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NLRP3インフラマソーム活性化の洞察

新しい研究が、NLRP3インフラマソームが有害な信号にどう反応するかを明らかにしてるよ。

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NLRP3NLRP3インフラマソームの洞察役割を探る。NLRP3の免疫活性化メカニズムにおける
目次

哺乳類の免疫システムは、感染症とかの有害な脅威から体を守るのに役立ってる。このシステムの中には、これらの脅威を検出して反応するための経路があるんだ。これらの経路はバランスを保つ必要があって、過剰に活性化されると炎症を引き起こして病気や老化、脳の障害に繋がることもあるんだ。

免疫応答の強さや長さは、いろんな要因によって変わる。たとえば、応答を引き起こすもの、関与する細胞のタイプ、それらの健康状態、起動される経路などが影響する。これらの変化からはいくつかの結果が生まれて、炎症が細胞死に繋がることもある。体の中のタンパク質は、これらの応答を始めるためのセンサーとして働いていて、有害な物質を検出したり、細胞内の特定のタンパク質や経路を保護したり、細胞の健康をチェックして適切な防御メカニズムを起動するんだ。

インフラマソームとその機能

特別なセンサータンパク質のグループが、危険を感じるとインフラマソームと呼ばれる複合体を形成することがある。このセンサーが有害な信号を認識すると、集合し始めてカスパーゼ-1というタンパク質を活性化させる。これは直接起こることもあれば、最初にASCという別のタンパク質を連れてくることもある。活性化されたカスパーゼ-1は、特定のシグナル伝達タンパク質であるサイトカインを活性型に変換し、別のタンパク質であるガスダーミン-Dの一部を放出する。

ガスダーミン-Dが活性化されると、細胞膜に穴を開けて、活性型サイトカインを細胞から放出させる。このプロセスは、特定のタイプの細胞死であるパイロプトーシスを引き起こすことが多い。これは、より大きな炎症性分子が放出されるような異なる細胞破裂を特徴とする。

インフラマソームのプロセスの各ステップを制御するために、多くの信号があり、炎症レベルを細かく調整するのに役立っている。異なるセンサータンパク質は、役割に応じて異なる組織の特定の有害なパターンを認識することができる。たとえば、特定の免疫細胞は、NLRP3と呼ばれるさまざまなセンサーを発現している。これらの細胞の一部は、応答する準備が整うために、細菌成分のような最初の信号が必要だ。この信号は特定の転写因子を活性化し、それがインフラマソームプロセスに関与するタンパク質の産生を促進する。

NLRP3の活性化は、いくつかの免疫細胞では前の信号なしに起こることもあるが、多くの場合、最初の信号が細胞がインフラマソームを活性化する前に受けられるストレスのしきい値を設定し、どれだけの炎症信号が放出されるかを決定するのに役立つ。

NLRP3の修飾と調節

NLRP3自体も作られた後に修飾されることがあり、これによりその活性化が微調整される。この修飾プロセスは、前の信号ステップなしに起こることもある。たとえば、特定の変化は、タンパク質の量を調整したり、NLRP3が活性化されるものに対して敏感になったり、不敏感になったりすることができる。これらの調節プロセスは重要で、NLRP3の異常な動作がさまざまな病気に繋がる可能性があるからだ。

NLRP3の活性化にしばしば関連付けられる相互作用の一つは、NEK7というタンパク質との結合だ。細胞周期の間、NEK7は捕まることがあり、その時にNLRP3の活性化のために使えるプールが減少する。この減少の正確な理由は不明だが、細胞が分裂している間に誤ってインフラマソームが活性化されるのを防ぐのを助けるかもしれない。

ただし、NLRP3を活性化できる物質が高レベルで存在する場合や、長時間それにさらされると、ある種の細胞はNLRP3を活性化するのにNEK7を必要としない。最終的に、NLRP3は活性化物質を検出するまで非活性の状態に留まる。

NLRP3を活性化する刺激

NLRP3を活性化する刺激にはいくつかのタイプがあり、その多くはカリウムイオンの細胞外への移動に関連している。これらの刺激の例には、尿酸やコレステロールからの結晶、特定の粒子、リソソームを破壊する物質が含まれる。イミキモドやその誘導体CL097のような特定の活性化因子は、インフラマソームの応答を引き起こすのにカリウムを必要としない。代わりに、それらはミトコンドリアの機能を妨げたり、エンドソームでの未知の変化を引き起こしたりするかもしれない。

