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# 生物学# 植物生物学

小麦の病気耐性研究の進展

研究者たちは小麦の病気抵抗性の遺伝子を特定するために進展を遂げている。

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小麦耐性遺伝子の研究進展小麦耐性遺伝子の研究進展を進めてるよ。科学者たちが小麦の重要な耐性遺伝子の特定
目次

小麦は世界的に重要な作物だけど、常にいろんな病気、特に真菌による被害にさらされてるんだ。真菌病は毎年15-20%の収量損失を引き起こすから、小麦を守るための効果的な方法を見つけることがめっちゃ大事。ひとつの鍵となる戦略は、これらの病原体に対する遺伝的抵抗性を持つ新しい小麦品種を育成すること。

小麦の抵抗性遺伝子

小麦の生産を向上させるために、科学者たちは抵抗性(R)遺伝子と呼ばれる新しい遺伝的抵抗源を見つけることに集中してるんだ。これらの遺伝子は、植物が病原体に攻撃されてるかどうかを認識するのを助ける。多くのR遺伝子は、植物の免疫反応に重要なタンパク質をコードしてる。これらは、病原体の特定のタンパク質、いわゆる無毒性(AVR)タンパク質を識別して防御反応を引き起こす。これによって、局所的な細胞死が起こることが多く、病原体の広がりを制限する助けになる。ただ、いくつかの病原体は急速に進化して、これらのR遺伝子による検知を回避するように適応するから、常に新しい抵抗源を見つけることが必要なんだ。

小麦のうどんこ病

小麦にとっての大きな脅威のひとつは、ブリュメリア・グラミニスF.sp.トリティチ(Bgt)によって引き起こされるうどんこ病。これは特に小麦をターゲットにしていて、適切に管理しないと壊滅的な作物損失を引き起こす可能性がある。ライフサイクルが短いから、特に単一作物の畑では急速に増殖する。これに立ち向かうために、研究者たちはBgtに対する抵抗性を提供できる69のR遺伝子を小麦から特定してるけど、まだ多くの遺伝子は詳細にクローン化されて研究されてないんだ。

AVR遺伝子の特定の重要性

科学者たちはR遺伝子の特定と分離に進展を見せているけど、病原体の対応するAVR遺伝子の特定は遅れてる。最近の研究では、これらのAVR遺伝子を特定することが重要だと強調されてる。病原体集団内での多様性を理解することで、R遺伝子がどれだけ効果的になるかを予測できるから。この情報は、常に進化する病原体から耐えられる強固な小麦品種を開発するために欠かせないんだ。

AVR遺伝子を特定する新しいアプローチ

AVR遺伝子の特定が遅れている問題を解決するために、研究者たちはAVR除去アッセイ(ADアッセイ)という新しい方法を開発した。この方法は、BgtのAVR遺伝子を特定するプロセスを簡素化することを目指していて、個々の植物を大規模にテストする必要なく、より早く発見できるようにしている。ADアッセイは、遺伝子マッピング戦略と選択プロセスを組み合わせて、AVR遺伝子を効果的に特定するんだ。

概念実証:AVR遺伝子の特定

ADアッセイの初期実験では、科学者たちはAvrPm3a2/f2として知られるAVR遺伝子の効果を確認しようとした。この遺伝子は小麦にあるR遺伝子Pm3aと相互作用するんだ。異なる病原性パターンを持つ2つのBgt分離株を交配することによって、このAVR遺伝子を系統のバルクシーケンシングを通じて特定することを期待してた。ADアッセイは、AvrPm3a2/f2遺伝子を成功裏に特定し、この新しいアプローチの可能性を示した。

AvrPm60の探索

AvrPm3a2/f2の成功を受けて、研究者たちはAvrPm60という別のAVR遺伝子に注目した。この遺伝子は幅広く効果的なPm60抵抗性遺伝子に対応している。再びADアッセイを使って、AvrPm60遺伝子に関連する特定のゲノム領域を特定できた。この領域は、以前に特定されたAvrPm3a2/f2領域と重なっていることがわかった。この重複は、異なるAVR遺伝子間に共有されたメカニズムがある可能性を示唆していて、今後の育種戦略に役立つかもしれない。

AVR遺伝子のメカニズムを理解する

研究者たちは、AvrPm60遺伝子がRNAse様エフェクターと呼ばれるタンパク質の大きなファミリーの一部であることを発見した。これらのタンパク質は感染プロセス中に重要な役割を果たしていて、初期感染段階での高い発現レベルは植物の免疫システムに認識されやすくする。AvrPm60の特定は、小麦が病原性真菌とどのように相互作用するかをさらに深く理解することになり、病気抵抗性管理におけるこれらのエフェクタータンパク質の重要性を強調している。

