アフリカの人々の大うつ病性障害について理解する
研究がアフリカ系の人々の抑うつリスクスコアを調べてるんだ。
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うつ病障害は、世界中で障害の主な原因のひとつだよ。大うつ病性障害(MDD)は、多くの人に影響を与える最も一般的なタイプのうつ病なんだ。推定では、世界中で322万人以上の人がMDDに苦しんでいて、アフリカにもかなりの数がいるみたい。アフリカではMDDの発症率がヨーロッパや北アメリカに比べて低いと報告されているけど、多くの人がこの数字は実際の状況を反映していないと思ってる。アフリカの多くのうつ病患者が診断されていないからね。
遺伝学とうつ病
MDDは遺伝の影響を受けることがあるんだ。研究によると、MDDを発症するリスクの30%から40%は遺伝する可能性があるらしい。MDDの背後にある遺伝についてもっと知ることで、状態をよりよく特定して、より効果的な治療法を見つけられるかもしれない。今のところ、研究では主にヨーロッパ系の人々に焦点を当てて、多くの遺伝的な違いが特定されているけど、ヨーロッパの人々を対象にした研究が多いから、他の祖先の人々はその結果からあまり恩恵を受けられない可能性もあるよ。
ヨーロッパの集団に焦点を当てているせいで、これらの研究から作られたリスクスコアは、アフリカ系の人々よりもヨーロッパの人々に対してうつ病をより正確に予測できることが多いんだ。これは、特性の表現方法や、環境と遺伝子の相互作用の違いなど、いろんな理由が影響しているかもしれない。アフリカ系の人々に対してこれらのリスクスコアがうまく機能するかどうかを調べた研究はほとんどないんだ。
研究について
この研究は、ヨーロッパの研究から作られたMDDのリスクスコアがアフリカ系の人々にどれくらい適用できるかを見たかったんだ。UKバイオバンクの参加者を調査して、英国にいる50万人以上のさまざまなバックグラウンドの人々から集めた健康関連の情報をたくさん使ったよ。
研究チームは、ヨーロッパの研究から得たデータを使ってうつ病関連のスコアを作成して、アフリカ系アメリカ人の小さな研究と結果を比較したんだ。彼らは、これらの異なるグループから作られたリスクスコアがUKバイオバンクのアフリカ系の人々でMDDを予測できるかを見たかったの。
参加者の評価
参加者を評価するために、チームは主成分分析(PCA)という方法を使ったんだ。これは遺伝的な類似性に基づいて人をグループ化するのに役立つ方法で、黒人またはアフリカ系の人々と報告した人に焦点を当てて、グローバル1000ゲノムプロジェクトのデータを使って適切なグループを特定したの。
UKバイオバンクから、アフリカ系の遺伝子クラスターに近い参加者を見つけて、さらに分析するために8,543人を選んだよ。その中で1,090人がメンタルヘルスの調査を完了して、190人がMDDの兆候を示して、671人が対照群になったんだ。
リスクスコアの計算
リスクスコアを計算するために、研究者たちは多くの研究からの遺伝データを組み合わせたソフトウェアプログラムを使ったの。彼らは、MDDのリスクに影響を与える可能性のあるDNAの小さな変化である一塩基多型(SNP)に注目したんだ。彼らは統計的な重要性に基づいてあまり関係のないSNPを排除して、最も意味のある結果だけを分析することにしたよ。
彼らは、アフリカ系アメリカ人やアフリカのさまざまなグループに焦点を当てた研究からデータを集めた。これにより、さまざまな研究がMDDに関する彼らの発見にどのように影響したかを見られたんだ。
研究の結果
結果として、アフリカ系アメリカ人のデータから作られたリスクスコアがUKバイオバンクのアフリカ系の参加者においてMDDをかなり正確に予測できたことがわかったよ。最も正確な予測は特定の統計的な閾値から得られ、うつ病リスクの小さな割合の変動を説明していた。
アフリカ系アメリカ人のサンプルから得たリスクスコアを、より大規模なヨーロッパの研究のものと比較したところ、アフリカ系アメリカ人の小さな研究は同等の予測精度を持っていた。でも、複数のアフリカの研究を含むメタアナリシスからのデータを調べた際に、結果は予想外だったんだ。彼らはそのスコアがうまく機能すると思っていたけど、MDDを効果的に予測できないことがわかったんだ。
これが重要な理由は?