これらのさまざまな物質は、細胞内の通常のバランスを乱すが、正確にどのようにそれを行うかはまだ完全には理解されていない。おそらく、リン脂質であるホスファチジルイノシトール4-リン酸(PI4P)の移動に影響を与え、正常な細胞のトラフィックを妨害していると考えられる。

細胞トラフィックとNLRP3活性化に関する最近の発見

最近の研究では、さまざまなインフラマソーム活性化因子が、細胞内のタンパク質の移動を中断し、オルガネラ同士の相互作用に影響を与えることが示されている。たとえば、細胞内で小胞体(ER)がゴルジ体やエンドソームなどの他のオルガネラと出会う場所がある。これらの場所は、これらの構造間でリン脂質を移動させるのに役立っている。もしこれらの動きが妨げられると、特定のリン脂質やタンパク質がエンドソームに蓄積されることになる。

特定のインフラマソーム活性化因子が存在すると、エンドソームにPI4Pの蓄積を引き起こし、NLRP3がこれらの場所に運ばれる。その後、NLRP3はPI4Pと結合する特定の領域を通じて膜に付着し、ゴルジや他の膜に局所化することができる。さまざまな手段によるNLRP3の修飾は、これらの膜への結合を増加させることができる。

PI4Pに結合する領域を取り除くと、NLRP3は活性化できなくなるが、他の手段でその結合領域を復元すると、活性化能力を取り戻すことができる。また、PI4Pの蓄積を阻止したり、その分解を促進したりすることで、NLRP3の活性化を止めることができる。これらの観察結果は、エンドソームがNLRP3の活性化に重要であり、特定のリン脂質の相互作用がその適切な機能に必要であることを支持している。

オルガネラとタンパク質の相互作用の調査

NLRP3インフラマソームの活性化因子が正常な細胞機能をどのように妨げるかを理解するために、研究者たちは、重要なオルガネラにおけるタンパク質の詳細なインベントリを作成した。これには、休息時とさまざまなタイプのNLRP3活性化因子に応答しているときが含まれる。彼らは、これらの活性化因子が細胞内のタンパク質の移動に重要な変化を引き起こし、正常な細胞プロセスの乱れを反映していることを発見した。

NLRP3が活性化因子に応答してどのように移動するかを監視することで、研究者たちはNLRP3が小胞体との接触をすぐに失い、代わりにアクチンやエンドソームに関連するタンパク質とより多く相互作用することを発見した。これにより、NLRP3は小胞体との通常の接触が失われたときにPI4Pが豊富なエンドソームからインフラマソーム複合体を形成することを示唆している。

刺激に対するタンパク質や細胞機能の変化

この研究では、NLRP3活性化因子で処理されたときに細胞の全体的なタンパク質構成がどのように変化するかを調べた。重要な変化を示したタンパク質は少数だったが、CDC25AおよびCDC25Bと呼ばれる2つのタンパク質が両方の処理条件で減少した。これらのタンパク質は細胞周期を制御するのを助けるため、その減少はストレスに応じて細胞周期の停止を引き起こす可能性がある。

研究者たちは、処理が細胞オルガネラにグローバルな変化を引き起こしたかどうかも調べ、大規模な再編成がこれらの構造内で行われていることを明らかにした。たとえば、ナイジェリシンや別の活性化因子であるCL097は、特にリソソームとミトコンドリアでさまざまなオルガネラに特異的な変化をもたらすことがわかった。

リソソームとミトコンドリアの役割

リソソームはNLRP3インフラマソーム活性化プロセスにおいて重要な役割を果たすことが知られている。リソソームを傷つける物質はNLRP3を活性化でき、研究者たちはこれらの応答中にリソソームの損傷に関連する一般的なパターンを理解しようとした。彼らはリソソームのプロテオームを調べる特定の方法を使用し、ナイジェリシンとCL097はリソソームマーカーのターゲティングを損なわないようであり、リソソームの完全性が保持されていることを示唆した。

一方で、ミトコンドリアの活動もNLRP3の活性化に影響を与える。研究者たちは、活性化因子がミトコンドリアのプロテオームをどのように再編成するかを調べた。彼らは抗酸化応答に関連するいくつかのタンパク質が減少していることを発見し、ミトコンドリアの健康がインフラマソーム応答に関連している可能性があることを示唆した。

エンドソームの変化を調査

NLRP3インフラマソームがエンドソームマーカーと共局在することが考えられるため、研究者たちはインフラマソーム活性化因子がエンドソームトラフィックにどのような影響を与えるかを調べた。彼らはナイジェリシンとCL097の両方が、エンドソームタンパク質の挙動に重要な変化を引き起こすことを発見した。特定のエンドソームトラフィックに関与するタンパク質が、処理後に濃縮されており、これらの経路はNLRP3の活性化中に大規模な変化を経ることが示された。

