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新しいファージAUBRB02:E. coliに対する希望

AUBRB02は抗生物質耐性の大腸菌感染症の治療に可能性があるよ。

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ファージAUBRB02は耐ファージAUBRB02は耐性E.coliを標的にする能性があるって。AUBRB02が抗生物質の代わりになる可
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大腸菌、一般的にはE. coliとして知られている、は人間や温血動物の腸にいる細菌の一種だよ。ほとんどの場合、特に害はないんだけど、いくつかの株は感染を引き起こすことがあって、これらは機会病原体として知られてる。今の大きな問題の一つに抗生物質耐性があって、これは細菌がそれを殺すための薬に対して耐性を持つようになることだ。この耐性は世界的な懸念になってる。

レバノンにおける抗生物質耐性

レバノンでは、農場での抗生物質の使用が耐性のあるE. coliや他の細菌の広がりに寄与している。動物におけるこれらの薬の誤用は、耐性のある細菌を人間に移す原因になることがある。状況は、不十分な廃水処理によって悪化していて、これが耐性のある細菌が環境で繁殖するのを許している。研究によると、病院で見つかるE. coli株のかなりの数が、広範囲スペクトルβ-ラクタマーゼ(ESBL)を含んでいて、これによって多くの一般的な抗生物質に対して耐性を持っていることがわかっている。

バクテリオファージ:自然の代替品

バクテリオファージ、簡単にファージとも呼ばれる、は細菌を特に標的にするウイルスだ。これらは細菌の細胞を感染させて殺すことができて、人間や動物の細胞には害を与えない。ファージは豊富で、いろんな形やサイズがあるんだ。細菌の中で複製できる独特なライフサイクルを持っていて、これが細菌の細胞死につながる。

抗生物質とは違って、ファージは固定された数ではなく、細菌を殺しながら増えることができる。E. coliを狙ったいくつかのファージが特定され、テストされている。つまり、ファージは、特に耐性のある株に対して抗生物質の価値ある代替品になるかもしれないってこと。

下水から新しいファージの分離

E. coli感染を防ぐために、研究者たちはベイルートの下水から新しいファージ、AUBRB02を分離した。このファージはE. coli株ATCC 25922を効果的に殺すことが示された。実験室でテストされたとき、AUBRB02は細菌がいるプレート上にクリアな円(プラーク)を形成し、その溶菌活性を示した。

ファージの宿主範囲のテスト

次のステップは、AUBRB02がどのくらいの異なるE. coli株に感染できるかを調べることだった。これは18の異なるE. coli株に対してテストすることで行われた。結果は、AUBRB02が多くの遺伝的に異なる株に感染できることを示し、その広い宿主範囲をデモンストレーションした。面白いことに、感受性のある株はファージに良く反応したけど、感受性がない株は抗生物質耐性が高いことが多かった。

ファージの挙動の理解

AUBRB02がE. coliとどのように相互作用するかを学ぶために、研究者たちは吸着率と成長曲線の研究を行った。彼らはわずか5分以内に高い割合のファージが細菌の細胞に付着することを発見した。初期の待機期間の後、ファージは増殖し、細菌から飛び出してその過程で細菌を殺した。この成長のタイプは、E. coliを標的にして破壊するAUBRB02の効率を示している。

溶菌活性の測定

AUBRB02の溶菌活性は、細菌に対するファージの比率を変えて測定された。結果は、高い比率でファージがすぐに細菌の数を減少させ、効果を確認した。低い比率でも、ファージは細菌の成長を減少させることができたけど、遅いペースだった。

AUBRB02の安定性

AUBRB02が異なる条件下でどれだけ安定しているかを理解することは、治療としての潜在的な使用にとって重要だ。研究者たちは、いろいろな温度やpHレベルでファージの安定性をテストした。AUBRB02は10°Cから60°Cの温度で安定していたけど、60°Cを超える高温では活性を失った。同様に、pHが4から10の範囲では安定だったけど、非常に酸性または塩基性の条件では安定性が低かった。

バイオフィルム形成への影響

バイオフィルムは、表面に付着して保護層を形成する細菌の集まりで、抗生物質で駆除するのが難しくなる。AUBRB02のバイオフィルムを減少させる能力もテストされた。ファージはE. coliによって形成された成熟バイオフィルムを分解するのに効果的で、バイオフィルムの存在によって難しい感染を治療する可能性を示している。

AUBRB02のゲノム解析

AUBRB02の遺伝的構成が徹底的に分析された。二本鎖DNAゲノムを含んでいて、他の既知のファージと類似点を持っている。抗生物質耐性や有害な特性に関連する遺伝子は見つからず、AUBRB02が治療に安全であることが確認された。このファージは、細菌だけを殺して自分のDNAを細菌細胞に組み込まないという意味で、病原性溶菌ファージとして分類されている。

ファージ療法の可能性

研究結果は、AUBRB02が抗生物質に耐性のあるE. coli感染の治療において期待できることを示している。さまざまなE. coli株に感染する能力、短い待機時間、効果的な溶菌、異なる条件下での安定性が、さらなる開発の強い候補にしている。

結論

要するに、AUBRB02は抗生物質耐性のE. coli感染に対する治療オプションとして大きな可能性を示している。ファージの全能力を理解し、実際のシナリオでの効果を調査するためには、引き続き研究が必要だ。抗生物質耐性の増加とともに、ファージ療法は貴重な代替治療戦略を提供できるかもしれなくて、特にレバノンのように問題が深刻な地域ではそうなるかもしれない。その効果を動物モデルで観察し、これらの発見に基づいて治療プロトコルを開発することが、将来的に進展するための鍵になるだろう。

オリジナルソース

タイトル: Isolation and Genomic Analysis of Escherichia Phage AUBRB02: Implications for Phage Therapy in Lebanon

概要: We obtained a new and unique Escherichia phage, AUBRB02, from sewage water in Beirut, Lebanon, as part of this research. AUBRB02 has an incubation period of around 45 minutes, a lysis period of about 10 minutes, and a burst size of around 30 plaque-forming units per cell. The phage exhibited strong biological stability over a pH range of 5.0-9.0 and temperatures ranging from 4{degrees}C to 60{degrees}C. AUBRB02 was found to have a genome size of 166,871 base pairs and a G+C content of 35.47% using whole-genome sequencing. A comparative analysis revealed that AUBRB02, a newly found phage, shares 93% intergenomic similarity to closest relative in refseq. Functional annotation revealed the presence of 10 tRNA and 262 coding sequences, out of which 123 are categorized as putative proteins. These results indicate that AUBRB02 is a highly infectious virus that belongs to the Tequatrovirus genus. This study is significant reference information that can be used in the development of phage therapy. IMPORTANCEEscherichia coli, a gram-negative bacterium, is a widely distributed pathogen in the natural environment and a frequent cause of illnesses. The extensive utilization of antibiotics has resulted in a rise of clinically resistant strains, posing a substantial obstacle to antimicrobial therapy. This urgent circumstance highlights the necessity for antibiotic substitutes to combat E. coli infections. In this context, we introduce AUBRB02, a novel Escherichia phage isolated from an untreated sewage source in Beirut. Our findings indicate that AUBRB02 is highly lytic, stable against extreme culturing conditions, and has a biofilm elimination capability.

著者: Esber S Saba, T. A. Abdo Ahmad, S. A. El Houjeiry, A. Abou Fayad, S. S. Kanj, G. M. Matar

最終更新: 2024-06-18 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599311

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599311.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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