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# 健康科学# 小児科

気管支肺異形成症と鉄依存性細胞死についての新しい見解

研究によれば、早産児のBPDと鉄喪失死に関連する重要な遺伝子が明らかになった。

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BPDとフェロトーシス遺伝BPDとフェロトーシス遺伝子の関連性が改善されるかもしれない。重要な遺伝子を特定することでBPDの治療
目次

ブロンコ肺異形成症、つまりBPDは、主に premature infant に影響を与える長期的な肺の病気だよ。肺が完全に発達していなくて、酸素や機械換気の使用によってダメージを受けることが多いんだ。早く生まれたり出生体重が低い赤ちゃんはBPDになりやすい。残念ながら、BPDの赤ちゃんは現在の治療にあまり反応せず、肺の問題が長引くことが多いんだ。例えば、肺気腫とか肺の高血圧、成長や発達の問題とか。

BPDが大事な理由

BPDは単なる医療の問題じゃなくて、家族にとって感情的にも経済的にも重い負担になるんだ。こんな病気を持つ赤ちゃんは、継続的な健康の課題があって、多くのケアが必要になるからさ。BPDの発症メカニズムを理解することができれば、医療従事者がより良い治療法を見つける手助けになるし、それが影響を受けた子供たちの生活を改善するために重要なんだよ。

フェロトーシスって何?

フェロトーシスは新しく発見された細胞死の一種で、アポトーシス(プログラムされた細胞死)や壊死(細胞損傷)とは違うんだ。このプロセスは、細胞内に鉄とダメージを受けた脂肪が多すぎると起こって、有害な分子が作られるんだ。これらの分子は細胞にストレスを与えて、最終的に細胞が死んじゃう。フェロトーシスは、特定のがんや心臓の問題など、さまざまな病気と関連しているんだ。

最近の研究では、フェロトーシスが高酸素レベルに関連する肺の損傷にも関与しているかもしれないってわかったんだ。もしフェロトーシスをコントロールできたら、BPDの新しい治療法が開発できるかもしれない。

研究アプローチ

私たちの研究では、高度なコンピュータ技術を使って、健康な子供とBPDの子供でフェロトーシスに関連する遺伝子を探したんだ。この遺伝子を特定することで、BPDの診断と治療の新しい方法を見つけたいと思ってる。

データ収集

公的な遺伝子データベースからデータを集めたよ。BPDと人間に関する研究に焦点を当ててデータをフィルターした後、294人の子供の血液サンプルを集めたんだ。健康な112人とBPDの182人って感じ。フェロトーシスに関連する遺伝子の情報も集めて、研究を進めたよ。

差異発現遺伝子(DEGs)の発見

集めた遺伝子データを分析して、健康な子供とBPDの子供で発現が異なるDEGsを見つけたんだ。具体的な基準を設けて分析を行ったおかげで、結果を視覚化することができたよ。

遺伝子ネットワークの構築

遺伝子の発現をさらに探るために、Weighted Gene Co-Expression Network Analysis(WGCNA)っていう方法を使ったんだ。これで一緒に働く遺伝子をグループ化できたよ。これらのグループを分析することで、BPDと関連する遺伝子をつなげることができたんだ。

重要な遺伝子の特定

BPDに関連する重要な遺伝子を見つけるために、私たちはDEGの分析とフェロトーシス関連の遺伝子リストの両方に出てきた遺伝子を探したんだ。結果、BPDに重要な役割を担っていると思われる6つの主な遺伝子が見つかったよ。

生物学的機能の評価

次に、私たちの重要な遺伝子がBPDでどんな役割を果たすかを調べたんだ。この遺伝子が関与する生物学的機能を研究したよ。他の生物学的プロセスや経路とどのように相互作用するかを見て、病気に影響する可能性があることを調べたんだ。

免疫システムとの相互作用

免疫システムはBPDに大きな役割を果たしているから、私たちの重要な遺伝子がさまざまな免疫細胞とどう関係しているかを評価したんだ。分析の結果、BPDの子供では免疫細胞の種類に変化が見られて、いくつかの中心的な遺伝子がこれらの変化と相関していたよ。

実験室テスト

私たちの発見を検証するために、特定の肺細胞を使って実験を行ったんだ。高い酸素レベルにこれらの細胞をさらして、BPDに似た状態をシミュレーションして、重要な遺伝子の発現を測定したんだ。結果は先に行った分析と一致していたよ。

