Simple Science

最先端の科学をわかりやすく解説

# 生物学# 合成生物学

新しいDIALシステムが遺伝子制御を革命化!

DIALは研究と医療治療のために遺伝子の活動を正確に調整することができるよ。

― 1 分で読む


DIAL:DIAL:ジーンコントロールの精密さ活性管理を強化する。新しいシステムが研究と治療のための遺伝子
目次

私たちの体の中の細胞は、遺伝子がオンまたはオフになることで機能が変わるんだ。時には、遺伝子活動のほんの少しの変化が、異なる細胞型を生み出すこともある。科学者たちは、細胞を望む方法で行動させるために、これらの遺伝子活動をよりよく制御したいと思っている。これは特に、組織を修復したり再生させたりする治療法にとって重要なんだ。

遺伝子制御の課題

遺伝子工学を使って、研究者は細胞に追加の遺伝子を導入して自然なプロセスに影響を与えることができる。でも、これらの追加遺伝子の適切な量を得るのは難しいんだ。多すぎたり少なすぎたりすると、予測できない結果を招くことがある。遺伝子をオンまたはオフにするためのツールはあるけど、微妙な遺伝子発現の変化を正確に制御することはできないことが多い。

これに対処するために、科学者たちは特に複雑な生物システムの中で遺伝子活動を正確に調整できる信頼できるツールが必要なんだ。現在の方法では、遺伝子活動の単純な増減ともっと複雑な効果を区別するのが難しいことがある。

より良いツールの必要性

遺伝子発現を細かく調整できるツールは、基礎研究や医療応用など多くの分野で役立つ。たとえば、医者が患者の細胞内の特定の遺伝子の活動を制御できれば、損傷した組織をより効果的に修復したり強化したりできる。これは、遺伝子活動の明確で安定したレベルを提供できるシステムが必要なんだ。

DIALシステム

遺伝子制御を改善するために、研究者たちはDIALという新しいシステムを開発した。これを使うと、科学者はシンプルなセットアップで遺伝子発現レベルを正確に調整できるんだ。DIALは、1つのセットアップから複数の予定された遺伝子活動レベルを生成できる。これは、遺伝子発現の正確なレベルが重要な実験に特に価値があるんだ。

DIALの仕組み

DIALは、遺伝子の周りのDNAを編集するプロセスを通じて動作する。特別なDNA配列を使って切断したり再配置したりして、遺伝子産物がどれだけ作られるかを変えるんだ。特定のDNA配列の間の距離を慎重に調整することで、DIALは基礎的な遺伝子を変えずに遺伝子活動を高めたり低下させたりできる。

DIALのセットアップは、DNAがどのように編集されるかに基づいて異なるレベルの遺伝子発現を生成できる。研究者が特定のタンパク質や化学物質を加えると、編集プロセスが引き起こされて、遺伝子出力が高くなったり低くなったりする。

遺伝子活動の調整

DIALシステムのスペーサーの長さを変更することで、科学者は出力をより効果的に調整できる。スペーサーは、DIALシステムの部分がどれだけ密接に接続されているかを制御して、遺伝子活動のより正確な調整を可能にするんだ。

DIALは、遺伝子発現を制御するタンパク質の様々なレベルに一貫して応答する能力がある。つまり、これらの制御タンパク質の量に変動があっても、出力は安定しているんだ。

DIALの実践

研究者たちは、DIALがどれだけうまく機能するかを確認するために、様々なタイプの細胞でテストを行った。彼らは、必要に応じてDIALが遺伝子発現レベルを大幅に変えることができると発見した。これにより、科学者たちは異なる遺伝子活動レベルが細胞の行動にどのように影響するかを研究できるようになり、これは病気を理解し治療法を開発するのに重要なんだ。

様々な細胞タイプでのDIALの使用

DIALは、標準的なラボの細胞株でよく機能するだけでなく、より複雑な一次細胞や幹細胞でもうまく働く。これにより、DIALは研究や治療の幅広い応用に使える可能性があるんだ。

