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# 生物学# 生化学

RNASEH1発現のためのuORF標的ASOの課題

新しい発見が、RNASEH1のレベルを上げるためのuORFを標的にしたASOの効果に疑問を投げかけてる。

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uORF ASO:uORF ASO:偽りの希望?がわかったよ。たASOがRNASEH1を増やせないこと最近の研究では、uORFをターゲットにし
目次

ステリックブロックオリゴヌクレオチド(ASOs)は、特定の標的ヌクレオチドに繋がる短いヌクレオ酸の鎖だよ。この繋がりは、ワトソン-クリック塩基対合というよく知られた方法で起こるんだ。ASOsの主な目的は、特定のタンパク質が互いにどう関わるかを妨げることなんだ。いくつかのASOsは医療用に承認されていて、特にデュシェンヌ型筋ジストロフィーや脊髄性筋萎縮症の治療に使われているよ。研究者たちはこれらASOsの働きについてたくさんのことを学んでいて、色々な病気の新しい治療法を開発するのに役立っているんだ。

メカニズムと応用

ASOsは特定のRNAの部分に結びつくようにデザインされていて、タンパク質の作り方に影響を与えることができるんだ。RNAのスプライシングエラーを修正したり、新しいタンパク質を生成したり、RNAの尾の長さを変えたり、さらにはRNAの望ましくない分解を防ぐなど、いろんな機能の可能性を示しているよ。特に注目すべきケースは、神経性セロイドリポフスチン症7という稀な遺伝的状態を治療するために特別に作られたミラセンだね。この治療法は、ASOsが個々の患者に適応できることを示しているんだ。

上流オープンリーディングフレーム(uORFs)の理解

uORFsはメッセンジャーRNA(mRNA)の始まりに見られる小さなRNAの部分で、タンパク質の作り方に影響を与えることがあるよ。リボソーム、つまり細胞のタンパク質を作る機械がuORFに出くわすと、メインのタンパク質コーディングセクションを翻訳する過程を止めたり遅らせたりすることがあるんだ。研究によると、uORFsの影響を和らげることで特定のタンパク質の生産量を増やす手助けができるかもしれないんだ。

製薬会社の研究では、uORFをターゲットにしたASOsが特定のケースで遺伝子発現を活性化できたことが強調されていて、RNASEH1という特定の遺伝子の発現を高めるために似たアプローチが使えるかどうかに関心が集まったんだ。

研究調査

uORFをターゲットにしたASOsがRNASEH1のタンパク質レベルを増加させるかテストするために、一連の実験が行われたよ。研究者たちはまず、RNASEH1の増加に以前に関連付けられたASOsを3つ選んだんだ。そして、これらのASOsを細胞に導入して、異なる時間と濃度で結果を注意深くモニターしたよ。

以前の報告にもかかわらず、これらの実験の結果はRNASEH1のタンパク質レベルの増加を示さなかったんだ。これは使用したASOの種類、投与された量、Exposureの期間に関わらず一貫していた。研究者たちは実験に使用した方法が妥当であり、材料の品質と手続きの有効性も確認したんだ。

uORFターゲットASOsに関する発見

試験の結果、uORFをターゲットにしたASOsで細胞を処理した後、RNASEH1のタンパク質レベルに有意な上昇は見られなかったよ。さまざまな投与量や時間点を変えても変わらなかったんだ。他の方法を使ってタンパク質レベルを観察したところ、RNASEH1は一定のままだった。このことは、以前報告されたようにRNASEH1の発現を増加させるというuORFターゲットASOsの効果に疑念をもたらしたんだ。

さまざまな投与量の探求

過去の研究でASOの投与量についての結果が異なっていたので、研究者たちはuORFターゲットASOsの異なる濃度でも実験したんだ。低いのから高いのまでいくつかの量をテストしたけど、RNASEH1のタンパク質レベルに影響は見られなかったよ。面白いことに、いくつかのASOsはRNASEH1のレベルを減少させる結果をもたらし、意図した効果よりも潜在的な悪影響を示唆していたんだ。