遺伝子コピー数変異の重要性

興味深い発見のひとつは、Bgt集団内でのAVR遺伝子のコピー数変異だった。いくつかの分離株はAvrPm60遺伝子の複数のコピーを持っている一方で、他のものは持っていなかった。この変異は、異なる地域で特定の抵抗性遺伝子がどれだけ効果的かに影響を与える可能性がある。アメリカでは、調査したBgt分離株のほぼ19%がAvrPm60遺伝子を失っていることがわかった。こうした損失は、Pm60抵抗性遺伝子の失敗につながる可能性があって、持続的な監視と研究が必要だってことを意味してる。

Pm60とそのアレル

Pm60遺伝子は古代の小麦の祖先から分離され、多くのBgt分離株に対して広く効果的だって知られてる。最近、Pm60遺伝子の2つの追加バリアント、Pm60aとPm60bが特定された。研究者たちは、これらのバリアントがAvrPm60遺伝子とどのように相互作用するのかを調べることを目指した。彼らは、3つのPm60バリアントすべてがAvrPm60エフェクターを認識できるけど、反応の強さには違いがあることを発見した。この情報は、新しい小麦品種の育種に最も効果的なR遺伝子を選ぶ際に価値があるかもしれない。

抵抗性のための育種

複数のR遺伝子を組み合わせた小麦品種の育成は、真菌病に対する持続的な抵抗性を確保するのに役立つ。Bgtのような真菌が進化し続ける中、育種のために利用できるR遺伝子のバリエーションを持つことが、潜在的な発生から小麦作物を守ることができるんだ。ADアッセイはAVR遺伝子を発見するための強力な新しいツールを提供していて、より抵抗性のある小麦品種の開発の道を切り開いている。

結論

うどんこ病のような小麦病との戦いは続いてるけど、改善してきてる。R遺伝子とAVR遺伝子の特定のための新しい方法を活用することで、研究者たちは小麦とその病原体間の相互作用をよりよく理解できる。これは、急速に進化する真菌病がもたらす課題に耐えうる強靭な小麦品種を育成する努力にとって必須なんだ。科学者たちはアプローチをさらに発展させ、洗練し続けているから、持続可能な小麦生産の未来は明るいだろう。

オリジナルソース

タイトル: Avirulence depletion assay: combining R gene-mediated selection with bulk sequencing for rapid avirulence gene identification in wheat powdery mildew

概要: Wheat production is threatened by multiple fungal pathogens, such as the wheat powdery mildew fungus (Blumeria graminis f. sp. tritici, Bgt). Wheat resistance breeding frequently relies on the use of resistance (R) genes that encode diverse immune receptors which detect specific avirulence (AVR) effectors and subsequently induce an immune response. While R gene cloning has accelerated recently, AVR identification in many pathogens including Bgt lags behind, preventing pathogen-informed deployment of resistance sources. Here we describe a new "avirulence depletion (AD) assay" for rapid identification of AVR genes in Bgt. This assay relies on the selection of a segregating, haploid F1 progeny population on a resistant host, followed by bulk sequencing, thereby allowing rapid avirulence candidate gene identification with high mapping resolution. In a proof-of- concept experiment we mapped the AVR component of the wheat immune receptor Pm3a to a 25kb genomic interval in Bgt harboring a single effector, the previously described AvrPm3a2/f2. Subsequently, we applied the AD assay to map the unknown AVR effector recognized by the Pm60 immune receptor. We show that AvrPm60 is encoded by three tandemly arrayed, nearly identical effector genes that trigger an immune response upon co- expression with Pm60 and its alleles Pm60a and Pm60b. We furthermore provide evidence that Pm60 outperforms Pm60a and Pm60b through more efficient recognition of AvrPm60 effectors, suggesting it should be prioritized for wheat breeding. Finally, we show that virulence towards Pm60 is caused by simultaneous deletion of all AvrPm60 gene paralogs and that isolates lacking AvrPm60 are especially prevalent in the US thereby limiting the potential of Pm60 in this region. The AD assay is a powerful new tool for rapid and inexpensive AVR identification in Bgt with the potential to contribute to pathogen-informed breeding decisions for the use of novel R genes and regionally tailored gene deployment.

著者: Marion C Mueller, L. Kunz, J. Jigisha, F. Menardo, A. G. Sotiropoulos, H. Zbinden, S. Zou, D. Tang, R. Hueckelhoven, B. Keller

最終更新: 2024-07-16 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602895

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602895.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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