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# 生物学# 細胞生物学

上皮細胞におけるタンパク質の動きを解明する

研究が上皮細胞におけるタンパク質輸送の複雑なダイナミクスを明らかにしてるよ。

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タンパク質輸送ダイナミクスタンパク質輸送ダイナミクスを探るに関する洞察。上皮細胞のタンパク質移動と分泌メカニズム
目次

上皮細胞は私たちの体の保護層を作って、器官や構造を覆ってるんだ。こいつらはバリアみたいな役割を果たして、腸や皮膚みたいな場所で何が入ったり出たりするかをコントロールしてる。上皮細胞には2つの面があって、外側や内部の空間に向かう頂側と、他の細胞や組織とつながる基底側がある。これらの細胞は栄養素を吸収したり、物質を分泌したり、体の内部環境を維持するのに重要なんだ。

イオンチャネルとトランスポーターの役割

上皮細胞の大事な仕事の一つは、イオンや栄養素、その他の物質の移動を管理することだよ。これには、イオンチャネルやトランスポーターっていう特別なタンパク質が関わっていて、細胞の頂側か基底側に存在してる。これらのタンパク質は上皮層を通じて物質を移動させる手助けをしているんだ。それに、細胞間にタイトジャンクションができてて、物質が隙間から滑り込むのを防いでるよ。

上皮細胞によるタンパク質の分泌

上皮細胞はしばしば、頂側か基底側から因子を分泌するんだ。それを実現するためには、タンパク質を細胞の正しい側に送らなきゃならない。新しくできたタンパク質はまず、内因性小器官(ER)やゴルジ体に運ばれる。そこから、それぞれの行き先に仕分けされて送られるんだ。いくつかのタンパク質は直接、最終地点に向かうけど、他のは色々な要因によって異なる道を通ることもあるよ。

RUSH技術

タンパク質が上皮細胞の正しい側にどうやって行くのかをもっと理解するために、研究者たちはRUSH(Selective Hooksを使ったRetention)という技術を開発したんだ。このシステムは科学者たちがタンパク質にタグを付けて、簡単に追跡できるようにするんだ。タグが付けられたタンパク質は信号が出るまでERで留められて、その後に放出されて目的地に動くんだ。この方法は、細胞内でのタンパク質の動きのタイミングや組織を明らかにしてくれるよ。

ショウジョウバエの上皮細胞の研究

これまでの上皮細胞内のタンパク質の動きの研究は、主に少数の哺乳類の細胞タイプに焦点を当ててた。研究者たちはショウジョウバエ(果実バエ)の卵胞上皮でこのプロセスを研究しようとしたんだ。この細胞は発育中の卵細胞を取り囲んでいて、遺伝子操作もしやすいんだ。ショウジョウバエの卵胞細胞の構造は、タンパク質の動きをより良くイメージングして研究するのに役立つんだ。

機械学習を使った動きの追跡

タンパク質や小胞の動きを分析するために、研究者たちはMSP-trackerっていう新しいプログラムを使ったんだ。このソフトウェアは機械学習を使って、細胞内の混雑した環境で小胞の動きを追跡することができるんだ。細胞の他の構造からのバックグラウンドノイズのせいで難しい小さな小胞を検出して追う能力を高めるんだよ。

MSP-trackerのパフォーマンス

MSP-trackerがどれくらい効果的かを評価するために、研究者たちはシミュレーションデータと実際の小胞の動画の両方でテストしたんだ。その結果、MSP-trackerは他の追跡プログラムよりも優れていて、真実データと比べて小胞の動きを大きな割合で正確に特定してることがわかったよ。

タンパク質分泌の可視化

RUSH技術を使って、研究者たちはショウジョウバエの卵胞細胞でCad99cやNidogenみたいな特定のタンパク質の動きを可視化できたんだ。Cad99cは細胞の頂側に移動する重要なタンパク質で、Nidogenは主に基底側に存在してるよ。

タンパク質の動態分析

タイムラプス録画によると、Cad99cはERから放出された後、すぐにゴルジ体に蓄積して頂側の表面に効率よく到達することがわかったよ。対照的に、Nidogenの動きのダイナミクスは少し違ってた。彼らの動きを追跡することで、これらのタンパク質がそれぞれの位置にどれくらいの速さで移動するかを特定することができたんだ。

