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細菌の宿主変更が公衆衛生に与える影響

研究は、バイ菌が宿主を変えて適応する方法とそれが健康に与える影響を探っている。

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細菌の宿主交代について説明細菌の宿主交代について説明するてる。バイ菌がいろんな宿主に感染する能力を調べ
目次

最近、科学者たちはウイルスや細菌のような病原体がどのように宿主を変えるかにもっと注目してるんだ。これは新しい病原体が人間の健康にとってますます危険になっているから重要なんだよ。例えば、コロナウイルスのようなパンデミックを引き起こすウイルスは、動物から人間に広がっているんだ。こうした病原体が宿主を変えるときは、通常、異なる種類の哺乳類や鳥のように密接に関連している種の間を移動することが多い。例えば、コロナウイルスやフィロウイルスはしばしばコウモリから来ていて、時にはヒョウモンダコやラクダのような他の動物を経由して人間に到達するんだ。一方で、新しいタイプのインフルエンザウイルスは主に水鳥から来ているよ。

おもしろいことに、人間から植物に飛び移るウイルスのケースはほとんど知られていない。一つの可能性としては、肝炎Dウイルスがあるけど、これは植物のウイルスと似ているところはあるけど、直接の関係はないんだ。

対照的に、細菌は異なる界を超えて宿主を変えることが多いんだ。つまり、かなり違う生物に移動できるってこと。こうした移動のほとんどは植物と人間の間で起こってる。これらの変化を引き起こす細菌は通常、感染症を引き起こすけど、一般的には免疫システムが弱い人、例えば病院の患者や特定の健康問題を持つ人にしか影響しないことが多い。

細菌の宿主ジャンプの理解

こうした宿主ジャンプがどのように起こるかの研究はとても興味深いよ。異なる生物が感染する方法は様々で、なぜ一部の細菌が植物と動物の両方に感染できるのかは、たくさん研究されているけど、まだ完全には理解されていない。細菌が異なる宿主に感染するのを助ける可能性のある既知の要因には特定の酵素や毒素が含まれるけど、研究者たちはまだこれらの要因がどのように結びついているかを解明中なんだ。

最近の研究で、特定の酵素であるリポキシゲナーゼが細菌がさまざまなタイプの宿主に感染できるかどうかに関与しているかもしれないという提案があったよ。リポキシゲナーゼは、ストレスや免疫反応において重要な役割を果たすオキシリピンと呼ばれるシグナル分子を生成するのを助けるんだ。この研究を通じて、細菌のリポキシゲナーゼは、ライフサイクルのいくつかの段階で多細胞性に関連していることが多いことがわかった。これはオキシリピンが細胞間のコミュニケーションに長い間使われていた可能性を示唆しているよ。

しかし、分析された一部の細菌は多細胞性の兆候を示さなかったし、あまり生態学的な情報がなかった。集めたデータから、細菌はその関連性に基づいて三つのグループに分けられた:人間や脊椎動物に感染するもの、植物に関連するもの、そして海洋生物に関連するもの。興味深いことに、緑膿菌やブコルデリア・グラジオリなどの細菌は、植物と人間の両方に感染できるんだ。

研究方法論

この研究を続けるために、科学者たちは細菌のリポキシゲナーゼに関するデータセットを更新して精査し始めたよ。さまざまなオンラインデータベースを使って新しい配列を探して既存のリストに追加したんだ。このリストに含める細菌の基準は、利用可能な生態学的データや異なる宿主との既知の関係に基づいているよ。

研究者たちは既存の文献を徹底的にレビューしたり、細菌の生態を特徴づけるために特定の用語を使ったりした。よく知られた医学記事のデータベースで各種の最初の十件の結果を見て、要約、タイトル、キーワードを分析して関連する生態学的用語を引き出し、人間、植物、昆虫、海洋生物に関連するものなどのグループに分類したんだ。

リポキシゲナーゼを持つ細菌の生態学的プロフィール

研究から、リポキシゲナーゼを持つ細菌の生態学的プロフィールにはいくつかの注目すべき特性があることがわかったよ。抗菌耐性のような公衆衛生への脅威に関連する用語が頻繁に現れ、多くのこれらの細菌が危険である可能性を示唆している。人間に関連するリポキシゲナーゼキャリアはしばしば肺に影響を与え、感染を引き起こす一方、植物に関連するものは通常、根に住んでいるんだ。

データの可視化表現では、特定のクラスタが現れたよ。例えば、植物に関連する用語のグループと人間や公衆衛生の脅威に関する別のグループがあった。この分析は、両方のリポキシゲナーゼを持つ細菌のグループが感染を引き起こすための類似のメカニズムを持っている可能性があることを示したんだ。

