非在来魚種の管理と保護
在来魚の個体群を保護するための障壁の役割を検証する。
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外来魚種を在来魚が住んでる場所に持ち込むと問題が起きるかもしれないんだ。これには捕食、餌や生息地の競争、病気、異種交配が関わってる。異種交配は淡水魚と塩水魚の両方でよく見られることだし、淡水魚の方が全体的に異種交配しやすい傾向がある。自然に異種交配が起こることもあるけど、スポーツフィッシングや養殖のために人間が作り出すことも多いんだ。そんな魚は有利な特性を持つ魚を生み出すためにやってるんだ。
特に絶滅の危機にある魚の個体数をモニタリングするのは難しい。異種の魚が親種に似てると分からなくなっちゃって、遺伝子検査をしない限り気づかれないことがあるんだ。魚の種を効果的に守るためには、異種交配の兆候を探るためにDNAを定期的に検査する必要がある。
淡水魚の一種であるナマズは異種交配しやすいことで知られているし、特にCatostomus属の魚がそうだ。上コロラド川流域では、在来のフランネルマウスナマズとブルーヘッドナマズが外来のホワイトナマズと交配してるのが特に心配されている。これらの在来種を守ることは、いろんな機関にとって優先事項なんだ。
保護活動は状況によって異なるし、各ケースの特定のニーズを考えるのが重要だ。この研究では、外来魚を捕まえつつ在来魚が上流に行けるようにバリアーを使ったんだ。バリアーは漁業科学ではあまり良いイメージじゃないけど、外来種をコントロールするなどの利点もあるんだよね。
研究の概要
この研究では、抵抗板式堰(RBW)を使って、外来ホワイトナマズとロングノーズナマズの産卵エリアを制限できるかを調べたんだ。RBWは、大人の魚が上流に泳げないようにしつつ、トラップに導く構造になってる。捕まったら、フィールド作業員が魚を識別して、外来のナマズを取り除く。認定された在来魚は上流に戻されて産卵するんだ。
RBWの効果は、産卵後に孵化した幼虫のDNAを分析することで測定された。RBWが稼働していた年には、外来ナマズの数が非稼働の年よりも少ないだろうと期待された。
研究はコロラド州のガニソン川流域で4年間行われた。RBWが設置された重要な地点はルービドクリークだった。このクリークは毎年の雪解けの時期に主に流れるし、繁殖期には多くの魚が移動してくる。RBWは特定のサイズ以上の魚が上流に行けないように設計されていたんだ。
場所とサンプリング
RBWはガニソン川の支流であるルービドクリークの河口に設置された。このクリークは流れが不定期で、ほとんどの水が雪解けの時に移動するんだ。春には通常、ガニソン川から大人の魚が来て、繁殖してから幼虫として下流に流れていく。研究者は、ルービドクリークが魚の利用と産卵活動が高いため、保全作業にとって重要な地点だと指摘している。
RBWには特定の魚が通過できないようにするための機能があり、定期的にゴミを監視していた。上流に向かう大人の魚は捕まえられ、識別されて分類された。ネイティブなナマズはクリークに戻され、外来のものは取り除かれた。
研究期間中に、大人と幼虫のナマズがサンプリングされた。遺伝子識別のために、異なるセットの大人のナマズが捕まえられ、フィールドスタッフの形態学的評価と比較された。これにより、スタッフが各魚の種をどれだけ正確に認識できるかが判断された。
ゲノムデータの準備
大人と幼虫の魚サンプルからDNAが抽出された。抽出されたDNAは遺伝子分析用のライブラリを作成するために使用された。これらのライブラリは、解釈のために大量のデータを収集するためにシーケンシングされた。
生のゲノムデータが収集されたら、それはデマルチプレックスされ、参照ゲノムにアラインされた。このプロセスの後、研究者たちは遺伝的変異を特定し、分析のために最も関連性の高い情報だけを保持するようにデータをフィルタリングした。
結果と観察
産卵する大人の割合
データによれば、産卵に来た魚の多くは在来種として識別された。ブルーヘッドナマズとフランネルマウスナマズの割合は毎年異なっていて、外来ナマズは少なかった。魚のタイプの相対的な割合は大きく変動していて、魚の個体群が年ごとに変わりやすいことを示している。
堰の使用の影響
異なる親種からの幼虫の割合は、年ごとにかなりの変化を見せた。堰の存在は、在来種と外来種の幼虫DNAの割合に影響を与えていたみたい。堰が完全に稼働しているときには効果があったけど、繁殖シーズンの全期間使えないときは影響が変わったようだ。
分析結果は、堰の稼働日と産卵した幼虫のホワイトナマズの祖先の割合との相関がないことを示している。つまり、他の外的要因が魚の個体数ダイナミクスに影響を与えることがあるってことだ。
異種交配のダイナミクスの変動
研究者たちは、種間の異種交配を調べ、ハイブリッドがどのくらい出現するかに注目したんだ。特定の交配では、F1ハイブリッドが多く出て、F2ハイブリッドは予想より少なかった。これは、異種交配の崩壊や後代の適応に影響を与える他の要因を示すかもしれない。
フィールドでの大人の識別
フィールドスタッフによる大人の魚の識別は、しばしば不正確だった。純粋な種が過剰に表示され、ハイブリッドは少なめに見積もられてた。この矛盾は、幼魚ハイブリッドを特定するのが難しいことを示していて、親種に似ていることが多いから注意が必要だ。
誤った識別は魚の個体数管理の問題につながるから、保護活動にとっては重要なんだ。特に、大量の魚を短い時間で扱うときには、フィールドでの識別の精度を改善する必要があるね。
結論と今後の方向性