重要な遺伝子の役割

  1. ACSL1: この遺伝子は脂肪代謝に重要で、細胞死に寄与する有害な脂肪レベルを減らす手助けをするかもしれない。私たちの研究では、BPDのサンプルではACSL1のレベルが低いことがわかったよ。

  2. GALNT14: この遺伝子はタンパク質の修飾に関与している。研究によるとGALNT14のレベルが低いと細胞死を促進する可能性があることがわかったし、BPDモデルでもそれを確認したんだ。

  3. WIPI1: この遺伝子はオートファジーに重要で、ダメージを受けた細胞を掃除する手助けをする。私たちのテストでWIPI1のレベルが低いことが示されていて、BPDの細胞死に関連しているかもしれない。

  4. MAPK14: この遺伝子は炎症やストレス応答を調整するのに役立つんだ。テスト中にその変化を見守っていると、BPDに複雑な役割を果たしていることを示唆しているよ。

  5. PROK2: この遺伝子は血管の発達や免疫応答に関与している。そのレベルは体がストレスに反応する方法に影響を与えるから、BPDとの潜在的な関連を示しているんだ。

  6. CREB5: この遺伝子は代謝や免疫応答を含むさまざまな生物学的プロセスを制御するのに役立ち、その調節はBPDの発症にも影響を与えるかもしれない。

BPDと免疫システムの関連

個々の遺伝子を調べるだけじゃなくて、BPDの子供たちの免疫環境も見たんだ。免疫細胞の種類や量に変化があったことがわかったんだ。特定の免疫細胞が増加し、他の細胞は減少している。この不均衡が、これらの赤ちゃんの持続的な肺の問題に寄与しているかもしれない。

結論:未来に向けて

私たちの研究は、BPDに関連するフェロトーシスの6つの重要な遺伝子を強調していて、これがBPDの理解と治療に役立つかもしれない。これらの遺伝子の役割や相互作用をさらに探ることで、新しい治療法や戦略を見つけて、難しい状況にある赤ちゃんのために改善をもたらしたいと思っているよ。

さらなる考慮事項

私たちの発見は期待できるものだけど、限界もあるんだ。一つのデータセットだけを分析したし、実験はラボの環境で行ったんだ。今後の研究では、もっと多様なデータを含めたり、現実のシナリオでのテストも考慮して、私たちの発見が臨床でうまく適用できるか確認するべきだよ。

サマリー

BPDは多くの premature infant に影響を与える深刻な病気で、長期的な健康問題を引き起こす。最近の研究で、特定の細胞死の形態であるフェロトーシスとの関連が明らかになった。関与する重要な遺伝子を特定し、その役割を探ることで、この状態の治療や管理に向けたより良いアプローチを見つけたいと考えている。これらのつながりを理解することで、BPDの複雑さについての洞察が深まり、影響を受けた赤ちゃんとその家族の生活の質を大幅に改善する新しい介入の道が開けるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Bioinformatics analyses and experimental validation of ferroptosis-related genes in bronchopulmonary dysplasia pathogenesis

概要: ObjectiveWe aimed to study the involvement of ferroptosis in the pathogenesis of bronchopulmonary dysplasia (BPD) by conducting bioinformatics analyses and identifying and validating the associated ferroptosis-related genes to explore new directions for treating BPD. MethodsThe dataset GSE32472 on BPD was downloaded from the public genome database. Using R language, differentially expressed genes (DEGs) between the BPD and normal group were screened. In the present study, we adopted weighted gene correlation network analysis (WGCNA) for identifying BPD-related gene modules and ferroptosis-related genes were extracted from FerrDb. Their results were intersected to obtain the hub genes. After that, to explore the hub gene-related signaling pathways, the hub genes were exposed to gene ontology enrichment analysis. With the purpose of verifying the mRNA expression of the hub genes, a single-gene gene set enrichment analysis and quantitative reverse transcription polymerase chain reaction were conducted. Immune cell infiltration in BPD was analyzed using the CIBERSORT inverse fold product algorithm. ResultsA total of 606 DEGs were screened. WGCNA provided the BPD-related gene module darkgreen4. The intersection of DEGs, intramodular genes, and ferroptosis-related genes revealed six ferroptosis-associated hub genes (ACSL1, GALNT14, WIPI1, MAPK14, PROK2, and CREB5). Receiver operating characteristic curve analysis demonstrated that the hub genes screened for BPD were of good diagnostic significance. According to the results of immune infiltration analysis, the proportions of a cluster of differentiation (CD)8, CD4 naive, and memory resting T cells and M2 macrophage were elevated in the normal group, and the proportions of M0 macrophage, resting mast cell, and neutrophils were increased in the BPD group. ConclusionsA total of six ferroptosis-associated hub genes in BPD were identified in this study, and they may be potential new therapeutic targets for BPD.

著者: Shibing Xi, Y. Luo, Z. Zhang, T. Li

最終更新: 2023-09-11 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.04.23295026

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.04.23295026.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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