相互主義と進化的救済:複雑な関係
研究によると、相利共生の相互作用が環境ストレス下での種の生存にどう影響するかがわかったんだ。
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環境の変化は、一部の種にとって生き残るのが難しくなり、絶滅につながることがある。でも、いくつかの種はこの運命を避けるために十分早く適応できることもある。この能力のことを進化的救済って呼ぶんだ。進化的救済を助けたり妨げたりする要因を理解することは、保護活動、農業、医療にとって重要だよ。
保護活動では、種がどのように適応できるかを知ることで、生物多様性を守るのに役立つ。特に生息地が失われたり気候が変わったときにね。農業や医療では、進化的救済が薬剤耐性の害虫や病気を排除するのを難しくするかもしれない。
進化的救済に影響を与える主要な要因
研究では、進化的救済に影響を与えるいくつかの主要な要因が調べられてきた。これには環境の変化の速さ、種が移動する速さ、またはその個体数の大きさが含まれる。これまでの研究の多くは単一の系統に焦点を当てていたけど、自然界では種は他の多くの系統や種と相互作用していることが多いんだ。これらの相互作用は進化的救済が起こる確率を変えることがある。
いくつかの理論では、種間の競争や協力がこれらの個体群が新しい課題にどのように適応するかに影響を与えるかもしれないと示唆されている。こうした相互作用は個体群の成長を変えることができ、サバイバルに影響を与える新しい圧力を導入することがある。また、特定の毒素が競争種に影響を与えるように、相互作用が種が新しい条件に適応する方法を変えることもある。
相利的相互作用の役割
もっと研究が必要なのが、種が生存のためにお互いに依存する相利的相互作用が進化的救済にどのように影響するかだ。相利的なシステムでは、グループ全体の生存が最も適応していない種に依存することがある。この考え方は「最も弱いリンクの仮説」って呼ばれていて、相利的な集まりでは、種が単独でいるときよりも適応が遅くなるかもしれないってことを示唆している。これは、相利関係の全てのパートナーが成功裏に適応するためには複数の変化が必要だから。ストレスはこれらの相利的な結びつきを弱め、協力の崩壊を引き起こすことがある。
自然界には、サンゴと藻類の白化現象や人間の行動による土壌マイクロバイオームの変化など、こうした崩壊の例が見られる。制御された環境下では、特定の細菌系統の相利的コミュニティが抗生物質の圧力の下でより苦労し、しばしば相利関係の崩壊につながることが示されている。
相利関係における進化的救済の調査
研究者たちは、相利的相互作用が急激な環境ストレスにさらされたときに絶滅を回避できるかを確かめたかった。そこで、アミノ酸のためにお互いに依存する2つのE. coli系統からなる合成コミュニティを作り、2種類の異なるストレス(高塩分とp-ニトロフェノールという有毒化合物)にさらした。
塩分は細胞が水を失い、重要なプロセスが妨げられる状況を作る一方、p-ニトロフェノールは細胞膜を傷つけて毒性の影響を引き起こすことがある。目的は、これらのコミュニティがこれらの課題を乗り越えて生き残れるかどうかを見ることだった。
研究結果
ストレスがなかったとき、相利的コミュニティも通常のE. coli個体群も繁栄していた。しかし、一旦ストレスがかかると、相利的グループは絶滅に向かって減少し始めた。個体数は大きく減少したにもかかわらず、多くの相利的コミュニティは生き残り、回復することができ、進化的救済にしばしば関連するパターンを示した。
研究者たちは、異なるストレス処理が同様の回復パターンをもたらしたかどうかを理解したいと考えた。高塩分にさらされたコミュニティは、p-ニトロフェノールにさらされたコミュニティよりも回復に時間がかかった。また、一度回復すると、塩分にさらされたコミュニティはより速く成長し、最終的な個体数密度も高かった。
コミュニティ構成の変化
研究者たちは、ストレスが細菌コミュニティの構成にどのように影響したかも調べた。研究の終わりにどの系統が存在していたかを特定の遺伝子テストで確認したんだ。興味深いことに、ストレスの下で持続的に生き残ったのは1つの系統だけだった。これらの証拠は、進化的救済がその系統が成長のためにパートナーに依存しなくなった状態に戻ることで達成されたことを示唆している。
これらのコミュニティから得られた培養物を追加の栄養素サポートがない条件下に置くと、彼らはうまく成長し、独立して機能できる新しい突然変異を得ていたことを示していた。このより自律的な状態への回帰が、相利関係の初期の生存を助けたけど、他のパートナーは回復しなかった。
ストレスへの系統の感受性
通常の系統は環境条件による影響をあまり受けなかったので、研究者たちは通常のE. coli系統が相利的コミュニティよりもストレスに対して耐性があるという仮説をテストした。両方のタイプの個体群をいくつかのストレスの形にさらした結果、相利的コミュニティは常に成長率が遅く、サバイバル率が低いことがわかった。
これらの発見は、相利的システムがそれぞれの前栄養的な仲間よりもストレスに対してより影響を受けやすいことを示した。相利的コミュニティは、通常の系統に比べて低レベルのストレスを生き延びることができた。
生存を支える遺伝的変化
この研究では、進化的救済を促進している特定の遺伝的変化が存在するかどうかを調べるために、生き残った系統の突然変異も調査した。ストレス環境から来た細菌は、元の相利関係と比べて成長率が高く、以前の依存性を回避することで適応したことを示していた。
救済された個体群からの遺伝データを分析することで、研究者たちは多くの突然変異を特定したが、その多くはアミノ酸代謝に関連していた。これにより、これらのコミュニティが生き残った主な方法は、互いに重要な栄養素を必要としない状態に戻ることであったことが強調される。
結論
