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肢の進化:ゼブラフィッシュからの洞察

研究が、遺伝子のコントロールが魚からの肢の進化にどのように影響を与えたかを明らかにした。

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ひれから手足へ:進化の洞察ひれから手足へ:進化の洞察法を明らかにした。遺伝子研究が魚のひれから四肢が進化した方
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四肢動物、つまりカエルや鳥、哺乳類みたいな動物は、ユニークな構造を持つ手足があるんだ。この手足は、いくつかのセグメントからできていて、一つの大きな骨がスタイロポッド(上腕や太もものようなもの)、二つの小さい骨がゼウゴポッド(前腕や下腿のようなもの)、手首や足首の部分にはメソポッドって呼ばれる骨のグループがあって、最後に手や足の骨がオートポッドって呼ばれるものなんだ。このデザインは、これらの生き物が水から陸に移動する前から存在していたんだ。しかも、これらの四肢動物の祖先となる魚も似たような骨の構造を持ってるんだよ。

魚と四肢動物の手足の論争

魚をよく見ると、特に四肢動物と近い関係にある魚は難しいことがわかる。似たような部分はあるけど、そのヒレが四肢動物の手足と同じと見なせるかどうかはまだ議論中なんだ。特に手首や足の骨についてね。確かにいくつかの魚のヒレには手足の構造に似た部分があるけど、これらの魚に本当のつま先のような骨が存在するかはまだ話し合われている状態さ。

手足の発達における遺伝子の役割

特定の遺伝子、特にHoxAとHoxDは四肢動物の手足を作るのに重要な役割を果たしてるんだ。科学者たちは、魚のヒレの発達の過程でこれらの遺伝子を見て、手足に似た構造のヒントがあるかどうかを探ってる。Hoxa13とHoxd13という特別な遺伝子は、四肢動物の手首やつま先の部分を作るのに役立つことが知られていて、これらの遺伝子がマウスでうまく機能しないと、手首やつま先のような部分が欠けちゃうんだ。

研究はまた、魚のヒレにも似た遺伝子活動が存在することを示していて、最初の手足が現れる前から発達のいくつかのルールがあったんじゃないかって示唆してる。ただし、遺伝子の設計はある程度保存されているけど、手足やヒレの発達の過程で現れる実際の部分は異なるかもしれない。

手足とヒレにおけるHox遺伝子の働き

四肢動物の手足芽の成長中、3DOMと呼ばれるDNAの部分が早い段階で特定のHox遺伝子がどのようにオンになるかを制御しているんだ。この部分は上腕や太ももの形成を司る遺伝子を調整する役割を持ってる。手足が発展を続けるにつれて、5DOMという別の部分が活性化し、手首や指に関連する遺伝子を調整するんだ。3DOMが削除されると、上肢構造が正常に発展しないし、5DOMを削除すると手首や指の形成が止まっちゃう。

ゼブラフィッシュと遺伝子研究

遺伝学の研究に使われることが多いゼブラフィッシュでは、ヒレが発達する際に似たような遺伝子活動が起こるんだ。初期の段階ではhoxda遺伝子がオンになって、マウスで起こることと一致するように拡張されるみたい。だけど、その後にはいくつかの違いがあるかもしれない。これらの類似点にもかかわらず、ゼブラフィッシュがマウスと同じようなHox遺伝子の遠距離制御パターンに従っているかどうかは不明なんだ。

ゼブラフィッシュにおける調整景観の調査

科学者たちは、ゼブラフィッシュのhoxda遺伝子がマウスに見られるような類似の遠距離制御で調整されるかどうかに興味があるんだ。hoxdaの調整領域の一部を削除したゼブラフィッシュ系統を作ることで、早期の手足の成長における主要な制御が魚とマウスの両方に存在していることがわかったけど、マウスに見られる長距離制御は魚のヒレにはなかったんだ。しかし、ゼブラフィッシュの5DOMは、特定の遺伝子がオンになる場所を整理する機能をまだいくらか示していて、特に消化系と泌尿系が交わる場所に関連しているんだ。

ゼブラフィッシュにおけるHoxDの構造と機能

ゼブラフィッシュのhoxda遺伝子の配置は哺乳類と似ていて、いろんな体の部分の発達をコントロールする重要な特徴が保存されてるんだ。遺伝子クラスターの組織や、このクラスターを囲む二つの領域は、棘鰭魚と四肢動物の進化の分岐以前から存在していたと考えられている。

これらの領域を調べると、いくつかの部分はマウスのものと配列を共有しているけど、他の部分はそれほどの類似性がないことがわかった。それでも、全体的な構造は、これらの遺伝子を制御する調整部分が重要であり、その重要な機能のおかげで保存されている可能性があることを示唆している。

ゼブラフィッシュにおける遺伝子活動の調査

ゼブラフィッシュのhoxda遺伝子がどのように活性化されるかを理解するために、研究者たちはhoxda遺伝子の周辺領域でのDNAへのアクセスとヒストンの修飾を調べたんだ。特定のテストでは、両方の周辺領域が遺伝子発現を調整するのに活性だということが示された。遺伝子編集技術を使って、これらの調整領域に削除があるゼブラフィッシュの突然変異体を作って、これらの削除が遺伝子発現にどのように影響するかを観察したんだ。

