大腸菌からのL-アスパラギナーゼの生産によるがん治療
研究によると、E.コリが重要な抗がん酵素を生産する可能性があることがわかった。
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L-アスパラギナーゼはアミノ酸L-アスパラギンと一緒に働く酵素だよ。主に特定のタイプの癌、特に白血病やリンパ腫の治療に使われるんだ。実際、癌治療の需要にかなり大きな影響を与えてる。L-アスパラギナーゼは、ビンクリスチンやグルココルチコイドみたいな他の薬と組み合わせて効果を高めることが多い。L-アスパラギナーゼには主に細胞外型と細胞内型の2種類があるけど、これらの酵素は動物やバクテリア、植物などいろんな生物に見られるけど、人間は自分では作れないんだ。
L-アスパラギンは健康な細胞にも癌細胞にも必要なものなんだ。癌細胞は体からL-アスパラギンを頼ってるけど、自分で作れないからね。L-アスパラギナーゼによってL-アスパラギンが減ると、癌細胞は成長に必要な栄養素を失って死ぬことがある。普通の細胞は自分で必要なL-アスパラギンを作れるから影響を受けないんだ。
L-アスパラギナーゼの利点の一つは、無毒で環境で簡単に分解されるから、安全に使えるってこと。主な供給源は特定のバクテリア、特に*大腸菌やエルウィニア*の種なんだけど、これらは臨床でリンパ芽球性白血病の治療にも効果的に使われてるんだ。
大腸菌(E. coli)は、温血動物の腸に住んでるバクテリアの一種だよ。ほとんどの株は無害だけど、中には食中毒のような深刻な病気を引き起こすものもあるんだ。無害な株はビタミンKを生成したり、腸内に有害なバクテリアが定着しないようにする役割がある。科学者たちはE. coliを分離するために、特別な成長メディウムであるEMB寒天を使うことが多いんだ。これはグラム陰性バクテリアに選択的だから、E. coliを見つけやすいんだ。
サンプル収集とラボ作業
最近の研究では、Gubriyeエリアから、特にWabe川とWolkite大学のカフェテリアの排水からサンプルが集められたよ。これらのサンプルは大学の分子バイオテクノロジーラボに運ばれて、使用するまで冷たい環境で保管されたんだ。
サンプル中のE. coliを特定するために、研究者たちはコロニーの数、色、サイズを推定したんだ。無菌テストチューブを用意して、蒸留水を加えてサンプルを希釈した。サンプルを混ぜた後、E. coliを育てるためのEosin Methylene Blue寒天プレートに接種した。プレートは24時間培養して、コロニーが発達するのを待ったんだ。コロニーが見えるようになったら、研究者たちはスプレッドプレート法を使って、さらにコロニーを分離してテストしたよ。
E. coliのコロニーの同定を確認するために、様々な生化学的テストが行われたんだ。これにはIMViCやTSI、カタラーゼテストのような、バクテリアの特定の特性を確認するためのテストが含まれてた。その結果、大部分のテストがE. coliに対して陽性で、存在が確認されたんだ。
L-アスパラギナーゼの生産
E. coliの分離株を特定した後、研究者たちはそのL-アスパラギナーゼの生産能力に焦点を当てたよ。分離株を特別な寒天プレートに置いて、それをセクションに分けたんだ。一つのプレートはコントロールとして正確なテストを確保するために使われた。研究者たちは、どの分離株がL-アスパラギナーゼを生産するかを確認するためにプレートを培養したんだ。
酵素の生産をテストするために、研究者たちはNaClやマルトース、L-アスパルチン酸などの特定の成分を含む生産メディウムを用意した。適切なpHを維持し、安全に使用するためにメディウムを滅菌したよ。バクテリアを加えて成長させた後、研究者たちは培養物の光学密度(OD)を測定して成長と酵素活性を監視したんだ。
その間、研究者たちはセンリフュージを使ってメディウムからサンプルを集めて、酵素を細胞廃棄物から分離したんだ。酵素を含む液体はさらなるテストのために保管され、固体部分は廃棄されたよ。
酵素活性テスト
L-アスパラギナーゼの効果を確認するために、研究者たちは酵素活性テストを行ったんだ。pHの変化に反応して色が変わる特別な寒天メディウムを使ったよ。酵素が働くと、L-アスパラギンが分解されてpHが上昇し、メディウムがオレンジからピンクに変わるんだ。ピンクのゾーンの大きさが酵素活性のレベルを示すんだ。
この研究では、様々なE. coliの分離株がL-アスパラギナーゼを生産する能力を調べられたよ。テストされた14の分離株のうち、11がカフェテリアの排水から、3が川の水から得られたものだった。研究者たちは、カフェテリアの排水からのE. coliがL-アスパラギナーゼを生産する能力がより高いことを発見したんだ。
この研究は、酵素生産における培養時間の重要性も強調してるんだ。結果は、長い培養期間が酵素活性を高めることを示してたよ。
L-アスパラギナーゼ生産の遺伝的確認
E. coliの分離株がL-アスパラギナーゼを生産する能力をさらに確認するために、研究者たちはPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)と呼ばれる方法を使ったんだ。この技術は科学者がDNAの断片を増幅できるようにして、L-アスパラギナーゼ生産に関連する特定の遺伝子を見つけることができるんだ。バクテリアの分離株からDNAを抽出して、L-アスパラギナーゼをコードする遺伝子向けに設計された特定のプライマーを使うことで、研究者たちはサンプル内での存在を確認できたんだ。
PCRの結果は、予想されたサイズの明確なバンドを示し、約50%の分離株がL-アスパラギナーゼを生産できる可能性があることを示してた。この確認は、治療用途にどの株が使えるか特定するためにとても重要なんだ。
結論
L-アスパラギナーゼは、特に白血病のような特定の癌の治療において重要な用途がある酵素なんだ。研究は、Wolkite大学のカフェテリアの排水からのE. coliがこの酵素を生産するための有望な源であることを示してる。研究は、これらのバクテリアの分離株が川からのものよりもL-アスパラギナーゼの生産能力が高いことを見つけたんだ。
