新しい方法でマウスの動きテストが改善された
Forestwalkは、科学者がマウスの運動機能を分析する方法を革新する。
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目次
マウスの運動機能をテストすることで、脳がどのように動きをコントロールしているかを科学者たちは理解できるんだ。よくやるテストの一つがビームウォークで、マウスが狭いビームを歩いてご褒美の箱に到達するの。これで彼らの調整力やバランスを測るんだけど、従来のパフォーマンス測定方法では微妙な問題を見逃しちゃったり、採点する人によって結果が影響されたりすることがあるんだ。
ビームウォークテスト
ビームウォークでは、マウスが一連の狭いビームを渡らなきゃいけないんだ。このビームは形やサイズがいろいろあって、ゴールはビームの端にある箱。テストの前にマウスはそのタスクをちゃんとできるようにトレーニングされるよ。準備が整ったら、何度もビームウォークをするんだ。もしマウスがビームから落ちちゃったら、もう一度挑戦できるんだ。
従来の採点方法
研究者は通常、マウスがビームを渡るのにかかる時間と、何回滑ったかの2つのメインスコアに頼ってる。これらのスコアは人間の観察者によって記録されるけど、人によって見方が違うから得点に不一致が出ることもある。これが結果の比較を難しくしちゃうんだ。
プロセスの自動化
こうした問題を解決するために、科学者たちはマウスの動きを自動で追跡する技術を取り入れているよ。高度なソフトウェアを使って、人間の観察なしにマウスのデータを集められるんだ。この方法は、マウスがビームを渡る時の動きについて、より信頼性が高く詳細な情報を提供してくれるんだ。
フォレストウォークの導入
ビームウォークで集めたデータをより良く分析するために、フォレストウォークという新しい方法が開発されたよ。このシステムはデループカットっていうテクニックを使って、マウスがビームを渡るときの体の重要なポイントを追跡するんだ。これで、基本的なスコアだけじゃなく、マウスの動きを詳しく把握できるようになるんだ。
フォレストウォークの仕組み
まず、デループカットはマウスの鼻や足、尾の特定のポイントを追跡するんだ。それに、ビーム自体のポイントも特定するよ。これらのポイントが、マウスのテスト中のパフォーマンスを判断するのに役立つんだ。そして、データは処理されて、体の部分間の距離や関節の角度など、いろんな特徴が抽出されるんだ。
フォレストウォークの利点
フォレストウォークにはいくつかの利点があるんだ。人の観察者がもたらすばらつきを排除できるし、手動での採点よりも早いし、データの幅も広いんだ。この方法は、従来の採点方法では見逃されるような微妙な動きの変化も捉えられるんだ。
ジアゼパムを使ったテスト
研究者たちは、動きに影響を与えうる薬のジアゼパムを使ったテストも行ったよ。低用量でもマウスのビームウォークのパフォーマンスに影響を与えることがわかったんだ。ビームを渡るのにかかる時間はあまり変わらなかったけど、滑った回数はジアゼパムの用量が増えるにつれて増えたんだ。
神経障害の検出
フォレストウォークは、特にアンジェルマン症候群に関連する遺伝的障害を理解するためにも使われたよ。この状態はバランスや調整に問題があることと関連しているんだ。この症候群の異なるマウスモデルがテストされて、フォレストウォークは従来のスコアでは見逃されていた重要な違いを見つけることができたんだ。
マウスモデルの発見
アンジェルマン症候群に関連する遺伝的変化のあるマウスのテストでは、フォレストウォークが彼らのビーム上の動きに違いを見つけたんだ。あるマウスは特定の動きのパターンを示して、他のマウスよりも滑りやすかったり、ビームを渡るのが早かったりしたんだ。これは、似たような遺伝子変化を持つマウスでも、異なる動きの特性があることを示しているよ。
GAT1ノックアウトマウス
この研究のもう一つの焦点は、関連する神経障害を研究するために使われるGAT1ノックアウトマウスだったよ。マウスはホモ接合体(両方の遺伝子がノックアウト)かヘテロ接合体(一つの遺伝子がノックアウト)になるんだ。従来の採点ではヘテロ接合体と普通のマウスの間に違いが見られなかったけど、フォレストウォークはヘテロ接合体のマウスに微妙な運動の変化を見つけることができたんだ。
結果の検証
フォレストウォークの信頼性を確認するために、研究者たちは別のマウス群でテストを繰り返したよ。検出された特徴が試行を通じて一貫性を保っていることがわかったんだ。この一貫性は、フォレストウォークの結果が信頼できることを示唆していて、運動障害の理解を深める手助けになるかもしれないんだ。
まとめ
全体的に、フォレストウォークの方法はマウスの運動機能を分析するのに重要な進展を示しているよ。行動の検出を自動化し、動きのパターンを詳しく分析することで、遺伝的要因や薬理学的要因が運動にどのように影響するかについて新しい洞察が得られるんだ。これらの要因を理解することで、最終的には運動機能に関連する人間の病気のより良い治療法につながるかもしれないね。
今後の方向性