これらの発見は、NLRP3アゴニストによって引き起こされる信号が細胞内の正常なトラフィックパターンを乱すことができることを示しており、エンドソームの動態とインフラマソームの活性化との直接的な関連を提案している。

ゴルジの再構築とNLRP3の活性化

ゴルジ体もNLRP3活性化プロセスにおいて重要なオルガネラだ。研究者たちはナイジェリシンとCL097がゴルジのプロテオームにどのように影響するかを調べた。彼らの発見によると、両方の処理がゴルジに関連するタンパク質の組成と動態に変化をもたらすことが示された。この乱れは、NLRP3がどのように炎症信号を集めて応答するかにおいてゴルジが役割を果たす可能性があることを示唆している。

NLRP3とPI4Pの相互作用の時間的・空間的分析

NLRP3が他のタンパク質やオルガネラとどのように相互作用するかをよりよく理解するために、研究者たちはインフラマソームの活性化中にNLRP3がどのようにトラフィックするかを監視するための高度な技術を使用した。彼らは活性化時にNLRP3がタンパク質と相互作用し、インフラマソームの組立が行われる場所に向かうことを反映していることを発見した。

特別なバイオセンサーを使用して、NLRP3がPI4Pと相互作用する様子を追跡し、このリン脂質が組立プロセスで重要な役割を果たしていることを示唆した。結果は、NLRP3が活性化されると、小胞体から移動し、細胞骨格やエンドソームに関連するタンパク質と関与することを確認した。

NLRP3の周辺タンパク質の分析

研究者たちは、NLRP3が活性化される際にその周囲のタンパク質をより包括的に理解しようとした。近くのタンパク質を選択的にラベル付けする技術を使用することで、炎症条件下でNLRP3に近づくタンパク質を特定することができた。多くの既知の相互作用因子がNLRP3に近づき、これらの相互作用がインフラマソームの活性にとって重要であるという結論をサポートした。

結論

NLRP3インフラマソームが脅威にどのように応答するかを理解することは、さまざまな炎症性疾患に取り組むための戦略を開発するのに重要だ。この発見は、NLRP3の活動を調節するのにおけるオルガネラの相互作用とタンパク質の修飾の重要性を強調している。これらのメカニズムのさらなる探求は、不適切なインフラマソーム活性化に関連する疾患に対する治療法の新たなターゲットを明らかにする可能性がある。NLRP3とその相互作用因子がさまざまな刺激に応じてどのように機能するかを広げることで、研究者たちは免疫応答の複雑さとそれが健康や病気に与える影響をよりよく把握することができるだろう。

オリジナルソース

タイトル: Spatiotemporal proteomic profiling of cellular responses to NLRP3 agonists

概要: Nucleotide-binding domain and leucine-rich repeat pyrin-domain containing protein 3 (NLRP3) is an innate immune sensor that forms an inflammasome in response to various cellular stressors. Gain-of-function mutations in NLRP3 cause autoinflammatory diseases and NLRP3 signalling itself exacerbates the pathogenesis of many other human diseases. Despite considerable therapeutic interest, the primary drivers of NLRP3 activation remain controversial due to the diverse array of signals that are integrated through NLRP3. Here, we mapped subcellular proteome changes to lysosomes, mitochondrion, EEA1-positive endosomes, and Golgi caused by the NLRP3 inflammasome agonists nigericin and CL097. We identified several common disruptions to retrograde trafficking pathways, including COPI and Shiga toxin-related transport, in line with recent studies. We further characterized mouse NLRP3 trafficking throughout its activation using temporal proximity proteomics, which supports a recent model of NLRP3 recruitment to endosomes during inflammasome activation. Collectively, these findings provide additional granularity to our understanding of the molecular events driving NLRP3 activation and serve as a valuable resource for cell biological research. We have made our proteomics data accessible through an open-access Shiny browser to facilitate future research within the community, available at: https://harperlab.connect.hms.harvard.edu/inflame/. We will display anonymous peer review for this manuscript on pubpub.org (https://harperlab.pubpub.org/pub/nlrp3/) rather than a traditional journal. Moreover, we invite community feedback on the pubpub version of this manuscript, and we will address criticisms accordingly.

著者: J. Wade Harper, L. R. Hollingsworth, P. Veeraraghavan, J. A. Paulo

最終更新: 2024-04-20 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590338

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590338.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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