結果は、カフェテリアの排水を利用することで、L-アスパラギナーゼを生産するバクテリアの持続可能な供給源が提供できる可能性があることを示してる。今後、この分野の研究が進むにつれて、癌治療に特に役立つ新しい効果的な酵素を見つける機会が増えるかもしれないね。分子生物学やバイオテクノロジーの分野での継続的な作業は、酵素生産のより良い方法の開発につながり、最終的には医療や産業に利益をもたらすことができるんだ。
タイトル: Potential L-asparaginase producing E.coli sources among River water and cafeteria sewage: The case of Wabe River and Wolkite University students' cafeteria in Wolkite, Ethiopia.
概要: L-asparaginase is a promising enzyme for cancer treatment and is found in plants, animals and microbes. This enzyme is of great medical and industrial importance. It is used with inside the remedy of acute lymphoblastic leukemia and helps in reducing the acryl amide substances found in fried and baked foods. Its source varies from bacteria to yeast and fungi. This study aimed to screen the potential L-asparaginase producing E. coli isolates among river water and cafeteria sewage samples near the Gubryie area, SNNPR-Ethiopia. In this study, E. coli isolates were isolated from sewage from the Wabe River and Wolkite University student cafeteria. During the study, 14 isolates, 11 from cafeteria sewage and 3 from Wabe River, were confirmed to be E. coli using IMViC, TSI, SCA, and Gram tests. For the E. coli-positive samples, screening of L-asparaginase was performed using the phenol red indicator. The change in color from yellow to pink in M9 media due to the acidic environment created when L-asparagine was degraded to urea indicates the presence of L-asparginase in the potent E. coli cells. The production of L-asparaginase was carried out using submerged fermentation method. Mechanical cell disruption method, high speed centrifugation, was used to separate the secreted enzyme from cells. The potential of the E. coli cells to produce L-asparginase was also checked using a rapid plate assay method with the indicator dye phenol red. The zone of inhibition for the intracellular enzyme activity ranges from 16.5 mm up to 22.25 mm while that of extracellular enzyme ranged from 7.5 mm up to 9 mm. The commonly used software system is SPSS version 23. The PCR result depicted that the ansA gene presence was confirmed in 50% of the isolates. The result confirmed that the E.coli isolates from sewage showed better L-asparaginase production potency than the Wabe River isolates. This study indicated that E. coli strains are promising sources of L-Asparginase for food and pharmacological companies if the scale-up of this work has been completed in the future.
著者: Kajelcha Fikadu Tufa, S. B. Mosisa, A. B. Beriso
最終更新: 2024-05-23 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.23.595502
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.23.595502.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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