コヒーシンとコデンシン:クロマチンの整理におけるキープレーヤー
コヒーシンとコンダンシンが細胞分裂中にクロマチンをどう形作るかを発見しよう。
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目次
細胞は遺伝物質を適切に機能させるために整理する必要がある。この整理は、DNAが正確にコピーされ、必要なときに遺伝子が発現することを確保するのに役立つ。コヒーシンとコデンシンという二つの重要なタンパク質複合体が、この整理を維持する上で重要な役割を果たしている。コヒーシンは細胞分裂中に姉妹染色分体を一緒に保持するのを助け、コデンシンはクロマチンをよりコンパクトな形に凝縮するのを助ける。
クロマチンの整理におけるコヒーシンの役割
コヒーシンはDNAに結合してループと呼ばれる構造を作るタンパク質複合体だ。このループの形成は、細胞周期中の染色体の適切な構造を維持するために重要だ。間期中、細胞が分裂していないときにコヒーシンはDNAを異なる領域に整理する。これらの領域は遺伝子発現や他の細胞機能にとって不可欠だ。
細胞が分裂の準備をする時、分裂期と呼ばれる過程が起こる。この段階で、姉妹染色分体を一緒に保持するコヒーシンは、それぞれの新しい細胞が遺伝物質の正確なコピーを受け取ることを確保するために重要だ。しかし、細胞が分裂期に入ると、コヒーシンの挙動は変化する。ほとんどのコヒーシンは染色体の腕から解放され、染色体がよりコンパクトな形に凝縮できるようになる。
間期から分裂期への移行
分裂期の初めに、クロマチンの整理は大きく変わる。間期中はコヒーシンが支配しているが、分裂期にはコデンシンという別のタンパク質のクラスが管理する構造に変わる。この移行は、染色体が適切に形成され、分裂の準備が整うために重要な一連のステップを含む。
細胞が分裂を開始すると、コヒーシンは染色体の腕から離れ始め、コデンシンが引き継ぐ。コデンシンはクロマチン内により大きなループ構造を作るのを助け、これは細胞分裂中に見られる密で棒状の染色体を形成するために必要だ。この変化は、二つの新しい細胞に分かれる姉妹染色分体の正しい物理的構造を得るために重要だ。
コヒーシンとコデンシンの複雑な相互作用
分裂期中、コヒーシンとコデンシンの間には継続的な相互作用がある。コデンシンがDNAのループを押し出し始めると、しばしばコヒーシンと出会う。この二種類のタンパク質の関係は単純ではない。
コデンシンがコヒーシンに出会うと、さまざまな方法で反応する。コヒーシンをバイパスしたり、DNAに沿って押しやったり、あるいは立ち往生させたりすることがある。この動的な相互作用は、分裂期中の染色体の形成や最終的な染色分体の構造に影響を与える可能性がある。
ループ形成におけるタンパク質複合体の役割
コヒーシンとコデンシンは、ループ押出しとして知られるプロセスに関与している。このプロセスは、タンパク質がクロマチン内を移動し、DNAのセクションをキャッチすることでループを作るものだ。間期中に存在するコヒーシンはこれらのループを形成するのを助け、遺伝子調節に必要なよく整理されたクロマチン構造を作り出す。
分裂期では、コデンシンが引き継ぎ、ループを作り続けるが、より動的な方法で行う。このループ押出しは、染色体を最終的な形に整えるために重要であり、細胞分裂中に分離の準備をする。
コヒーシンの重要性
姉妹染色分体の間に安定した接続を形成するコヒーシンは、細胞分裂中に重要な役割を果たす。これにより、姉妹染色分体の間の関係が分離の段階に至るまで維持される。これにより、それぞれの新しい細胞が正しい遺伝情報を受け取ることが確保される。
研究によれば、コヒーシンは排出性コヒーシンよりも長く染色体に留まる。コヒーシンの存在は、コデンシンが染色体構造に必要なループを形成する方法に影響を与える。つまり、コヒーシンは姉妹染色分体を一緒に保持するだけでなく、分裂期中の適切な染色体の整理を促進するためにも必要だ。
分裂期中の変化の観察
最近の研究では、分裂期中のコヒーシンとコデンシンの動態の変化を観察するために高度なイメージング技術が使用された。研究者たちは、細胞が間期から分裂期に移行する際に、これらのタンパク質の挙動が大きく変化することを発見した。
ライブ細胞イメージングを通じて、クロマチンの凝縮が細胞がG2期を出て初期の前期に入るとすぐに始まることが示された。前期が進むにつれて、核膜が崩壊し、個々の染色体がより明確になる。姉妹染色分体の分離は、コヒーシンとコデンシンの両方の作用の結果として焦点を当てられるイベントになる。
繰り返し構造の解体におけるコデンシンの役割
間期のクロマチン構造から分裂期のものへの移行は、主にコデンシンの作用に依存している。細胞が分裂に移行すると、コデンシンが間期中に確立された整理された構造を解体するために働く。これが起こると、トポロジカルに関連するドメイン(TAD)やコンパートメントのような特徴が消える。
コデンシンの存在がこのプロセスに必要であることが示されている。コデンシンの機能が障害されると、通常消失する特徴が消えなくなり、コデンシンが分裂期の入り口でクロマチンをリモデリングするのに積極的に参加していることを示唆している。
クロマチンに結合したコヒーシンとコデンシンの動態
細胞が分裂期の段階を進むにつれて、コヒーシンとコデンシンのレベルと位置が大きく変化する。研究によれば、前期中にコヒーシンは豊富さが減少する傾向があり、コデンシンのレベルは動的に上昇する。
この増加は重要で、クロマチンをよりコンパクトな形に変えるのを助ける。これらのタンパク質の関係の研究は、コヒーシンが整理を維持するのに役立つ一方、コデンシンが細胞分裂の成功に必要なコンパクトさを促進することを示唆している。
コヒーシンとコデンシンの相互作用
分裂期中、コデンシンとコヒーシンがどのように相互作用するかは、染色体の構造に大きな影響を与える。コデンシン複合体がコヒーシンに出会うと、いくつかの結果があり得る。
コデンシンはコヒーシンをバイパスして、DNAのループ作用を続けることができる。また、コデンシンがコヒーシンで立ち往生するかもしれず、これが期待されるループパターンを変更することにつながる。この相互作用は、細胞が分裂に向かうときに染色体の構造がどれだけ良くなるかを決定する上で重要だ。
コヒーシンの枯渇の影響
細胞周期の特定のフェーズでコヒーシンを減少させる実験は、その染色体の整理における役割について貴重な洞察を提供している。コヒーシンが取り除かれると、姉妹染色分体は分裂期中により簡単に分かれることができる。この分離は、染色体の形態に変化をもたらし、完全なものよりも幅が広く短い構造になる。
さらなる分析によれば、コヒーシンがなくても染色体は分裂に入って棒状の構造を形成することができる。しかし、コヒーシンがないと染色体の整理が大きく変化し、細胞分裂中の構造的完全性を保つためのコヒーシンの役割を強調している。
各コデンシン複合体の影響