全体的には、抵抗板式堰は翌年以降の外来ナマズの存在を大きく減らす効果を示さなかった。ただし、堰が繁殖シーズン全体で稼働していたときには、ホワイトナマズの祖先の量が少なく見られた。
この研究の結果は、特に環境条件が魚の個体数に与える影響を強調してる。今後の研究では、変動する流れの条件に耐えられる除外方法を改善することに焦点を当てるべきだ。さらに長期的な研究が、魚のダイナミクスに影響を与える要因を特定し、保護戦略の改善につながるかもしれないね。
最後の考え
この研究からの重要な教訓は、数年にわたる観察の重要性だ。そうしないと、一年だけの結果から導き出される結論は誤解を招くかもしれない。それに、変化する環境の中での様々な魚種の関係を理解することが、効果的な保護活動を発展させるために重要だってことも示してる。さらなる研究が、異種交配の理解を深め、外来種によるリスクから在来魚の保護を助けるだろうね。
タイトル: Test of a conservation intervention highlights temporal variability in hybridization dynamics in Catostomus fishes
概要: Non-native species are a leading threat to fish biodiversity. They pose risks to native populations through human-mediated introductions resulting in hybridization events, which could result in demographic or genetic swamping. Catostomus fishes in the Upper Colorado River Basin are an example of this. Extensive hybridization occurs between non-native white suckers (C. commersonii ) and native flannelmouth and bluehead suckers (C. latipinnis and C. discobolus). This system provides a suitable model for using genomic analyses to test the efficacy of an intervention to reduce the abundance of non-native species and production of hybrid offspring. This study implemented a Resistance Board Weir (RBW) as a fish barrier across Roubideau Creek, a tributary of the Gunnison River in Colorado (USA), to restrict non-native sucker participation in spawning events. Conducted over four years, the study gathered genomic data from larval fish samples, pre- and post-implementation of the RBW. We used genomic data to determine the efficacy of a RBW at limiting non-native and hybridized sucker larval production. We found no significant effect of the weir on the proportion of white sucker ancestry in larval fish across the four years of the study, which included three years of weir usage when access was successfully controlled for variable amounts of time. Overall, this work provides insight into the efficacy of a resistance board weir as a management tool for non-native suckers, and highlights interannual variability. This work contributes valuable information for policy and fisheries management in Colorado.
著者: Zachary Hooley-Underwood, J. N. Campbell, E. Mandeville
最終更新: 2024-07-23 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.19.604301
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.19.604301.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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