アフリカ由来のスコアが強く機能しなかった理由を理解することは、いろんな課題を示唆しているかもしれない。研究間でうつ病の定義や測定方法の違いが影響した可能性が高い。たとえば、厳しい基準を使った研究もあれば、もう少し緩やかな基準のものもあって、そういった一貫性の欠如があったかもしれない。さらに、メタアナリシスのグループの遺伝的構成が混合祖先のために大きく異なっていて、正確な予測を妨げる要因になったかもしれない。
以前の研究では、うつ病が他の特性と遺伝的に関連していることがわかっているけど、さまざまな集団を対象にその共有遺伝的基盤を調査した研究は限られている。この研究は、アフリカの集団からのデータを使ってリスクスコアを開発する必要性を強調しているんだ。
特性の予測の横断
この研究では、ヨーロッパでMDDに関連していると知られている特性がアフリカ系の人々にMDDを予測できるかどうかも見たよ。分析の結果、ヨーロッパの研究から得た結果がアフリカの参加者の中でいくつかの特性を予測していたけど、関連する特性を使ってMDDの予測には成功しなかったんだ。この発見は、他の集団でのうつ病を研究するのにヨーロッパのデータを使うのは効率的ではないかもしれないことを示唆しているよ。
結論
まとめると、この研究はさまざまな集団の間でMDDがどのように理解され、評価されるかの違いを明らかにしているんだ。また、研究される個人の祖先を反映した関連のある遺伝データを使うことの重要性を強調している。アフリカの集団に特化したリスクスコアを調査して開発するさらなる努力は、これらのコミュニティにおけるうつ病の理解と治療を改善する可能性があるよ。
現在の研究の限界を認めて、多様な祖先に対応する研究を進めることで、うつ病のようなメンタルヘルスの課題への反応を向上させることができるんだ。遺伝学の進展があっても、異なる集団のユニークなニーズに対応するように研究の努力を調整することが重要だよ。そうすることで、世界中のメンタルヘルス障害の予測、診断、治療方法をもっと効果的に進められるはずさ。
タイトル: Polygenic prediction of major depressive disorder and related traits in African ancestries UK Biobank participants.
概要: IntroductionGenome-Wide Association Studies (GWAS) over-represent European ancestries compared to the global population, neglecting all other ancestry groups and low-income nations. Consequently, polygenic risk scores (PRS) more accurately predict complex traits in Europeans than African Ancestries groups. Very few studies have looked at the transferability of European-derived PRS for behavioural and mental health phenotypes to non-Europeans. We assessed the comparative accuracy of PRS for Major Depressive Disorder (MDD) trained on European and African Ancestries GWAS studies to predict MDD and related traits in African Ancestries participants from the UK Biobank. MethodsUK Biobank participants were selected based on Principal component analysis (PCA) clustering with an African genetic similarity reference population and MDD was assessed with the Composite International Diagnostic Interview (CIDI). Polygenic Risk Scores (PRS) were computed using PRSice2 using either European or African Ancestries GWAS summary statistics. ResultsPRS trained on European ancestry samples (246,363 cases) predicted case control status in Africans of the UK Biobank with similar accuracies (190 cases, R2=2%) to PRS trained on far much smaller samples of African Ancestries participants from 23andMe, Inc. (5045 cases, R2=1.8%). This suggests that prediction of MDD status from Africans to Africans had greater efficiency per unit increase in the discovery sample size than prediction of MDD from Europeans to Africans. Prediction of MDD status in African UK Biobank participants using GWAS findings of causal risk factors from European ancestries was non-significant. ConclusionGWAS studies of MDD in European ancestries are an inefficient means of improving polygenic prediction accuracy in African samples.
著者: Andrew M McIntosh, S. C. Kanjira, M. C. Adams, Y. Jiang, C. Tian, 23andMe Research Team, C. Lewis, K. Kuchenbaecker
最終更新: 2023-12-28 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.24.23300412
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.24.23300412.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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