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# 健康科学# 遺伝学・ゲノム医学

早期発症BAVに対するCNVsの影響

この研究は、早期発症のBAV合併症におけるCNVの役割を強調している。

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CNVと早期のBAV合併症CNVと早期のBAV合併症で重要な役割を果たしていることがわかった研究によると、CNVが早期のBAVケース
目次

コピー数変異(CNVs)は、特定のDNAのセクションのコピー数が変わることで、人間のさまざまな病気に関与することがあるんだ。特に大きなCNVsは、発達遅延や先天的欠損に関連付けられている。研究によると、これらの病状の重症度は、個人が持っている珍しいCNVの数に関係があるみたい。つまり、大きくて珍しいCNVは健康に大きな影響を与える可能性があるってこと。

先天性心疾患(CHD)はCNVが重要だとされる分野の一つだ。世界中で新生児の約1,000人に8.2人がCHDを持っている。CNVは2種類のCHDに関連していて、症候群性(他の身体的問題を伴う場合)と非症候群性(心疾患が主な問題の場合)に分けられるんだ。特定の症候群では、染色体における欠失や重複のようなCNVが心臓の欠損を引き起こすことが示されている。全体で、CNVはCHDの約10%のケースに存在し、他の症候群的特徴がある場合は25%まで増えることもある。CHDの原因となることで知られている特定の遺伝子、例えばGATA4やTBX1もCNVの影響を受けることがあるよ。

バイカスピッド大動脈弁(BAV)は、生まれつき存在する心臓欠損の中で最も一般的なタイプだ。人口の約0.5%から2%に現れる。BAVは大動脈弁の狭窄や大動脈の拡張のような問題を引き起こすことがある。BAVの家族歴がある家族では、この状態の発生率が高くなることが多いから、家族内で受け継がれる可能性があるんだ。BAVは単独で発生することもあれば、他の健康問題と一緒に症候群の一部として現れることもあるよ。GATA4、GATA6、NOTCH1など、家族性BAVに関与していることで知られる遺伝子がある。BAVの表現型は大きく異なることがあり、時には高齢者で予期せず見つかることもあるし、他のケースでは乳児や幼児に深刻な問題を引き起こすこともある。

研究の仮説

私たちは、大きくて珍しいCNVがBAVの早期合併症に寄与していると考えている。BAVの早期発症を持つ人は、後に診断される人や一般の人と比べて、もっと多くの珍しいCNVを持っていると思うんだ。新しいCNVを見つけることで、BAVの遺伝的要因についての重要な洞察が得られるし、特定のCNVに基づいて個人のリスクを判断するのにも役立つ可能性があるよ。

材料と方法

この研究は厳格な倫理ガイドラインに従い、関連する委員会の承認を受けた。合計で、早期発症BAVを持つ欧州系272人の参加者が登録された。早期発症は、30歳未満でBAVの症状があることと定義される。症状には、大動脈手術が必要だったり、大動脈弁の重度の問題があったり、関連する状態の治療が必要だったりすることが含まれる。既知の遺伝的症候群を持つ参加者は含まれなかった。全体で、研究には293家族から544人の個人が参加した。

CNVを分析するために、さまざまな技術やアルゴリズムを使用した。データの信頼性を確保するために品質チェックが行われ、最も信頼性の高いCNVの発見だけがさらなる分析に含まれることになった。別のグループから選ばれた高齢者のBAVを持つ個人と比較が行われた。

ケースコホートの発見

研究は、医療記録を通じて詳細な健康情報を集めた。データ分析では、異なるグループ間で大きくて珍しいCNVの発生率が似ていることが示された。ただし、早期発症BAVを持つ人は心臓発生遺伝子に関連した特定のタイプのCNVが多かった。

合計で、早期発症BAVを持つ人々で影響を与えるタンパク質コーディング遺伝子の大きなCNV領域が34ヵ所特定された。これらの領域のいくつかは、対照群と比べて早期発症のケースでより頻繁に見つかった。PCP4やDSCAMのような特定の遺伝子がこれらのCNVの中で際立っていた。また、既知の症候群に関連するいくつかの大きな遺伝的重複も、早期発症BAVのケースでより一般的だった。

分析結果は、全体的な大きくて珍しい遺伝子CNVの負担はグループ間であまり変わらないものの、BAVを引き起こすことが知られている特定のCNVは早期発症のケースで有意に多く存在していることを示している。

追加のCNVの調査

さらなる検査で、心臓発生に関与することが知られている遺伝子に影響を与える他のCNVが明らかになった。これらのCNVの多くは、早期発症BAVを持つ参加者で豊富に見つかった。また、他のデータセットで高齢BAV患者を調べ、同様のCNVが存在するか確認した。特に、いくつかの大きな遺伝的重複もこの高齢のグループで一般的だった。