信号の伝達

DIALの面白い特徴は、変化を記憶できることだ。特定の信号が適用されると、DIALは将来の細胞世代が引き継ぐことができる遺伝子発現の持続的な変化を作り出せる。これは、細胞が時間の経過とともに異なる環境の手がかりにどのように反応するかを理解するのに役立つ。

一時的な入力で永久的な変化を

DIALは、特定のタンパク質のパルスのような短期的な信号を受け取り、これを遺伝子活動のより持続的な変化に変換できる。この能力は、細胞が時間の経過とともにどのように変わるかを追跡するのに役立ち、発展や病気の進行のプロセスを研究するのに役立つ。

DIALの能力を拡張する

DIALシステムは、他の遺伝子制御の方法を取り入れるために拡張できる。たとえば、薬や光に反応するシステムと連携することもできる。この柔軟性により、DIALは特定の実験や治療法に合わせて調整できるんだ。

DIALと小分子制御

小分子-遺伝子発現を制御できる薬-を統合することで、DIALは遺伝子のオンオフをさらに洗練できる。これにより、科学者は特定のトリガーに正確に反応できるようになり、より効果的な研究方法や治療法につながるんだ。

結論

DIALシステムは、遺伝子制御の分野で重要な進展を示している。遺伝子発現の精密なレベルを設定し維持する方法を提供することで、DIALは研究と治療の新しい道を開く。様々な細胞タイプで機能し、変化する条件下でも安定性を保ち、一時的な信号を永久的な変化に変換する能力は、科学者にとって強力なツールになるんだ。

研究者たちがDIALの可能性を探求し続ける中で、遺伝子制御の理解や健康と病気への影響に関するブレイクスルーにつながるかもしれない。DIALの影響はラボの外にも及ぶ; より良い病気治療戦略や健康の改善に向けた期待を抱かせるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Programmable promoter editing for precise control of transgene expression

概要: Subtle changes in gene expression direct cells to distinct cellular states. Identifying and controlling dose-dependent transgenes require tools for precisely titrating expression. To this end, we developed a highly modular, extensible framework called DIAL for building editable promoters that allow for fine-scale, heritable changes in transgene expression. Using DIAL, we increase expression by recombinase-mediated excision of spacers between the binding sites of a synthetic zinc finger transcription factor and the core promoter. By nesting varying numbers and lengths of spacers, DIAL generates a tunable range of unimodal setpoints from a single promoter. Through small-molecule control of transcription factors and recombinases, DIAL supports temporally defined, user-guided control of transgene expression that is extensible to additional transcription factors. Lentiviral delivery of DIAL generates multiple setpoints in primary cells and iPSCs. As promoter editing generates stable states, DIAL setpoints are heritable, facilitating mapping of transgene levels to phenotypes. The DIAL framework opens new opportunities for tailoring transgene expression and improving the predictability and performance of gene circuits across diverse applications. HighlightsPromoter editing generates unimodal setpoints from a single synthetic promoter DIAL setpoints are tuned by the length of an excisable spacer within the promoter DIAL setpoints are uniform and robust to varying levels of the transcription factor DIAL transmits transient inputs into heritable promoter states The TET-DIAL system enables small-molecule activation at defined setpoints DIAL regulates physiologically-relevant transgenes and performs in primary cells and iPSCs One Sentence SummaryDIAL offers an extensible framework for designing synthetic promoters that perform across a range of cell types to generate heritable setpoints of gene expression.

著者: Kate E Galloway, S. R. Kabaria, Y. Bae, M. E. Ehmann, A. M. Beitz, B. A. Lende-Dorn, E. L. Peterman, K. S. Love, D. S. Ploessl

最終更新: 2024-07-14 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.19.599813

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.19.599813.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

著者たちからもっと読む

類似の記事