タンパク質輸送における微小管の影響

微小管は細胞内でタンパク質を輸送する重要な構造だよ。研究者たちは微小管の変化がCad99cやNidogenの動きにどう影響するかを調べたんだ。微小管を妨害する薬を使って、Cad99cの動きが大幅に減少した一方で、Nidogenの動きはほとんど影響を受けなかったんだ。これはこの2つのタンパク質の輸送メカニズムに違いがあることを示してるね。

小胞輸送におけるモーターの役割

さまざまなモータータンパク質が細胞内で小胞を移動させるんだ。この研究では、2つの重要なモーター、ダイニンとKhc73を調べたんだ。ダイニンは主にタンパク質を頂側に輸送する役割があって、Khc73はNidogenのようなタンパク質の基底輸送を助けるんだ。通常のダイニン機能が欠けた変異体を研究することで、Cad99cやNidogenの分布にどう影響するかを見ることができたんだ。

微小管が妨害されたときの分泌パターンの変化

微小管が妨害されたとき、研究者たちはCad99cの分泌が卵胞細胞の頂側から横側に移ったことに気づいたんだ。この発見は、正しい位置にタンパク質が配置されるのが微小管ネットワークの完全性に大きく依存していることを示唆してる。Nidogenの分泌パターンも影響を受けたけど、Cad99cほど大きくは変化しなかったよ。

輸送の双方向分泌

興味深いことに、この研究では異なるタンパク質が上皮細胞から異なる分泌パターンを示すことがわかったんだ。例えば、Nidogenは移動する細胞の先端で分泌される傾向がある一方、コラーゲンIVのような他のタンパク質は主に後方で分泌されてるんだ。これは、タンパク質がどこでどうやって放出されるかをコントロールする高度なメカニズムがあることを示してるね。

上皮細胞の分泌に関する結論

この研究の結果は、上皮細胞内でのタンパク質の移動と分泌の複雑さを強調しているんだ。進んだイメージング技術や機械学習ツールを使うことで、科学者たちはこれらの重要な細胞がどのように機能しているかをより深く理解できるんだ。タンパク質の輸送メカニズムを理解することは、細胞機能についての知識を提供するだけでなく、上皮細胞に関わるさまざまな病気や状態の理解にも影響を与えるんだよ。

タンパク質移動研究の今後の方向性

研究者たちがタンパク質の移動や分泌の intricacies を探求し続ける中で、細胞の輸送が不適切なことから生じる状態に対する新しい治療法の可能性がある新しい発見が期待されるね。今後の研究では、他のモータータンパク質の役割や、それらが細胞骨格とどのように相互作用するか、さらに様々な外部要因がこれらの細胞プロセスにどう影響するかを深掘りするかもしれないね。

オリジナルソース

タイトル: Tracking exocytic vesicle movements reveals the spatial control of secretion in epithelial cells.

概要: Understanding how specific secretory cargoes are targeted to distinct domains of the plasma membrane in epithelial cells requires analysing the trafficking of post-Golgi vesicles to their sites of secretion. We used the RUSH (retention using selective hooks) system to synchronously release an apical cargo, Cadherin 99C (Cad99C), and a basolateral cargo, the ECM protein Nidogen, from the endoplasmic reticulum and follow their movements to the plasma membrane. We also developed an interactive vesicle tracking framework, MSP-tracker and viewer, that exploits developments in computer vision and deep learning to determine vesicle trajectories in a noisy environment without the need for extensive training data. MSP-tracker outperformed other tracking software in detecting and tracking post-Golgi vesicles, revealing that Cad99c vesicles predominantly move apically with a mean speed of 1.1{micro}m/sec. This is reduced to 0.85 {micro}m/sec by a dominant slow dynein mutant, demonstrating that dynein transports Cad99C vesicles to the apical cortex. Furthermore, both the dynein mutant and microtubule depolymerisation cause lateral Cad99C secretion. Thus, microtubule organisation plays a central role in targeting apical secretion, suggesting that Drosophila does not have distinct apical versus basolateral vesicle fusion machinery. Nidogen vesicles undergo planar-polarised transport to the leading edge of follicle cells as they migrate over the ECM, whereas most Collagen is secreted at trailing edges. The follicle cells therefore bias secretion of different ECM components to opposite sides of the cell, revealing that the secretory pathway is more spatially organised than previously thought.

著者: Daniel St Johnston, J. H. Richens, M. Dmitrieva, H. L. Zenner, N. Muschalik, R. Butler, J. Glashauser, C. Camelo, S. Luschnig, S. Munro, J. Rittscher

最終更新: 2024-04-30 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.25.577201

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.25.577201.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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