高い遺伝的リスクを持っている可能性があることも明らかにした。これは遺伝と病気の相互作用を強調し、神経変性疾患が別の実体として存在するのではなく、スペクトラム上にあることを示唆している。
疾患理解への影響
研究の結果は、神経変性疾患が共有された遺伝的要因を通じて相互に関連していることを示唆している。これは、治療が単一の疾患診断に焦点を当てるのではなく、患者の遺伝的構成の広い文脈を考慮する必要があるかもしれない。
研究は、これらの疾患の従来の分類を超えて見通す必要があり、個人が持つ複雑な遺伝的リスクを認識することを強調している。これらの重なりに焦点を当てることで、医師は治療計画をより的確に調整し、特定の介入から利益を得る可能性のある人を特定できるかもしれない。
研究の限界
この研究が貴重な洞察を提供する一方で、限界もある。研究は主に欧州系の個人に焦点を当てていたため、結果がすべての人口に適用できるわけではない。また、異なる疾患からのサンプル数に大きな不均衡があり、結果に影響を与えた可能性がある。さらに、研究は主に一般的な遺伝的変異に焦点を当てており、これらの疾患についてより多くの情報を提供できる可能性のある希少な変異を含んでいなかった。
今後の方向性
今後、研究者たちはより多様な人口を含め、希少な遺伝的変異を調べることでこれらの研究を拡大することを目指している。また、遺伝的リスクと相互作用する可能性のある環境やライフスタイルの要因を探りたいとも考えている。これにより、神経変性疾患の発症や進行に影響を与える要因の全体像が見えてくるかもしれない。
さらに、これらの疾患の関連性をよりよく理解することで、より効果的な治療法や診断が可能になるだろう。研究者たちは、これらの疾患間の複雑な関係を探求することで、最終的に神経変性疾患に影響を受ける患者の生活の質を向上させることに期待を寄せている。
結論
この研究は、神経変性疾患間のつながりを深く探るもので、共有された遺伝的要因が異なる状態において重要な役割を果たしていることを示している。これらの関係を認識することで、将来的にこれらの疾患についての考え方、診断、治療が変わるかもしれない。私たちの知識が増え続ける中で、これらの難しい状態を抱える人々をサポートする新たな方法が見つかるかもしれず、神経変性疾患の管理への全体的なアプローチが改善される可能性がある。
タイトル: Genetic risk factor clustering within and across neurodegenerative diseases
概要: Overlapping symptoms and copathologies are common in closely related neurodegenerative diseases (NDDs). Investigating genetic risk variants across these NDDs can give further insight into disease manifestations. In this study we have leveraged genome-wide single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genome-wide association study (GWAS) summary statistics to cluster patients based on their genetic status across identified risk variants for five NDDs (Alzheimers disease [AD], Parkinsons disease [PD], amyotrophic lateral sclerosis [ALS], Lewy body dementia [LBD], and frontotemporal dementia [FTD]). The multi-disease and disease-specific clustering results presented here provide evidence that NDDs have more overlapping genetic etiology than previously expected and how neurodegeneration should be viewed as a spectrum of symptomology. These clustering analyses also show potential subsets of patients with these diseases that are significantly depleted for any known common genetic risk factors suggesting environmental or other factors at work. Establishing that NDDs with overlapping pathologies share genetic risk loci, future research into how these variants might have different effects on downstream protein expression, pathology and NDD manifestation in general is important for refining and treating NDDs.
著者: Mathew J Koretsky, C. Alvarado, M. B. Makarious, D. Vitale, K. Levine, S. Bandres Ciga, A. Dadu, S. W. Scholz, L. Sargent, F. Faghri, H. Iwaki, C. Blauwendraat, A. Singleton, M. Nalls, H. Leonard
最終更新: 2023-04-11 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.12.01.22282945
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.12.01.22282945.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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