分裂期中の各タイプのコデンシンの独自の貢献を理解するために、研究者たちはコデンシンIまたはIIが単独で存在する細胞株を使用した実験を行った。これらの研究は、各コデンシン複合体が染色体を形成する上で果たす異なる役割を浮き彫りにした。
コデンシンIは長くて変動のある構造を生成する傾向があり、コデンシンIIはよりコンパクトで整理された配置に関連している。どちらかのコデンシンが欠如すると、染色体の全体的な構造的完全性が損なわれ、それぞれの重要性が明らかになる。
染色体構造を理解するためのポリマーモデリング
染色体の整理をさらに理解するために、ポリマーモデリングが使用されている。このモデリングは、ライブセル実験で観察された構造的ダイナミクスを再現しようとするものだ。染色体の寸法と挙動の既知の測定を使用することで、研究者たちは細胞分裂中に染色体がどのように折りたたまれ、整理されるかをシミュレートすることができる。
これらのモデルは、コヒーシンとコデンシンの異なる構成が特定の染色体の形につながる様子を視覚化するのに役立つ。これらは、機能的な染色体構造を形成する際のこれらのタンパク質間の複雑な関係を示している。
コデンシンとコヒーシンの関わりのルール
広範な研究に基づいて、コデンシンとコヒーシンが分裂期中にどのように相互作用するかを説明するために三つの主要な「関わりのルール」が定義されている。
コデンシンはコヒーシンをバイパスする: コデンシンがコヒーシンに出会うと、効果的にバイパスすることができる。これにより、コヒーシンはコデンシンのループの端に留まり、姉妹染色分体を接続したまま、コデンシンはループを続けて形成できる。
コデンシンは排出性コヒーシンを取り除く: コデンシンが排出性コヒーシンに出会うと、通常それらをクロマチンから取り除く。これにより、コデンシンによって形成されたループが分裂期中の支配的な構造になることが確保される。
コデンシンはお互いに出会うと立ち往生する: 二つのコデンシンが出会うと、しばしばお互いをバイパスするのではなく立ち往生する。この立ち往生は、ループ構造に影響を与え、最終的な染色分体の構造形成に寄与する。
結論
コヒーシンとコデンシンの相互作用は、分裂期中のクロマチンの成功した整理に不可欠だ。これらのタンパク質は一緒に働いて、染色体が適切に形成され、分離されることを確保し、細胞分裂中の正確なDNAの複製と分配を可能にする。
これらの複合体の役割を理解することは、基本的な生物学的プロセスに光を当てるだけでなく、これらのメカニズムのエラーが癌のような病気につながる方法にも洞察を提供する。今後の研究は、クロマチンの整理の複雑さと細胞分裂中のタンパク質相互作用の影響をさらに解明していくでしょう。
タイトル: Rules of engagement for condensins and cohesins guide mitotic chromosome formation
概要: During mitosis, interphase chromatin is rapidly converted into rod-shaped mitotic chromosomes. Using Hi-C, imaging, proteomics and polymer modeling, we determine how the activity and interplay between loop-extruding SMC motors accomplishes this dramatic transition. Our work reveals rules of engagement for SMC complexes that are critical for allowing cells to refold interphase chromatin into mitotic chromosomes. We find that condensin disassembles interphase chromatin loop organization by evicting or displacing extrusive cohesin. In contrast, condensin bypasses cohesive cohesins, thereby maintaining sister chromatid cohesion while separating the sisters. Studies of mitotic chromosomes formed by cohesin, condensin II and condensin I alone or in combination allow us to develop new models of mitotic chromosome conformation. In these models, loops are consecutive and not overlapping, implying that condensins do not freely pass one another but stall upon encountering each other. The dynamics of Hi-C interactions and chromosome morphology reveal that during prophase loops are extruded in vivo at [~]1-3 kb/sec by condensins as they form a disordered discontinuous helical scaffold within individual chromatids.
著者: William C. Earnshaw, K. Samejima, J. H. Gibcus, S. Abraham, F. Cisneros-Soberanis, I. Samejima, A. J. Beckett, N. Pucekova, M. A. Abad, B. Medina-Pritchard, J. R. Paulson, L. Xie, A. A. Jeyaprakash, I. A. Prior, L. A. Mirny, J. Dekker, A. Goloborodko
最終更新: 2024-04-30 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590027
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590027.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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