3DOMが削除されたゼブラフィッシュでは、ヒレの発達に必要な遺伝子のいくつかが発現できなくなったんだけど、5DOMを削除しても初期の段階では影響が少なかったみたい。一部の遺伝子活動は最初は変わらなかったんだ。これは、3DOMが手足の構造を確立するのに重要で、5DOMが特にヒレの発達の後の段階でより微妙な役割を果たすことを示してる。

ゼブラフィッシュにおける肛門と泌尿生殖系の発達

肛門は多くの動物でさまざまな体のシステムの開口部として機能する構造だ。ゼブラフィッシュでは、発達中の領域が他の種でのこのような構造の進化に関連しているかもしれない興味深い側面を示しているんだ。研究者たちは、ゼブラフィッシュの肛門に、泌尿生殖系と消化系のための2つの別々の開口部が、hox13のような遺伝子の影響を受けていることを発見したんだ。

特定のhox13遺伝子が欠けた突然変異体は、肛門領域で重要な発達の問題を示していて、これらの開口部が合体しちゃったんだ。マウスでの類似の研究は、Hox遺伝子が泌尿生殖腺の適切な形成に重要であることを示していて、これも肛門から派生しているんだ。

泌尿生殖系におけるエンハンサーと遺伝子調整

マウスの研究者たちは、5DOM領域が泌尿生殖系の発達に関連するHox遺伝子を調整するのに重要な役割を果たすことを発見したんだ。この調整領域のセクションを削除すると、機能の重要な喪失が起こり、その重要性が証明されたんだ。この研究は、この調整領域にあるエンハンサーが泌尿生殖系の形成に重要な遺伝子の発現を駆動する様子を明らかにしている。

調整景観の進化

この発見は、魚の肛門発達に責任がある調整景観が後の適応に大きな影響を与え、四肢動物における手足や外部生殖器の形成につながったことを示唆している。ヒレから手足への移行は、この古い調整システムが再利用され、最初は肛門の配置を制御していたものが、後に陸上動物の手足や生殖系の複雑さを管理するように調整されたことを涉及しているんだ。

広範な研究を通じて、ヒレから手足への進化が新しい構造を伴いながらも、さまざまな生物のニーズに応じて時間をかけて適応してきた既存の調整システムを利用していることが明らかになったんだ。

まとめと意義

この研究は、手足とヒレの発達に関する遺伝的制御の深い関連性や、肛門のような古代の特徴が現代の種の進化にどのように影響を与えたかを明らかにしているんだ。これらのプロセスを理解することで、さまざまな動物形態の物理的構造だけでなく、その発達を促進する基盤となる遺伝的枠組みについての洞察を得ることができる。

つまり、脊椎動物の手足とヒレの構造の関係は、Hox遺伝子とその調整景観の重要性を強調していて、進化のプロセスがどのように既存の遺伝的システムをうまく利用して異なる種の多様な適応を生み出してきたかを示しているんだ。研究は続いていて、生命が水から陸へ進化した過程の新しい視点を提供している。

オリジナルソース

タイトル: EVOLUTIONARY CO-OPTION OF AN ANCESTRAL CLOACAL REGULATORY LANDSCAPE DURING THE EMERGENCE OF DIGITS AND GENITALS

概要: The transition from fins to limbs has been a rich source of discussion for more than a century. One open and important issue is understanding how the mechanisms that pattern digits arose during vertebrate evolution. In this context, the analysis of Hox gene expression and functions to infer evolutionary scenarios has been a productive approach to explain the changes in organ formation, particularly in limbs. In tetrapods, the transcription of Hoxd genes in developing digits depends on a well-characterized set of enhancers forming a large regulatory landscape1,2. This control system has a syntenic counterpart in zebrafish, even though they lack bona fide digits, suggestive of deep homology3 between distal fin and limb developmental mechanisms. We tested the global function of this landscape to assess ancestry and source of limb and fin variation. In contrast to results in mice, we show here that the deletion of the homologous control region in zebrafish has a limited effect on the transcription of hoxd genes during fin development. However, it fully abrogates hoxd expression within the developing cloaca, an ancestral structure related to the mammalian urogenital sinus. We show that similar to the limb, Hoxd gene function in the urogenital sinus of the mouse also depends on enhancers located in this same genomic domain. Thus, we conclude that the current regulation underlying Hoxd gene expression in distal limbs was co-opted in tetrapods from a preexisting cloacal program. The orthologous chromatin domain in fishes may illustrate a rudimentary or partial step in this evolutionary co-option.

著者: Denis Duboule, A. Hintermann, C. C. Bolt, M. B. Hawkins, G. Valentin, L. Lopez-Delisle, S. Gitto, P. B. Gomez, B. Mascrez, T. A. Mansour, T. Nakamura, M. P. Harris, N. H. Shubin

最終更新: 2024-03-27 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.24.586442

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.24.586442.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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