デュアルルシフェラーゼアッセイ

さらなる検証のために、研究者たちはレポータシステムを含むデュアルルシフェラーゼアッセイを実施したよ。この方法で特定の遺伝子活動を測定できるんだけど、結果は以前の観察と同様に、ASOs治療後にRNASEH1の活性に有意な変化は見られなかったんだ。

ASOの品質確認

研究で使用されたASOsが欠陥品でないことを確認するのは重要だったんだ。徹底的なテストで、すべてのASOsが無傷で期待される基準を満たしていることが確認されたよ。この保証は、RNASEH1のレベルが増加しなかった理由がASOsの質が悪いせいではないことを強化するものだったんだ。

発見の影響

以前の結果を再現できなかったことで、RNASEH1の発現を増加させるための道具としてのuORFターゲットASOsの信頼性に疑問が生じるんだ。uORFsは遺伝子発現の調節において重要な要素と認識されているけど、現時点での証拠は、uORFsをターゲットにすることがRNASEH1のレベルを高めるための効果的な戦略ではないことを示唆しているんだ。

代替アプローチの必要性

uORFsに対するASOsを使う特定の戦略が良い結果を生まなかったとしても、他の役割でASOsを使う可能性は消えないんだ。研究者たちは、さまざまな方法論を探求することを奨励されているよ。RNAの構造を破壊したり、異なるRNA要素を利用したり、さまざまなタイプのオリゴヌクレオチドを使用することで、新しい治療の応用が開けるかもしれないんだ。

結論

要するに、ASOsは特定のRNA領域をターゲットにしてタンパク質の生産を修正する可能性を示したけど、uORFターゲットASOsがRNASEH1の発現を増加させる効果は限られているようだね。将来的な遺伝子調節の努力に有益な代替手段を探るために、もっと調査が必要なんだ。オリゴヌクレオチド治療の世界は広いし、研究者たちは遺伝病に立ち向かうためのより良い方法を求め続けているよ。ASOsの役割を包括的に調査することによって、科学者たちはさまざまな遺伝的障害に苦しむ患者のための知識や治療の選択肢を広げることを目指しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: uORF-targeting steric block antisense oligonucleotides do not reproducibly activate RNASEH1 expression

概要: Upstream open reading frames (uORFs) are cis-regulatory motifs that are predicted to occur in the 5' untranslated region (UTR) of the majority of human protein-coding transcripts. uORFs are typically associated with repression of the downstream primary open reading frame (pORF) at either the level of translation, or by promoting mRNA turnover via the nonsense-mediated decay pathway. Interference with uORF activity provides a potential mechanism for targeted upregulation of the expression of specific transcripts. It was recently reported that steric block antisense oligonucleotides (ASOs) can bind to and mask uORF start codons in order to inhibit translation initiation, and thereby disrupt uORF-mediated gene regulation. Given the relative maturity of the oligonucleotide field, such a uORF blocking mechanism might have widespread therapeutic utility. Here, we re-synthesised three of the most potent ASOs targeting the RNASEH1 uORF described in the study by Liang et al. and investigated their potential for RNASEH1 protein upregulation. No upregulation (of endogenous or reporter protein expression) was observed with any of the oligonucleotides tested at doses ranging from 25 nM to 300 nM. Conversely, we observed downregulation of expression in some instances, consistent with well-established mechanisms of blocking ribosome procession. Experiments were performed using multiple transfection protocol setups, with care taken to replicate the conditions of the original study. Transfection efficiency was confirmed using a MALAT1-targeting gapmer ASO as a positive control. We conclude that previously-described RNASEH1 uORF-targeting steric block ASOs are incapable of upregulating pORF protein expression in our hands.

著者: Thomas C Roberts, N. Ahlskog, N. Svrzikapa, R. Abuhamdah, M. Kye, Y. Jad, N. Feng, B. Hanson, M. Wood

最終更新: 2024-06-14 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.598998

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.598998.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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