このネットワーク分析は、植物と動物の宿主を飛び越える能力がリポキシゲナーゼを持つ細菌の共通の特性であるという以前の仮説を支持している。ただし、海洋に関連する細菌はこれらのパターンからより孤立しているようで、異なる生態学的機能を示しているよ。

系統解析

リポキシゲナーゼを持つ細菌の系統解析は、そのパターンが進化の歴史ではなく生態学的プロフィールに一致していることを示した。研究されたリポキシゲナーゼは、人間の病原体または植物の病原体との関連性を反映するクラスタにグループ化できた。異なるタイプの細菌の間で遺伝子が交換される水平遺伝子転移の証拠も示されたよ。

興味深いことに、海洋生物に関連する細菌は別のクラスタを形成していて、植物と動物の両方に感染できる多様な病原体を含んでいなかった。この発見は、海洋環境のリポキシゲナーゼを持つ細菌が異なる生態学的ルールの下で動作していることを示唆しているんだ。

結合部位の構造と機能

この研究では、リポキシゲナーゼの結合部位の構造も調べられたよ。研究者たちは基質と相互作用する特定の領域の体積を計算した。分析の結果、人間と植物に関連する細菌のリポキシゲナーゼの結合部位は似ているのに対し、海洋関連の細菌のものは大幅に小さかった。このことは、リポキシゲナーゼの構造が特定の宿主に合わせて調整されていることを示唆しているんだ。

この分析は、これらの酵素が植物と人間の相互作用の間で機能を容易に切り替えられる可能性があることを示唆したけど、海洋宿主への切り替えは、海洋生物の独特の環境条件や要求のためにあまり一般的ではないかもしれない。

公衆衛生への影響

この発見は、特に免疫システムが弱い人々にとって、細菌のリポキシゲナーゼが公衆衛生に影響を与える可能性について懸念を引き起こしたよ。この研究は、これらの細菌が特に病院環境で重要なリスクをもたらすことが多いことを示しているんだ。

ある細菌の間でリポキシゲナーゼの「スーパースプレッディング」のリスクがあったけど、さらなる調査で以前の結論が誇張されている可能性があることが分かって、この考えは少し後退したよ。それでも、抗菌耐性や多剤耐性の存在は依然として心配で、これらの病原体の継続的な監視が必要だということを強調しているんだ。

今後の方向性

この研究は、脆弱な患者の間でのアウトブレイクを防ぐために、これらの細菌の相互作用を理解することの重要性を強調しているよ。また、海洋生態系におけるリポキシゲナーゼを持つ細菌の生態的役割を探る必要があるとも言っている。

これらの細菌が異なる宿主システムをどのように利用するかを理解することは、基礎科学と応用分野、例えば医療微生物学や公衆衛生の両方にとって重要なんだ。リポキシゲナーゼの研究を続けることで、微生物がさまざまな環境でどのように適応し繁栄しているのかが明らかになり、最終的には感染症との戦いに役立つかもしれない。

結論

まとめると、この研究は細菌と宿主の複雑な相互作用について光を当てているよ。細菌が異なる宿主を切り替える能力や、このプロセスにおけるリポキシゲナーゼの役割は、病原体の行動を理解し、感染症に対抗する戦略を開発するために重要なんだ。感染症の景観が進化し続ける中で、微生物の生態と人間の健康のつながりを認識することがますます重要になっているんだよ。

オリジナルソース

タイトル: Bacterial lipoxygenases are associated with host-microbe interactions and may provide cross-kingdom host jumps

概要: In this bioinformatic research, we studied the association of bacterial lipoxygenases (LOXs) with pathogenic and symbiotic traits by text networks analysis, phylogenetic analysis, and statistical analysis of molecular structure. We found that bacterial lipoxygenases are associated with a broad host range -- from coral to plants and humans. In humans, bacterial LOXs are associated with opportunistic and nosocomial infections as well as with affecting specific patient populations like cystic fibrosis patients. Moreover, bacterial LOXs are associated with plant-human (or human-plant) host jumps in emerging pathogens. We also inferred a possible mechanism of such host jumps working via a hosts oxylipin signalling "spoofing". Graphical abstract O_FIG O_LINKSMALLFIG WIDTH=200 HEIGHT=81 SRC="FIGDIR/small/497025v5_ufig1.gif" ALT="Figure 1"> View larger version (21K): [email protected]@17c5242org.highwire.dtl.DTLVardef@fca335org.highwire.dtl.DTLVardef@3f2cae_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG C_FIG

著者: Georgy Kurakin

最終更新: 2024-04-07 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.21.497025

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.21.497025.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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