早期発症BAVの家族では、GATA4やDSCAMに関与する特定のCNVの存在が注意深く観察された。これらのCNVは、重度の弁の問題や他の心臓関連の状態に関連していることが多かった。

臨床的意義

この研究は、早期発症BAVを持つ個人の約10%が心臓発生に関与する遺伝子に影響を与える大きくて珍しい、おそらく有害なCNVを持っていることを強調している。これらの発見は、これらのCNVが単一の変異遺伝子よりもBAVを引き起こす上で大きな役割を果たしているという考えを支持している。

GATAファミリーの遺伝子、特にGATA4のCNVは、いくつかの心臓欠損と関連付けられている。これらの遺伝子における変異は心臓の形成に重要だけど、いくつかのバリアントは病気のレベルが低いこともある。つまり、これらのCNVを持つ人が全員症状を示すわけではないし、家族に心臓の問題を持つ人がいるわけでもない。

DSCAMでも似たようなパターンが見られていて、珍しいCNVが非症候群性BAVのいくつかのケースで役割を果たしているかもしれない。特に、大きなCNVが早期発症グループで高齢グループに比べて有意に多いことが注目される。これは、こうしたCNVが病気の進行を早めたり、より深刻な合併症を引き起こす可能性があることを示唆している。

結論

全体として、この研究は早期発症BAVの遺伝的な状況を詳しく見て、大きくて珍しいCNVが多くのケースに存在することを明らかにしている。この研究は、これらのCNVが誰が早期の合併症を経験する可能性があるかを予測するのに役立ち、臨床的な決定を導く助けになると提案している。この知識は、心臓の状態や個々のリスク要因の遺伝学をより深く理解するための将来の研究の基盤を提供することにもなるだろう。

オリジナルソース

タイトル: Rare Genomic Copy Number Variants Implicate New Candidate Genes for Bicuspid Aortic Valve

概要: Bicuspid aortic valve (BAV), the most common congenital heart defect, is a major cause of aortic valve disease requiring valve interventions and thoracic aortic aneurysms predisposing to acute aortic dissections. The spectrum of BAV ranges from early onset valve and aortic complications (EBAV) to sporadic late onset disease. Rare genomic copy number variants (CNVs) have previously been implicated in the development of BAV and thoracic aortic aneurysms. We determined the frequency and gene content of rare CNVs in EBAV probands (n = 272) using genome-wide SNP microarray analysis and three complementary CNV detection algorithms (cnvPartition, PennCNV, and QuantiSNP). Unselected control genotypes from the Database of Genotypes and Phenotypes were analyzed using identical methods. We filtered the data to select large genic CNVs that were detected by multiple algorithms. Findings were replicated in cohorts with late onset sporadic disease (n = 5040). We identified 34 large and rare (< 1:1000 in controls) CNVs in EBAV probands. The burden of CNVs intersecting with genes known to cause BAV when mutated was increased in case-control analysis. CNVs intersecting with GATA4 and DSCAM were enriched in cases, recurrent in other datasets, and segregated with disease in families. In total, we identified potentially pathogenic CNVs in 8% of EBAV cases, implicating alterations of candidate genes at these loci in the pathogenesis of BAV. Author SummaryBicuspid aortic valve (BAV) is the most common form of congenital heart disease and can lead to long-term complications such as aortic stenosis, aortic regurgitation, or thoracic aortic aneurysms. Most BAV-related complications arise in late adulthood, but 10-15% of individuals with BAV develop early onset complications before age 30. Copy number variants (CNVs) are genomic structural variations that have been previously implicated in some types of congenital heart disease, including BAV. Here we demonstrate that individuals with early onset complications of BAV are enriched for specific rare CNVs compared to individuals with late-onset BAV disease. We also describe novel CNVs involving DSCAM, a gene on chromosome 21 that has not previously been associated with the development of BAV. These results may lead to improved risk stratification and targeted therapies for BAV patients.

著者: Siddharth Prakash, S. G. Carlisle, H. Albasha, H. Michelena, A. Sabate-Rotes, L. Bianco, J. De Backer, L. M. Mosquera, A. T. Yetman, M. M. Bissell, M. G. Andreassi, I. Foffa, D. S. Hui, A. Caffarelli, Y. Y. Kim, D. Guo, R. Citro, M. De Marco, J. T. Tretter, K. L. McBride, D. M. Milewicz, S. C. Body

最終更新: 2023-10-24 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.23.23297397

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.23.23297397.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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