この研究は、運動に関連するさまざまな状態を理解するためにビームウォークテストの応用をさらに探求することを示唆しているよ。技術が進歩することで、異なる要因が運動制御に与える影響についてさらに詳細なデータが得られるかもしれない。似たような方法が他のテストにも適用される可能性があって、動物や人間の運動行動の理解がさらに深まるかもしれないんだ。
人間の健康への影響
これらのテストの結果は、マウスだけに関連するわけじゃないよ。これらのモデルで脳が運動をどうコントロールしているかを学ぶことで、研究者たちはバランスや調整に関連する人間の健康問題を治療するためのより良い戦略を開発するかもしれないんだ。これは高齢者や特定の神経障害のある人にも影響を与えるかもしれなくて、ビームウォークが動物と人間の研究の両方で貴重なツールになるんだ。
これからの課題
フォレストウォークの有望な結果にもかかわらず、解決すべき課題があるんだ。システムが異なるマウスや条件に正確に一般化できるかどうかを確認することが重要だよ。将来の研究で、検出された特徴がモデル化された基礎的な健康状態を信頼性高く反映できるかをさらに確認することができるんだ。
最後のコメント
フォレストウォークの開発は、技術と生物学的研究の交差点を示しているよ。現代のツールを活用することで、科学者たちは健康や病気における運動の制御についての理解を深めることができて、最終的にはより良い治療法の道を開く手助けになるんだ。研究が進化し続ける中で、フォレストウォークのようなツールの貢献は、運動機能の謎を解き明かすためにますます重要になっていくと思うよ。
タイトル: Forestwalk: A machine learning workflow brings new insights into posture and balance in rodent beam walking
概要: AbstractThe beam walk is widely used to study coordination and balance in rodents. While the task has ethological validity, the main endpoints of foot slip counts and time to cross are prone to human-rater variability and offer limited sensitivity and specificity. We asked if machine learning-based methods could reveal previously hidden, but biologically relevant, insights from the task. Marker-less pose estimation, using DeepLabCut, was deployed to label 13 anatomical points on mice traversing the beam. Next, we automated classical endpoint detection, including foot slips, with high recall (>90%) and precision (>80%). A total of 395 features were engineered and a random-forest classifier deployed that, together with skeletal visualizations, could test for group differences and identify determinant features. This workflow, named Forestwalk, uncovered pharmacological treatment effects in C57BL/6J mice, revealed phenotypes in transgenic mice used to study Angelman syndrome and SLC6A1-related neurodevelopmental disorder, and will facilitate a deeper understanding of how the brain controls balance in health and disease.
著者: Eoin C O\'Connor, F. Tozzi, Y.-P. Zhang, D. Roqueiro, R. Narayanan, E. C. O'Connor
最終更新: 2024-04-29 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.590945
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.590945.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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