この研究は、相利的相互作用がストレス下で進化的救済の可能性にどのように影響するかを理解する重要性を浮き彫りにした。見つかった結果は、より自律的な状態に戻る能力が、これらのコミュニティの生存に重要な役割を果たすかもしれないことを示唆している。
この研究は特定の相利関係に焦点を当てているけど、さまざまな環境や生態系でこれらのダイナミクスがどのように展開するかについてはまだ学ぶことがたくさんある。人間の活動が私たちの世界を変え続ける中、これらの関係を理解することは、急速に変化する気候の中での種の回復力を管理するためや保護にとって重要になるかもしれない。
今後の研究では、これらの発見の広範な意味、特にさまざまな形の相利関係や生態的相互作用が環境変化に直面する種の適応能力と生存にどのように影響するかを探ることを目指すべきだね。
タイトル: Reversion to metabolic autonomy underpins evolutionary rescue of a bacterial obligate mutualism
概要: Populations facing lethal environmental change can avoid extinction by undergoing rapid genetic adaptation, a phenomenon termed evolutionary rescue. While this phenomenon has been the focus of much theoretical and empirical research, our understanding of evolutionary rescue in communities consisting of interacting species is still limited, especially in mutualistic communities, where evolutionary rescue is expected to be constrained by the less adaptable partner. Here, we explored empirically the likelihood, population dynamics, and genetic mechanisms underpinning evolutionary rescue in an obligate mutualism in which auxotrophic Escherichia coli strains exchanged essential amino acids reciprocally. We observed that >80% of the communities avoided extinction when exposed to two different types of lethal and abrupt stresses. Of note, only one of the strains survived in all cases. Genetic and phenotypic analyses show that this strain reverted to autonomy by metabolically bypassing the auxotrophy, but we found little evidence of specific adaptation to the stressors. Crucially, we found that the mutualistic partners were substantially more sensitive to both stresses than prototrophs, so that reversion to autonomy was sufficient to alleviate stress below lethal levels. We observed that increased sensitivity was common across several other stresses, suggesting that this may be a general property of obligate mutualisms mediated by amino acid exchange. Our results reveal that evolutionary rescue may depend critically on the specific genetic and physiological details of the interacting partners, adding rich layers of complexity to the endeavor of predicting the fate of microbial communities facing intense environmental deterioration.
著者: Ignacio José Melero-Jiménez, I. J. Melero-Jimenez, Y. Sorokin, A. Merlin, A. Couce, J. Friedman
最終更新: 2024-07-02 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.600993
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.27.600993.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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